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Report for Sequence Feature Glyma.18g232900

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm18
Start:52409925
stop:52426481
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.18g232900
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G00450.1AT CCT,CRP JGI N/AIEA
GO:0006357GO-bp regulation of transcription by RNA polymerase II JGI N/AIEA
GO:0016592GO-cc mediator complex JGI N/AIEA
PTHR13992PantherFam NUCLEAR RECEPTOR CO-REPRESSOR RELATED NCOR JGI N/AIEA
PF09497Pfam Transcription mediator complex subunit Med12 JGI N/AIEA

Proteins Associated with Glyma.18g232900
LocusGene SymbolProtein Name
MED12-4 Mediator Complex 12 gene 4

Gene model name correspondences to Glyma.18g232900 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma18g46703 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.18g232900
>Glyma.18g232900.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g232900.2.p locus=Glyma.18g232900 id=Glyma.18g232900.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g232900.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g232900.3.p locus=Glyma.18g232900 id=Glyma.18g232900.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCAAAGGTATCATGCTGGCAGCTGCACTAGTGCAGTTAATAACAGTGCAATTGGTGGGCCATCCACTAGGGACATTGGAAGAACTGATTCATCTTCTTTGCCAGCTAACTTTCCTGTGAGTTCAAGGCGACAACCACCATTAACCCCATACAAGTTGAAGTGTGATAAAGAACCTCTGAACTCTAGGCTTGGGCCTCCAGACTATCACCCCCAAACACCAAATTGTCCTGAAGAGATTCTGACCAGAGAATATTTGCAATCTGGATATAGGGACACAGTTGAAGGGCTTGAGGAATCTAGAGAAATTTCTCTGACCCAGGTTCAAAATTTTAGCAAGAAAGTTGTCCTTAATTGCAAAGAGGCTATTAGAAAACGGCTACGGGCCATCAATGAATCTCGCGTGCAGAAGCGGAAGGCTGGTCAAGTATATGGAGTGGCTCTTTCAGGGTCACAACTTGCTAAGCCTGGTGTTTTCCCTGAACAAAGGCCCTGTCCTGAAGACTTCCGAAAGAAATGGATTGAGGGCTTATCTCAACCGCACAAGCGATTACGATCTTTGACGGATCTTGTTCCTCATGTTAGAAGGAAATCACTTTCAGAGGTTCTTATTAGGAATAATGTGCCATTGTTGAGGGCTACCTGGTTTATAAAGGTTTCTTACCTTAATGTGGTTCGGCCAGGCTCTGCTAGTATTCCTTCTGGGACTGCTGACAAAACTCAGCTGTCTTGTTCTGAGCTTTGGACAAAAGATGTTATTGAATACTTGCAAACTCTTCTTGATGAATTCTTCTCAAAAAATTCTTCTCATTTTACTCCTCATAATCGAGACCGATCACCCCAAGTACCTTATACTGCGTCATTTCAGCACAGAAGTGACCAGTTATTATCTGTTGCTGATGGTGAAGAACCATCTTTACATTTTAGATGGTGGTATATTGTTCGGCTTTTGCAATGGCATCACGCTGAAGGGCTTCTTCTTCCTTCTCTTATCATTGACTGGGTTTTGCGTCAATTGCAGGAAAAACAATTGCTTGAGATTTGGCAGCTGCTATTGCCTATTGTATATGGATTTTTAGAAATTGTTGTTCTATCTCAAACATATGTTCGCACTCTTGCCGGTGTAGCTCTTCGTATTATTCGTGATCCTGCACCTGGTGGATCAGATCTAGTAGACAATTCCCGGAGGGCATATACGACTTCTGCTCTGATTGAGATGCTCCGATATTTAATATTTGCGGCTCCAGAGACTTTTGTTGCTTTGGATTGCTTTCCTTTGCCATCCTCTGTAGTTTCACATACAATAAATGATGGGAATTTTGTACTGAAAGCAACTGAAGCAGCTGGAAAGATAAAAAGTAGTTCAGAAGATGTTGTGTGTTTATTTAGAAGTAAAGGATTTGATGCACAATTCCAGTCATTGGCATTTGATCATGTTATTTCGTGCATTCAAGAATGTGTAGAAGATCTCACAAAGGCTGTAAGCCCAGGCTATCCAGGTCAATGTCTGGCTAAAGCTGCACAAGCCTTGGATAAATCCCTTGTACTTGGTGATATACATGGAGCATACAAATTTCTTTTTGAAGATCATTGTGATGAAACTGTATCTGAAGGTTGGGTTGCAAAAGTCAGCCATTGTTTAAGGTTATCGCTGAAGTGGTTTGTGACTGTAAATAAATCACTTGTTTATTCAGTGTTTTTCCTGTGTGAGTGGGCAACATGTGATTTCAGGGATTTTCGGAATGCTCCTCCTTGTGATGTAAAGTTCACTGGCAGGAAAGATCTTTCCCATGTCCATATAGCAATTAGACTTTTAAAGATGAAACTGAGGGATATGCAGATTTCACCAAAGCATAAGAGTGGAAGCACTCGTGGTTGTGGAGTCAGTTATTTAGCAAAATGTTCAAGTCAGCAGAGAAATCAGAATTTTGTGAACAATGCATTCAAAATAAAATCTAGTTCAAGAAATTTGGATCAGAATATCTGTTCTTCAGCTGTATTTGAAAGCCCAGGTCCTCTACATGATATTATTGTTTGTTGGATTGATCAGCATATGGTGCATAAAGGGGAAGGTCTCAAACGCCTACATCTATTTATAGTGGAACTCATACGGGCAGGCATCTTTTACCCACTGGCATATGTACGTCAGCTGATAGTGAGTGGGATCATGGATATGAATGTAAATGTAGTTGACTTGGAGAGACAGAAGAGACATTGCCGAATCTTGAAGCAGCTTCCTGGGAAGTTTGTGCGTCGGGCTTTGGTAGAATCAGGGATTAGTGAAGGGCCACGGCTCACTGAAGCATTGCAAGTTTACTTGAATGAGCGCCGCTTCATACTTCGTGGTTCCTTATGGGAGAACCATGGCAATGCCAATAATGTGAATATATCTTCTCTCAAGCAAAACCACTGTACATCTTCAACAAAAGACAAAACTTCTACAGTGTCAATTGATCCATGGAAAAGTGTTTTTTCTAATAAAACATCCTCTAAAAATGCAAAGGATGACAATGGTGTTGAAGAACTGAAGACATTCATCTCAACCCTGCTACAGCTCCCAAAAAGTTTATCTAATTTGAGCACTACAGGATTGGACGAATCTCAAGGCAGTGTCAGAAAACCTATTGGGTCTCACAACAAGAGTGATCTAGTGGAGGCTACCCCTGGGTGTGAAGAATGTAGAAAAGCAAAGAGGCAAAAATTGAGTGAGGAAAGAAGCTCATTTGTTCAAGCTCCGTCTCCAATACTATCTGATGATGAAGATACTTGGTGGGTGAAGAAGGGGCTAAAATCTTCAGAGCATCTCAAAGTTGATCAACCACTTAAGCCAACTAAACAGGTTACTAAGACTCGGCAGAAGACTGTCCGTAAAACCCAGAGTCTTGCTCAACTGGCAGCTTCTAGAATTGAGGGTAGCCAAGGGGCATCAACAAGTCATGTGTGTGGCAATAAGGTTAGCTGTCCTCACCATAGAACTGCTATGGATGGAGATACAACAAGGTCTGTTGATGGAATTCGATCAGGTCACTGTGAAGATATTGTTTCAATTGGAAGGGCACTTAAACAGCTACGCTTTGTTGAGAGAAAGGAAGTAACACTTTGGCTGATGACTGTAGTTAGGCAGCTTATTGAAGAGAGTGAAAAGAATGTTGGTAAAGTTAGCCAGTTTGGTAGGCCTTTTGCCACTGTGGATGATAAAAGTTCAATACGGTGGAAACTTGGTGAGGATGAACTTTCTGCTTTACTTTATTTGATGGATGTCTCAGACGATTTAGTATCAGCTGTCAAATTCCTCTTATGGTTGCTGCCAAAGGTTTATAGTAGCCCTAATTCTACAATTCATAGTGGAAGGAATGCTTTAATGCTGCCAAGGAATGTGGAGAACCAAGCTTGTGATGTTGGCGAGGCTTTTCTGTTATCATCACTGAGAAGATATGAGAACATTCTTGCTGCAGCAGATCTTCTTCCTGAAGCTCTGTCATCTATAATGCATCGTGCTGCGGCTATTATAGCATCTAATGGGAGGGTTTCAGGTTCAGGTGCCCTAACTTTTGCTTGTTATTTATTAAAAAAATATGGCAATGTGGTCAGTGTCATTGAGTGGGAGAAAAGTTTTAAGAGTACATGTGATAAGAGACTTGCTTCTGAAATAGAGTCTGGACGGTCAGTTGATGGAGAGTTAGGGCTTCCACTTGGTGTGCCTGCTGGAGTTGAGGACCCTGATGACTTTTTCCGTCAAAAGATAAGTGGTGGCCGGTTACCGTCCAGAGTGGGTTCAGGCATGAGAGATGTTGTACAGCGTAATGTGGAAGAAGCATTTCGTGATCTTTTTGGAAAAGACAGAAAGCTCTTTGCTGCTGGTACACCAAAAGGTCCTGCTTTTGAAAAATGGGATAATGGTTATCAAATTGCTCAACAAATAGTTATGAGTTTGATAGATTGCATAAGGCAGACTGGTGGTGCTGCTCAAGAAGGGGACCCCTCTTTGGTTACTTCTGCTGTTTCTGCCATAGTTGGCAGTGTTGGTCCAACATTAGCAAAATTGCCTGATTTTTCAGCTGGCAGTAATCATTCAAATATGTCATTGGCTACAAGTTCATTGAACTATGCTAAATGCATTCTGCGAATGCATATAACTTGTTTGTGCTTGCTTAAGGAAGCCTTGGGAGAACGCCAAAGCCGTGTATTTGAGATAGCTCTTGCAATGGAAGCTTCTACCGCTCTTGCTGGAGTTTTTGCTCCAAGTAAAGCATCTCGAGCTCAGTTTCAAATGTCACCTGAAACCCATGATACTGGTACTATTTCGAACGACGTTGCTGCAAATAACACTAGTAAAATTGTGGTTGCTAGAACAACGAAAATTAGTGCTGCTGTTTCTGCACTTGTTGTTGGTGCAATTATATGTGGTGTTACCAGCCTGGAAAGAATAGTAACCATTCTCAGATTAAAGGAGGGCCTGGATGTTGTACACTTTGTAAGAAGCACAAGATCCAATTCAAATGGGAATGTACGTTCAGTTGGGGCTTTTAAGTTGGATAGTTCAGTTGAAGTTCATGTCCATTGGTTTAGATTGCTTGTTGGGAACTGCAGAACCATCTGTGAAGGCTTAGTGGTGGATCTCTTGGGTGAACCATCCATTGTTGCTCTTTCAAGGATGCAGCGCATGCTTCCTCTAACTTTGGTTTTTCCACCGGCCTATTCAATATTTGCTTTTGTTATGTGGCGGCCCTTTGTTATGAATGCCAATGTAGCAGTTCGTGAAGACATGAATCAACTTTATCAGTCTCTAACAATAGCCATAAGTGATGCAATAAAACATTGGCCGTTCCGAGATGTATGCTTAAGAGAGTGTCAGGGTCTTTATGATCTTATGGCTGCAGATACAAGTGATGCAGAGTTTGCAACCTTGCTAGAGTTGAATGGCTCTGATATGCATTCAAAATCTCTGGCATTTGTTCCGCTCCGTGCCAGACATATTCTAAATGCCATGATTGATTGTAA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Predicted protein sequences of Glyma.18g232900
>Glyma.18g232900.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g232900.2 locus=Glyma.18g232900 id=Glyma.18g232900.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.18g232900.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g232900.3 locus=Glyma.18g232900 id=Glyma.18g232900.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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