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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.17g006100

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm17
Start:556273
stop:561048
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.17g006100
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G16370.1AT ATOPT3,OPT3 JGI N/AIEA
GO:0055085GO-bp transmembrane transport JGI N/AIEA
PTHR22601PantherFam ISP4 LIKE PROTEIN JGI N/AIEA
PF03169Pfam OPT oligopeptide transporter protein JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.17g006100 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma17g01000 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.17g006100
>Glyma.17g006100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g006100.1.p locus=Glyma.17g006100 id=Glyma.17g006100.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCGACTGTGAAGAGCAGCAGCATGGACGCCGAGAAGGCGGCGAACGGGGAATCTCCACCGGAGCGGTGTCCGGTGGAGGAGGTGGCTCTGGTGGTGCCGGAGACCGACGACCCATCACTTCCGGTGATGACTTTCCGAGCATGGTTTCTGGGAATAGCCTCATGTGTGCTCCTGATCTTCCTCAACACTTTCTTCACCTTCAGGACTCAGCCACTCACCATCTCTGCCATTCTCATGCAAATCGCGGTTCTTCCCATAGGAAGGTTCATGGCCGCGACTCTTCCCACCAAAGAGTACGGCTTTCTCGGGTCGCGCTTCACCTTCAACCCTGGACCCTTCAACATGAAGGAGCATGTCATCATCACCATCTTCGCTAACTGTGGTGTTTCCTTTGGAGGAGGCGATGCTTACTCCATTGGTGCCATTACTGTCATGAAGGCTTACTATAAACAGAGTTTGAGCTTTCTCTGTGCCCTCTTCATCGTCTTAACTACTCAGATGATGGGGTATGGATGGGCTGGGATTCTGAGGAGGTATCTGGTTGATCCCGTTGAAATGTGGTGGCCAGCAAACCTTGCTCAAGTGTCGCTCTTTAGGGCACTCCATGAAAAGGAGCCGAAATCAAAAGGTTTAACGAGGATGCAGTTTTTCCTCATTGCCATGGGTGCAAGCTTCTTGTATTATGCACTCCCTGGCTATCTCTTCATGGTCTTAACATTCTTCTCATGGATATGTTGGGCATGGCCACATAGCATCACTGCACAGCAAATTGGCTCAGGTTATCACGGACTTGGGATTGGTGCCTTCACACTTGATTGGGCAGGGATTTCAGCTTATCATGGCAGTCCCCTTGTTTCACCATGGTCTTCCATTGTTAATGTGGGAATTGGATTTATCATGTTCATCTACATCATTCTACCTCTCTGTTACTGGAAGTTCAACACTTTTGATGCACACAAGTTTCCTATATTTTCTAACCAGTTGTTCACGGCCAGTGGACATAAATATGACACCACCAAGATCTTAACCCCTGAGTATGTCCTTAATGTTGATGCATACAACAAGTACAGCAAGTTATACCTTAGCCCTCTGTTTGCATTATCTATTGGATCAGGTTTTGCAAGATTTACGGCAACCCTCACTCATGTAGCACTCTTTAATGGAAGAGACATTTGGAGACAGAGTAGATCAGCAATGAGTAACGCAAAATTGGATATCCATGGTAGACTGATGAAAGCTTATAAGCAAGTACCAGAATGGTGGTTCCTCAGTATATTGTTTGGGAGCATGGCGCTATCCTTGCTAATGGCTTTTGTGTGGAAAACGGATGTGCAACTGCCATGGTGGGGTATGCTCTTTGCTTTTGGTTTGGCTTTTATTGTAACCCTTCCTATTGGTGTCATTCAAGCAACTACCAACCAGCAACCTGGATATGACATTATAGCACAGTTCATGATTGGGTATGTCCTTCCTGGACAACCAATTGCAAACTTGCTCTTCAAGATTTACGGGAGAATCAGCACCGTCCATGCTCTCTCTTTCTTGTCAGATCTCAAACTTGGCCACTACATGAAAATTCCTCCACGGTGCATGTACACCGCTCAGCTGGTGGGAACTCTAGTTGCTGGTGTAGTGAACCTGGCAGTGGCTTGGTGGATGTTGGATAGCATTAAGGACATCTGCATGGATGATAAAGTGCACCATGACAGTCCTTGGACATGCCCTAAGTACAGAGTGACATTTGATGCATCAGTTATATGGGGTCTGATTGGACCAAAGAGGCTATTTGGACCTGGTGGGCTGTACAGGAACCTTGTGTGGTTATTCCTGATTGGAGCAGTGCTTCCAGTTCCTATTTGGGTGTTGAGCAAAATCTTCCCTGAGAAGAAATGGATACCACTGATCAACATACCAGTTATAACCTATGGCTTTGCTGGAATGCCGCCAGCAACTCCTGCCAATATTGCAAGCTGGCTAGTGACTGGAATGATCTTCAATTACTTCGTGTTCCGCTACAACAAACGCTGGTGGCAGAAGTACAATTATGTACTATCTGCAGCACTGGATGCAGGCACAGCTTTTATGGGTGTTCTGATATTCTTTGCCCTGCAAAATGCTGGCCATAATCTCAAATGGTGGGGAAGTGAATTGGACCATTGCCCATTGGCCACTTGCCCAACTGCACCAGGAATTGAGGTTGATGGCTGTCCAGTATTCAAATAG

>Glyma.17g006100.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g006100.2.p locus=Glyma.17g006100 id=Glyma.17g006100.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGATGGGGTATGGATGGGCTGGGATTCTGAGGAGGTATCTGGTTGATCCCGTTGAAATGTGGTGGCCAGCAAACCTTGCTCAAGTGTCGCTCTTTAGGGCACTCCATGAAAAGGAGCCGAAATCAAAAGGTTTAACGAGGATGCAGTTTTTCCTCATTGCCATGGGTGCAAGCTTCTTGTATTATGCACTCCCTGGCTATCTCTTCATGGTCTTAACATTCTTCTCATGGATATGTTGGGCATGGCCACATAGCATCACTGCACAGCAAATTGGCTCAGGTTATCACGGACTTGGGATTGGTGCCTTCACACTTGATTGGGCAGGGATTTCAGCTTATCATGGCAGTCCCCTTGTTTCACCATGGTCTTCCATTGTTAATGTGGGAATTGGATTTATCATGTTCATCTACATCATTCTACCTCTCTGTTACTGGAAGTTCAACACTTTTGATGCACACAAGTTTCCTATATTTTCTAACCAGTTGTTCACGGCCAGTGGACATAAATATGACACCACCAAGATCTTAACCCCTGAGTATGTCCTTAATGTTGATGCATACAACAAGTACAGCAAGTTATACCTTAGCCCTCTGTTTGCATTATCTATTGGATCAGGTTTTGCAAGATTTACGGCAACCCTCACTCATGTAGCACTCTTTAATGGAAGAGACATTTGGAGACAGAGTAGATCAGCAATGAGTAACGCAAAATTGGATATCCATGGTAGACTGATGAAAGCTTATAAGCAAGTACCAGAATGGTGGTTCCTCAGTATATTGTTTGGGAGCATGGCGCTATCCTTGCTAATGGCTTTTGTGTGGAAAACGGATGTGCAACTGCCATGGTGGGGTATGCTCTTTGCTTTTGGTTTGGCTTTTATTGTAACCCTTCCTATTGGTGTCATTCAAGCAACTACCAACCAGCAACCTGGATATGACATTATAGCACAGTTCATGATTGGGTATGTCCTTCCTGGACAACCAATTGCAAACTTGCTCTTCAAGATTTACGGGAGAATCAGCACCGTCCATGCTCTCTCTTTCTTGTCAGATCTCAAACTTGGCCACTACATGAAAATTCCTCCACGGTGCATGTACACCGCTCAGCTGGTGGGAACTCTAGTTGCTGGTGTAGTGAACCTGGCAGTGGCTTGGTGGATGTTGGATAGCATTAAGGACATCTGCATGGATGATAAAGTGCACCATGACAGTCCTTGGACATGCCCTAAGTACAGAGTGACATTTGATGCATCAGTTATATGGGGTCTGATTGGACCAAAGAGGCTATTTGGACCTGGTGGGCTGTACAGGAACCTTGTGTGGTTATTCCTGATTGGAGCAGTGCTTCCAGTTCCTATTTGGGTGTTGAGCAAAATCTTCCCTGAGAAGAAATGGATACCACTGATCAACATACCAGTTATAACCTATGGCTTTGCTGGAATGCCGCCAGCAACTCCTGCCAATATTGCAAGCTGGCTAGTGACTGGAATGATCTTCAATTACTTCGTGTTCCGCTACAACAAACGCTGGTGGCAGAAGTACAATTATGTACTATCTGCAGCACTGGATGCAGGCACAGCTTTTATGGGTGTTCTGATATTCTTTGCCCTGCAAAATGCTGGCCATAATCTCAAATGGTGGGGAAGTGAATTGGACCATTGCCCATTGGCCACTTGCCCAACTGCACCAGGAATTGAGGTTGATGGCTGTCCAGTATTCAAATAG

>Glyma.17g006100.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.17g006100.3.p locus=Glyma.17g006100 id=Glyma.17g006100.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCAGTTTTTCCTCATTGCCATGGGTGCAAGCTTCTTGTATTATGCACTCCCTGGCTATCTCTTCATGGTCTTAACATTCTTCTCATGGATATGTTGGGCATGGCCACATAGCATCACTGCACAGCAAATTGGCTCAGGTTATCACGGACTTGGGATTGGTGCCTTCACACTTGATTGGGCAGGGATTTCAGCTTATCATGGCAGTCCCCTTGTTTCACCATGGTCTTCCATTGTTAATGTGGGAATTGGATTTATCATGTTCATCTACATCATTCTACCTCTCTGTTACTGGAAGTTCAACACTTTTGATGCACACAAGTTTCCTATATTTTCTAACCAGTTGTTCACGGCCAGTGGACATAAATATGACACCACCAAGATCTTAACCCCTGAGTATGTCCTTAATGTTGATGCATACAACAAGTACAGCAAGTTATACCTTAGCCCTCTGTTTGCATTATCTATTGGATCAGGTTTTGCAAGATTTACGGCAACCCTCACTCATGTAGCACTCTTTAATGGAAGAGACATTTGGAGACAGAGTAGATCAGCAATGAGTAACGCAAAATTGGATATCCATGGTAGACTGATGAAAGCTTATAAGCAAGTACCAGAATGGTGGTTCCTCAGTATATTGTTTGGGAGCATGGCGCTATCCTTGCTAATGGCTTTTGTGTGGAAAACGGATGTGCAACTGCCATGGTGGGGTATGCTCTTTGCTTTTGGTTTGGCTTTTATTGTAACCCTTCCTATTGGTGTCATTCAAGCAACTACCAACCAGCAACCTGGATATGACATTATAGCACAGTTCATGATTGGGTATGTCCTTCCTGGACAACCAATTGCAAACTTGCTCTTCAAGATTTACGGGAGAATCAGCACCGTCCATGCTCTCTCTTTCTTGTCAGATCTCAAACTTGGCCACTACATGAAAATTCCTCCACGGTGCATGTACACCGCTCAGCTGGTGGGAACTCTAGTTGCTGGTGTAGTGAACCTGGCAGTGGCTTGGTGGATGTTGGATAGCATTAAGGACATCTGCATGGATGATAAAGTGCACCATGACAGTCCTTGGACATGCCCTAAGTACAGAGTGACATTTGATGCATCAGTTATATGGGGTCTGATTGGACCAAAGAGGCTATTTGGACCTGGTGGGCTGTACAGGAACCTTGTGTGGTTATTCCTGATTGGAGCAGTGCTTCCAGTTCCTATTTGGGTGTTGAGCAAAATCTTCCCTGAGAAGAAATGGATACCACTGATCAACATACCAGTTATAACCTATGGCTTTGCTGGAATGCCGCCAGCAACTCCTGCCAATATTGCAAGCTGGCTAGTGACTGGAATGATCTTCAATTACTTCGTGTTCCGCTACAACAAACGCTGGTGGCAGAAGTACAATTATGTACTATCTGCAGCACTGGATGCAGGCACAGCTTTTATGGGTGTTCTGATATTCTTTGCCCTGCAAAATGCTGGCCATAATCTCAAATGGTGGGGAAGTGAATTGGACCATTGCCCATTGGCCACTTGCCCAACTGCACCAGGAATTGAGGTTGATGGCTGTCCAGTATTCAAATAG
Predicted protein sequences of Glyma.17g006100
>Glyma.17g006100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g006100.1 locus=Glyma.17g006100 id=Glyma.17g006100.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MATVKSSSMDAEKAANGESPPERCPVEEVALVVPETDDPSLPVMTFRAWFLGIASCVLLIFLNTFFTFRTQPLTISAILMQIAVLPIGRFMAATLPTKEYGFLGSRFTFNPGPFNMKEHVIITIFANCGVSFGGGDAYSIGAITVMKAYYKQSLSFLCALFIVLTTQMMGYGWAGILRRYLVDPVEMWWPANLAQVSLFRALHEKEPKSKGLTRMQFFLIAMGASFLYYALPGYLFMVLTFFSWICWAWPHSITAQQIGSGYHGLGIGAFTLDWAGISAYHGSPLVSPWSSIVNVGIGFIMFIYIILPLCYWKFNTFDAHKFPIFSNQLFTASGHKYDTTKILTPEYVLNVDAYNKYSKLYLSPLFALSIGSGFARFTATLTHVALFNGRDIWRQSRSAMSNAKLDIHGRLMKAYKQVPEWWFLSILFGSMALSLLMAFVWKTDVQLPWWGMLFAFGLAFIVTLPIGVIQATTNQQPGYDIIAQFMIGYVLPGQPIANLLFKIYGRISTVHALSFLSDLKLGHYMKIPPRCMYTAQLVGTLVAGVVNLAVAWWMLDSIKDICMDDKVHHDSPWTCPKYRVTFDASVIWGLIGPKRLFGPGGLYRNLVWLFLIGAVLPVPIWVLSKIFPEKKWIPLINIPVITYGFAGMPPATPANIASWLVTGMIFNYFVFRYNKRWWQKYNYVLSAALDAGTAFMGVLIFFALQNAGHNLKWWGSELDHCPLATCPTAPGIEVDGCPVFK*

>Glyma.17g006100.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g006100.2 locus=Glyma.17g006100 id=Glyma.17g006100.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MMGYGWAGILRRYLVDPVEMWWPANLAQVSLFRALHEKEPKSKGLTRMQFFLIAMGASFLYYALPGYLFMVLTFFSWICWAWPHSITAQQIGSGYHGLGIGAFTLDWAGISAYHGSPLVSPWSSIVNVGIGFIMFIYIILPLCYWKFNTFDAHKFPIFSNQLFTASGHKYDTTKILTPEYVLNVDAYNKYSKLYLSPLFALSIGSGFARFTATLTHVALFNGRDIWRQSRSAMSNAKLDIHGRLMKAYKQVPEWWFLSILFGSMALSLLMAFVWKTDVQLPWWGMLFAFGLAFIVTLPIGVIQATTNQQPGYDIIAQFMIGYVLPGQPIANLLFKIYGRISTVHALSFLSDLKLGHYMKIPPRCMYTAQLVGTLVAGVVNLAVAWWMLDSIKDICMDDKVHHDSPWTCPKYRVTFDASVIWGLIGPKRLFGPGGLYRNLVWLFLIGAVLPVPIWVLSKIFPEKKWIPLINIPVITYGFAGMPPATPANIASWLVTGMIFNYFVFRYNKRWWQKYNYVLSAALDAGTAFMGVLIFFALQNAGHNLKWWGSELDHCPLATCPTAPGIEVDGCPVFK*

>Glyma.17g006100.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.17g006100.3 locus=Glyma.17g006100 id=Glyma.17g006100.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MQFFLIAMGASFLYYALPGYLFMVLTFFSWICWAWPHSITAQQIGSGYHGLGIGAFTLDWAGISAYHGSPLVSPWSSIVNVGIGFIMFIYIILPLCYWKFNTFDAHKFPIFSNQLFTASGHKYDTTKILTPEYVLNVDAYNKYSKLYLSPLFALSIGSGFARFTATLTHVALFNGRDIWRQSRSAMSNAKLDIHGRLMKAYKQVPEWWFLSILFGSMALSLLMAFVWKTDVQLPWWGMLFAFGLAFIVTLPIGVIQATTNQQPGYDIIAQFMIGYVLPGQPIANLLFKIYGRISTVHALSFLSDLKLGHYMKIPPRCMYTAQLVGTLVAGVVNLAVAWWMLDSIKDICMDDKVHHDSPWTCPKYRVTFDASVIWGLIGPKRLFGPGGLYRNLVWLFLIGAVLPVPIWVLSKIFPEKKWIPLINIPVITYGFAGMPPATPANIASWLVTGMIFNYFVFRYNKRWWQKYNYVLSAALDAGTAFMGVLIFFALQNAGHNLKWWGSELDHCPLATCPTAPGIEVDGCPVFK*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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