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Report for Sequence Feature Glyma.20g221000

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm20
Start:45528068
stop:45537433
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.20g221000
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G04240.1AT SEC JGI N/AIEA
2.4.1.255EC protein O-GlcNAc transferase JGI N/AIEA
K09667KEGG Chromosome and associated proteins JGI N/AIEA
PTHR23083PantherFam TETRATRICOPEPTIDE REPEAT PROTEIN, TPR JGI N/AIEA
PF13414Pfam TPR repeat JGI N/AIEA
PF13424Pfam Tetratricopeptide repeat JGI N/AIEA
PF13844Pfam Glycosyl transferase family 41 JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.20g221000 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma20g36330 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.20g221000
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>Glyma.20g221000.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.20g221000.2.p locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.20g221000.3.p locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.20g221000.6.p locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.20g221000.7.p locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.7.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.20g221000
>Glyma.20g221000.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g221000.1 locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g221000.2 locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g221000.3 locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g221000.4 locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g221000.5 locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g221000.6 locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g221000.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g221000.7 locus=Glyma.20g221000 id=Glyma.20g221000.7.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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