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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
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UniRef100_C6T6B1 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Best UniRef hit: Putative uncharacterized protein (Fragment) n=2 Tax=Glycine max RepID=C6T6B1_SOYBN | SoyBase | E_val: 1.00E-126 | ISS |
Glyma13g29987 not represented in the dataset |
Glyma13g29987 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma.13g227600 | Wm82.a2.v1 | IGC | As supplied by JGI |
Schmutz et al. 2010 Genome sequence of the palaeopolyploid soybean Nature 2010, 463:178-183 |
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>Glyma13g29987.5 sequence type=CDS gene model=Glyma13g29987 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high ATGCATTCAGCTAACGAATCTATCTCTGTTCCTCTTTCTAATTTCAAGGTTTCCCCACTCAAATTACCAATAACCGAATTGCCCTCCGCTAAAAACACTTCTCAAAATCAGTCTTCCAAGAATTTGGGTGAAAGTGACTCTGATGTGGATTCTCCTTGTTGGAAGGGAACCATGGCTTTTTGTCTAACTCCAATAGAAAATTCAGGATCAATACAAATTAGTAATGTTGAGAAAGCAACAGAAAAACATAATAGTTTAAACCCTTTGGCTCCTCAGTTCTTTCCGGGTATTGGATATGTTAAGGATGATTTTGGGTCTTCCATCTCTTGTACGCCTGTAGCTACTAATTTGTTGTCAGGAGAGGACATGCTCATTAAAACTGTTATGGCTGAATCCCCAGTAGAGCCGAGGAAGGGGATTGAGCTTCAGTCTTCTAGTAACACCTGTGGAAGAGAAAAGGCATTTAATATGTTTAATAATCCAAAAAATAGCTCTGTGGATCCTGTGCTAAATTTGCATTGTATGGTGACACAATCTTCCTCTAAAGAAGACTGCTCAATATCCAATGGAAAACTTGAAACTGTTGTGGATGTTGATAACTTTGTAAAGGGAACTAAAGATTCCAGGGTTTGTAATGCTTTCCCTGCAAAGGGTCATTTTCCATTTCCAACTCAGGCAGCATTGTCATCTGGGGTTAATGCTGTTCCTGATCCTCTGAAAACATTTGAAGGTCTTTCAAAGACCTTAATTAAATCTCCAAAACCTGATGTTGGGACAATTGTCAGTGCAATTCATGTTCTTTCAGAATTGCTTGTGCAAACATCCATGGATGGAGTAGACTCAAATAGTGAACATGGTCATGATGAGATTATGATCCAGCAAATAATCAATAACCTAAATGATTTCAGCACAAAAAGATGTGGCCTAAGGATTCCAACCCTTGATTCAACTCCCACAGATAATCCATTTGGTCCTGATAGGTCATTGGAGGGTTCCAAGGGACTTGAAATGACAAGTATAGAGACCCTTAATGATCCAAACCAGCTTTATCAACAAAATGATTATATGGGAAAAAACAGAGTTTTTAATATGTTTGGGCAGAGTGGACAGAGATTTTTAGCATCTAGCAGTGAACACCAGGACAAAGGCAATGAAATAGCTCAGCTTCAGGTTATTAGGAGGAGTCTGGGGAAAACTCTGCATTTTGATAAACACATGCACCCAGAGGCGTCACTGTTTTTGAACTTATGGCTTGATTCTGAAGCAGAACGATGTTATAGGAAATATAAAACTTATCATTGCCTTATGGAAGCTGGGCTGGATGTAAATTGCACAACTGTTGCGGAATTGTTGAGCTGA >Glyma13g29987.6 sequence type=CDS gene model=Glyma13g29987 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high ATGCATTCAGCTAACGAATCTATCTCTGTTCCTCTTTCTAATTTCAAGGTTTCCCCACTCAAATTACCAATAACCGAATTGCCCTCCGCTAAAAACACTTCTCAAAATCAGTCTTCCAAGAATTTGGGTGAAAGTGACTCTGATGTGGATTCTCCTTGTTGGAAGGGAACCATGGCTTTTTGTCTAACTCCAATAGAAAATTCAGGATCAATACAAATTAGTAATGTTGAGAAAGCAACAGAAAAACATAATAGTTTAAACCCTTTGGCTCCTCAGTTCTTTCCGGGTATTGGATATGTTAAGGATGATTTTGGGTCTTCCATCTCTTGTACGCCTGTAGCTACTAATTTGTTGTCAGGAGAGGACATGCTCATTAAAACTGTTATGGCTGAATCCCCAGTAGAGCCGAGGAAGGGGATTGAGCTTCAGTCTTCTAGTAACACCTGTGGAAGAGAAAAGGCATTTAATATGTTTAATAATCCAAAAAATAGCTCTGTGGATCCTGTGCTAAATTTGCATTGTATGGTGACACAATCTTCCTCTAAAGAAGACTGCTCAATATCCAATGGAAAACTTGAAACTGTTGTGGATGTTGATAACTTTGTAAAGGGAACTAAAGATTCCAGGGTTTGTAATGCTTTCCCTGCAAAGGGTCATTTTCCATTTCCAACTCAGGCAGCATTGTCATCTGGGGTTAATGCTGTTCCTGATCCTCTGAAAACATTTGAAGGTCTTTCAAAGACCTTAATTAAATCTCCAAAACCTGATGTTGGGACAATTGTCAGTGCAATTCATGTTCTTTCAGAATTGCTTGTGCAAACATCCATGGATGGAGTAGACTCAAATAGTGAACATGGTCATGATGAGATTATGATCCAGCAAATAATCAATAACCTAAATGATTTCAGCACAAAAAGATGTGGCCTAAGGATTCCAACCCTTGATTCAACTCCCACAGATAATCCATTTGGTCCTGATAGGTCATTGGAGGGTTCCAAGGGACTTGAAATGACAAGTATAGAGACCCTTAATGATCCAAACCAGCTTTATCAACAAAATGATTATATGGGAAAAAACAGAGTTTTTAATATGTTTGGGCAGAGTGGACAGAGATTTTTAGCATCTAGCAGTGAACACCAGGACAAAGGCAATGAAATAGCTCAGGTTATTAGGAGGAGTCTGGGGAAAACTCTGCATTTTGATAAACACATGCACCCAGAGGCGTCACTGTTTTTGAACTTATGGCTTGATTCTGAAGCAGAACGATGTTATAGGAAATATAAAACTTATCATTGCCTTATGGAAGCTGGGCTGGATGTAAATTGCACAACTGTTGCGGAATTGTTGAGCTGA
>Glyma13g29987.1 sequence type=predicted peptide gene model=Glyma13g29987 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high KKREGKHNNHTTWRRSYYILSLVNSNPHKRFDFASFGVSSDTLGFAVHFQTSKLQRMMKKNQSKQVNSLTTTRLSPLAKPFTLNRSTLQPCSSSPFSGYPFLESPKEYDFDGFGEDFSLPSYSPLCHGKQGEGDSHESLFHKGKHAVDGVSPCPESAGTSTIVAEDLPSNSKGLMHSANESISVPLSNFKVSPLKLPITELPSAKNTSQNQSSKNLGESDSDVDSPCWKGTMAFCLTPIENSGSIQISNVEKATEKHNSLNPLAPQFFPGIGYVKDDFGSSISCTPVATNLLSGEDMLIKTVMAESPVEPRKGIELQSSSNTCGREKAFNMFNNPKNSSVDPVLNLHCMVTQSSSKEDCSISNGKLETVVDVDNFVKGTKDSRVCNAFPAKGHFPFPTQAALSSGVNAVPDPLKTFEGLSKTLIKSPKPDVGTIVSAIHVLSELLVQTSMDGVDSNSEHGHDEIMIQQIINNLNDFSTKRCGLRIPTLDSTPTDNPFGPDRSLEGSKGLEMTSIETLNDPNQLYQQNDYMGKNRVFNMFGQSGQRFLASSSEHQDKGNEIAQVIRRSLGKTLHFDKHMHPEASLFLNLWLDSEAERCYRKYKTYHCLMEAGLDVNCTTVAELLS* >Glyma13g29987.2 sequence type=predicted peptide gene model=Glyma13g29987 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high MMKKNQSKQVNSLTTTRLSPLAKPFTLNRSTLQPCSSSPFSGYPFLESPKEYDFDGFGEDFSLPSYSPLCHGKQGEGDSHESLFHKGKHAVDGVSPCPESAGTSTIVAEDLPSNSKGLMHSANESISVPLSNFKVSPLKLPITELPSAKNTSQNQSSKNLGESDSDVDSPCWKGTMAFCLTPIENSGSIQISNVEKATEKHNSLNPLAPQFFPGIGYVKDDFGSSISCTPVATNLLSGEDMLIKTVMAESPVEPRKGIELQSSSNTCGREKAFNMFNNPKNSSVDPVLNLHCMVTQSSSKEDCSISNGKLETVVDVDNFVKGTKDSRVCNAFPAKGHFPFPTQAALSSGVNAVPDPLKTFEGLSKTLIKSPKPDVGTIVSAIHVLSELLVQTSMDGVDSNSEHGHDEIMIQQIINNLNDFSTKRCGLRIPTLDSTPTDNPFGPDRSLEGSKGLEMTSIETLNDPNQLYQQNDYMGKNRVFNMFGQSGQRFLASSSEHQDKGNEIAQLQVIRRSLGKTLHFDKHMHPEASLFLNLWLDSEAERCYRKYKTYHCLMEAGLDVNCTTVAELLS* >Glyma13g29987.3 sequence type=predicted peptide gene model=Glyma13g29987 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high MMKKNQSKQVNSLTTTRLSPLAKPFTLNRSTLQPCSSSPFSGYPFLESPKEYDFDGFGEDFSLPSYSPLCHGKQGEGDSHESLFHKGKHAVDGVSPCPESAGTSTIVAEDLPSNSKGLMHSANESISVPLSNFKVSPLKLPITELPSAKNTSQNQSSKNLGESDSDVDSPCWKGTMAFCLTPIENSGSIQISNVEKATEKHNSLNPLAPQFFPGIGYVKDDFGSSISCTPVATNLLSGEDMLIKTVMAESPVEPRKGIELQSSSNTCGREKAFNMFNNPKNSSVDPVLNLHCMVTQSSSKEDCSISNGKLETVVDVDNFVKGTKDSRVCNAFPAKGHFPFPTQAALSSGVNAVPDPLKTFEGLSKTLIKSPKPDVGTIVSAIHVLSELLVQTSMDGVDSNSEHGHDEIMIQQIINNLNDFSTKRCGLRIPTLDSTPTDNPFGPDRSLEGSKGLEMTSIETLNDPNQLYQQNDYMGKNRVFNMFGQSGQRFLASSSEHQDKGNEIAQLQVIRRSLGKTLHFDKHMHPEASLFLNLWLDSEAERCYRKYKTYHCLMEAGLDVNCTTVAELLS* >Glyma13g29987.4 sequence type=predicted peptide gene model=Glyma13g29987 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high MHSANESISVPLSNFKVSPLKLPITELPSAKNTSQNQSSKNLGESDSDVDSPCWKGTMAFCLTPIENSGSIQISNVEKATEKHNSLNPLAPQFFPGIGYVKDDFGSSISCTPVATNLLSGEDMLIKTVMAESPVEPRKGIELQSSSNTCGREKAFNMFNNPKNSSVDPVLNLHCMVTQSSSKEDCSISNGKLETVVDVDNFVKGTKDSRVCNAFPAKGHFPFPTQAALSSGVNAVPDPLKTFEGLSKTLIKSPKPDVGTIVSAIHVLSELLVQTSMDGVDSNSEHGHDEIMIQQIINNLNDFSTKRCGLRIPTLDSTPTDNPFGPDRSLEGSKGLEMTSIETLNDPNQLYQQNDYMGKNRVFNMFGQSGQRFLASSSEHQDKGNEIAQLQVIRRSLGKTLHFDKHMHPEASLFLNLWLDSEAERCYRKYKTYHCLMEAGLDVNCTTVAELLS* >Glyma13g29987.5 sequence type=predicted peptide gene model=Glyma13g29987 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high MHSANESISVPLSNFKVSPLKLPITELPSAKNTSQNQSSKNLGESDSDVDSPCWKGTMAFCLTPIENSGSIQISNVEKATEKHNSLNPLAPQFFPGIGYVKDDFGSSISCTPVATNLLSGEDMLIKTVMAESPVEPRKGIELQSSSNTCGREKAFNMFNNPKNSSVDPVLNLHCMVTQSSSKEDCSISNGKLETVVDVDNFVKGTKDSRVCNAFPAKGHFPFPTQAALSSGVNAVPDPLKTFEGLSKTLIKSPKPDVGTIVSAIHVLSELLVQTSMDGVDSNSEHGHDEIMIQQIINNLNDFSTKRCGLRIPTLDSTPTDNPFGPDRSLEGSKGLEMTSIETLNDPNQLYQQNDYMGKNRVFNMFGQSGQRFLASSSEHQDKGNEIAQLQVIRRSLGKTLHFDKHMHPEASLFLNLWLDSEAERCYRKYKTYHCLMEAGLDVNCTTVAELLS* >Glyma13g29987.6 sequence type=predicted peptide gene model=Glyma13g29987 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high MHSANESISVPLSNFKVSPLKLPITELPSAKNTSQNQSSKNLGESDSDVDSPCWKGTMAFCLTPIENSGSIQISNVEKATEKHNSLNPLAPQFFPGIGYVKDDFGSSISCTPVATNLLSGEDMLIKTVMAESPVEPRKGIELQSSSNTCGREKAFNMFNNPKNSSVDPVLNLHCMVTQSSSKEDCSISNGKLETVVDVDNFVKGTKDSRVCNAFPAKGHFPFPTQAALSSGVNAVPDPLKTFEGLSKTLIKSPKPDVGTIVSAIHVLSELLVQTSMDGVDSNSEHGHDEIMIQQIINNLNDFSTKRCGLRIPTLDSTPTDNPFGPDRSLEGSKGLEMTSIETLNDPNQLYQQNDYMGKNRVFNMFGQSGQRFLASSSEHQDKGNEIAQVIRRSLGKTLHFDKHMHPEASLFLNLWLDSEAERCYRKYKTYHCLMEAGLDVNCTTVAELLS*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||