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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
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AT5G63420.1 | AT | RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein | JGI | N/A | IEA |
GO:0016787 | GO-mf | hydrolase activity | JGI | N/A | IEA |
KOG1137 | KOG | mRNA cleavage and polyadenylation factor II complex, BRR5 (CPSF subunit) | JGI | N/A | IEA |
PTHR11203 | Panther | CLEAVAGE AND POLYADENYLATION SPECIFICITY FACTOR | JGI | N/A | IEA |
PTHR11203:SF24 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00753 | PFAM | Metallo-beta-lactamase superfamily | JGI | N/A | IEA |
PF07521 | PFAM | RNA-metabolising metallo-beta-lactamase | JGI | N/A | IEA |
PF10545 | PFAM | Alcohol dehydrogenase transcription factor Myb/SANT-like | JGI | N/A | IEA |
GN7V-67224 | SoyCyc9-rxn | β-lactamase | Plant Metabolic Network | ISS |
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Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
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Glyma17g13780 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.17g128500.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g128500 ID=Glyma.17g128500.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.17g128500.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g128500 ID=Glyma.17g128500.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 AAGTATTTTGATCTTACTGTATATTTTCTAGTACTCTTTTTTTCCCTCTACCATTTAATCTAATTCATTATTCTTTTATTTTAAAACAAATGTGTTTTGTCATTTCCTTACATGAGTTACGTCTACTCTTTATTTAACTTTGACTTGGTCCATCAGGTCATTCCAGCATTAGATTCTCATACACCAATTTTTGCATCATCCTTTACAATGGAGCTTATAAGGAAACGTTTGAAGGATCATGGTATTTTTGTTCCATCCCGACTCAAAGTATTTAGAACGAGGAAGAAGTTTATGGCTGGGCCATTTGAGGTAGAGCCTATCACAGTGACTCATTCTATTCCTGATTGCTGTGGACTAGTGCTCCGTTGTTCTGATGGTACCATTCTTCACACTGGGGATTGGAAGATTGATGAAACGCCATTAGATGGTAGAGTTTTTGATCGTGAAGCTCTAGAGGAACTCTCAAAAGAAGGAGTCACATTGATGATGAGTGATTCGACAAATGTACTCTCACCTGGAAGGACAACCAGTGAATCTGTTGTGGCAGATGCATTATTAAGGAATATTTCAGCTGCTAAAGGAAGGGTTATAACGACCCAGTTTGCATCCAATATACATCGTCTTGGAAGTGTGAAAGCTGCTGCTGATTTAACTGGTAGAAAGTTGGTATTTGTTGGCATGTCGTTAAGAACATATTTAGATGCAGCTTGGAAGGATGGAAAGTCTCCAATTGATCCATCTACTCTGGTGAAAGCGGAAGATATTGATGCTTATGCGCCAAAGGATTTGCTTATTGTGACAACGGGATCTCAAGCAGAGCCACGTGCTGCCTTAAATCTAGCATCTTTTGGAAGTAGTCATTCTTTCAAGCTGACAAAGGAAGATACTGTTTTGTATTCAGCTAAGGTTATACCTGGTAACGAGTCTCGTGTTATGGAAATGCTAAACCGCATATCAGAGATTGGATCAACTATAGTTATGGGGAAGAATGAATGTCTGCACACATCTGGTCATGGGTATCGTGGAGAATTAGAGGAAGTACTTAGAATTGTGAAGCCACAGCATTTTCTACCCATACATGGAGAACTCTTGTTCTTGAAGGAGCACGAATTACTTGGAAAATCAACTGGCATTCGGCACACAACTGTTATTAAGAATGGAGAGATGCTTGGAGTTTCTCATTTGAGAAATAGAAGAGTCCTTTCTAATGGTTTTATTTCACTTGGAAAAGAGAATTTGCAGTTGATGTATAGTGATGGCGAGAAAGCGTTTGGTACATCAAGTGACCTCTTTATTGATGAAAGATTGAAAATTGCATTAGATGGCATCATAGTGGTTAACATGGAAATATTTCGCCCTCAAAATTTAGACAGTCCAGTTGAGAACACCTTAAAAGGAAAAATAAGAATTACCACCAGATGCCTGTGGCTTGACAAGGGGAAGCTGTTGGATGCTCTCCATAAAGCTGCTCATGCTGCTCTTGCAAGCTGCCCTGTAAGCTGTCCACTGGCTCATATGGAAAAAATTGTGTCTGAGATGTTGAGAAAAATGGTGAGGAAGTACAGTGGCAAACGGCCTGAAGTTATTGCCATTGCCATAGAAAATCCTGCAGCTGTTCTTGCTAATGAGATAAACACAAAGTTGTCTGGAAAATTAAATGTGGATGGGATGTCGGCATTGAGAAAAGTGGTGGATGGACATGAGAAAGAGAATCAGAGAACCGAAATGCAAATAAGAGATCGTATTGATGTAGGTGGTCTACTACCTACAAAAGACAATGCTATCTCAAGTGGAGCTGAGGATGGCTTGTCTGATGCGGAGGATCCAAATGATTATTTTAAACCATTTGTTGAATCCTCTCCAGTTGAGAAGTCAATTAAAACTAACAATGGTTATGTTCCACGAAAGGAGAAGTCATCCCCATTGAAGGATGACTGTTCTGAAGACACTGAAGAATGCAATTCTGTAAATACATCAGATTCTGAACCCAAATCTTCAAAATCAGCAAAGAGAAATAAATGGAAACATGAAGAAGTTAAGAAGCTGATTGATATGCGTGGGGAACTGAATGACAGATTTCAAGTTGTGAAGGGAAGGATGGCCCTCTGGGAAGAAATATCTCAGAATTTGTTGGCTAATGGGATCAGCAGAAGTCCTGGGCAGTGTAAATCTCTGTGGACTTCTTTGTTACAGAAATATGAGcaggaggtgaagaatgaaaagaagaacaagaaaaaATGGCCGTATTTTGAGGACATGGAAAGGATTCTAGCTGATAACAAGACACTAGAAACAAAATGATTATAAAGGTGATGCACCAGACAAGAAAAATTTGCAAGAGTTTTCTGCATTATGATTGGTAATATGTCTGAGCATGGTCGCTGGGAAGGTAATCCATCAGTTGCATTATTCTTGCATCTTGAACTCCTTCATTGAATATCCATAGTTTTGTGAGGAGATGGACAGCGTTAAATGCATTGACATTTTACATTAACACAAGTTAATGAGGGAGACTATGCTGGTTCAGGGGATGATTTATCCCCTTCCTCAAAAGGTAACTACCTACCCAGTGACAGCATTTTAGGGTCATTTTGATGATATTGATTGACATATTGAACAACTATTTTAATGATAGTGAAGGGTTAATATAATGTAACGAGACCAAAGTACATTTTTTCTGTTACTTATAATTAATTTCATTATTTTGTTAGTGGCGCGTTTGGTATGAAACAACGTTGCATTTTGCATATTG >Glyma.17g128500.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g128500 ID=Glyma.17g128500.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.17g128500.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.17g128500 ID=Glyma.17g128500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||