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A newer version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G58350 | AT | Annotation by Michelle Graham. TAIR10: Putative serine esterase family protein | chr1:21663131-21666827 REVERSE LENGTH=794 | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
GO:0008150 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: biological process | SoyBase | N/A | ISS |
KOG2205 | KOG | Uncharacterized conserved protein | JGI | ISS | |
PTHR12482 | Panther | UNCHARACTERIZED | JGI | ISS | |
PF05057 | PFAM | Putative serine esterase (DUF676) | JGI | ISS | |
PF12394 | PFAM | Protein of unknown function (DUF3657) | JGI | ISS | |
UniRef100_G7J418 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Most informative UniRef hit: Protein FAM135A n=1 Tax=Medicago truncatula RepID=G7J418_MEDTR | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
UniRef100_UPI000233E6B5 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Best UniRef hit: UPI000233E6B5 related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI000233E6B5 | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
Glyma17g26573 not represented in the dataset |
Glyma17g26573 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma.17g191900 | Wm82.a2.v1 | IGC | As supplied by JGI |
Schmutz et al. 2010 Genome sequence of the palaeopolyploid soybean Nature 2010, 463:178-183 |
>Glyma17g26573.2 sequence type=transcript gene model=Glyma17g26573 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high GTGCAACAATAACAGTACGAGTTGGCGCAAACCAATCAAAACGAGGAACAGCACACGTCGTTCAAATCCGCATAATAACATCTCAGATTACCTCGGCGTGCGTTTCTTCCTCTCTTTCTTTCTACTTTTCGCAGCAACAGAAAAAACCATCTTTCACACAACCACGAACCCTAGCAATTCCCACACATTCCCAATTTCAGCTGTAGTTTACCGTGGAGGGAGCTAGTGAATGCTACAGATTACAATCCAGTGTTTCATTTTTATAGATGGTTAATTTGGCCAAGAATTAGCAATATGCAACAAATATGATTTGATATGATAAGAACTGAAGGGGGGCACATGAATTCACTGCTTATTATGACTTAAGAGAATGAGATACGTGTGTTATTACAGGTTATCGTTGCACATAACTAGGATTATCTGTTGGTGTGAAATACAGAAGCTGGCCAGCAAAGTGGCTTCCTGATGTAATGCCACACTCTCTTAAGGTCAGAGCGGTGGCTATGTTTGAAGCTGTACAGGAGATTGCCATATACATTCATAGGTTTCACAATCTTGACCTTTTTCAGCAGGGATGGTATCAGATTAAAATTACTATGAGATGGGAAGATGATGAAGATGTATCTTTTGGAATCCCAGCTAGAGTTGTTCAATACGAAGCTCGAGATCTGGGTCCTAGCAGTATATATGGTATTTGGAGGATTGATGATACAGACAACAGTTTCTCAACACAGCCCTTTCGGATAAAATATGCTAGGCAGGACATTCATTTATGTATGATGATCTCATTCAACTTATCCCTTGGTAGATTTGAGGTTTTACCTACAACAGCTGTAATTTTAAAATTTGAGCTTATGTATGCTCCCACATTTGAAAATGGTGCTGACTTGCAAGCTTCGCTGGATGCTTACCCTGCTGCTGTCCACGAATTCCGAATTCCTCCAAAAGCTCTTCTAGGATTGCATTCTTATTGTCCTGTACATTTTGATGCTTTACATGCAGTGCTGGTTGATGTCAGTATACATGTAAGTTTACTGAAAGCTGCATCGACGGCACCCAGGAATTCTCGTAATGCTGAATTTGTTGCTAATAAAAGTTACGACACATTGGATCAAGGTTTGAGTGATGCTGCCTCTGTAAAGTTGAAAGCCTTCATGATTGTTAAAGCATTATTAACAGCTCATGGTATATTACTTGAAGAACTACAAAAACTTAGCAAAGCAGTTGATCAGGCTATTGATATTCCAGAGTTTGTGTCAAAAAGGAACGATATGAAATTAATAAATTCTGTTCCGCAAGCTAATCAGTTTACTACAGAAGTTGAAATTTCAGGTCAACGCATGCCACAAAATGGTCTCGAGGGAGCAGACAGAGCTTTAGATTTTGAGACTGCTGAAAAGCTTCGTTCCTTGTCAAAGAGAGAGCTGTTGAACTGTTATCATTCAGTGGGAAATCGATTGTTGTATTTATGGAACATATTTCTGAAGTTCCACAGGGATAACAAAACAAAGATTCTAGAATTTTTGCATGATGCTTGGGCTAAGGATCGAAAAGCTGAATGGTCAATATGGATGGTGTACTCTAAGGTCGAGATGCCTCATCATTATATAAATAGTGGTGTACACAGAAGAGTTTCCAGTTTGTGGAAACTACCTGATGAGCCTCCTCAGACTGCTGCTACACGTGCAGAACTTCATCGAAGAAGCATTGCACAAATGAGGATTAACAACCGGTCAATTCAAGACATGCATATATTCGGTGATCCTTCAAGCATACCAATTGTCATTGTTGAACGTGTGATGAATGCACCACGTCGGACTATCAGTGACAATTCATACTTGAGACAGGTAGAACTTGTAAATTCACATAGCTTTCAAACTGGACTCAACTTGGACACTGCAAACAAGATATCTGCTCCACAAACTAGTACCCGTGTGTTGAAGATTGTTGTCTTTGTGCATGGGTTTCAGGGGCATCATCTGGATCTACGGCTTATTCGAAATCAATGGCTTTTGATAGATCCCAAGGTAGAATTTCTAATGTCGGAGACTAATGAAGATAAAACTTCAGGAGACTTCAGAGAAATGGGTCATCGGCTGGCTCAGGAAGTAATTTCTTTTGTTAGAAAGAAAATGGACAAGGCCTCAAGATATGGGAATTTAGGAGATATTAGGCTAAGTTTCGTTGGACATTCTATTGGTAACCTTATTATAAGAACAGCACTAGCAGAGAGCATGATGGAGCCATTTCTAAGATATCTATATACATATGTTTCGGTATCTGGTCCACACTTGGGGTATCTTTACAGTTCAAACTCTTTGTTTAATTCTGGATTGTGGCTTTTGAAGAAACTAAAAGGCACACAGTGTATTCATCAACTCACCTTCACAGATGATCAGGATATTCAAAATACATTCATCTATAAACTGTGTAAGCAGAAGACTCTGGATCATTTTAGGCATATTATCTTGCTATCTTCCCCTCAGGATGGTTATGTGCCTTACCATTCTGCTAGAATAGAATTATGCCAGGCTGCTTCACGTGACAAATCAAAGAAGGGTAGAGTGTTCCTTGAGATGCTGAATGATTGTTTGGACCAAATCCGTGCCAATCCCTCTGAACATCGAGTTTTCATGCGTTGTGATGTCAATTTTGATGCCACTTCCTACGGCAAGAATTTAAACTCTTTCATTGGGCGTGCTGCACATATTGAGTTTCTGGAGTCTGACATTTTTGCAAGGTTCATAATGTGGTCATTTCCGGAACTATTTCGGTAGGTGATAGTTATGTGAATACTCAAATTTTGAGCATCCCCTACTGACAAGCTTCCTACCACCTTCAAGAGACCAGTTGTGGCCAGATTTCACTCACAAGATAATCAAAGAATGGCAACCATCTTGGTATGTGTAAATTGGCAGGAGGATATGCATCGAAGCTGCATATTTAGTCGGCTTCAAATGTTTATTTGCAATACTTGTATACATATATAGCTTTAGAAACAGTTCTTAGTATAGTGATGTAATTATTTTAGGTTAGGTAGATAAGCTGTTAATGCCATGGGGAAGGGATTCAGCGCGCATGGGAACGCAATAACAAAAATAATTAGGCATAGATTATCTACTAAGAAATAGGCATATTTTAAACTTAAAAAACTGAATTCTCACTTATGTTAATTTGCTTTACTTTCTCTTTGAAGGAATAAAACATTTCGTTGCTCAATCTACGCTTCTTTTGAAAAGGGA >Glyma17g26573.3 sequence type=transcript gene model=Glyma17g26573 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma17g26573.4 sequence type=transcript gene model=Glyma17g26573 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma17g26573.1 sequence type=CDS gene model=Glyma17g26573 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma17g26573.2 sequence type=CDS gene model=Glyma17g26573 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma17g26573.3 sequence type=CDS gene model=Glyma17g26573 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||