Glyma.17g191900

SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

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Warning: get_headers(https://bar.utoronto.ca/api/efp_image/efp_soybean/soybean_severin/Absolute/Glyma.17g191900): Failed to open stream: php_network_getaddresses: getaddrinfo for bar.utoronto.ca failed: Temporary failure in name resolution in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1020

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Report for Sequence Feature Glyma.17g191900

Feature Type:	gene_model
Chromosome:	Gm17
Start:	27318916
stop:	27345167
Source:	JGI
Version:	Wm82.a2.v1
High confidence:	yes

A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.17g191900

Database ID	Annotation Type	Annotation Description	Annotation Source	Match Score	Evidence Code
AT1G58350.1	AT	Putative serine esterase family protein	JGI	N/A	IEA
GO:0044255	GO-bp	cellular lipid metabolic process	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0052689	GO-mf	carboxylic ester hydrolase activity	EnsemblGenomes	N/A	IEA
KOG2205	KOG	Uncharacterized conserved protein	JGI	N/A	IEA
PTHR12482	Panther	UNCHARACTERIZED	JGI	N/A	IEA
PF05057	PFAM	Putative serine esterase (DUF676)	JGI	N/A	IEA
PF12394	PFAM	Protein of unknown function (DUF3657)	JGI	N/A	IEA

Expression Patterns of Glyma.17g191900

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.17g191900 not represented in the dataset	Glyma.17g191900 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection	Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.

Gene information in GlycineMine developed by LIS.

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Gene families from PhyloGenes.

Gene model name correspondences to Glyma.17g191900 Gene Call Version Wm82.a2.v1

Corresponding Name	Annotation Version	Evidence	Comments
Glyma17g26573	Wm82.a1.v1.1	IGC	As supplied by JGI

Transcripts of Glyma.17g191900

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.17g191900.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g191900.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g191900.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g191900.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.17g191900

Limit To All Plant Sequences

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>Glyma.17g191900.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g191900.4.p locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g191900.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g191900.5.p locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g191900.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g191900.6.p locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g191900.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g191900.7.p locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g191900.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g191900.8.p locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.17g191900

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.17g191900.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g191900.1 locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.17g191900.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g191900.2 locus=Glyma.17g191900 ID=Glyma.17g191900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA

U.S. Public Domain