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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G07380.1 | AT | Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase | JGI | N/A | IEA |
KOG2232 | KOG | Ceramidases | JGI | N/A | IEA |
PTHR12670 | Panther | CERAMIDASE | JGI | N/A | IEA |
PF04734 | PFAM | Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase | JGI | N/A | IEA |
PWY-6483 | SoyCyc9 | ceramide degradation | Plant Metabolic Network | ISS | |
GN7V-53865 | SoyCyc9-rxn | ceramidase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.18g068800 not represented in the dataset |
Glyma.18g068800 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.08g335200 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma18g07680 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.18g068800.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.18g068800.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 TAACCTTGTTCCTTTAAAACAATTTCATAGCAGCTATGCCCAAACTTGACAAAAGGGACGATGTGGTGTTGTGTGTTCGAATGCTGCGAATCTTAGGCTGAATGGAATTGTAAAATCTCGACATTTAGGACAAAGAAAGTTAATGTTTTATTTGTTTATTTATTGATGATTAGATGATGATGAGGAATAATAATGTCAAATTGGGAAGCTTCAAATTTCAGAGGGAAATTACCCATTCGTGTCTTCTCAAGGTCGTTGGCAGTTGGCACTTACAATTGCTTCCTACAAGTCAAGGGGAATGAGTAGAACTTGCTAAGCTTGGAAAAATTGGCCCTTTTTGCTTTGAAATTGAGTGTGTGATGGAGTTTCCTTCCTTTGATCATTTAAATGTTTGGAGGGCATGTGCAAATGTGCGAGTTTGGATCCTTTTCTTACTCCTGCTGCTACTGAAGAGTGATATTGCGTGTTCTGGTTCTGACTACTTGGTTGGTCTTGGAAGCTATGACATTACTGGCCCTGCTGCTGATGTTAACATGATGGGGTATGCTAACACAGGACAGATTGCATCTGGAATTCACTTCAGGCTGCGGGCTCGTGCTTTCATTGTTGCAGAGCCAAATGGTAACTGGGTAGTGTTTGTAAACCTTGATGCTTGCATGGCTTCACAGATTGTGAAGATCAAAGTAATTGAGAGGCTGAAAGCAAGATATGGTGATCTATATACTGAAGAGAATGTGGCCATTAGTGGAATTCACACTCATGCTGGTCCTGGGGGCTATCTCCAATATGTTGTGTACATTGTAACTTCTCTTGGATTTGTGCACCAGTCCTTTGATGTCATTGTCAATGGCATTGAGAAATGCATTATCCAGGCCCATGAAAATCTCCGCCCAGGATCAATATTTATCAATAAGGGAGAACTCTTAGATGGTGGTGTAAATCGCAGTCCCAGTGCTTATCTCAATAATCCTGCCACAGAGAGAAGAAAATATAAGTATAATGTTGATACAGAAATGACTCTTTTAAAATTTGTTGATGATGAATGGGGACCTGTTGGAAGCTTCAATTGGTTTCCTACTCATGGAACTTCAATGAGTCGTACAAACTCATTAATTAGTGGGGATAATAAAGGTGCTGCTGCACGATTTATGGAAGACTGGTTCGAGCAAAAAGATTATGGAAAAACAGATTCTGTTGTATTTGAAGATGATGTCTTGCTCCGAAGAATCTCAAATATAATTCCTAGCCGTCATGATAATCACCATGAATTACTGGAACTTGCTACCTCCTTCCAGTCTCCTCCTGGTAGACCTGTAAGCAAAACTTCGAGTGTTGCTAAACGAGTGAGAAGTGCTCATAGGAAGGTTGACAAGCCTCGATTTGTATCTGCATTCTGTCAATCAAATTGTGGAGATGTTAGTCCAAATGTGCTTGGAGCATTTTGCATAGACACTGGATTACCTTGTGACTTCAATCATAGTACATGTGGAGGGAAGAACGAATTATGCTATAGCCGGGGACCTGGCTACCCAGATGAATTTGAAAGTACCCGCATTATAGGAGAAAGACAATTTAGAAAAGCAGTGGATCTTTTTAATGCTGCAGATGAAGAGATTGAAGGGGGCGTTGATTTTCGACATGCATATATAGATTTCTCCCAACTTGAGGTAACTATTTCTGATCAAGGATATTCTGAGGTTGTAAAGACATGCCCTGCTGCAATGGGGTTTGCATTTGCGGCTGGAACAACAGATGGACCTGGAGCTTTTGATTTTCAGCAAGGTGATGATAAGGGCAATCCTTTCTGGAAGCTGGTCCGTGACATGCTTAAGACTCCAAGCAAGGAACAAACAGATTGTCAACGCCCAAAGCCTATTTTGCTAGATACTGGTGAAATGAAGAAACCATATGATTGGGCTCCTTCAATACTTCCAATTCAGATCCTCCGAATTGGGCAGCTTATCATTCTTAGTGTACCAGGAGAATTCACAACAATGGCCGGGAGGCGTCTTCGTGATGCAGTGAAGACAGTGCTAACTAGTGAAGAATATTTTGAATTTGATGACATTCACATTGTTATAGCAGGGTTAACTAATACTTATTCACAGTACATCACTACATACGAAGAGTACCAGGTGCAAAGATATGAGGGTGCTTCTACGCTATATGGTCCACACACACTCAGTGCATACATTCAGGAGTTTAAGAAACTTGCAGAGGCTCTCGTCTACGGCGAACCAGTAGAACCTGGTCCTCAACCTCCTGATCTCCTGGAGAAGCAAATAAGCTTACTTCCACCTGTTGTGGTGGATGCAACCCCCCTTGGTGTAAATTTTGGGGATGTTTGCACTGATGTACCACGGAACTCCACCTTCAAGAGTGGTGACTTGGTGACAGCTTCGTTCTGGTCTGCATGTCCTCGTAACGACCTTATGACTGAAGGCACCTTTGCACTGGTGGAATTTCTCCAAGAAAAGGATGCTTGGACTCCTGCTTATGATGATGATGATTTCTGCCTGCGCTATAAGTGGTCAAGGCCTTCCAAACTGAGTTCTAGGAGCAAAGCAACCTTGGAATGGAGGATACCACAGAGTGTGGCTCCTGGTGTGTACAGATTAAGACACTTTGGAGCTGCAAAGGGCTTATTTGGATCAATTCATCACTTTACAGGTTCATCCACTGCGTTTGTAGTAGCCTAAAGGGAGGCATGTTGTTTCAGCCGTTACTATATTTGTGATTTGTTTTTCTGAACTTTAGCAGAATCTATTCAATCCTAAAGAAGGATGTTTCACTATGGATCATCATCTGTTACCAGCTCGTCTTTATCCTCTTCCCCACAAATTCTACCGCTAACCGAATATTTGCTTAGTGTTGATATGGCAAAACTTACTCTTTAAAACTTGTTAACTACTTCTAGTTCAATCATTTACAATTTGAAAACTGCAGTTACATTTTTAAATATATTTATCATGAATAATCATCAAATTAGGATTTC >Glyma.18g068800.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.18g068800.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.18g068800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g068800.1.p locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGAGTTTCCTTCCTTTGATCATTTAAATGTTTGGAGGGCATGTGCAAATGTGCGAGTTTGGATCCTTTTCTTACTCCTGCTGCTACTGAAGAGTGATATTGCGTGTTCTGGTTCTGACTACTTGGTTGGTCTTGGAAGCTATGACATTACTGGCCCTGCTGCTGATGTTAACATGATGGGGTATGCTAACACAGGACAGATTGCATCTGGAATTCACTTCAGGCTGCGGGCTCGTGCTTTCATTGTTGCAGAGCCAAATGGTAACTGGGTAGTGTTTGTAAACCTTGATGCTTGCATGGCTTCACAGATTGTGAAGATCAAAGTAATTGAGAGGCTGAAAGCAAGATATGGTGATCTATATACTGAAGAGAATGTGGCCATTAGTGGAATTCACACTCATGCTGGTCCTGGGGGCTATCTCCAATATGTTGTGTACATTGTAACTTCTCTTGGATTTGTGCACCAGTCCTTTGATGTCATTGTCAATGGCATTGAGAAATGCATTATCCAGGCCCATGAAAATCTCCGCCCAGGATCAATATTTATCAATAAGGGAGAACTCTTAGATGGTGGTGTAAATCGCAGTCCCAGTGCTTATCTCAATAATCCTGCCACAGAGAGAAGAAAATATAAGTATAATGTTGATACAGAAATGACTCTTTTAAAATTTGTTGATGATGAATGGGGACCTGTTGGAAGCTTCAATTGGTTTCCTACTCATGGAACTTCAATGAGTCGTACAAACTCATTAATTAGTGGGGATAATAAAGGTGCTGCTGCACGATTTATGGAAGACTGGTTCGAGCAAAAAGATTATGGAAAAACAGATTCTGTTGTATTTGAAGATGATGTCTTGCTCCGAAGAATCTCAAATATAATTCCTAGCCGTCATGATAATCACCATGAATTACTGGAACTTGCTACCTCCTTCCAGTCTCCTCCTGGTAGACCTGTAAGCAAAACTTCGAGTGTTGCTAAACGAGTGAGAAGTGCTCATAGGAAGGTTGACAAGCCTCGATTTGTATCTGCATTCTGTCAATCAAATTGTGGAGATGTTAGTCCAAATGTGCTTGGAGCATTTTGCATAGACACTGGATTACCTTGTGACTTCAATCATAGTACATGTGGAGGGAAGAACGAATTATGCTATAGCCGGGGACCTGGCTACCCAGATGAATTTGAAAGTACCCGCATTATAGGAGAAAGACAATTTAGAAAAGCAGTGGATCTTTTTAATGCTGCAGATGAAGAGATTGAAGGGGGCGTTGATTTTCGACATGCATATATAGATTTCTCCCAACTTGAGGTAACTATTTCTGATCAAGGATATTCTGAGGTTGTAAAGACATGCCCTGCTGCAATGGGGTTTGCATTTGCGGCTGGAACAACAGATGGACCTGGAGCTTTTGATTTTCAGCAAGGTGATGATAAGGGCAATCCTTTCTGGAAGCTGGTCCGTGACATGCTTAAGACTCCAAGCAAGGAACAAACAGATTGTCAACGCCCAAAGCCTATTTTGCTAGATACTGGTGAAATGAAGAAACCATATGATTGGGCTCCTTCAATACTTCCAATTCAGATCCTCCGAATTGGGCAGCTTATCATTCTTAGTGTACCAGGAGAATTCACAACAATGGCCGGGAGGCGTCTTCGTGATGCAGTGAAGACAGTGCTAACTAGTGAAGAATATTTTGAATTTGATGACATTCACATTGTTATAGCAGGGTTAACTAATACTTATTCACAGTACATCACTACATACGAAGAGTACCAGGTGCAAAGATATGAGGGTGCTTCTACGCTATATGGTCCACACACACTCAGTGCATACATTCAGGAGTTTAAGAAACTTGCAGAGGCTCTCGTCTACGGCGAACCAGTAGAACCTGGTCCTCAACCTCCTGATCTCCTGGAGAAGCAAATAAGCTTACTTCCACCTGTTGTGGTGGATGCAACCCCCCTTGGTGTAAATTTTGGGGATGTTTGCACTGATGTACCACGGAACTCCACCTTCAAGAGTGGTGACTTGGTGACAGCTTCGTTCTGGTCTGCATGTCCTCGTAACGACCTTATGACTGAAGGCACCTTTGCACTGGTGGAATTTCTCCAAGAAAAGGATGCTTGGACTCCTGCTTATGATGATGATGATTTCTGCCTGCGCTATAAGTGGTCAAGGCCTTCCAAACTGAGTTCTAGGAGCAAAGCAACCTTGGAATGGAGGATACCACAGAGTGTGGCTCCTGGTGTGTACAGATTAAGACACTTTGGAGCTGCAAAGGGCTTATTTGGATCAATTCATCACTTTACAGGTTCATCCACTGCGTTTGTAGTAGCCTAA >Glyma.18g068800.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.18g068800.2.p locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.18g068800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g068800.1 locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MEFPSFDHLNVWRACANVRVWILFLLLLLLKSDIACSGSDYLVGLGSYDITGPAADVNMMGYANTGQIASGIHFRLRARAFIVAEPNGNWVVFVNLDACMASQIVKIKVIERLKARYGDLYTEENVAISGIHTHAGPGGYLQYVVYIVTSLGFVHQSFDVIVNGIEKCIIQAHENLRPGSIFINKGELLDGGVNRSPSAYLNNPATERRKYKYNVDTEMTLLKFVDDEWGPVGSFNWFPTHGTSMSRTNSLISGDNKGAAARFMEDWFEQKDYGKTDSVVFEDDVLLRRISNIIPSRHDNHHELLELATSFQSPPGRPVSKTSSVAKRVRSAHRKVDKPRFVSAFCQSNCGDVSPNVLGAFCIDTGLPCDFNHSTCGGKNELCYSRGPGYPDEFESTRIIGERQFRKAVDLFNAADEEIEGGVDFRHAYIDFSQLEVTISDQGYSEVVKTCPAAMGFAFAAGTTDGPGAFDFQQGDDKGNPFWKLVRDMLKTPSKEQTDCQRPKPILLDTGEMKKPYDWAPSILPIQILRIGQLIILSVPGEFTTMAGRRLRDAVKTVLTSEEYFEFDDIHIVIAGLTNTYSQYITTYEEYQVQRYEGASTLYGPHTLSAYIQEFKKLAEALVYGEPVEPGPQPPDLLEKQISLLPPVVVDATPLGVNFGDVCTDVPRNSTFKSGDLVTASFWSACPRNDLMTEGTFALVEFLQEKDAWTPAYDDDDFCLRYKWSRPSKLSSRSKATLEWRIPQSVAPGVYRLRHFGAAKGLFGSIHHFTGSSTAFVVA* >Glyma.18g068800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g068800.2 locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MMGYANTGQIASGIHFRLRARAFIVAEPNGNWVVFVNLDACMASQIVKIKVIERLKARYGDLYTEENVAISGIHTHAGPGGYLQYVVYIVTSLGFVHQSFDVIVNGIEKCIIQAHENLRPGSIFINKGELLDGGVNRSPSAYLNNPATERRKYKYNVDTEMTLLKFVDDEWGPVGSFNWFPTHGTSMSRTNSLISGDNKGAAARFMEDWFEQKDYGKTDSVVFEDDVLLRRISNIIPSRHDNHHELLELATSFQSPPGRPVSKTSSVAKRVRSAHRKVDKPRFVSAFCQSNCGDVSPNVLGAFCIDTGLPCDFNHSTCGGKNELCYSRGPGYPDEFESTRIIGERQFRKAVDLFNAADEEIEGGVDFRHAYIDFSQLEVTISDQGYSEVVKTCPAAMGFAFAAGTTDGPGAFDFQQGDDKGNPFWKLVRDMLKTPSKEQTDCQRPKPILLDTGEMKKPYDWAPSILPIQILRIGQLIILSVPGEFTTMAGRRLRDAVKTVLTSEEYFEFDDIHIVIAGLTNTYSQYITTYEEYQVQRYEGASTLYGPHTLSAYIQEFKKLAEALVYGEPVEPGPQPPDLLEKQISLLPPVVVDATPLGVNFGDVCTDVPRNSTFKSGDLVTASFWSACPRNDLMTEGTFALVEFLQEKDAWTPAYDDDDFCLRYKWSRPSKLSSRSKATLEWRIPQSVAPGVYRLRHFGAAKGLFGSIHHFTGSSTAFVVA* >Glyma.18g068800.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g068800.3 locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MEFPSFDHLNVWRACANVRVWILFLLLLLLKSDIACSGSDYLVGLGSYDITGPAADVNMMGYANTGQIASGIHFRLRARAFIVAEPNGNWVVFVNLDACMASQIVKIKVIERLKARYGDLYTEENVAISGIHTHAGPGGYLQYVVYIVTSLGFVHQSFDVIVNGIEKCIIQAHENLRPGSIFINKGELLDGGVNRSPSAYLNNPATERRKYKYNVDTEMTLLKFVDDEWGPVGSFNWFPTHGTSMSRTNSLISGDNKGAAARFMEDWFEQKDYGKTDSVVFEDDVLLRRISNIIPSRHDNHHELLELATSFQSPPGRPVSKTSSVAKRVRSAHRKVDKPRFVSAFCQSNCGDVSPNVLGAFCIDTGLPCDFNHSTCGGKNELCYSRGPGYPDEFESTRIIGERQFRKAVDLFNAADEEIEGGVDFRHAYIDFSQLEVTISDQGYSEVVKTCPAAMGFAFAAGTTDGPGAFDFQQGDDKGNPFWKLVRDMLKTPSKEQTDCQRPKPILLDTGEMKKPYDWAPSILPIQILRIGQLIILSVPGEFTTMAGRRLRDAVKTVLTSEEYFEFDDIHIVIAGLTNTYSQYITTYEEYQVQRYEGASTLYGPHTLSAYIQEFKKLAEALVYGEPVEPGPQPPDLLEKQISLLPPVVVDATPLGVNFGDVCTDVPRNSTFKSGDLVTASFWSACPRNDLMTEGTFALVEFLQEKDAWTPAYDDDDFCLRYKWSRPSKLSSRSKATLEWRIPQSVAPGVYRLRHFGAAKGLFGSIHHFTGSSTAFVVA* >Glyma.18g068800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g068800.4 locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MEFPSFDHLNVWRACANVRVWILFLLLLLLKSDIACSGSDYLVGLGSYDITGPAADVNMMGYANTGQIASGIHFRLRARAFIVAEPNGNWVVFVNLDACMASQIVKIKVIERLKARYGDLYTEENVAISGIHTHAGPGGYLQYVVYIVTSLGFVHQSFDVIVNGIEKCIIQAHENLRPGSIFINKGELLDGGVNRSPSAYLNNPATERRKYKYNVDTEMTLLKFVDDEWGPVGSFNWFPTHGTSMSRTNSLISGDNKGAAARFMEDWFEQKDYGKTDSVVFEDDVLLRRISNIIPSRHDNHHELLELATSFQSPPGRPVSKTSSVAKRVRSAHRKVDKPRFVSAFCQSNCGDVSPNVLGAFCIDTGLPCDFNHSTCGGKNELCYSRGPGYPDEFESTRIIGERQFRKAVDLFNAADEEIEGGVDFRHAYIDFSQLEVTISDQGYSEVVKTCPAAMGFAFAAGTTDGPGAFDFQQGDDKGNPFWKLVRDMLKTPSKEQTDCQRPKPILLDTGEMKKPYDWAPSILPIQILRIGQLIILSVPGGTILSPSL* >Glyma.18g068800.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.18g068800.5 locus=Glyma.18g068800 ID=Glyma.18g068800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MEFPSFDHLNVWRACANVRVWILFLLLLLLKSDIACSGSDYLVGLGSYDITGPAADVNMMGYANTGQIASGIHFRLRARAFIVAEPNGNWVVFVNLDACMASQIVKIKVIERLKARYGDLYTEENVAISGIHTHAGPGGYLQYVVYIVTSLGFVHQSFDVIVNGIEKCIIQAHENLRPGSIFINKGELLDGGVNRSPSAYLNNPATERRKYKYNVDTEMTLLKFVDDEWGPVGSFNWFPTHGTSMSRTNSLISGDNKGAAARFMEDWFEQKDYGKTDSVVFEDDVLLRRISNIIPSRHDNHHELLELATSFQSPPGRPVSKTSSVAKRVRSAHRKVDKPRFVSAFCQSNCGDVSPNVLGAFCIDTGLPCDFNHSTCGGKNELCYSRGPGYPDEFESTRIIGERQFRKAVDLFNAADEEIEGGVDFRHAYIDFSQLEVTISDQGYSEVVKTCPAAMGFAFAAGTTDGPGAFDFQQGDDKGNPFWKLVRDMLKTPSKEQTDCQRPKPILLDTGEMKKPYDWAPSILPIQILRIGQLIILSVPGGTILSPSL*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||