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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT2G23093 | AT | Annotation by Michelle Graham. TAIR10: Major facilitator superfamily protein | chr2:9832193-9834416 FORWARD LENGTH=449 | SoyBase | E_val: 4.00E-175 | ISS |
GO:0008150 | GO-bp | Annotation by Michelle Graham. GO Biological Process: biological process | SoyBase | N/A | ISS |
GO:0003674 | GO-mf | Annotation by Michelle Graham. GO Molecular Function: molecular function | SoyBase | N/A | ISS |
KOG4332 | KOG | Predicted sugar transporter | JGI | ISS | |
PTHR24003 | Panther | MAJOR FACILITATOR SUPERFAMILY DOMAIN-CONTAINING PR | JGI | ISS | |
PTHR24003:SF253 | Panther | JGI | ISS | ||
PF05631 | PFAM | Protein of unknown function (DUF791) | JGI | ISS | |
UniRef100_G7K3W5 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Most informative UniRef hit: Major facilitator superfamily domain-containing protein n=1 Tax=Medicago truncatula RepID=G7K3W5_MEDTR | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
UniRef100_I1J9C6 | UniRef | Annotation by Michelle Graham. Best UniRef hit: Uncharacterized protein n=1 Tax=Glycine max RepID=I1J9C6_SOYBN | SoyBase | E_val: 0 | ISS |
Glyma01g39910 not represented in the dataset |
Glyma01g39910 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma.01g191800 | Wm82.a2.v1 | IGC | As supplied by JGI |
Schmutz et al. 2010 Genome sequence of the palaeopolyploid soybean Nature 2010, 463:178-183 |
>Glyma01g39910.3 sequence type=transcript gene model=Glyma01g39910 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma01g39910.4 sequence type=transcript gene model=Glyma01g39910 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma01g39910.5 sequence type=transcript gene model=Glyma01g39910 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma01g39910.6 sequence type=transcript gene model=Glyma01g39910 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma01g39910.7 sequence type=transcript gene model=Glyma01g39910 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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>Glyma01g39910.8 sequence type=transcript gene model=Glyma01g39910 sequence assembly version=Glyma 1.0 annotation version=1.1 JGI Gene Call confidence=high 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||