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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT5G49890.1 | AT | chloride channel C | JGI | N/A | IEA |
GO:0006811 | GO-bp | ion transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0006821 | GO-bp | chloride transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0006821 | GO-bp | chloride transport | JGI | N/A | IEA |
GO:0034220 | GO-bp | ion transmembrane transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0055085 | GO-bp | transmembrane transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0055085 | GO-bp | transmembrane transport | JGI | N/A | IEA |
GO:1902476 | GO-bp | chloride transmembrane transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0009705 | GO-cc | plant-type vacuole membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016020 | GO-cc | membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016020 | GO-cc | membrane | JGI | N/A | IEA |
GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005216 | GO-mf | ion channel activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005247 | GO-mf | voltage-gated chloride channel activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005247 | GO-mf | voltage-gated chloride channel activity | JGI | N/A | IEA |
GO:0030554 | GO-mf | adenyl nucleotide binding | JGI | N/A | IEA |
KOG0474 | KOG | Cl- channel CLC-7 and related proteins (CLC superfamily) | JGI | N/A | IEA |
PTHR11689 | Panther | CHLORIDE CHANNEL | JGI | N/A | IEA |
PTHR11689:SF11 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00571 | PFAM | CBS domain | JGI | N/A | IEA |
PF00654 | PFAM | Voltage gated chloride channel | JGI | N/A | IEA |
Glyma.16g208400 not represented in the dataset |
Glyma.16g208400 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.09g157900 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma16g33351 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.16g208400.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g208400 ID=Glyma.16g208400.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.16g208400.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g208400 ID=Glyma.16g208400.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.16g208400.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g208400 ID=Glyma.16g208400.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATAATTTGCAAGTTGTTTCTGTACAGGAAAGTCAAGGGAAGGTTAATTTTGAGTGTTGAATGTGAGATGGCACTTTGATTACACGACATGCTTAAGATGGGGTTGTGCTTGTTGCAGGTTCTGATTAATATACATGTGCTGTAGTGTAAATTAGGTTCTTATCATGACACCAACCAGCGGCGAAGGAGCTGAGAAGATGGATGCAGAAGATGGTGTAAACTGCAGTGATTATGAGCATGACATAGAAAATGAAGATTTGTGGGATGGGAATGAAGAAAGTGGAGGGTACTGGTCAGGGATATATGACAGAAACAAGGCTCATACAAAGCCACTTCTTATGAAGGGGACTAACACCACCTCCCAGATTGCTATTATTGGTGCCAACCTCTGCCCTATTGAAAGCCTTGACTATGAGATTTTTGACAATGAAATATTGAAGAATGACTGGAGTTCCAGGAAGAAGGTTCAGATAATCCATTATGTGATGCTTAAGTGGGGATTTGCTCTTCTTATTGGATTAGGTACTGGATTGGTTGGCTTCTTTAACAGTTTTGCAGTTGAGAACATAGCTGGTTTCAAGCTGTTTATGACCACCAGTCTCATGTCTAAACACAGATATCTTGAAGCTTTCTTAGCATATGCTGGTGCGAATATGTGTTTAGCAGCAGCTGCTGCTGCACTTTGTGCTTTCATCGCTCCAGCAGCTGCAGGCTCTGGCATTCCAGAGGTAAAAGCATATCTCAATGGTGTGGATGCTCAACATATATTGGCTCCAAGCACCCTTTTTGTAAAGATATTTGGTTCCATCCTTGGAGTTTCTGCTGGATTTGTGGTGGGCAAAGAGGGGCCTATGGTACATACAGGTGCATGCATAGCTTCTTTATTGGGGCAGGGTGGATCTCGCAAGTATCACTTGACTTGCACTTGGCTTAGATATTTCAAAAATGACCGAGACCGGCGAGACATGATTACTTGTGGTGCAGCTGCTGGGGTTGCTGCTGCCTTTCGTGCACCAGTAGGTGGTGTCCTCTTTGCTCTTGAAGAGGCAGCTACATGGTGGCGGAGTGCTCTTCTTTGGAGGACTTTTTTCACAACAGCAGTGGTTGCTATTGTTTTAAGAGTTGCAATTCAGTTTTGTGCCACAGGCGGGAAATGTGGGCTATTTGGGGAAGGTGGTCTGATAATGTATGATGTTAGTTCAGCCAATATAACATATAGTGCTAGTGGGATATTTGCAGTACTACTAATGGGAGCCATTGCTGGAATTCTTGGAAGCATATATAATTACCTTGTGGATAAGGTTGTTCGGACATATAGCATCATCAATGGAAAAGGTGCATTTTCAAAAATCTCTCTTGTTGTCACAATTGCTCTTTTGACATCATGTTGTTATTATTTCTTGCCATGGATTGCATACTGCATTCCCTGCCCTTCTAATTCGACAGTGATCTGTCCCTCTGTTGATGAGTCTGGAGAATACAAAAACTTTCAATGCCCACCAGGTTACTACAATGATCTTGCTTCTCTGTTTCTAAACACCAATGATGATGCTATTCGCAATCTATTTAGCCCCAGGATAATCAAAGAGTTTCATATTACCAGTTTGTTTATCTACTTTGCTACTATTTACTGTCTTGGGATAATCACTTATGGCATTGCTATTCCATCCGGGCTCTTCATTCCTGTGATACTTGCTGGTGCTGCCTATGGCCGTCTTTTCGGCCGGCTCTTCGAAACGATCACCAAACTCGACAGAGGACTATTTGCCCTACTTGGAGCTGCTTCCTTCCTTGGTGGCACCATGAGAATGACAGTGTCTATTTGTGTCATATTGCTTGAGCTCACTAATGATCTCTTGTTACTTCCACTTGTAATGTTGGTCTTATTAGTCTCAAAAACTGTGGCAGACAGCTTCAACAAGGGTGTCTATGATCAAATACTTAAGATCAAAGGACTTCCTTATTTGGAGGCTCATGCAGAACCTTACATGAGGAATTTAGTAACACGCGATGTTGTTTCAGGTCCATTGATAACCTTTTCTGGCATCGAAAAGGTTAGGAATATATTGCATGCACTGCATACTACAGGGCATAATGGGTTTCCTGTCATTGATGAACCACCTTTCTCAGATGCACCAGAGTTATGTGGGCTTGTACTGAGGTCTCATTTACTAGTGTTACTGAAGGAGAAGATCTTTTCAAGAGATAGGGGTTTTGCGAATCCAGTGATCTTCCAAAGAATTTCTACTTTGGATTTTGGAAAGGCAGGATCAGGAAAGGAAATCAAACTAGAGGATCTTGATATCCAAGAGGAAGAGATAGATATGTATGTTGATCTCCATCCAATAACTAATGCATCTCCTTACACTGTGGTTGAGACAATGTCACTTGCCAAAGCTGCTATTCTTTTCCGCCAACATGGACTCAGGCACATGTGTGTTGTTCCAAAGAGCCAAGGGAGACCTCCAGTTGTTGGGATTCTAACTCGCCATGATTTTATGCCAGAGCATGTTTTGGGACTTTACCCTGATATCAAGCCTCACAAATGGCAATGAGCGATCTCAATGAAAAATATTCTTTCTTCTGTGTTGGAGTGTTGCATTCATTAGTTGATCAAAGTTTTTATATACAGTAGAGTGCAATTATTATTCATAGAACACTTGAAGCAAAAAATGTTGCTTAAGAAGTGACTTCTGCATATGGATTTGTTAATCTCTATTTCATGAAGTCAGCTTGATACTTTCAGATAGACACTTTTAAACACAAAAGTTAGGTACCACGGTTAGTTGATAATGATCTCTTCTACATGTTGCTTTTTTTATTTTTTTGAATAAATTTGCAAGCTTAATGATCAATTCTCTTTGTATGAT >Glyma.16g208400.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g208400 ID=Glyma.16g208400.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.16g208400.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g208400.1 locus=Glyma.16g208400 ID=Glyma.16g208400.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MTPTSGEGAEKMDAEDGVNCSDYEHDIENEDLWDGNEESGGYWSGIYDRNKAHTKPLLMKGTNTTSQIAIIGANLCPIESLDYEIFDNEILKNDWSSRKKVQIIHYVMLKWGFALLIGLGTGLVGFFNSFAVENIAGFKLFMTTSLMSKHRYLEAFLAYAGANMCLAAAAAALCAFIAPAAAGSGIPEVKAYLNGVDAQHILAPSTLFVKIFGSILGVSAGFVVGKEGPMVHTGACIASLLGQGGSRKYHLTCTWLRYFKNDRDRRDMITCGAAAGVAAAFRAPVGGVLFALEEAATWWRSALLWRTFFTTAVVAIVLRVAIQFCATGGKCGLFGEGGLIMYDVSSANITYSASGIFAVLLMGAIAGILGSIYNYLVDKVVRTYSIINGKGAFSKISLVVTIALLTSCCYYFLPWIAYCIPCPSNSTVICPSVDESGEYKNFQCPPGYYNDLASLFLNTNDDAIRNLFSPRIIKEFHITSLFIYFATIYCLGIITYGIAIPSGLFIPVILAGAAYGRLFGRLFETITKLDRGLFALLGAASFLGGTMRMTVSICVILLELTNDLLLLPLVMLVLLVSKTVADSFNKGVYDQILKIKGLPYLEAHAEPYMRNLVTRDVVSGPLITFSGIEKVRNILHALHTTGHNGFPVIDEPPFSDAPELCGLVLRSHLLVLLKEKIFSRDRGFANPVIFQRISTLDFGKAGSGKEIKLEDLDIQEEEIDMYVDLHPITNASPYTVVETMSLAKAAILFRQHGLRHMCVVPKSQGRPPVVGILTRHDFMPEHVLGLYPDIKPHKWQ* >Glyma.16g208400.10.p 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||