Glyma.17g204000

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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.17g204000

Feature Type:	gene_model
Chromosome:	Gm17
Start:	32873557
stop:	32920344
Source:	JGI
Version:	Wm82.a2.v1
High confidence:	yes

A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.17g204000

Database ID	Annotation Type	Annotation Description	Annotation Source	Match Score	Evidence Code
AT2G25660.1	AT	embryo defective 2410	JGI	N/A	IEA
PF04357	PFAM	Family of unknown function (DUF490)	JGI	N/A	IEA

Expression Patterns of Glyma.17g204000

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology


Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection	Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene families from PhyloGenes.

Gene model name correspondences to Glyma.17g204000 Gene Call Version Wm82.a2.v1

Corresponding Name	Annotation Version	Evidence	Comments
Glyma17g30240	Wm82.a1.v1.1	IGC	As supplied by JGI

Transcripts of Glyma.17g204000

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.17g204000.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g204000 ID=Glyma.17g204000.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.17g204000

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.17g204000.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g204000.1.p locus=Glyma.17g204000 ID=Glyma.17g204000.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g204000.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g204000.2.p locus=Glyma.17g204000 ID=Glyma.17g204000.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATGAGTCTGAAAAACCACACCTTGTTTTTCTGGACAAGTCTGCATGGTTCTTTGGAAAGCGGCACCACCGGCAAGAGGAACCCTTTTCGTTTGGACAAGAGGAAGTTGTTGCTGCAGAAGAATGGTCTCTGCAGTTGCACGTGCTGCGTCTCCCCAAAACGGTGTCGTTTGGTAAGCCAAGCGTTACGGTTTTCATCTTTTTCGGGGCAAAAAAACGTGGGGTTATTGGGAAAAGACGTGATTTTGAGAAGTGAGTCGAGGTTAGAATGTGCCAGGGAACCTTATTTTAGGGGTGAGTCATTGGTTAGTTATTTGACACCGTTGTGGGAAGAGGGGCTTTTTCTGATAAGGGCTTCTGTTTACACTGCTGTTATTGCTGGGCAATCAGTGAGCACATTCAGCGTGACCTGTGTTTGGCAAGGTTCGGCGGATTTCGCCGTTGAGCATCACGTGGAGTCGTGCTCGTTTGGGCCTCACAAGGAGGAGTTTTCGTGTGGTGAGGCTCCCACGGTTAAGCTCCGCCTCCGTCCCTTTGTGAGCTTGAGGAGGGGGAAGTTGGTGATTGATGCAGTTTTGTTGCATCCAAGTTTCTTGGTGGTGCAGAGGAAGGACTTTACTTGGTTGGGAATACCCTTCAATGAAGGAGGCAGGGAGAGAAGTTTCTCGGCTGAAGAGGGGATAGATTATCGCACGAGAACTAGGAGGCTTGCACGAGAGGAAGCCTTTGCTCAGTGGGAAAGAGAAAGGGATGGTGCAGCTAGGGAAGCTGCTGAGGTGGGGTACTTTGTTTCTGAGCGGAGTTGTGGTCTATCCAAAGGTGATGATGGTTTAAAGGAGATTGAAACTCGATCGTTGGAGTCAACTGAGTCTGCGCCCTTTTTCTGTATGAATGATGGGAAGCACGATCATTGGTTGATGGACAAAGGTGTTAATTATGATACGAAACACACAGCTTTGGAAAAATCATTTGGAGTAAGATTTCCTGGATTGGGACTTCGATTTTGGTCCAGAGTAATATCAGGGCTTAGGAAACACAAGTTGAATAGGAAGGCTAATGGGAGTAACATCTTTGCATCTGGTGGTGCTATCAAAAAGATAATATTGGAACGTAGTGCATCAGCTGCTCATGCATACTTTTGTGATCAACCACAATGGAAGTTTGAGGAGCCTTCATCACCTTCTGAAAGTTATGGTTTTATGAGTCATGATATGCATTTGGTGAAAAGTGAGGTTGACAGAAATACAATATCTGTTATTGTTAGTGATGAAAATAGAAGTGATGATAACCAAAGTGGAACACAATTCAAAGATCTGGGATTCCAGTCCCCCTTAGTAAATGAAAATGTTAGCAGTCAATCAGATTATTTAAAGTTTGTCTGTGATTCAACTTTACGGACAAGAGAGAGTGAAATTGAAAATTTGCAATCTAGTGATGATGTTGCAAAACCTGCTAATCCAAATAGTAGTACAGTGAAAAATGAGGAGTTTGTACCATATGTTGCTGAGAATCAAATTGATGATAATGATAGTTCATCAGGGGGCCAACAGGGTTTGCCATCTGAAGATTTGGGTATTGTGAAGCCTGAGCCTCAGTTGGCAACTTATTTTCAAAATCCATTTGAGCACTTGCTCGTGAAATTTGGCTTAACCTCATTTTTAAAAAATATTGAAGAGTTGATATCTCATTTTCTTTCTGGTTCCATTGAAATGTTGAAGTCTGATGTGGGTCTGAAAGTTGAAGATATTGTTTCAGAACATGTTGATGGGGTAGATTTTGTGCAGTCTGAAGGCGTTACGAAGACTCTGCCTGTTACGCTGGATTCAGTTCATTTCAGAGGTGCAACACTGATGCTACTTGCATATGGTGACAAGGAAGTTAGGGAGATGGAGAATGTCAATGGAAATGTAAAGTTCCAAAACCACTATAGTCGCATACATGTGGATCTGAGTGGAAATTGTAATACCTGGAGATCAGATATTATATCTGAAGATGGAGGCTGGTTGTCTGCCAATGTTTTTGTTGACACTATTGAGCAGAATTGGCATGCTAATTTAAAAATTGATAATCTTTTTGTCCCGCTGTTTGAAAGGATCCTTGAAATTCCAATTACATGGTCTAAAGGGTGGGCTAGTGGCGAGGTTCACTTGTGCATGTCAAAGGGGGAGACTTTTCCAAATTTTCATGGACAACTTGATGTTAGAGGGTTGGATTTCCAACTGTTGGATGCTCCATCATCTTTTTCTAACATATCAGCGAGTTTATGTTTTCGTGGTCAAAGAATATTTTTACACAATGCAAGTGGCTGGTTTGGTAGTGTTCCTTTAGAAGCATCAGGAGACTTTGGCATTCATCCCGAAGAAGGAGAGTTTCATCTTATGTGTCAGGTTCCTGGTGTTGAAGTGAATGCTTTGATGAGAACTTTCAAGATGAAACCTCTTCTCTTCCCGCTAGCTGGATCAGTAACTGCTCTATTTAATTGTCAAGGCCCACTGGATACTCCTGTATTTGTTGGCACTGGAATGGTTTCTAGGACATTCTCTTATTTACAGACTGAGAGCACTGCATCTGTAGCATCTGAAGCACTTGCTACGAGTAAGGAAGCTGGAGCGCTGGCAGCATTTGATCGTGTTCCATTCTCATATGTATCTGCTAATTTCACTTTCAACACTGATAACTGTGTTGCTGATTTATATGGAATTAGGGCATGCCTTGTAGATGGAGGTGAAATTCGTGGGGCTGGGAATGCATGGATATGCCCAGAGCTGGATGCCTCTGGTAGAACTGATGAAAGTCTTGCAGTGGAGTTTGTTGGGCCACTACAGCCCAGTAGCGAAGATGGTCTGCAAAGTGGGAAACTGTTGTCTATTTCCCTTCAGAAAGGGCAATTGAGGGCTAACATTTGTTTTCAACCATTTCATTCTGCTAACTTGGAGGTACGGCATTTTCCACTTGATGAATTAGAGCTCGCTTCTCTCAGGGGAACTATACAGAGAGCAGAAATCCAGCTTAATCTTCAAAAAAGAAGAGGACATGGAGTCCTGTCTGTACTTCAGCCAAAATTCAGTGGCGTGCTCGGCGAAGCCCTAGATGTGGCAGCTAGGTGGAGTGGAGATGTTATCACTATTGAAAAAACAGTTTTGCAACAAAACTACAGTTGTTATGAACTTCAAGGCGAATATGTGTTGCCCGGCACCCGAGATCGTAATCCCATTGACAAAGGTGGCCTTATAAAAAGACTAATGTCTGGTCATATTGGTAATGCTATATCCTCGATGGGCAGGTGGAGAATGAAACTTGAAGTTCGTAGAGCTGAGGTTGCTGAGATGCTTCCCCTTGCTAGGCTTCTTTCTCGAAGTATGGATCCTGCTGTTCAGTCAAGATCTAAGGATTTCTTCATGCAAAGTTTGCAGTCAGTAGGATTATATACCGAAAGCCTTCAACAATTGCTTGAGACAGTGAGGGGGCTTCATGCTCCATCAAATGATGTTGTTCTTGAAGACTTAAGTCTGCCTGGTTTATCTGAACTCAAAGGTCACTGGCATGGATCTCTTGACGCTAGTGGTGGGGGAAATGGAGACACCCTGGCAGAATTTGACTTTCATGGGGAGGACTGGGAATGGGGAGACTACAAAACTCAGCGTGTGTTGGCAGTTGGTGCTTACAGTAATGATGATGGTATGTACCTGGAGAGAATTTTTATCCAGAAGGATAATGCCACCATCCATGCAGATGGAACATTGCTAGGACCTAAAACCAACCTCCATTTTGCGGTATTAAATTTTCCTGTTAGTCTGGTCCCAACTGTAGTCCAGATCATTGAATCTACAGCAATGGATGTTGTCCATTCTCTGCGACAGTTGTTGGCACCCATTAAGGGTATATTGCATATGGAAGGAGATCTTAGAGGAAGTTTAGCAAAACCAGAATGTGATGTGCAAGTAAGGCTCCTGGATGGTTCCGTTGGTGGTGTTGATCTTGGAAGAGCCGAAGTTGTTGCTTCTCTAACCTCAACCAGTCGTTTTCTATTCAATGCAAAATTTGAGCCTACAACCCAAAATGGTCATGTACTCATTCAGGGTAGCATTCCTGTTGCATTTGTGCAAAATAACACGTTACAGGAGGATGTAGAATTAGATAAGAGTCAGGTTACTTGGGTTCCTGATTGGGTGAAGGAGAAGAATAGAGGGACCGTTGATGATGCCAGCGACAAAAAAGTTTCTAGAGATAGAAACGAAGAAGGTTGGAATACTCAATTAGCAGAAAGCCTTAAAGGTTTAAATTGGCAAATTTTAGATGATGGAGAAGTCAGGATTGATGCTGATATAAAAGATGGGGGAATGACATTGGTTACAGCTTTATCTCCTCATGTGAATTGGCTTCATGGCAATGCGGATTTGAAGCTAGAGGTCAGAGGTACAGTTGATCAACCAGTACTTAATGGACACGCATCTTTCCACAGGGCATCTATTTCTTCACCAGTGCTCCAAAAACCACTAACCAACTTTGGTGGAAATGTTCATGTGCAATCAAACAGGTTATGCATCACCTCACTGGAGAGTAGGGTAAGCAGAAAAGGAAAGCTTCTTGTAAAAGGGAACCTGCCACTCAGAACTAGTGAAGCAGCCCCAGATGACAAGATTGAATTGAAGTGCGAAGTTCTGGAAGTACGGGCACAAAAAGTATTAAGTGGTCAGGTTGATTCTCAGTTGCAAATAACTGGTTCAATATTGCAACCAAACATATCTGGGAATATCAAAATAAGTCAGGGAGAAGCATATTTGCCTCATGACAGAGGTGGTACTCCTGCTTCTAATAGATTTCCATCAAATCAGTCTGTGCTTCCTACTGCTGGTGTTAGTCGCATGTTTGCTTCGAGATATGTTTCAAGATTTCTCAACTCAGAATCTGCTTCTTCAAGGGAAAAAGTATCTCAATCCTCTGGCTCTGTGCCAGTTAATAAGTCAACTCAGGTTGAAAAGCAGATGGAGCAAGTGCAGAT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Predicted protein sequences of Glyma.17g204000

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.17g204000.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g204000.1 locus=Glyma.17g204000 ID=Glyma.17g204000.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g204000.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g204000.2 locus=Glyma.17g204000 ID=Glyma.17g204000.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA

U.S. Public Domain