SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.18g300200

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm18
Start:58057947
stop:58089497
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.18g300200
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G13000.1AT ATGSL12,gsl12 JGI N/AIEA
2.4.1.34EC 1,3-beta-glucan synthase JGI N/AIEA
GO:0006075GO-bp (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process JGI N/AIEA
GO:0000148GO-cc 1,3-beta-D-glucan synthase complex JGI N/AIEA
GO:0016020GO-cc membrane JGI N/AIEA
GO:0003843GO-mf 1,3-beta-D-glucan synthase activity JGI N/AIEA
K11000KEGG Glycosyltransferases JGI N/AIEA
PTHR12741PantherFam LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 JGI N/AIEA
PF02364Pfam 1,3-beta-glucan synthase component JGI N/AIEA
PF04652Pfam Vta1 like JGI N/AIEA
PF14288Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.18g300200 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma18g53823 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.18g300200
>Glyma.18g300200.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g300200.1.p locus=Glyma.18g300200 id=Glyma.18g300200.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g300200.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g300200.2.p locus=Glyma.18g300200 id=Glyma.18g300200.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGTCGTCGTCCAGAGGAGGCGCTGGGCCGTCCTCGGAGGCTCCGCCGCCGAGGCGGATCATGCGGACTCAGACTGCGGGGAACTTGGGAGAGTCGGTGATTGACAGTGAGGTGGTGCCTTCCTCTCTGGTCGAGATTGCGCCCATTCTTCGTGTCGCTAACGAAGTTGAAAAGACTCATCCCAGGGTTGCTTATCTCTGCCGTTTTTATGCCTTTGAGAAAGCTCATAGGTTGGATCCCAATTCAAGTGGTCGTGGTGTTCGCCAATTCAAAACTGCGCTTCTTCAACGCCTTGAAAGAGAAAACGATCCAACTCTGAAGGGAAGGGTAAAGAAAAGTGATGCTCGCGAGATGCAGAGTTTTTATCAGCATTACTACAAAAAATATATCCAAGCTTTACAAAATGCTGCCGATAAAGCTGACCGTGCACAGCTTACCAAGGCGTATAACACAGCTAATGTTCTTTTTGAGGTTTTGAAGGCTGTTAACATGACACAATCTATGGAAGTTGATCGCGAGATTTTGGAGACCCAAGATAAAGTTGCTGAGAAAACCGAGATCTTAGTCCCTTACAATATTCTTCCTCTTGATCCTGACAGTGCTAACCAGGCTATAATGAGATTTCCTGAGATCCAAGCTGCTGTATATGCTCTTCGTAACACCAGGGGTCTTCCTTGGCCTAAGGACTACAAGAAAAAAAAGGATGAAGACATCCTGGATTGGCTTGGGTCGATGTTTGGATTTCAGAAACACAATGTTGCAAATCAGAGAGAACATTTGATCTTACTGCTTGCTAATGTTCACATAAGACAATTTCCAAAGCCTGATCAGCAACCAAAGTTGGATGAACGTGCTCTGACAGAAGTGATGAAGAAACTGTTCAAGAATTACAAAAAGTGGTGCAAGTATTTGGGTCGGAAAAGTAGCCTTTGGTTACCTACCATTCAGCAAGAAGTACAGCAGCGCAAACTACTATATATGGGTCTGTATCTTCTAATATGGGGTGAAGCTGCCAACCTAAGATTCATGCCAGAATGCCTTTGTTATATATATCACCATATGGCTTTTGAATTGTATGGTATGCTTGCGGGTAATGTCAGTCCGATGACAGGAGAGAATGTGAAGCCAGCGTATGGAGGTGAAGAGGAGGCTTTTTTAAGGAAAGTGGTCACTCCTATCTATAACGTGATTGCTAAGGAAGCTGCACGTAGCAAAAAGGGAAGGTCAAAGCATTCACAATGGAGAAACTATGACGATTTAAATGAATATTTCTGGTCTGCTGATTGTTTTCGAGTAGGTTGGCCAATGCGTGCTGATGCTGATTTCTTTTGCCTCCCAGCCGAAAAGCTGGTTTTTGATAAATCAAATGATGACAAGCCACCTAGCAGAGACAGATGGGTTGGAAAAGTGAATTTTGTTGAGATTAGATCATTTTGGCATATGTTTAGAAGTTTTGATCGAATGTGGAGTTTTTTCATTCTGTGTTTACAGGCTATGATTATTGTTGCTTGGAATGGATCTGGGGATCCCAGTGCAATATTTAATGGTGATGTGTTCAAGAAGGCATTGAGTGTGTTTATAACAGCAGCAATATTGAAGTTTGGGCAAGCTGTTCTAGATGTGATCCTAAGTTGGAAAGCACAACAGAGTATGTCGCTGTATGTTAAGTTAAGATACATTCTAAAAGTTGTTTCAGCTGCAGCATGGGTGATTGTTCTCTCAGTTACTTATGCGTATACTTGGGATAATCCTCCTGGGTTTGCTCAAACCATTAAAAGTTGGTTTGGAAGTGGTGGTTCAAGTTCTCCTTCATTGTTTATTCTGGCTGTTGTTGTTTACCTGTCACCAAATATGCTTGCTGCGATATTCTTTCTGATCCCTTTTATTCGTCGTCATCTCGAAAGGTCGAACTATAGGATTGTAATGCTAATGATGTGGTGGTCACAGCCTCGATTGTATGTTGGTAGGGGAATGCATGAGAGCGCATTTTCCCTTTTCAAATACACAATGTTTTGGATCTTGCTCATAATTACGAAGTTGGCTTTCAGTTACTATATAGAGATAAAACCTCTGGTGGGACCTACGAAAGCTATAATGAGTGTAAAAATCACAATCTTCCAGTGGCATGAATTCTTTCCTCATGCTAGGAACAATATTGGTGTTGTAATTGCACTTTGGGCTCCAATTATTCTGGTATACTTTATGGATACCCAAATTTGGTATGCCATATTCTCAACATTATTTGGTGGTGTTTATGGGGCCTTTCGTCGGCTTGGGGAGATACGGACACTGGGAATGCTAAGGTCTCGTTTTCAATCATTGCCTGGTGCCTTCAATGCCAGTTTGATTCCGGAAGAAACAAATGAGCCAAAGAAAAAAGGATTAAAAGCCACTTTATCCCGCAGATTTCCTGAGATCTCATCTAACAAAGGGAAGGAGGCTGCAAGGTTTGCACAGTTGTGGAACCAAATAATTACTAGTTTCAGGGATGAAGATCTTATTGATGATAGGGAAATGAACCTTTTGCTTGTACCTTATTGGGCTGATACTCAGTTGGACCTTATACAATGGCCCCCCTTTCTTCTTGCTAGCAAGATTCCAATTGCACTGGATATGGCGAAGGACAGCAATGGAAAGGACCGAGAGCTGAAGAAAAGAATTGCGGCTGATAACTACATGTCTTGTGCTGTCCGTGAGTGCTATGCTTCATTTAAGAGCATTATTAAGCACTTGGTTCAAGGGGAACGAGAGATACCGGTTATAGAGTACATGTTCAATGAAGTGGATAAACATATAGAATCAGATAAACTGATTAGTGAATTCAAAATGAGTGCACTTCCTATCCTCTATGGACAGTTTGTTGAGTTAATCCAATATTTGTTGACAAATGATCCGAAAGATAGGGACCGAGTTGTTCTTCTATTCCAGGACATGCTGGAGGTTGTGACAAGAGATATAATGATGGAGGATCAGGATCAAATATTCAGTTTGGTAGATTCAAGCCATGGTGGTACTGGACATGAGGGGATGCTTCACCTTGAGCCTGAGCCACATCACCAACTTTTTGCATCTGAAGGAGCTATCAAGTTTCCAATTGAACCACTTACAGCAGCTTGGACAGAGAAGATTAAACGACTTCACTTGCTGCTTACGACAAAAGAATCTGCCATGGATGTACCATCCAACTTGGAAGCAAGGAGACGTATTTCTTTCTTCTCAAATTCGTTGTTTATGGACATGCCTATGGCACCAAAAGTTCGCAACATGCTTTCATTCTCGGTTTTGACACCATACTATACAGAAGAAGTTCTATTCTCCTTGAATGATTTGGATTCACAGAATGAGGATGGGGTTTCAATACTGTTCTACTTGCAAAAGATTTTTCCAGATGAGTGGAACAATTTTCTTGAACGAGTGAATTCTACTGAGGAGGATATTAAAGGGAGTGAATCTGATGAGTTAGTAGAAGAACTTCGTCTTTGGGCATCATATAAGGGGCAAACATTGACCAGAACTGTAAGAGGTATGATGTATTATAGAAAAGCTTTGGAACTCCAGGCTTTTCTTGATATGGCCAAAGATGAAGATTTGATGGAAGGTTATAAAGCCATGGAAAACTCAGATGACAATTCAAGGGGGGAAAGATCATTGTGGACACAGTGTCAAGCAGTAGCTGATATGAAATTTACATATGTGGTATCGTGCCAACAATATGGCATTGATAAGCGATCTGGTTCTCCTCGTGCACAGGACATATTAAGGCTTATGACAAGATATCCGTCACTCCGAGTTGCCTATATTGATGAGGTAGAGGAACCTGTCAAAGACAGCAAGAAAAAGATCAACAAGGTTTACTACTCTTGCTTGGTGAAGGCTATGCCTAAATCGAATATTCCTTCAGAGCCTGAGCGGAATCTGGACCAGATCATATATAAAATAAAGCTTCCTGGACCAGCGATTTTGGGTGAGGGTAAGCCCGAAAATCAGAATCATGCCATAATTTTCACACGTGGAGAGGGCTTGCAAACAATAGATATGAACCAGGATAACTACATGGAAGAAGCTTTGAAAATGAGAAATTTGTTGCAAGAATTTCTTAAGAAGCATGATGGTGTTCGGTTCCCTAGTATTCTTGGACTTAGGGAGCATATATTTACTGGAAGTGTTTCTTCCCTTGCATGGTTCATGTCAAATCAGGAAACAAGTTTTGTGACAATTGGTCAGAGATTGTTGGCTAATCCTTTGAAGGTTCGTTTCCATTATGGTCATCCTGATGTCTTTGATAGGCTTTTTCACCTGACAAGAGGGGGTGTGAGTAAAGCCTCCAAAGTTATCAATCTAAGTGAAGATATTTTTGCTGGCTTCAACTCTACACTCCGTGAAGGAAATGTTACTCACCATGAGTACATACAAGTAGGGAAGGGAAGAGATGTGGGTCTCAATCAGATTTCTATGTTTGAAGCAAAAATAGCTAATGGGAATGGAGAGCAAACACTAAGTCGAGATGTATACCGACTTGGGCACCGTTTTGACTTCTTCAGAATGTTGTCCTGTTATTTCACCACAGTTGGATTTTATTTCAGCACTCTTATAACTGTTCTCACTGTGTATGTATTCCTCTATGGTCGCCTCTATCTTGTTCTCAGTGGGCTCGAAGAAGGTCTGAGCACTCAGAAAGCCATTCGAGACAATAAGCCTCTTCAAGTGGCTCTTGCTTCTCAGTCATTTGTTCAAATTGGGGTTTTGATGGCCTTGCCCATGTTGATGGAAATTGGTTTGGAGAGGGGTTTCCGAACTGCACTTAGTGAGTTCATATTGATGCAACTGCAGCTTGCCCCAGTATTCTTCACATTTTCACTTGGGACAAAAACTCATTATTTTGGAAGGACATTGCTTCATGGAGGTGCGAAGTATAGACCCACTGGTCGAGGATTTGTGGTTTTCCATGCTAAATTTGCTGACAACTATAGACTTTACTCTCGTAGCCACTTTGTCAAGGG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Predicted protein sequences of Glyma.18g300200
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>Glyma.18g300200.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g300200.2 locus=Glyma.18g300200 id=Glyma.18g300200.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MSSSRGGAGPSSEAPPPRRIMRTQTAGNLGESVIDSEVVPSSLVEIAPILRVANEVEKTHPRVAYLCRFYAFEKAHRLDPNSSGRGVRQFKTALLQRLERENDPTLKGRVKKSDAREMQSFYQHYYKKYIQALQNAADKADRAQLTKAYNTANVLFEVLKAVNMTQSMEVDREILETQDKVAEKTEILVPYNILPLDPDSANQAIMRFPEIQAAVYALRNTRGLPWPKDYKKKKDEDILDWLGSMFGFQKHNVANQREHLILLLANVHIRQFPKPDQQPKLDERALTEVMKKLFKNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEVQQRKLLYMGLYLLIWGEAANLRFMPECLCYIYHHMAFELYGMLAGNVSPMTGENVKPAYGGEEEAFLRKVVTPIYNVIAKEAARSKKGRSKHSQWRNYDDLNEYFWSADCFRVGWPMRADADFFCLPAEKLVFDKSNDDKPPSRDRWVGKVNFVEIRSFWHMFRSFDRMWSFFILCLQAMIIVAWNGSGDPSAIFNGDVFKKALSVFITAAILKFGQAVLDVILSWKAQQSMSLYVKLRYILKVVSAAAWVIVLSVTYAYTWDNPPGFAQTIKSWFGSGGSSSPSLFILAVVVYLSPNMLAAIFFLIPFIRRHLERSNYRIVMLMMWWSQPRLYVGRGMHESAFSLFKYTMFWILLIITKLAFSYYIEIKPLVGPTKAIMSVKITIFQWHEFFPHARNNIGVVIALWAPIILVYFMDTQIWYAIFSTLFGGVYGAFRRLGEIRTLGMLRSRFQSLPGAFNASLIPEETNEPKKKGLKATLSRRFPEISSNKGKEAARFAQLWNQIITSFRDEDLIDDREMNLLLVPYWADTQLDLIQWPPFLLASKIPIALDMAKDSNGKDRELKKRIAADNYMSCAVRECYASFKSIIKHLVQGEREIPVIEYMFNEVDKHIESDKLISEFKMSALPILYGQFVELIQYLLTNDPKDRDRVVLLFQDMLEVVTRDIMMEDQDQIFSLVDSSHGGTGHEGMLHLEPEPHHQLFASEGAIKFPIEPLTAAWTEKIKRLHLLLTTKESAMDVPSNLEARRRISFFSNSLFMDMPMAPKVRNMLSFSVLTPYYTEEVLFSLNDLDSQNEDGVSILFYLQKIFPDEWNNFLERVNSTEEDIKGSESDELVEELRLWASYKGQTLTRTVRGMMYYRKALELQAFLDMAKDEDLMEGYKAMENSDDNSRGERSLWTQCQAVADMKFTYVVSCQQYGIDKRSGSPRAQDILRLMTRYPSLRVAYIDEVEEPVKDSKKKINKVYYSCLVKAMPKSNIPSEPERNLDQIIYKIKLPGPAILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEALKMRNLLQEFLKKHDGVRFPSILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTIGQRLLANPLKVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKASKVINLSEDIFAGFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQISMFEAKIANGNGEQTLSRDVYRLGHRFDFFRMLSCYFTTVGFYFSTLITVLTVYVFLYGRLYLVLSGLEEGLSTQKAIRDNKPLQVALASQSFVQIGVLMALPMLMEIGLERGFRTALSEFILMQLQLAPVFFTFSLGTKTHYFGRTLLHGGAKYRPTGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELMILLVVYQIFGHSYRSTVAYILITASMWFMVGTWLFAPFLFNPSGFEWQKIVDDWTDWNKWISNRGGIGVPPEKSWESWWEEEQEHLQYSGMRGIIVEILLSLRFFIYQYGLVYHLNITKKGPKSFLVYGISWLVIFVILFVMKYLLGGVNSVQTFNLSSD*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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