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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT5G25770 | AT | Annotation by Michelle Graham. TAIR10: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | chr5:8969308-8971389 REVERSE LENGTH=360 | SoyBase | E_val: 1.00E-165 | ISS |
GO:0008150 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: biological process | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0010260 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: organ senescence | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0046482 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: para-aminobenzoic acid metabolic process | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0009507 | GO-cc | Annotation by Michelle Graham. GO Cellular Compartment: chloroplast | SoyBase | N/A | ISS |
PTHR17630 | Panther | DIENELACTONE HYDROLASE | JGI | ISS | |
PTHR17630:SF20 | Panther | CARBOXYMETHYLENEBUTENOLIDASE | JGI | ISS | |
PF00326 | PFAM | Prolyl oligopeptidase family | JGI | ISS | |
PF01738 | PFAM | Dienelactone hydrolase family | JGI | ISS | |
UniRef100_B9RS30 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Most informative UniRef hit: Catalytic, putative n=1 Tax=Ricinus communis RepID=B9RS30_RICCO | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
UniRef100_UPI000233A30D | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Best UniRef hit: UPI000233A30D related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI000233A30D | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
Glyma06g08750 not represented in the dataset |
Glyma06g08750 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma.06g083200 | Wm82.a2.v1 | IGC | As supplied by JGI |
Schmutz et al. 2010 Genome sequence of the palaeopolyploid soybean Nature 2010, 463:178-183 |
>Glyma06g08750.3 sequence type=transcript gene model=Glyma06g08750 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma06g08750.5 sequence type=transcript gene model=Glyma06g08750 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma06g08750.6 sequence type=transcript gene model=Glyma06g08750 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||