Report for Sequence Feature Glyma.20g003400
| Feature Type: | gene_model |
| Chromosome: | Gm20 |
| Start: | 307316 |
| stop: | 343185 |
| Source: | JGI |
| Version: | Wm82.a4.v1 |
| High confidence: | yes |
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Annotations for Glyma.20g003400
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
| AT5G23110.1 | AT |
|
JGI | N/A | IEA |
| K17592 | KEGG |
Protein phosphatases and associated proteins |
JGI | N/A | IEA |
| KOG4172 |
KOG |
Predicted E3 ubiquitin ligase |
JGI | N/A | IEA |
| PTHR15600 | PantherFam |
SACSIN |
JGI | N/A | IEA |
| PF13920 | Pfam |
Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) |
JGI | N/A | IEA |
Gene model name correspondences to Glyma.20g003400 Gene Call Version Wm82.a4.v1
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
| Glyma20g00565 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
Coding sequences of Glyma.20g003400
>Glyma.20g003400.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.20g003400.1.p locus=Glyma.20g003400 id=Glyma.20g003400.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCCGTCGTCTCCGGAATCCATCTTTCTGGAAGACTTCGGCCAGACGGTTGATCTGACGCGCCGCATCCGCGAGGTTCTGCTCAACTACCCGGAGGGAACCACCGTCCTGAAGGAGCTCATACAGAACGCCGACGACGCCGGCGCCACCACCGTCTCTCTCTGCCTCGACCGCCGCTCCCACCCTGCCGGCTCCCTGCTCTCCGACTCCCTCGCGCAGTGGCAGGGACCCGCACTGCTTGCCTTCAACGACGCCGTCTTCACCGAGGAGGATTTCGTCAGCATCTCCAAGATTGGCGGGAGCACCAAGCACGGTCAGGCCTCCAAGACCGGTCGCTTCGGGGTTGGCTTCAACTCAGTATACCATTTGACAGATCTTCCCTCTTTTGTGAGTCACAAATATGTTGTACTGTTCGACCCTCAGGGTGTTTATCTTCCAAGAGTTTCTGCTGCAAATCCTGGGAAGCGGATTGATTTTACTGGTTCATCTGCCTTCTCCTTCTACAGGGACCAGTTTTCCCCATATTGTGCTTTTGGTTGTGACATGCAAAGTCCTTTTTCTGGAACTTTATTCCGTTTTCCTTTAAGAAATGCTGACCAGGCAGCCAAAAGTAAGCTCTCAAGGCAAGCATATTCACCAGAAGATATTTCCTCCATGTTTGTTCAGCTCTTCGAAGAAGGGGTTTTGACGCTTCTCTTTCTAAAGAGTGTGCTGTGTATTGAAATGTATTTGTGGGATGCTGGAGAACCTGAACCTAAGAAAATTCATTCATGTTCTGTCAGTTCAGTAACTGATGATACAGTTTGGCATCGACAGTCACTGCTCAGATTGTCTAAGAGTTTAAATACCATTGCTGAAGTGGATGCATTTCCATTGGACTTCTTAATCGAGAGAATAAGTGGAGATGAAGCTGAAAGGCAAACAGAGAGATTTTATGTGGTGCAAACCATGGCCTCAACATCTAGTAGGATTGGTTCTTTTGCTTCTACTGCATCAAAAGAATATGACATTCACTTGCTGCCATGGGCATCAGTTGCGGCATGCATTTCTGATAATTTTCTGAATAATAATATTCTTAGGACTGGTCAGGCATTCTGTTTTCTTCCATTACCTGTTAGAACTGGCCTTAGTGTACAAGTCAATGGATTCTTTGAGGTCTCATCAAATCGTCGTGGCATCTGGTATGGGGATGATATGGACAGAAGTGGAAAAGTTCGTTCTACCTGGAATAGGCTTCTTCTGGAAGATCTTGTAGCTCCTGCTTTTATGCATATGCTACTTGGTATAAAAGAATTGCTAGGGCCAACAGACATTTACTACTCTTTGTGGCCTATTGGTTCATTTGAAGAGCCATGGAATATTTTGGTTCAACAAATATACAAAAACATTGGTAATGCTCCAGTTATGTATTCTAATTACAATGGAGGAAGATGGGTATCACCAAGTGAAGCCTTTCTTCATGATGAAAAATTCACCAAAAGTGAAGACCTTGGTTTGGCTCTGATGCAACTGGGAATGCCAGTTGTGCATTTGCCTAATTCATTGTTTGACATGCTTTTACAATATAGTTCATGCAAGGTGGTTACTTCTGGTACAGTACGTCAATTTCTTAGGGAGTGTGGAATGTTCAATTATTTGAGCAGACAATACAAGCTTCTATTGCTGGAATATTGCCTAGAGGACTTGGTTGATGATGACGTTGGTAAAGAGGCTTATGATCTGCCTTTACTTCCTTTAGCAAATGGCAATTTTGCATCTTTTTCAGAAGCATCAAAAGGAGTCTCTTATTTCATTTGTGATGAATTTGAATATAAGCTGATGCAGCCAGTTTCTGATAGAGTAATTGATCAGAACATTCCTCCCAATATATTGAACAGACTCACTGGTATTGCGATGTCCTCAAAGACCAATGTTATTCTTTGTAGTATTCACCATTTTGCTCAGCTATTCCCTGCATTTATGTCAGCTGACTGGAAATATAGGAGTAAAGTGTTCTGGGACCCTGAATCTTGTCAAAAGCCAACGTCATCATGGTTTCTGCTATTCTGGCAATATCTAGGAAAGCAGACTGAAATATTACCACTATTTAGTGAATGGCCAATTTTACCTTCCACATCTGGGCATCTGTTAAGACCTTCCAGACAATTGAAAATGATCAATGGAAGCAATCTCTCTGATACAGTACAGGATATCCTTGTTAAAGTTGGATGTAATATATTGAGTCCGAAATATGTAGTTGAACATCCGGATATATCTAATTATGTATGTGATGGCAGTGCAGGTGCTGTTCTGGAATCAATATTTAATGCAGTTTCAGGTCCAGTTGTTATGCATGCTTCATTTGATAGTCTAGTAACTGAAGAACGAAATGAGCTCCGGAGATTCCTTCTTGACCCTAAATGGTATGTTGGACGCTCTATGGATGAATTTGTCATAAGGCTTTGCAAGAGATTACCTATATTTCAAGTCTATGGAAGAGACTCTGCTCAAGATTACCAATTCTCTGACTTAGAAAATCCTCGAAAGTACTTACCACCATTAGATGTGCCGGAAATTATTCTGGTGGGCATAGAATTCATGGTCAGATCCTCAACTATAGAAGGCGATATTTTGTCAAGATATTATGGAGTTGAGAGAATGGGAAAAGCACAGTTTTACAAGCAACATGTTTTTAATAGAGTTGGTGATTTGCAAGCTGATGTTCGTGATAGCATAATGTTATCAGTTCTACAAAATTTGCCACTTTTGTCTCTTGAAGACATATCTATCAAGGACTCATTGAGAAATTTGAAATTCATCCCGACGTTCATTGGTGCTCTTAAGTGTCCTTCAGTTTTATATGATCCTAGTAATGAAGAACTATATGCATTACTAGAAGACTCAGATAGTTTCCCTGCTGGTGCTTTTCGAGAATCTGAAATACTTAATATTCTGCGAGGCCTGGGACTCAGAACTTCTGTCTCTCCCAACACTGTTTTAGAATGTGCTCGATGCATAGAGCGTTTGATACACGAGGATCAACAAAAAGCATATTTAAGAGGGAGAGTGCTTTTCTCTTACCTTGAAGTTAATGCATTGAAGTGGCTTCCTGATCAAGTTATTGATAATAAAGGAGCAGTTAACCGAATGTTGTCACGAGCAACAACTGCTTTTAGGTCTTGCAACACAAAATCTGATCTTGAAAAATTCTGGAATGATCTACGGCTGGTTTCCTGGTGCCCAGTTTTAGTCTCTACTCCTTTTCAGTCATTACCATGGCCAGTTGTGTCATCAATGGTTGCTCCTCCAAAACTTGTAAGGCCACTGAATGATTTGTGGCTTGTCTCAGCTAGCATGCGGATACTGGATGGTGAATGCTCTTCAACAGCCTTATTGTATGGCCTGGGATGGATGTCTCCACCAGGAGGAGGTGTAATTGCTGCACAGTTACTGGAGCTTGGAAAAAACAATGAGATTGTGTCTGATCAAGTTCTTAGGCAGGAATTAGCCATGGCAATGCCAAGGATATACTCAATACTGAGTGGAATGATGGCTTCAGATGAGATTGAGATTGTAAAAGCTGTTCTTGAAGGATGTCGATGGATTTGGGTGGGGGATGGATTTGCAACTTCTGATGAGGTTGTCCTTGATGGCCCTCTTCATTTGGCTCCATACATTCGAGTTATCCCAGTTGACTTGGCAGTTTTCAAAAAAATGTTTCTAGAACTTGGTATCCGTGAATTCTTGCAACCTGCTGATTATGCTCATATTCTTTGTAGGATGGCAGTTAGAAAAGGATCATCCCCTCTTGACACACAGGAGATTAGGGTTGTCACGCTAATAGTGCATCATCTAGCTGAAGTTTATCATCATGAACCAGTCCAGCTCTATCTGCCAGATGTGTCTGGTAGATTATTTCTTGCTGGTGACTTGGTTTATAATGATGCCCCTTGGTTGCTTGGCTCAGATGATCCTAATGGCTCATTTGGCAATGCACCAACTGTGGCTTTGAATGCAAAGAGAACAGTTCAAAAATTTGTGCACGGAAACATTTCTAATGATGTAGCAGAAAAGCTGGGAGTCTGTTCTCTTCGCCGGATGATGCTGGCTGAGAGTTCAGATTCAATGAATTTTGGCCTGTCTGGTGCTGCTGAGGCTTTTGGGCAGCACGAGGCTTTGACTACAAGGCTTAAGCATATACTTGAAATGTATGCTGATGGACCTGGTACTCTGTTTGAGATGGTACAAAATGCAGAAGATGCAGGAGCTTCTGAAGTAATGTTTCTTTTGGATAAATCTCACTATGGGACTTCTTCTGTTCTTTCTCCTGAAATGGCTGATTGGCAAGGTCCTGCTCTATACTGTTTCAATGACTCAGTTTTTAGTCCCCAAGATCTTTATGCAATTTCTCGTATTGGTCAAGAAAGTAAACTTGAGAAGGCTTTTGCAATTGGAAGATTTGGACTAGGATTTAATTGTGTCTATCACTTTACAGACATCCCTATGTTTGTTTCTGGAGAAAATGTTGTAATGTTTGACCCTCATGCCAGTAATTTGCCTGGGATTTCTCCTTCACACCCTGGTTTACGAATTAAGTTTGTGGGACAACAGATTTTGGAGCAATTTCCTGACCAATTTTCTCCATTGCTACATTTTGGCTGTGATTTGCAACACCCTTTTCCTGGAACGCTATTCCGATTCCCTCTTAGAACTGCAGGTCTTGCCTCCCGGAGCCAAATTAAAAAGGAAGCCTATACACCTGAAGATGTCAGATCTCTCTTGGCTGCTTTTTCTGAGGTTGTTTCTGAAACATTACTTTTCCTGCGTAATGTGAAATCTATCTCTATTTTTGTGAAGGAAGGAACAGGGCAAGAAATGCGCCTACTGCACCGTGTACATAGAACCTGTATTGGTGAGCCTGAAATTGGATCCACTGAAGCCCAGGACATGTTCAACTTTTTGAAGGAAAGTAGACATGTCGGAATGAATAGAGTTCAGTTTCTGAAGAAACTAAGCCTATC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Predicted protein sequences of Glyma.20g003400
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>Glyma.20g003400.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g003400.2 locus=Glyma.20g003400 id=Glyma.20g003400.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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