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A previous version of this gene model can be found here:
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT5G27970.1 | AT | ARM repeat superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
| GO:0005488 | GO-mf | binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| KOG1848 | KOG | Uncharacterized conserved protein | JGI | N/A | IEA |
| PTHR10663 | Panther | GUANYL-NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR | JGI | N/A | IEA |
| PTHR10663:SF55 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
| PF09324 | PFAM | Domain of unknown function (DUF1981) | JGI | N/A | IEA |
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Glyma.20g229100 not represented in the dataset |
Glyma.20g229100 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Paralog | Evidence | Comments |
|---|---|---|
| Glyma.10g159500 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma20g37298 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.20g229100.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.20g229100 ID=Glyma.20g229100.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 TGCAAAATTGTGATCGGGTAACGGGATTAGCCAAACCCGACCCGACCCGTAAATATCCCTAGACTGGACCAGAAATACAAGAAAAAATAGATTTATTGCAGAAACTGCCCAATTTAAGCGGATACCATGTCTCAAGCTCTTGGCATCTGTCTCAGGCTTCTTGAAAACACTCGATCTTCTGATAGTGTGCGGAATACTGCAGCAGCTACCTTCAGGCAAGCAGTGGCCTTGATTTTTGATCGTGTAGTTTTTGCTGAGTCTCTTCCTGCTGGCAAATTTGTTTTTGGAGGTCAGCTTTCTCGGACAAATTCAGTTACTGGTGATGTTAACCGTGGCATCAATTTGTCTGACTCATTAGGTCATGAGTCCATTTCTGGAAGGCCCCCTGTGATGAGGGAGACTTTAACTGAAACTGGAAAACTTGGACTTCGCTTGCTTGAAGACCTGACATCCCTTGCCGCAGGTGGATCTGCAATTTGGTTATGTGTGAATATTCTTCAGAGGACATTTGCACTTGATATTCTTGAGTTCATTTTGTCCAATTATGTGGCTGTCTTCAGAACATTGTTACCCTATGAACAGGCTTTACGACGGCAAATTTGTTCACTTCTTATGACTTCACTTCGTACCAATGCTGAGCTTGAAGGAGAAACTGGTGAACCTAGCTTTCGTCGTTTGGTCTTGCGTTCAGTTGCTCATATTATAAGACTTTACAGTTCTTCCCTTATAACTGAATGTGAGGTTTTTCTCAGTATGCTACTCAAGGTTACTTTTCTTGATTTGCCATTATGGCATCGCATTCTTGTTCTTGAGATTTTGAGGGGGTTTTGTGTTGAGGCACGCACATTGCGGATTCTTTTTCAAAATTTTGATATGCACCCCAAGAATACAAATGTTGTGGAGGGAATGGTCAAAGCTCTTGCTAGAGTTGTTTCAAATGTACAGGCTCAAGAATCAAGTGAGGAGAGCCTGGCAGCTGTTGCTGGAATGTTTAGTAGCAAAGCCAAAGGTATTGAATGGAGTCTAGATAATGATGCATCCAATGCTGCAGTTTTGGTTGCCAGTGAAGCACATGCTATAACATTGGCAGTTGAAGGCCTGTTAGGGGTTGTCTTCACTGTTGCAACTTTAACAGATGAAGCCATAGATGTTGGAGAGCTTGAGTCCCCTAGATGTGATAATGACCCACCTGTGAAATGGAGTGGTAAAACTGCAGTTCTCTGCATCTCAATGGTTGACTCACTGTGGTTGACAATACTTGATGCATTATCCCTTATTCTATCAAGGTCACAAGGAGAGGCCATTGTGTTGGAAATATTAAAGGGATACCAGGCATTTACTCAGGCTTGTGGGATTCTCCGAGCCGTAGAACCTTTAAATTCCTTTCTTGCATCCCTTTGTAAATTTACTATCAATTTTCCTGTTGAAACAGAAAAAAGGAGTGCTTTGCCATCTCCTGTATCAAAACGGTCAGAACTATCAGTTGACCAGAGGGATAGCATTGTGCTTACTCCCAAGAATGTTCAGGCATTGAGAACCCTTTTCAACATCGCTCATCGATTGCATAATGTTCTAGGCCCATCCTGGGTTCTGGTGTTGGAAACTCTGGCAGCTTTAGATCGAGCAATTCATTCTCCACATGCCACTACCCAGGAGGTCTCCACCCCTGTCCCGAAGTTCACAAGGGAGTTATCTACCCAATCCAGTGACTTCAATATACTCTCTTCTTTGAACTCTCAGCTCTTTGAGAGCTCTGCTCTGATGCATATATCTGCTGTAAAGTCTCTCCTCTCTGCATTATGTCAACTTTCACATCAATGCATGACTTCAAGCAGTTTGGGACCAACAACTAGTCAAAAAATTGGAAGCATCAGCTTTTCAGTGGAAAGAATGATATCCATCCTTGTGAATAATGCTCACAGAGTTGAGCCATTTTGGGATCAAGTTATTAGTCACTTTCTTGAGCTAGCTGATAATTCTAATACACATTTGAAAAACATGGCACTTGATGCGCTGGATCAGTGTATATCTGCTGTCTTAGGTTCTGATCGGTTCCAAGACTACAAACTATCCAAGTCTCTTGAATCATCACAGGAAATGGAAGTCAATCTTGATAAGTTGAGGTCTCTTGAATGTTCTGTCATATCTCCACTAAAGGTTCTTTATTTTTCTACTCAAAGTGTAGATGTTCGTGTTGGATCTTTGAAAATTCTTTTGCATGTCTTAGAGAGATATGGAGAGAAACTTCATTACAGCTGGCCTAATATACTTGAAATGTTGAGGTATGTAGCAGATGTTTCAGAGAAGGATCTTGTTACTCTTGGCTTCCAGAACCTAAGAGTGATAATGAACGATGGACTGTCTGCTTTACCTACAGACTGCCTTCAAGTATGTGTTGATGTGACTGGAGCATACAGTGCTCAGAAGACTGAGTTGAACATAAGCTTGACAGCAGTTGGACTTCTGTGGACTATGACTGATTTCATTGCAAAGGGCCTTCTCAATGGACCTTTTGAAGAAAAGGAAGCAGGTGTTGGTTCCACAGTGAAGCAGATAGACAGCAAAAAGATGGAGGATCAAACACGTATTTCTAATAATGTGAGAGACCAGGCTTCTGTAGATGGTGTTGATTTTGAGAAGCTTCTATTCTCTGTATTCTCATTACTTCAAAACCTTGGGGCAGATGAGAGACCAGAGGTGAGGAATTCTGCTGTCAGGACACTGTTCCAAACTTTAGGAACGCATGGGCAAAAGCTTTCAAAGAGCATGTGGGAAGATTGTCTTTGGAATTATGTATTTCCTACATTGGATCGTGCTTCTCATATGGCTGCTACGTCATCAAAAGATGAATGGCAAGGGAAAGAACTTGGAACCCGAGGAGGAAAAGCAGTTCACATGCTCATACATCATAGTCGTAACACGGCTCAGAAGCAGTGGGATGAAACTCTTGTGCTTGTTTTGGGTGGAATTGCACGTATATTACGGTTGTTCTTTCCTTTTTTCACAAGCTTAAGTAACTTCTGGTCTGGCTGGGAATCATTGCTTCAATTTGTTGAGAATAGCATTTTAAATGGAAGTAAAGAGGTAGCACTTGCAGCAATAAATTGTTTGCAGACAACTGTTAACTCTCATTCGTCGAAGGGACATATGCCAATGCCTTACCTTATTTCAGTAATTGATGTTTACGAGCTTGTTCTGAGAAAGCCTTCTAGTTACCGTGGCAATGCTGCTGATAAAGTGATGCAGGAGATTTTGCATGGTCTTGGAGAGCTTTATGTGCAGGCTCAAGGATTATTCAATGATGTTGCATACACGCAGTTGATAGCAATCATAGATTTGGCTGTGAAGCAAGCCATGTTAACTAATGATAACTTTGAAATGGAATTTGGGAATGTCCCACCTGTGCTACGGACTATACTGGAAATCTTACCACTGTTACGTCCAACAGAGCACATATCTTCTATGTGGCCTGTTCTTCTTCGAGAGTTTCTGCAGTATCTTCCTAGACAAGATTCATATTTACAGAATGAGGATGATTCTCAGGTGAACTATGATGCACCTAATGGTGCTACTCCAATATCACCCAACAAAATAGCAGTATCTCCAGGTTCTGGATCAACTGCAGCCATAACAGCCATTCCTAGTTACATATTTGCAGAAAAGCTAGTTCCCGTGCTAGTAGATCTTTTCTTGCGGGCACCTACTGTCGAAAAGTATATTATATACCCTGAAATTATTCAAAGCCTTGGAAGGTGTATGACAACAAGAAGAGACAATCCAGATAGTGCACTTTGGAGGTTAGCTGTTGAAGCTTTCAACCATGTTCTTATTGACTATGTTACCAAATTAATCAATGGAGGTCCAGATTCGACCATTAGCAAACCTGTCAGAACACGAATATGGAAAGAAATTGCAGATGTTTATGAAATATTCCTAGTTGGATATTGTGGACGAGCTCTTCCTTCAAATTCCCTCTCAGCAGTGGTGCTAGAGGCTGATGAGTCCCTTGAGATGTCAATATTAAATATTCTTGGTGACACAATCCTTAAGCTGCCAGTTGACACTCCTTTGGATATTCTGCAGCGACTGGTCTCCACATTGGACCGTTGTGCATCACGCACATGCTCATTACCTGTTGAGACTGTAGAGCTTATGCCTCCTCACTGCAGCAGATTTTCCTTGACTTGTTTACAGAAGTTATTTTCTTTGTGCAGTTATTCTAATGAAGTCAATTGGAATATGACAAGATCTGAAGTCAGCAAAATCTCAATTACAGTGCTCATGACCAGATGTGAATACATCTTGAGCAGGTTTCTGACAGATGAAAATGGCTTAGGTGACTGTCCATTACCAAAAGCAAGACTTGATGAAATTATTTATGTTCTCCAAGAACTGGCACATCTTGTAATTCATCCAGATGCAGCACCCATTCTCCCTTTACACCCATTGTTGAGAACTGGCCTAGCAGAGGAAAAGGAGAAGCATGACAACCGTCCCCATCTGTTTGTGCTATTACCATCCCTTTGTGAACTTGTCACATCAAGAGAATTAAGAATACGGGAGCTGGTGCAAGTACTGCTTCGATTAGTCACCAAGGAATTGTCTCTGGAAAAGCTCAGCTTGGCAAGTGAAAAGAGTACTTCCAGATAAGCCCATTTCATAAGTTGTTCTCTTCGAAATTTTTAAGCTTATGAAATACCAAGCTTTTCTTCTTTTACCCTTGTCTAGGATTGTATTTTTTTTTTTTTTCTGTAGACTACACTAGAACCACCTATAGGAGATTTTCACAGTCTTCTCTTCTCTGTTGCCTGTCATAAATTATGGTCAACCATACTTTCTCAGCTCCATCAGATATTCTAAAGGCGGGAACAGCAAAGAAGAGGAAGAAATCTGTTAAAATGGTCCAAGTAAGAGGATCAATATGCCCCATGCATTGCCAATTTTGTTGTACCAAGTCACTGAAATATTATGAGTCTGACGTTGAGCCCGATTTTTTTAAC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>Glyma.20g229100.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.20g229100 ID=Glyma.20g229100.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.20g229100.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.20g229100 ID=Glyma.20g229100.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.20g229100.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.20g229100.4.p locus=Glyma.20g229100 ID=Glyma.20g229100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.20g229100.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.20g229100.5.p locus=Glyma.20g229100 ID=Glyma.20g229100.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.20g229100.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.20g229100.6.p locus=Glyma.20g229100 ID=Glyma.20g229100.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||