Report for Sequence Feature Glyma06g17451
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm06
Start: 13802452
stop: 13808691
Source: JGI
Version: Wm82.a1.v1.1
High confidence: yes
A newer version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma06g17451
Database ID Annotation Type Annotation Description Annotation Source Match Score Evidence Code
AT3G26890 AT
Annotation by Michelle Graham. TAIR10: unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G41110.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | chr3:9907456-9910463 REVERSE LENGTH=649
SoyBase E_val: 1.00E-51 ISS
GO:0008150 GO-bp
Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: biological process
SoyBase N/A ISS
GO:0009507 GO-cc
Annotation by Michelle Graham. GO Cellular Compartment: chloroplast
SoyBase N/A ISS
GO:0003674 GO-mf
Annotation by Michelle Graham. GO Molecular Function: molecular function
SoyBase N/A ISS
PTHR13199 Panther
FAMILY NOT NAMED
JGI ISS
PTHR13199:SF7 Panther
OS08G0536100 PROTEIN
JGI ISS
PTHR13199:SF9 Panther
UNKNOWN PROTEIN
JGI ISS
UniRef100_I1JXN8 UniRef
Annotation by Michelle Graham. Best UniRef hit: Uncharacterized protein n=1 Tax=Glycine max RepID=I1JXN8_SOYBN
SoyBase E_val: 0 ISS
UniRef100_Q949N7 UniRef
Annotation by Michelle Graham. Most informative UniRef hit: AT3G26890 protein n=1 Tax=Arabidopsis thaliana RepID=Q949N7_ARATH
SoyBase E_val: 5.00E-49 ISS
Expression Patterns of Glyma06g17451
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Paralogs of Glyma06g17451
Paralog Evidence Comments
Glyma04g37640 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.3.
Gene model name correspondences to Glyma06g17451 Gene Call Version Wm82.a1.v1.1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma.06g166100 Wm82.a2.v1 IGC As supplied by JGI
References for Glyma06g17451
Transcripts of Glyma06g17451
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma06g17451.2 sequence type=transcript gene model=Glyma06g17451 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
CTTGACTTCAATACCCGACTTGTTTGTGGTTTCCCTTTTGCTGCAAGTTGTGGCTTTCAAAAGTACAGCCAGAAAAATTCTGGCTAAGCCATGCATGCCCCACAAATTGAATCCATATCGTATAGTCGTCCACCAATGCTTACCCCCCCAAACCCGTGTTTTATGTGATACACGGTAGTTTTGAGCAACAACAACCACAAGGAATTTCTTGGACATATGAGGCCTTTTAACGTTGTGGGGTTTGCAAAAGTTTTTTCCTTTGATTGGTATTGTTGGTGAATTGTGGTAAAAAGATTGAATTTTGAGCTTTCGTATGGATTGAACGGAACCACATGTTGTGGTGCGTGTTTTCCCCATGACTCGGTGTTTTGGTACTTTAAGCTCTTTGTCTGAGTATGGATTAGAGAAAGATAGGAGGGTGTTGCATTTGGGTATTCCATGTTTTGCTTGTGTGGTTTTAAGGATGAATACAATGATGTGCATCACATTATTTTTTAATCTAGATTATGTAAATAACACTTGTGGACTAATGATTTTCCCCCCTTGCTATTGGATTGGTTGTTTGGGTTTATAGCCAAACGGGGAATTGTTAGGGGTTTCTTAGAGGGTGTGTTGAATTAAAATTCCTTCTTTAGTTTATGGTTCAACTTAGCAATTGAAGACTGAAAAAAAAAATTGTAAGAACTGTGATAATGTGAGGACTAATTGTTGAAGGTTACTGATTTTCTATGTAATTAGTATAGTTATGTGTTTACATTGTATTATCTGAAAGAAATTATCAATAATTTCTTCATTTCTGCAGGAGAGTACCACTAGTCTGATGATGCCGTAAAGTCCGATTATTAAGATTTTTACTTTTCATTGGAGGAATCAATTTATTTATGACTTCTGGGCTGTGTGTGGTTTTGAGATTACAATTGAAACATGAATTTATCGCTGAAAGATAGTAATTGAAGAAGTGATTCTTTTTGGGAAATTCGGAAGAACCCTGCCCGAAAAATAAAAATGGGGTTGCCACAGGTGGCTTCGGCTGCGCTCTGAGGAAGTGGCAGCGTCACTAGGCACATTCATGCAAACTGCACCTAGAATGGTCAGCATAGGCAACTATGAGGTGAACTTGTTAGCTAGAGAAGACATAGGTAATTGCATGCACATAGTTGTGCTTAAATCTGAAAAAAAAATATTCTAGAGCTTTCAAAAGAATCGCATATTTCAAGTATGTGTAGAGATAGTAAGTTGAAAATTAACCCCATGGAACAAATTAGCAAGTTGTCTGTCAATTCAGAGAAAACTAGGCAGACACCTGTTTCTAGGACTGTAGGTTTTCAAATTAGAACATCAACTGTGGCGTGTTAATGGTTTCGGAGGAAATGGATATTCATCAACCGTCTTTAATGTCATCAGTGATGCAACTGAAGCTTCTGAGTCACAAGTTAGAAAACAGTTATTGTCACCTTTGAATGGGATGCTGCTTGCGGATCATTTTAAAGGTGATCCACTAGACATTGGTGCTGGTATTTATCAAAGTCGTTCAAAGGCTGGTGATCATAATTCTAATGCTTTACATGAGTATAAGAAGGATCATATTGGAAACAACAATAAGATTCATTCAATGATCTGGACTACATCTTGTTTTCAGGAATTTACAAATTCATCCTGTAATGACAATACTATAAACCATATTGTATCTAGTCATCACCAACGTGCAGAGCCATGGTCTATTAAGCATTTTAAATCATCTCCAGTACGTAATGCTTCTGAAGAAACAACTAAAACAAGGTCCCAAACAGCTGCATTGTCTATACCACAAAAAAATGTGTCATCACCTACCTTCCCTTTGTCTCCTCTGGGTAAAAAATCTTCTAAAAATGAAAATTTGGGAGAATGCAGAAATATTGATGTTATCTTGGACAATGACAATTTTACTTTTAATAGTGTGGAACAGTCACTTGATAGAACTTGTCAAGGCATTTCATCAGCACAGGAGATACCAAGTACATCACAGCTCAATTTGAACAATATGCAGCAAAAGTCTGACCTGTTTACTCCTGACAACATGATTAATATGAAAGAGTATTGGACTCATTCTGGTAGCTTTCCTCCTTGGGATGCCAAGTTACGTGGAACTATGAGTAGACTGCCAATTAGAAGGTCCTTGGTTGGTTCATTTGAAGAATCTTTGTTATCTGGTCGCTTACTATCTGGGAAAGTTAGTCAGGTTGGAATTATTCTCATATACAGGCATCCTACATTATGCACTAGTTTCCTGATGACCTTTCTGTTATTTTACTCGTGTAATTGTCGTGGCTTCTATTTGCAGAAAATTGAAGGCTTTCTTGCATTCCTGAATGTAACTGGCGGCAATTTCTCACCTCAATCACAGAAAATACCATTTGCAGTAACCAGCGTGGATGGAGACAAGTATTTACTTTATTATTCATCAATTAATCTTTCAGGAAAGCTATTATCAGGCAAGTCTAGAGTTGCTAAATTTCAGAGAACCCTTAGCATGGATGAATCTCGATCTGAAAAGCCCCATATACGTGTACCTATGAAAGGACGTATTCAACTGGTTCTCACCAATCCAGAGAGGACACCTATCCATACCTTCTTTTGCAATTATGATTTGAGTGACATGCCAGCTGGTACCAAGACGATCTTGCGGCAAAAGGTCACTTTAACTGCGTCTAGATCAATGTCTATGACGGGTAACGAAAGCCAAGCAGATTCTGACATCAAAGCTGATGCCAAGTCGTCGTTGATCTCAGTCACACGCCACCGAGATAAAGATCTTCTCACCACAAAATGTGGAGAGTTTGATAGTCTGACATGTTCAAAGGCTGGCATTTTGCTTTATGCTCTTCACCTTCGCTTCATGTGCCCCTTTCCTAAGAGACGTTCAAGGTCTGTTCATAAGTGCAAATCTGGCCCTGTCTCTGCTGAAGTGAGAAATATTGTGGACGTTGAACATGAAAGAAGCTTCTACTTGTATGATGATATGAGGGTAGTGTTTCCTCAACGTCATTCAGATTCTGATGAGGGAAAGTTACATGTGGAATATCATTACCCTTCAAATCCAAAATATTTCGACATCAGCTGCTGAATGCCGCCGTCTCCCAGTGATTTTTGTATATATAGTTGTAAATGTTGTACGTATACAATTCATTTCCTTCAATTTTGCCATGTAACTAATAATTTGTAAAATTGGATTGTAGATGTTCATATTTGATTCATAGTACTTGCTTTGACCCTTAACGAGGGTGCTTATGCTCTCCTACTACTGTCCATCAAATTTTTTAATTTTTAAATAATTTTCAAATCCGTATGTTCTCATACGGATCATCAA
>Glyma06g17451.3 sequence type=transcript gene model=Glyma06g17451 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
TAAAAATATAAAGAGATGCTCTTGCATTTGTTGACATGGTTTGACACATGTCACGGGCAGAGAAAGAAAGAAAAGAGAACCGCAACTTGACTTCAATACCCGACTTGTTTGTGGTTTCCCTTTTGCTGCAAGTTGTGGCTTTCAAAAGTACAGCCAGAAAAATTCTGGCTAAGCCATGCATGCCCCACAAATTGAATCCATATCGTATAGTCGTCCACCAATGCTTACCCCCCCAAACCCGTGTTTTATGTGATACACGGTAGTTTTGAGCAACAACAACCACAAGGAATTTCTTGGACATATGAGGCCTTTTAACGTTGTGGGGTTTGCAAAAGTTTTTTCCTTTGATTGGTATTGTTGGTGAATTGTGGTAAAAAGATTGAATTTTGAGCTTTCGTATGGATTGAACGGAACCACATGTTGTGGAGAGTACCACTAGTCTGATGATGCCGTAAAGTCCGATTATTAAGATTTTTACTTTTCATTGGAGGAATCAATTTATTTATGACTTCTGGGCTGTGTGTGGTTTTGAGATTACAATTGAAACATGAATTTATCGCTGAAAGATAGTAATTGAAGAAGTGATTCTTTTTGGGAAATTCGGAAGAACCCTGCCCGAAAAATAAAAATGGGGTTGCCACAGGTGGCTTCGGCTGCGCTCTGAGGAAGTGGCAGCGTCACTAGGCACATTCATGCAAACTGCACCTAGAATGGTCAGCATAGGCAACTATGAGGTGAACTTGTTAGCTAGAGAAGACATAGGTAATTGCATGCACATAGTTGTGCTTAAATCTGAAAAAAAAATATTCTAGAGCTTTCAAAAGAATCGCATATTTCAAGTATGTGTAGAGATAGTAAGTTGAAAATTAACCCCATGGAACAAATTAGCAAGTTGTCTGTCAATTCAGAGAAAACTAGGCAGACACCTGTTTCTAGGACTGTAGGTTTTCAAATTAGAACATCAACTGTGGCGTGTTAATGGTTTCGGAGGAAATGGATATTCATCAACCGTCTTTAATGTCATCAGTGATGCAACTGAAGCTTCTGAGTCACAAGTTAGAAAACAGTTATTGTCACCTTTGAATGGGATGCTGCTTGCGGATCATTTTAAAGGTGATCCACTAGACATTGGTGCTGGTATTTATCAAAGTCGTTCAAAGGCTGGTGATCATAATTCTAATGCTTTACATGAGTATAAGAAGGATCATATTGGAAACAACAATAAGATTCATTCAATGATCTGGACTACATCTTGTTTTCAGGAATTTACAAATTCATCCTGTAATGACAATACTATAAACCATATTGTATCTAGTCATCACCAACGTGCAGAGCCATGGTCTATTAAGCATTTTAAATCATCTCCAGTACGTAATGCTTCTGAAGAAACAACTAAAACAAGGTCCCAAACAGCTGCATTGTCTATACCACAAAAAAATGTGTCATCACCTACCTTCCCTTTGTCTCCTCTGGGTAAAAAATCTTCTAAAAATGAAAATTTGGGAGAATGCAGAAATATTGATGTTATCTTGGACAATGACAATTTTACTTTTAATAGTGTGGAACAGTCACTTGATAGAACTTGTCAAGGCATTTCATCAGCACAGGAGATACCAAGTACATCACAGCTCAATTTGAACAATATGCAGCAAAAGTCTGACCTGTTTACTCCTGACAACATGATTAATATGAAAGAGTATTGGACTCATTCTGGTAGCTTTCCTCCTTGGGATGCCAAGTTACGTGGAACTATGAGTAGACTGCCAATTAGAAGGTCCTTGGTTGGTTCATTTGAAGAATCTTTGTTATCTGGTCGCTTACTATCTGGGAAAGTTAGTCAGGTTGGAATTATTCTCATATACAGGCATCCTACATTATGCACTAGTTTCCTGATGACCTTTCTGTTATTTTACTCGTGTAATTGTCGTGGCTTCTATTTGCAGAAAATTGAAGGCTTTCTTGCATTCCTGAATGTAACTGGCGGCAATTTCTCACCTCAATCACAGAAAATACCATTTGCAGTAACCAGCGTGGATGGAGACAAGTATTTACTTTATTATTCATCAATTAATCTTTCAGGAAAGCTATTATCAGGCAAGTCTAGAGTTGCTAAATTTCAGAGAACCCTTAGCATGGATGAATCTCGATCTGAAAAGCCCCATATACGTGTACCTATGAAAGGACGTATTCAACTGGTTCTCACCAATCCAGAGAGGACACCTATCCATACCTTCTTTTGCAATTATGATTTGAGTGACATGCCAGCTGGTACCAAGACGATCTTGCGGCAAAAGGTCACTTTAACTGCGTCTAGATCAATGTCTATGACGGGTAACGAAAGCCAAGCAGATTCTGACATCAAAGCTGATGCCAAGTCGTCGTTGATCTCAGTCACACGCCACCGAGATAAAGATCTTCTCACCACAAAATGTGGAGAGTTTGATAGTCTGACATGTTCAAAGGCTGGCATTTTGCTTTATGCTCTTCACCTTCGCTTCATGTGCCCCTTTCCTAAGAGACGTTCAAGGTCTGTTCATAAGTGCAAATCTGGCCCTGTCTCTGCTGAAGTGAGAAATATTGTGGACGTTGAACATGAAAGAAGCTTCTACTTGTATGATGATATGAGGGTAGTGTTTCCTCAACGTCATTCAGATTCTGATGAGGGAAAGTTACATGTGGAATATCATTACCCTTCAAATCCAAAATATTTCGACATCAGCTGCTGAATGCCGCCGTCTCCCAGTGATTTTTGTATATATAGTTGTAAATGTTGTACGTATACAATTCATTTCCTTCAATTTTGCCATGTAACTAATAATTTGTAAAATTGGATTGTAGATGTTCATATTTGATTCATAGTACTTGCTTTGACCCTTAACGAGGGTGCTTATGCTCTCCTACTACTGTCCATCAAATTTTTTAATTTTTAAATAATTTTCAAATCCGTATGTTCTCATACGGATCATCAA
>Glyma06g17451.4 sequence type=transcript gene model=Glyma06g17451 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
CTTGACTTCAATACCCGACTTGTTTGTGGTTTCCCTTTTGCTGCAAGTTGTGGCTTTCAAAAGTACAGCCAGAAAAATTCTGGCTAAGCCATGCATGCCCCACAAATTGAATCCATATCGTATAGTCGTCCACCAATGCTTACCCCCCCAAACCCGTGTTTTATGTGATACACGGTAGTTTTGAGCAACAACAACCACAAGGAATTTCTTGGACATATGAGGCCTTTTAACGTTGTGGGGTTTGCAAAAGTTTTTTCCTTTGATTGGTATTGTTGGTGAATTGTGGTAAAAAGATTGAATTTTGAGCTTTCGTATGGATTGAACGGAACCACATGTTGTGGTGCGTGTTTTCCCCATGACTCGGTGTTTTGGTACTTTAAGCTCTTTGTCTGAGTATGGATTAGAGAAAGATAGGAGGGTGTTGCATTTGGGTATTCCATGTTTTGCTTGTGTGGTTTTAAGGATGAATACAATGATGTGCATCACATTATTTTTTAATCTAGATTATGTAAATAACACTTGTGGACTAATGATTTTCCCCCCTTGCTATTGGATTGGTTGTTTGGGTTTATAGCCAAACGGGGAATTGTTAGGGGTTTCTTAGAGGGTGTGTTGAATTAAAATTCCTTCTTTAGTTTATGGTTCAACTTAGCAATTGAAGACTGAAAAAAAAAATTGTAAGAACTGTGATAATGTGAGGACTAATTGTTGAAGGTTACTGATTTTCTATGTAATTAGTATAGTTATGTGTTTACATTGTATTATCTGAAAGAAATTATCAATAATTTCTTCATTTCTGCAGGAGAGTACCACTAGTCTGATGATGCCGTAAAGTCCGATTATTAAGATTTTTACTTTTCATTGGAGGAATCAATTTATTTATGACTTCTGGGCTGTGTGTGGTTTTGAGATTACAATTGAAACATGAATTTATCGCTGAAAGATAGTAATTGAAGAAGTGATTCTTTTTGGGAAATTCGGAAGAACCCTGCCCGAAAAATAAAAATGGGGTTGCCACAGGTGGCTTCGGCTGCGCTCTGAGGAAGTGGCAGCGTCACTAGGCACATTCATGCAAACTGCACCTAGAATGGTCAGCATAGGCAACTATGAGGTGAACTTGTTAGCTAGAGAAGACATAGGTAATTGCATGCACATAGTTGTGCTTAAATCTGAAAAAAAAATATTCTAGAGCTTTCAAAAGAATCGCATATTTCAAGTATGTGTAGAGATAGTAAGTTGAAAATTAACCCCATGGAACAAATTAGCAAGTTGTCTGTCAATTCAGAGAAAACTAGGCAGACACCTGTTTCTAGGACTGTAGGTTTTCAAATTAGAACATCAACTGTGGCGTGTTAATGGTTTCGGAGGAAATGGATATTCATCAACCGTCTTTAATGTCATCAGTGATGCAACTGAAGCTTCTGAGTCACAAGTTAGAAAACAGTTATTGTCACCTTTGAATGGGATGCTGCTTGCGGATCATTTTAAAGGTGATCCACTAGACATTGGTGCTGGTATTTATCAAAGTCGTTCAAAGGCTGGTGATCATAATTCTAATGCTTTACATGAGTATAAGAAGGATCATATTGGAAACAACAATAAGATTCATTCAATGATCTGGACTACATCTTGTTTTCAGGAATTTACAAATTCATCCTGTAATGACAATACTATAAACCATATTGTATCTAGTCATCACCAACGTGCAGAGCCATGGTCTATTAAGCATTTTAAATCATCTCCAGTACGTAATGCTTCTGAAGAAACAACTAAAACAAGGTCCCAAACAGCTGCATTGTCTATACCACAAAAAAATGTGTCATCACCTACCTTCCCTTTGTCTCCTCTGGGTAAAAAATCTTCTAAAAATGAAAATTTGGGAGAATGCAGAAATATTGATGTTATCTTGGACAATGACAATTTTACTTTTAATAGTGTGGAACAGTCACTTGATAGAACTTGTCAAGGCATTTCATCAGCACAGGAGATACCAAGTACATCACAGCTCAATTTGAACAATATGCAGCAAAAGTCTGACCTGTTTACTCCTGACAACATGATTAATATGAAAGAGTATTGGACTCATTCTGGTAGCTTTCCTCCTTGGGATGCCAAGTTACGTGGAACTATGAGTAGACTGCCAATTAGAAGGTCCTTGGTTGGTTCATTTGAAGAATCTTTGTTATCTGGTCGCTTACTATCTGGGAAAGTTAGTCAGGTTGGAATTATTCTCATATACAGGCATCCTACATTATGCACTAGTTTCCTGATGACCTTTCTGTTATTTTACTCGTGTAATTGTCGTGGCTTCTATTTGCAGAAAATTGAAGGCTTTCTTGCATTCCTGAATGTAACTGGCGGCAATTTCTCACCTCAATCACAGAAAATACCATTTGCAGTAACCAGCGTGGATGGAGACAAGTATTTACTTTATTATTCATCAATTAATCTTTCAGGAAAGCTATTATCAGGCAAGTCTAGAGTTGCTAAATTTCAGAGAACCCTTAGCATGGATGAATCTCGATCTGAAAAGCCCCATATACGTGTACCTATGAAAGGACGTATTCAACTGGTTCTCACCAATCCAGAGAGGACACCTATCCATACCTTCTTTTGCAATTATGATTTGAGTGACATGCCAGCTGGTACCAAGACGATCTTGCGGCAAAAGGTCACTTTAACTGCGTCTAGATCAATGTCTATGACGGGTAACGAAAGCCAAGCAGATTCTGACATCAAAGCTGATGCCAAGTCGTCGTTGATCTCAGTCACACGCCACCGAGATAAAGATCTTCTCACCACAAAATGTGGAGAGTTTGATAGTCTGACATGTTCAAAGGCTGGCATTTTGCTTTATGCTCTTCACCTTCGCTTCATGTGCCCCTTTCCTAAGAGACGTTCAAGGTCTGTTCATAAGTGCAAATCTGGCCCTGTCTCTGCTGAAGTGAGAAATATTGTGGACGTTGAACATGAAAGAAGCTTCTACTTGTATGATGATATGAGGGTAGTGTTTCCTCAACGTCATTCAGATTCTGATGAGGGAAAGGACTACGCAAAGCACTGATAGTGTGGTATCTTCAGTAATGAATGTTCATTTAAACAGTCTTGAGCTAAATGATGTTAATCTTCTTGAGGAACATTGCACTTTTATGTTAATATGATTTCAAATCTCGTTCTTGAAGCATCAGTTATGGAATAAAAAATTGTCACTTTCTGGTTCC
>Glyma06g17451.5 sequence type=transcript gene model=Glyma06g17451 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
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>Glyma06g17451.6 sequence type=transcript gene model=Glyma06g17451 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
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Predicted protein sequences of Glyma06g17451
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