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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.19g012300

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm19
Start:1158790
stop:1166710
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.19g012300
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT3G48050.1AT JGI N/AIEA
GO:0006351GO-bp transcription, DNA-templated JGI N/AIEA
GO:0005634GO-cc nucleus JGI N/AIEA
GO:0003677GO-mf DNA binding JGI N/AIEA
GO:0003682GO-mf chromatin binding JGI N/AIEA
KOG1886 KOG BAH domain proteins JGI N/AIEA
PTHR15141PantherFam TRANSCRIPTION ELONGATION FACTOR B POLYPEPTIDE 3 JGI N/AIEA
PF01426Pfam BAH domain JGI N/AIEA
PF08711Pfam TFIIS helical bundle-like domain JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.19g012300 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma19g01523 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.19g012300
>Glyma.19g012300.11 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.19g012300.11.p locus=Glyma.19g012300 id=Glyma.19g012300.11.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.19g012300.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.19g012300.2.p locus=Glyma.19g012300 id=Glyma.19g012300.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.19g012300.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.19g012300.3.p locus=Glyma.19g012300 id=Glyma.19g012300.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.19g012300.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.19g012300.5.p locus=Glyma.19g012300 id=Glyma.19g012300.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.19g012300.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.19g012300.6.p locus=Glyma.19g012300 id=Glyma.19g012300.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.19g012300
>Glyma.19g012300.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.19g012300.11 locus=Glyma.19g012300 id=Glyma.19g012300.11.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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