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Report for Sequence Feature Glyma.20G090000

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm20
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Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.20G090000
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
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GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
K12120KEGG Circadian rhythm - plant JGI N/AIEA
PTHR24423PantherFam TWO-COMPONENT SENSOR HISTIDINE KINASE JGI N/AIEA
PF00360Pfam Phytochrome region JGI N/AIEA
PF00989Pfam PAS fold JGI N/AIEA
PF01590Pfam GAF domain JGI N/AIEA
PF02518Pfam Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase JGI N/AIEA
PF08446Pfam PAS fold JGI N/AIEA

Proteins Associated with Glyma.20G090000
LocusGene SymbolProtein Name
E4 PHYA2 Phytochrome A gene 2
E4 PHYA2 Phytochrome A gene 2

Gene model name correspondences to Glyma.20G090000 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma.20g090000 Wm82.a4.v1ISS As supplied by JGI
Glyma20g22160 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.20G090000
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Predicted protein sequences of Glyma.20G090000
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>Glyma.20g090000.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g090000.2 locus=Glyma.20g090000 id=Glyma.20g090000.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g090000.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g090000.3 locus=Glyma.20g090000 id=Glyma.20g090000.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g090000.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g090000.5 locus=Glyma.20g090000 id=Glyma.20g090000.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.20g090000.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.20g090000.7 locus=Glyma.20g090000 id=Glyma.20g090000.7.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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