SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.18g281700

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm18
Start:56536129
stop:56544160
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.18g281700
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G09730.1AT JGI N/AIEA
GO:0006508GO-bp proteolysis JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
GO:0008234GO-mf cysteine-type peptidase activity JGI N/AIEA
GO:0043531GO-mf ADP binding JGI N/AIEA
K08596KEGG Ubiquitin system JGI N/AIEA
KOG4658 KOG Apoptotic ATPase JGI N/AIEA
PTHR23155PantherFam DISEASE RESISTANCE PROTEIN RP JGI N/AIEA
PF00931Pfam NB-ARC domain JGI N/AIEA
PF02902Pfam Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain JGI N/AIEA
PF13855Pfam Leucine rich repeat JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.18g281700 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma18g51765 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.18g281700
>Glyma.18g281700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g281700.1.p locus=Glyma.18g281700 id=Glyma.18g281700.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g281700.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g281700.2.p locus=Glyma.18g281700 id=Glyma.18g281700.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g281700.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g281700.3.p locus=Glyma.18g281700 id=Glyma.18g281700.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g281700.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g281700.4.p locus=Glyma.18g281700 id=Glyma.18g281700.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.18g281700
>Glyma.18g281700.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g281700.1 locus=Glyma.18g281700 id=Glyma.18g281700.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g281700.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g281700.2 locus=Glyma.18g281700 id=Glyma.18g281700.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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