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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.18g204600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm18
Start:49059254
stop:49063073
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.18g204600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT2G33060.1AT AtRLP27,RLP27 JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
KOG0472 KOG Leucine-rich repeat protein JGI N/AIEA
PTHR27004PantherFam RECEPTOR-LIKE PROTEIN 12 ISOFORM X1 JGI N/AIEA
PF00560Pfam Leucine Rich Repeat JGI N/AIEA
PF13855Pfam Leucine rich repeat JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.18g204600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma18g43510 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.18g204600
>Glyma.18g204600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g204600.1.p locus=Glyma.18g204600 id=Glyma.18g204600.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGTCAAACTGCAATCTGTCTGGACCCCTTGATCCTTCCTTGACAAGACTTCAGTATCTATCAATCATTCGTCTTGATCTGAACAATTTCTCATCCCCAGTGCCAGAAACCTTTGCTAATTTTACAAATTTAACCACCCTTCACCTTAGTTCTTGTGAATTGACTGGTACATTTCCAGAGAAAATCTTTCAGGTAGCAACATTGTCTGTTGTAGACTTATCATTCAATTATCATCTGTATGGATCTTTGCCTGAATTCCCACTGAATAGTCCTCTTCAGACATTGATTGTGAGTGGCACAAATTTCTCGGGAGGAATACCACCTATAAATAATCTTGGGCAGTTATCCATCTTGGATCTTTCTAATTGCCATTTTAACGGAACACTGCCCAGTTCAATGTCAAGACTCAGGGAACTCACTTATCTGGATTTGTCATTTAATGACTTCACTGGTCAAATTCCATCCCTGAATATGTCCAAGAATCTCACCCATTTAGACTTCACACGTAATGGTTTCACAGGTTCAATCACATATCATTTTGGCGGCCTAAGAAATCTGCTCCAAATTGATTTGCAGGACAACTTCCTGGATGGAAGCCTTCCTTCCTCTCTTTTTTCTCTCCCACTGCTACGAAGTATTCGACTTTCCAACAACAATTTCCAGGATCAACTGAATAAATATTCAAATATCTCTTCCTCCAAGCTAGAGGTCCTTGATTTAAGTGGAAATGATTTAAACGGGTCCATTCCTACAGATATTTTTCAACTCAGATCACTTAGTGTCCTTGAACTATCTTCAAACAAGTTAAATGGCACGTTGAAGCTAGATGTGATTCATAGACTTGAAAATCTAACTACACTGGGACTTTCACACAACCATTTGTCAATAGACACAAATTTTGCAGATGTTGGCCTAATATCTTCCATCCCCAATATGAAAATTGTAGAGTTGGCCTCTTGCAACCTGACAGAGTTCCCTAGTTTCTTGAGAAACCAATCAAAAATAACAACTTTAGACCTCTCAAGCAACAATATTCAAGGATCTATACCAACATGGATTTGGCAACTTAACTCTCTCGTTCAATTAAATCTTTCTCACAATTTACTCAGCAATTTAGAAGGACCTGTGCAGAACTCTAGTTCCAATTTGAGTCTCCTTGACCTTCATGATAATCACCTCCAAGGGAAGCTTCAAATATTTCCGGTGCATGCCACTTATTTGGACTATTCAAGCAATAACTTCAGTTTCACTATTCCATCAGATATTGGTAATTTTCTGTCTTCCACAATTTTCCTGTCTCTTTCCAAAAACAATTTATCTGGGAATATTCCACAATCCTTGTGCAATAGTTCAAATATGCTAGTTCTGGATTTTTCCTATAATCACTTGAATGGGAAAATTCCAGAGTGCTTAACACAGAGTGAGAAACTTGTGGTATTAAATATGCAACATAACAAGTTCCATGGCAGCATTCCAGACAAATTTCCAGTATCTTGTGTTCTAAGGACTCTGGATCTTAATAGTAATCTATTGTGGGGCTCAATTCCCAAATCTCTTGCAAATTGCACATCATTAGAGGTGTTGGATCTTGGTAACAATCAGGTAGATGATGGGTTTCCATGCTTCTTAAAGACAATATCTACACTACGTGTCATGGTTTTGAGGGGAAACAAATTCCATGGTCATATTGGATGTCCTCATGCTAACAGTACTTGGCATGTGCTTCAAATTGTTGATCTAGCTTTAAACAATTTCAGTGGTGTACTTCCAAAAAACTGCTTCAAAACTTGGAAGGCAATGATGCTTGATGAAGATGATGATGGATCAAAGTTCAATCACATTGCATCTCCAGTCCTTAAGTTTGGTGGTATATATTATCAGGATTCTGTGACACTTACAAGCAAAGGTTTACAGATGGAGTTTGTTAAAATCCTAACTGTCTTCACATCTGTTGACTTCTCATCCAACAATTTTGAAGGAACAATACCAGAAGAGCTTATGAATTTTACAAGACTTAATTTGCTCAACTTGTCAGATAATGCTTTAGCAGGCCATATCCCTTCATCTATAGGGAATTTAAAACAGCTTGAATCATTGGACCTGTCAAGAAACCATTTTGATGGGGAGATTCCCACACAGCTTGCAAATTTAAATTTCCTCTCGTACCTAGACCTTTCCTCTAATCGTCTGGTGGGAAAAATCCCCGTAGGTAACCAGCTTCAAACATTTGATGCATCTTCCTTTGTTGGTAATGCAGAATTGTGTGGAGCACCTTTGACTAAAAAGTGCTCTGATACGAAAAATGCAAAAGAAATACCTAAAACAGTTTCTGGAGTTAAATTTGACTGGACTTATGTATCAATTGGAGTGGGTTTTGGGGTTGGAGCAGGATTGGTTGTAGCTCCAGCATTGTTTTTGGAGAGACTGAAAAAATGGAGCAACCATAAAATTGATAAAATTCTCCTTGTCATTCTTCCAATGTTTGGTTTGACTTGGATACCTACTGATGATGATGAAGCAGAGGAAGATACTGAAGAAAATAACTCGGACATGGAAGAGGAGTCTGATTACAATGAGGATCAAAATAGTTTGGTCCATCAAAGGTTTCAAGGGTGGTATTGTGTGTTGTGTTCAAAGCTTGATATCAGTAAGAAGAAGGTAATTCATGACCCAAGGTGTACATGTTACCCCTCACCACCCATTTCAACATCAACTTATCCGGATTCATATTCTTATCATTCACATACATGA

>Glyma.18g204600.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g204600.2.p locus=Glyma.18g204600 id=Glyma.18g204600.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGAGAATTCCCCATGTTCCCTTCCTTTCCTTCATATTCTGCTACTGCTTCTTGATACACCACAGTGTTTACTACACCGGGGTAAAAGCCCAAATTGTTGAGGATCAACAACAATCATTGCTCAAACTTAAGAATAGCCTCAAATTCAAGACTAATAAGTCTACAAAACTTGTGTCTTGGAATTCAAGCATAGATTTCTGTGAGTGGAGGGGTGTTGCCTGTGACGAGGATGGGCAAGTTACTGGCCTTGACCTGAGTGGAGAATCTATCTATGGTGGATTTGACAATTCAAGTACTCTTTTCAGTTTGCAAAATCTCCAGATACTGAATTTGTCTGCTAATAACTTCAGTTCTGAGATACCATCCGGTTTCAACAAGTTGAAGAACTTAACATATCTGAATTTGTCTCATGCTGGCTTTGTGGGGCAGATTCCAACAGAGATTTCTTACCTGGCAAGGTTGGTAACTCTTGATATCTCTTCTGTTTCCTATTTATATGGGCAACCACTGAAACTTGAAAACATAGATCTACAAATGCTTGTCCATAACCTCACCATGCTTAGACAATTGTATATGGATGGTGTAATTGTAACAACTCTGGGAAATAAATGGAGCAATGCTTTGTTTAAACTTGTTAACCTGCAGGAGCTGAGCATGTCAAACTGCAATCTGTCTGGACCCCTTGATCCTTCCTTGACAAGACTTCAGTATCTATCAATCATTCGTCTTGATCTGAACAATTTCTCATCCCCAGTGCCAGAAACCTTTGCTAATTTTACAAATTTAACCACCCTTCACCTTAGTTCTTGTGAATTGACTGGTACATTTCCAGAGAAAATCTTTCAGGTAGCAACATTGTCTGTTGTAGACTTATCATTCAATTATCATCTGTATGGATCTTTGCCTGAATTCCCACTGAATAGTCCTCTTCAGACATTGATTGTGAGTGGCACAAATTTCTCGGGAGGAATACCACCTATAAATAATCTTGGGCAGTTATCCATCTTGGATCTTTCTAATTGCCATTTTAACGGAACACTGCCCAGTTCAATGTCAAGACTCAGGGAACTCACTTATCTGGATTTGTCATTTAATGACTTCACTGGTCAAATTCCATCCCTGAATATGTCCAAGAATCTCACCCATTTAGACTTCACACGTAATGGTTTCACAGGTTCAATCACATATCATTTTGGCGGCCTAAGAAATCTGCTCCAAATTGATTTGCAGGACAACTTCCTGGATGGAAGCCTTCCTTCCTCTCTTTTTTCTCTCCCACTGCTACGAAGTATTCGACTTTCCAACAACAATTTCCAGGATCAACTGAATAAATATTCAAATATCTCTTCCTCCAAGCTAGAGGTCCTTGATTTAAGTGGAAATGATTTAAACGGGTCCATTCCTACAGATATTTTTCAACTCAGATCACTTAGTGTCCTTGAACTATCTTCAAACAAGTTAAATGGCACGTTGAAGCTAGATGTGATTCATAGACTTGAAAATCTAACTACACTGGGACTTTCACACAACCATTTGTCAATAGACACAAATTTTGCAGATGTTGGCCTAATATCTTCCATCCCCAATATGAAAATTGTAGAGTTGGCCTCTTGCAACCTGACAGAGTTCCCTAGTTTCTTGAGAAACCAATCAAAAATAACAACTTTAGACCTCTCAAGCAACAATATTCAAGGATCTATACCAACATGGATTTGGCAACTTAACTCTCTCGTTCAATTAAATCTTTCTCACAATTTACTCAGCAATTTAGAAGGACCTGTGCAGAACTCTAGTTCCAATTTGAGTCTCCTTGACCTTCATGATAATCACCTCCAAGGGAAGCTTCAAATATTTCCGGTGCATGCCACTTATTTGGACTATTCAAGCAATAACTTCAGTTTCACTATTCCATCAGATATTGGTAATTTTCTGTCTTCCACAATTTTCCTGTCTCTTTCCAAAAACAATTTATCTGGGAATATTCCACAATCCTTGTGCAATAGTTCAAATATGCTAGTTCTGGATTTTTCCTATAATCACTTGAATGGGAAAATTCCAGAGTGCTTAACACAGAGTGAGAAACTTGTGGTATTAAATATGCAACATAACAAGTTCCATGGCAGCATTCCAGACAAATTTCCAGTATCTTGTGTTCTAAGGACTCTGGATCTTAATAGTAATCTATTGTGGGGCTCAATTCCCAAATCTCTTGCAAATTGCACATCATTAGAGGTGTTGGATCTTGGTAACAATCAGGTAGATGATGGGTTTCCATGCTTCTTAAAGACAATATCTACACTACGTGTCATGGTTTTGAGGGGAAACAAATTCCATGGTCATATTGGATGTCCTCATGCTAACAGTACTTGGCATGTGCTTCAAATTGTTGATCTAGCTTTAAACAATTTCAGTGGTGTACTTCCAAAAAACTGCTTCAAAACTTGGAAGGCAATGATGCTTGATGAAGATGATGATGGATCAAAGTTCAATCACATTGCATCTCCAGTCCTTAAGTTTGGTGGTATATATTATCAGGATTCTGTGACACTTACAAGCAAAGGTTTACAGATGGAGTTTGTTAAAATCCTAACTGTCTTCACATCTGTTGACTTCTCATCCAACAATTTTGAAGGAACAATACCAGAAGAGCTTATGAATTTTACAAGACTTAATTTGCTCAACTTGTCAGATAATGCTTTAGCAGGCCATATCCCTTCATCTATAGGGAATTTAAAACAGCTTGAATCATTGGACCTGTCAAGAAACCATTTTGATGGGGAGATTCCCACACAGCTTGCAAATTTAAATTTCCTCTCGTACCTAGACCTTTCCTCTAATCGTCTGGTGGGAAAAATCCCCGTAGGTAACCAGCTTCAAACATTTGATGCATCTTCCTTTGTTGGTAATGCAGAATTGTGTGGAGCACCTTTGACTAAAAAGTGCTCTGATACGAAAAATGCAAAAGAAATACCTAAAACAGTTTCTGGAGTTAAATTTGACTGGACTTATGTATCAATTGGAGTGGGTTTTGGGGTTGGAGCAGGATTGGTTGTAGCTCCAGCATTGTTTTTGGAGAGACTGAAAAAATGGAGCAACCATAAAATTGATAAAATTCTCCTTGTCATTCTTCCAATGTTTGGTTTGACTTGGATACCTACTGATGATGATGAAGCAGAGGAAGATACTGAAGAAAATAACTCGGACATGGAAGAGGAGTCTGATTACAATGAGGATCAAAATAGTTTGGTCCATCAAAGGTTTCAAGGGTGGTATTGTGTGTTGTGTTCAAAGCTTGATATCAGTAAGAAGAAGGTAATTCATGACCCAAGGTGTACATGTTACCCCTCACCACCCATTTCAACATCAACTTATCCGGATTCATATTCTTATCATTCACATACATGA
Predicted protein sequences of Glyma.18g204600
>Glyma.18g204600.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g204600.1 locus=Glyma.18g204600 id=Glyma.18g204600.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MSNCNLSGPLDPSLTRLQYLSIIRLDLNNFSSPVPETFANFTNLTTLHLSSCELTGTFPEKIFQVATLSVVDLSFNYHLYGSLPEFPLNSPLQTLIVSGTNFSGGIPPINNLGQLSILDLSNCHFNGTLPSSMSRLRELTYLDLSFNDFTGQIPSLNMSKNLTHLDFTRNGFTGSITYHFGGLRNLLQIDLQDNFLDGSLPSSLFSLPLLRSIRLSNNNFQDQLNKYSNISSSKLEVLDLSGNDLNGSIPTDIFQLRSLSVLELSSNKLNGTLKLDVIHRLENLTTLGLSHNHLSIDTNFADVGLISSIPNMKIVELASCNLTEFPSFLRNQSKITTLDLSSNNIQGSIPTWIWQLNSLVQLNLSHNLLSNLEGPVQNSSSNLSLLDLHDNHLQGKLQIFPVHATYLDYSSNNFSFTIPSDIGNFLSSTIFLSLSKNNLSGNIPQSLCNSSNMLVLDFSYNHLNGKIPECLTQSEKLVVLNMQHNKFHGSIPDKFPVSCVLRTLDLNSNLLWGSIPKSLANCTSLEVLDLGNNQVDDGFPCFLKTISTLRVMVLRGNKFHGHIGCPHANSTWHVLQIVDLALNNFSGVLPKNCFKTWKAMMLDEDDDGSKFNHIASPVLKFGGIYYQDSVTLTSKGLQMEFVKILTVFTSVDFSSNNFEGTIPEELMNFTRLNLLNLSDNALAGHIPSSIGNLKQLESLDLSRNHFDGEIPTQLANLNFLSYLDLSSNRLVGKIPVGNQLQTFDASSFVGNAELCGAPLTKKCSDTKNAKEIPKTVSGVKFDWTYVSIGVGFGVGAGLVVAPALFLERLKKWSNHKIDKILLVILPMFGLTWIPTDDDEAEEDTEENNSDMEEESDYNEDQNSLVHQRFQGWYCVLCSKLDISKKKVIHDPRCTCYPSPPISTSTYPDSYSYHSHT*

>Glyma.18g204600.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g204600.2 locus=Glyma.18g204600 id=Glyma.18g204600.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MRIPHVPFLSFIFCYCFLIHHSVYYTGVKAQIVEDQQQSLLKLKNSLKFKTNKSTKLVSWNSSIDFCEWRGVACDEDGQVTGLDLSGESIYGGFDNSSTLFSLQNLQILNLSANNFSSEIPSGFNKLKNLTYLNLSHAGFVGQIPTEISYLARLVTLDISSVSYLYGQPLKLENIDLQMLVHNLTMLRQLYMDGVIVTTLGNKWSNALFKLVNLQELSMSNCNLSGPLDPSLTRLQYLSIIRLDLNNFSSPVPETFANFTNLTTLHLSSCELTGTFPEKIFQVATLSVVDLSFNYHLYGSLPEFPLNSPLQTLIVSGTNFSGGIPPINNLGQLSILDLSNCHFNGTLPSSMSRLRELTYLDLSFNDFTGQIPSLNMSKNLTHLDFTRNGFTGSITYHFGGLRNLLQIDLQDNFLDGSLPSSLFSLPLLRSIRLSNNNFQDQLNKYSNISSSKLEVLDLSGNDLNGSIPTDIFQLRSLSVLELSSNKLNGTLKLDVIHRLENLTTLGLSHNHLSIDTNFADVGLISSIPNMKIVELASCNLTEFPSFLRNQSKITTLDLSSNNIQGSIPTWIWQLNSLVQLNLSHNLLSNLEGPVQNSSSNLSLLDLHDNHLQGKLQIFPVHATYLDYSSNNFSFTIPSDIGNFLSSTIFLSLSKNNLSGNIPQSLCNSSNMLVLDFSYNHLNGKIPECLTQSEKLVVLNMQHNKFHGSIPDKFPVSCVLRTLDLNSNLLWGSIPKSLANCTSLEVLDLGNNQVDDGFPCFLKTISTLRVMVLRGNKFHGHIGCPHANSTWHVLQIVDLALNNFSGVLPKNCFKTWKAMMLDEDDDGSKFNHIASPVLKFGGIYYQDSVTLTSKGLQMEFVKILTVFTSVDFSSNNFEGTIPEELMNFTRLNLLNLSDNALAGHIPSSIGNLKQLESLDLSRNHFDGEIPTQLANLNFLSYLDLSSNRLVGKIPVGNQLQTFDASSFVGNAELCGAPLTKKCSDTKNAKEIPKTVSGVKFDWTYVSIGVGFGVGAGLVVAPALFLERLKKWSNHKIDKILLVILPMFGLTWIPTDDDEAEEDTEENNSDMEEESDYNEDQNSLVHQRFQGWYCVLCSKLDISKKKVIHDPRCTCYPSPPISTSTYPDSYSYHSHT*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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