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A newer version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
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AT5G24740 | AT | Annotation by Michelle Graham. TAIR10: Protein of unknown function (DUF1162) | chr5:8470073-8489703 REVERSE LENGTH=3464 | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
GO:0006396 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: RNA processing | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0008104 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: protein localization | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0009887 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: organ morphogenesis | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0009888 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: tissue development | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0010413 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: glucuronoxylan metabolic process | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0010638 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: positive regulation of organelle organization | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0022402 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: cell cycle process | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0033044 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: regulation of chromosome organization | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0045492 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: xylan biosynthetic process | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0005794 | GO-cc | Annotation by Michelle Graham. GO Cellular Compartment: Golgi apparatus | SoyBase | N/A | ISS |
PTHR16166 | Panther | VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN (VPS13) | JGI | ISS | |
PTHR16166:SF7 | Panther | gb def: tipc protein - slime mold (dictyostelium discoideum) | JGI | ISS | |
PF06650 | PFAM | Protein of unknown function (DUF1162) | JGI | ISS | |
UniRef100_G7IJW3 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Most informative UniRef hit: Vacuolar protein sorting-associated protein n=1 Tax=Medicago truncatula RepID=G7IJW3_MEDTR | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
UniRef100_I1M061 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Best UniRef hit: Uncharacterized protein n=2 Tax=Glycine max RepID=I1M061_SOYBN | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
Glyma13g24305 not represented in the dataset |
Glyma13g24305 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
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Glyma.13g174600 | Wm82.a2.v1 | IGC | As supplied by JGI |
Schmutz et al. 2010 Genome sequence of the palaeopolyploid soybean Nature 2010, 463:178-183 |
>Glyma13g24305.2 sequence type=transcript gene model=Glyma13g24305 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high CTAGGATCAGCATGATAGCTATTATTCTAATTTTATGTTGGCTTTCAGTCAATTCTTGCTCTTTAAATGAAATTGTCCCTTTTATATAAAAAGTTTAGTTTGAGGTTTTTCAAATATTCTAATCATTATATTATATAGGTATGGTCGCTTTCGTCCCTGGCATTGTCTTTTACCAAGAAAATGTGAAGGTTGGCAAATATTTTGGTGGCACTATGCACAAGAATCAGTCCTTTCTGATGTTCGTAGGAAATTGAAGAAAACATCTTGGAGATACCTTGGGGATCGATTAAGTTTCCGACGGAAATATTTGAACTTGTACAAGGCTAAGTTGGATTTTCTTCAACAAGAGCAGCTAGTTGATGATGATGTTCTTCGAGATTTGGAGCAAATGGAGAAAGAATCAGATCTAGATGATATATTAAATTATCGATCTGCTGCAGAATATGAAATGCAGGAATTTCTTTCAAGGTGTTCTATGCCTAACAATGGCAAGATTAACAATGATATTCCTACAGAGAAGTCTTGCAATGATGAACATACAGTAAAATCTCGGGGATGGTTGAATTGGCTTTCTCGTGGTATGCTTGGTGCTGGGGGAACTGATGATTCGAGTCAATTTTCTGGAGTTGTGTCATATGATGTTAAGGATATATCTGAAGCAACTGAGTTTCATCCTCTAGTTTCATCTAGCTTTGATGTTGCTGTAAAGCATGAATTATGCATATTTTCAATCAAGTTTCAGATTCATCAGATTTCTGCAACTCTCTGTAACAAGAGGCACAATAAAGGAATTGCAGAAATAATTATTGAAGGTGGAATTGTCGAGTCTAACATCTACAAAGAACGTGGAATTGTTATATCCAAATTCAATTCTGGGAAAATGGTTGATCTAAGCAACAAGACAGTCGTTGTACATATTGGAGGGCCTGTCATTGAAAACAACATACTGGACAATTTGGATAGTTGTTGCAGCATTCAAGTAAATTTTTCTTCTCATGGAGATATGGACGTGTCAGTGAAGGGAATACTTCAACAACTTGAAGTGACAGTTGATGCAAATATTTTATCAAATTTGTTAGAGTTTTCTGATGTCTTTACATCCTTCAAATTTCTTAATGAAAGGGTGCTGTTGTCACTGAATGGAATTGAAAATGACAATATTAGGCTCCTATCCAAAGCAGAATACATTTCTGTAAACCATAAAAAAGTTGTGTGGGATGTTAGTATTGTTGATGTTTCTGTTAATTTTCCTTGGAGAAGTACAGCATCAGAGTATAGCAACTTGGTATTGAAGTCAAGATCTTTATGCTGTAAATCCACAAATAGTCTTGAGTCTTTTTCTTCAAAAGTTGAGGAGCAACCGTACTCTCTGAAGAACTTTTTAAATTCAATATCCACATCTGGGATTTGTTTAGGCATCCAACTTCAAGATCTATATGATTATTTTGATGTTACACTAAATGATTTTAAGATCATCATGGTAAATTCTGACCAGTCACAAAAGGTTTATATTCTTGAGAAATTTAGTGTTTCGTTCTTCCTGGCACTTTGCATGATCCCAGATGAGTCCATTTTGAAGCAGTTAGAGGTTTATGTACTTATTGAATCACTTAAAGTACACTTCTCTCCTTCAATATACGGTGCATTCATAGAATTGACGAATCATCTGGGTACATTGCATGTAACGGGTGAATCTGGAGTCTTAAATTCCCCTCATCCTCCCAATATTGTTTCAGTTTTGCCAACATATTCTACTTTTGGCATATCCATTGTTTCAATAATTGATTCCATTGATCTTGATGTTGACCTTGAAGATAGTGGAGATAACAGCTCAAAGCTCATGGTTTCCTTACAAAAAATGGTCTTACGGTATGCTTCTTCAGAATTTCAGGAGTTATCTCTCAGTATGAAGTCTTTAATGATCTGTGCTTGTAAAATGAAGGAAGAAAAAGACAGCCAGGTTGTGCTTTTATCGGGAAATTTATCTTCTCCTGGTGCTGCAGTTGGAGAAGACTGTGTTTCTGGACCAAATATTGAAGTTGATCAATATTCTGATGTGGCTATGCTGGCTGATGCATGTTTCGCTATGCATTATGAATCTTCCAGAACTGATGTGCTTTGTCATAAGATTTTTATGTACTTAAATAATGCTGATATCCACTGCTACCCACATATTGCTGGACTGCTCATTGGATTCTTTCATAGGTTGTCTGCCTATAGTAGCAGTTTTGAGAAATCCTCTGCCAGTAATACTGTTGACATTTCAAAAATTTTCTCAAGTTTTGGGTTACAGAAGTTTGGCTTCTCAAATTATTTTGAATTTGGTTTCACTGATTCTGCTTGCATTCCATTGGATTGCTTTCCATTTGTAACGATTCACAATTCTGGTTCTCTTGGTAATCTAGAGAGCGCACTCGTACATGCCATTCCTGACTGGAGAAAATATTTTATCCTGAGGGACAGAAAAATCAAAAGTTCCAATATAAATATGAGGAGAGGGTCCAAATTTTTCCAGGTCTCTCCCTCAAAATCCAAATCTGATTTTGTATATTCTCATGAAACTGGGATTGCGAGCACCTGTGATATTTTTTCTACTGAATTGCACCTATTTGGAATAAGAGCACATTTTCATGACTCATCATGCATTATTGGGACAATCATGGTGCCTACTTCTAAGTCTTCTCTATTATTTTGTGAAGACAGTATGGATATATTGTCTTCTTCTGAAGGATTGGCTCTTACATCATCTTGGGGGCCGCAAAATTTTCAAGATAATCTATGGGGTCCCTCTTCACCAAATTTGTCTCCTATTTTAAATGTACGAGTCAGGAAAGGACAAAATATATCTTCAACTATTGATTTGGAAATAAGCATTGGCATTCAGCATGTCTACTGCATGTTACCTTCCGAATATCTCTCCATTATCATTGGTTACTTCTCATTATCTGATTGGGGTGGTGCTTCTGGTGACCAGTGTTTCTCTGACGAGCAAAGTGATACAGATGTAAAAAATGAAATGAAAATTACATATAAATTTGAAATCTTGGACTCCAATCTTATTTTTCCAGTGGTAAGTAATGACCGTCAGTTTATAAAGATTGAAATGCCACAGCTTTATTGTAGTTTCATCGAGAATTCTGGTGTTGATGAAGTACTAAAGAACATCCCTCCTGAATGTTTGGTTCCTATTCATAAGCTTGCAAAAAGAAATGATTGTTTAAATGTATTTGGGCGAGACTTGTTTGTATCATTCCTTCTTTACAAGAATGATTTGCTTGGCTTAGCAACAGTTGAACGGAATACGGAATTTTTAACAAGTGCTTTAATTGCACCCATAAATGCAGATGTTTGGGTCAGAATTCCAGTTGGTGGCAAATCTAATTGCAAAAGTACTTCATCAATATGTTTCATGACAAGCATCAGCAGTTGTCATATTGTTGCAGAAGATAGCCACTTTTTTGATGGATGCATGGCCATATGGGATGTTATTGAGGAATTCTCCTCAGTTGATGATCAATCCAAATGTTTCAAATCAGATGTTCTGCAATTCCTTAATTCAAAGAGAAGTTTAGAGGCAACCCGAACCATTTCTCCAACTCTGATGGCCTCAACTATCATGTCAACAGAAGTTAAATGTTGCGCACAGTCTTTATTTATAAGCTTCCATCATAGAAAAGAAGATTTTGTGGAATTAATAACCAAGGGTGATTTGGGGTTTGTTTGTTCTGCATCCTTAATAAATGATTCCTTGGTATGTTTAGATTTGGGTTTCTCTTCCGTAGTGTTTTACTCTCCACGTGATTCTATTTTAGCAAAATGCACCCCAACTTCCTTTTCCATGTCAGTACTTAGTATCTCTTTTTCTCAATCTATTGGTGGAAAAAATAAACTTGACCTTTGTCTTTCATCCATTGATATTTGGCTTCATTTGGCTGAGTGGACTGAGGTTGTTAAATTCCTTAATCATTTCCGTTTACATTTGGAAAGAACTCCTGTGAATGCAATAACAAATAGTTTGTCCGTGGATGCTTCTAATTCTGTAAAAAAATCAACAGTTCAACATAGTTCAAGTTTCCTTGATTCTGAAAGCACCTCAGCACCTTTTACTTCACAAGAGATTGAGAATGATGTCTTTATAATTAAGTCAGAAAATTTTTGTATTACATTTCACATCCCTGTTTGGGTTGGTGAGGAACCTCATGTGGAATTTCAGCATTCTCAAGGTCTCAATGTGACACCTTTAAGTGTATCTTCTGATATAGTTGAAGAAAAAGATGCAAAATTTCTTACTGTTTCTTTCAACATGAATGGTTTTGAATTAGTTATAAGAAGCAGAGATATCCAACTGACGTCCAAAATGGAAAAACTTAGCAGTGTAATAATGATAGTTGAGAATGGAAGACATACATCTTGCCCACTGCTTGATGTAATTGAGGTTCAAGTGGATGCTGTACTCTGTAAGAATCATACGAACACCATTGAGCTCAATGTGGAAATTGCATGTGATAATTCAAATGTATGGATTTCGCATCCTACATTTCATTTATGGAATGCTGTAAAATTTGATGTTCCGGAATCAGGACCTTCTCAATATTCAACTAGTGGCATTACTTTCAAATTCCAGATGAGGAAGGTTTCTATTCTACTAACAGATGGAAGGTGGAGCTACAATGGGCCTGAGCTGGAGATTCTGGTCAGAAACATCTTGTTTCATACAATTGCAAGTGGAAAGCACATGGAATGTTCTGTCAATGGTGATCTTCAAGTAAACTACAATAACATCGAAAAGGTGTCATGGGAGCCTTTTATTGAGCCTTGGAAGTTTGTGTTGACATTAGTCAGGGAACAAGAAATGAGTGTTATGCCGAATAGGTCCGTTTCAACAGATATCATTCTCAAATCTACAACCCAGCTGAACATTAATATTACAGAATCCTTAGTAGAGTGTCTTTCACGTGCTACAGAGATGTTTTCTGATGCCCTGGGTCTTATGGTATTGG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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||