Report for Sequence Feature Glyma06g03310
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm06
Start: 2336471
stop: 2342924
Source: JGI
Version: Wm82.a1.v1.1
High confidence: yes
A newer version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma06g03310
Database ID Annotation Type Annotation Description Annotation Source Match Score Evidence Code
AT1G22100 AT
Annotation by Michelle Graham. TAIR10: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase family protein | chr1:7798023-7800030 REVERSE LENGTH=441
SoyBase E_val: 0 ISS
GO:0005634 GO-cc
Annotation by Michelle Graham. GO Cellular Compartment: nucleus
SoyBase N/A ISS
GO:0005524 GO-mf
Annotation by Michelle Graham. GO Molecular Function: ATP binding
SoyBase N/A ISS
GO:0035299 GO-mf
Annotation by Michelle Graham. GO Molecular Function: inositol pentakisphosphate 2-kinase activity
SoyBase N/A ISS
KOG4749
KOG
Inositol polyphosphate kinase
JGI ISS
PTHR14456 Panther
INOSITOL POLYPHOSPHATE KINASE 1
JGI ISS
PTHR14456:SF6 Panther
gb def: Hypothetical protein MJB21.19
JGI ISS
PF06090 PFAM
Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
JGI ISS
UniRef100_A7X641 UniRef
Annotation by Michelle Graham. Most informative UniRef hit: Inositol pentakisphosphate 2-kinase n=1 Tax=Glycine max RepID=A7X641_SOYBN
SoyBase E_val: 0 ISS
UniRef100_I1K7Q2 UniRef
Annotation by Michelle Graham. Best UniRef hit: Uncharacterized protein n=1 Tax=Glycine max RepID=I1K7Q2_SOYBN
SoyBase E_val: 0 ISS
Expression Patterns of Glyma06g03310
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Paralogs of Glyma06g03310
Paralog Evidence Comments
Glyma04g03240 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.3.
Gene model name correspondences to Glyma06g03310 Gene Call Version Wm82.a1.v1.1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma.06g030100 Wm82.a2.v1 IGC As supplied by JGI
References for Glyma06g03310
Transcripts of Glyma06g03310
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma06g03310.11 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03310 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
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>Glyma06g03310.12 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03310 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
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>Glyma06g03310.2 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03310 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
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>Glyma06g03310.3 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03310 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
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>Glyma06g03310.4 sequence type=transcript gene model=Glyma06g03310 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high
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Coding sequences of Glyma06g03310
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Predicted protein sequences of Glyma06g03310
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
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