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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.17g057800

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm17
Start:4374362
stop:4392289
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.17g057800
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G57110.1AT ACA8,AT-ACA8 JGI N/AIEA
3.6.3.8EC JGI N/AIEA
GO:0000166GO-mf nucleotide binding JGI N/AIEA
GO:0005516GO-mf calmodulin binding JGI N/AIEA
GO:0046872GO-mf metal ion binding JGI N/AIEA
K01537KEGG Enzymes with EC numbers JGI N/AIEA
PTHR24093PantherFam CATION TRANSPORTING ATPASE JGI N/AIEA
PF00122Pfam E1-E2 ATPase JGI N/AIEA
PF00689Pfam Cation transporting ATPase, C-terminus JGI N/AIEA
PF00690Pfam Cation transporter/ATPase, N-terminus JGI N/AIEA
PF00702Pfam haloacid dehalogenase-like hydrolase JGI N/AIEA
PF12515Pfam Ca2+-ATPase N terminal autoinhibitory domain JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.17g057800 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma17g06520 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.17g057800
>Glyma.17g057800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g057800.1.p locus=Glyma.17g057800 id=Glyma.17g057800.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.17g057800.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g057800.6.p locus=Glyma.17g057800 id=Glyma.17g057800.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.17g057800.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g057800.7.p locus=Glyma.17g057800 id=Glyma.17g057800.7.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.17g057800
>Glyma.17g057800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g057800.1 locus=Glyma.17g057800 id=Glyma.17g057800.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.17g057800.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g057800.6 locus=Glyma.17g057800 id=Glyma.17g057800.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.17g057800.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g057800.7 locus=Glyma.17g057800 id=Glyma.17g057800.7.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MSFSKGSPGSQTPRDLEAGSPASFSADFDDGDVSADPFDVTRTKNAPVQRLRRWRQAALVLNASRRFRYTLDLKKEEEKKRVLRIVIVHTRAIQAAYRFKEAGQMNGIVKSPSSSTGEFSVGQEQLSSISRDRDATALQENGGVVGLSHLLKTNLEKGIQSDDADLLKRRSAFGSNNYPRKSGRSFLMFMWDACKDLTLIILMVAAMASLALGIKSEGIKEGWYDGGSIAFAVILVILVTAISDYKQSLQFQDLNEHKRNIHLEVIRDGRRVEISIYDVVVGDVIPLNIGNQVPADGVLITGHSLAIDESSMTGESKIVEKNSSDPFLISGCKVADGSGTMLVTAVGINTEWGLLMASISEDNGEETPLQVRLNGLATLIGIVGLSVAVVVLMVLLARYFSGHTRNPDGSVQFIAGKTKVGDAIDGVIKIFTIAVTIVVVAVPEGLPLAVTLTLAYSMKKMMADKALVRRLSACETMGSATTICSDKTGTLTMNQMTVVEAWIGGGKKIADPHDVSQFSRMLCSLLIEGVAQNTNGSVYIPEGGNDVEISGSPTEKAILEWGVKLGMNFDTARSKSSIIHVFPFNSDKKRGGVATWVSDSEVHIHWKGAAEIVLACCTRYFDANDQLVEMDEAKMSTFKKAIEDMAADSLRCVAIAYRSYEMKNVPTSEEELAHWSLPEDDLVLLAIIGLKDPCRPGVKDAVQLCQKAGVEVKMVTGDNVKTARAIAVECGILGSISDATEPIIIEGKRFRALTDEGRADIVEKILVMGRSSPNDKLLLVQALRRKGHVVAVTGDGTNDAPALHEADIGLAMGIQGTEVAKESSDIIILDDNFASVVKVVKWGRSVYANIQKFIQFQLTVNIAALAINVVAAFTTGDIPLNTVQLLWVNLIMDTLGALALATEPPTDSLMDQSPKGRREPLVSNIMWRNLLIQAMYQVSVLLILNFRGVSLLALRDEPNRPAIKVKNSLIFNAFVLCQVFNEFNARKPDKFNIFKGVTRNYLFMGIVGITVVLQIVIIEYLGKFTKTAKLNWKQWLISVIIAFISWPLAVVGKLIPVPEAELSNFFRKCLRRQN*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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