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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
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AT4G18230 | AT | Annotation by Michelle Graham. TAIR10: FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like (InterPro:IPR013969); Has 640 Blast hits to 640 proteins in 277 species: Archae - 4; Bacteria - 281; Metazoa - 94; Fungi - 127; Plants - 57; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 77 (source: NCBI BLink). | chr4:10080521-10081710 REVERSE LENGTH | SoyBase | E_val: 2.00E-98 | ISS |
GO:0008150 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: biological process | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0005739 | GO-cc | Annotation by Michelle Graham. GO Cellular Compartment: mitochondrion | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0003674 | GO-mf | Annotation by Michelle Graham. GO Molecular Function: molecular function | SoyBase | N/A | ISS |
KOG3339 | KOG | Predicted glycosyltransferase | JGI | ISS | |
PTHR12154 | Panther | GLYCOSYL TRANSFERASE-RELATED | JGI | ISS | |
PF08660 | PFAM | Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like | JGI | ISS | |
UniRef100_G5DXJ6 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Most informative UniRef hit: Beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (Fragment) n=1 Tax=Silene latifolia RepID=G5DXJ6_SILLA | SoyBase | E_val: 1.00E-98 | ISS |
UniRef100_I1K7U8 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Best UniRef hit: Uncharacterized protein n=1 Tax=Glycine max RepID=I1K7U8_SOYBN | SoyBase | E_val: 8.00E-169 | ISS |
Glyma06g03790 not represented in the dataset |
Glyma06g03790 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma.06g034800 | Wm82.a2.v1 | IGC | As supplied by JGI |
Schmutz et al. 2010 Genome sequence of the palaeopolyploid soybean Nature 2010, 463:178-183 |
>Glyma06g03790.3 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03790 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma06g03790.7 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03790 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high TTTATTTTCAATTTACAATAATTTTTTAAAATTTCAAAACAAAAATAAACTGAAACCCGACTCTGCGACTTCACTCCCTCGTGTCAAACAAGTTTTTAATTTTTAATTTTAAAAAATAAAATTTGTTTTTGACAAGAGTAATTAAAATTTAAAAAGGTCCTAATTTTGCTAACCTTACGTTACAACACGAACCCCAAATTCCGGCGTAAGTATCAAACCCTAAGTCGTCAATTTGATTATCAAATAAGAATTGTCAGACATGATCTTTTAAGTCTATGATTATTCTCGTCAGATTGCATTTCTTCTTGTTCAATTACTTATTTAATTGCGCCTCTTCTTGTTGGGAATTCTCATTTGTTTGATTACTCCTTCGATTCTCCTGCTCAAGCTGCTTCAATGGTTGCTGACAAAAAAAAAAAAGCTGCTCCAATGGTTCTCCCTCGTCCTTGCTTCTTAGTTCTTAGTTCTTATAGAATATGATGTGTACCTCTGACTGAAATCTTGAAGCTACCTCTGATGGACAAAAGCAATGGCTGCCGCTTCTCTAGTGTGACTTCAATTGCTGTCTTCTCAAGTGCCATTTTTGTTGTAACTTTGATTTTGGTTCGTCTCCTTTATGTCATGTATTGTAGCAGCAGATCCTTGAGCAAAAGGGTTTTAAAACCTGCCAGTACCCTTATTATTTTAGGATCAGGTGGTCATACTGCTGAGATGCTTAATCTATTGGCAGTGTTGCAGAAAGATAGGTTCAAGCCAAGATTCTACATTGCTGCTGCTACTGATAATATGAGTCTTCAAAAAGCTCAGTTGTTGGAGAATTCCTTGGCTGCTGAGAATGCAGCAAGGGTAACTGATACTGCACAGTTCATGAAGATATATCGGAGTAGGGAAGTTGGTCAATCATATATAACCTCAATTTGGACTACTTTAATTGCAATGGTGCATGCACTGTGGCTAATGATTAAAATTAGACCTGAAGTGATACTTTGTAATGGACCTGGAACTTGCATTCCCCTATGTTCAATTGCATTCATATTTAAGATACTGGGAATTAGATGGTCATCAATTTTCTATGTTGAGAGTATTGCAAGAGTCAGAAGGCTCTCCTTGAGTGGCCTGCTCCTATACAAGTTGCGGATGGTTGATCAACTATTTGTTCAGTGGCCACAGTTGCAACGACAATATCCCCGTGCTACCTATGTTGGTCGACTCATGTAACCAATTGGTTCCTTTAAATATCATTCAAGAGAAATTTGTATGATGAAGTCGGTTGGTGACTTACAGTATTGCTTAGGATGATTCAGATAGATTGTTATTAGCAAACGATAATATTTTGGCTGCTATAACACTCCATACGTGCATCAAAAACGTGGAAAATGAGAAATTATACTGCTTCTGCTTGGACGTGAGAAATGGACGTAAGTCACCTTTAACGTGATGCTAAACCAAACATCCACATATTCACTTAGTATGTGTCATAATGGAAAAAAAAAAAGTCATGTGAATTCCGATGGACTCTTTATGAAGTAGTGTGAGGTGGTATATCAAATGAGAAAAAATCAAGTTATTCCACTGGAATAACTCATGATAAAATTACTCCCTTTAATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTACAGGATCTACTCCCTTTAATAAGTCTTTGTACAAATTAATTTTTATTAATCTAATTATTGAACAATTTGTTTAATTTAACGATCATATACATGAAATTTTAGATAAATGATATATT >Glyma06g03790.8 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03790 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma06g03790.9 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03790 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma06g03790.10 sequence type=CDS gene model=Glyma06g03790 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high ATGGACAAAAGCAATGGCTGCCGCTTCTCTAGTGTGACTTCAATTGCTGTCTTCTCAAGTGCCATTTTTGTTGTAACTTTGATTTTGGTTCGTCTCCTTTATGTCATGTATTGTAGCAGCAGATCCTTGAGCAAAAGGGTTTTAAAACCTGCCAGTACCCTTATTATTTTAGGATCAGTGTTGCAGAAAGATAGGTTCAAGCCAAGATTCTACATTGCTGCTGCTACTGATAATATGAGTCTTCAAAAAGCTCAGTTGTTGGAGAATTCCTTGGCTGCTGAGAATGCAGCAAGGGTAACTGATACTGCACAGTTCATGAAGATATATCGGAGTAGGGAAGTTGGTCAATCATATATAACCTCAATTTGGACTACTTTAATTGCAATGGTGCATGCACTGTGGCTAATGATTAAAATTAGACCTGAAGTGATACTTTGTAATGGACCTGGAACTTGCATTCCCCTATGTTCAATTGCATTCATATTTAAGATACTGGGAATTAGATGGTCATCAATTTTCTATGTTGAGAGTATTGCAAGAGTCAGAAGGCTCTCCTTGAGTGGCCTGCTCCTATACAAGTTGCGGATGGTTGATCAACTATTTGTTCAGTGGCCACAGTTGCAACGACAATATCCCCGTGCTACCTATGTTGGTCGACTCATGTAA >Glyma06g03790.3 sequence type=CDS gene model=Glyma06g03790 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||