Report for Sequence Feature Glyma.16g203900
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm16
Start: 36485467
stop: 36506395
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.16g203900
Expression Patterns of Glyma.16g203900
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Related Plant Genes
Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.16g203900
Paralog Evidence Comments
Glyma.09g153100 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.16g203900 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma16g32890 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.16g203900
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.16g203900.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g203900 ID=Glyma.16g203900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g203900.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g203900 ID=Glyma.16g203900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.16g203900
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.16g203900.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g203900.1.p locus=Glyma.16g203900 ID=Glyma.16g203900.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATGAGTTTTGCGGCGTACAAGATGATGCAGTGCCCCACCGGCATCGACAACTGCGCCGCCGGGTTCCTCACCCACTCCCGCTCTGACTTCGTCCCTCTCCAGCCCGACGACCTCGACGCCGAGTGGCCCTCCCGCCCCCGCCACCACGTCGGCTCCCTCCCCAACCTCGTCGTCACCGCCGCCAACGTCCTCGAAGTCTACGCCGTCCGCCTCCAGGAGGACCAGCCGCCCAAGGCCGCCGCCGACTCCCGCCGCGGCGCCCTCCTCGACGGCATTGCCGGGGCCTCCCTCGAACTCGTGTGCCACTACAGGTTGCATGGTAATGTTGAAACCATGGCTGTTTTGAGCATTGGAGGTGGTGATGTTTCTAGGAGGAGAGATTCTATCATGTTAACTTTTGCAGATGCAAAGATTTCAGTTCTTGAGTATGATGATTCTATTCACGGACTTCGTACTAGTTCTTTGCATTGTTTTGAGGGTCCTGAATGGCTTCATCTGAAAAGAGGAAGAGAACAATTTGCAAGAGGACCAGTGGTAAAGGTTGATCCTCAAGGCAGGTGTGGTGGAGTTCTTATCTATGATTTGCAAATGATAATACTAAAGGCTACTCAGGCTGGTTCTGGTTTAGTTGGGGAGGATGATGCCTTGGGATCTTCAGGAGCAGTTGCTGCTCGTATTGAGTCATCTTATATGATAAACCTACGTGACTTGGATATGAGGCATGTAAAAGATTTTACGTTTGTTCATGGCTATATTGAACCTGTAATGGTGATTTTGCATGAACGTGAACTCACTTGGGCCGGGCGTGTCTCATGGAAGCATCATACTTGCATGATATCAGCACTTAGTATCAGCACAACTTTGAAGCAGCATCCACTTATTTGGTCAGCTGTTAATCTTCCCCATGATGCGTACAAGCTTCTTGCAGTGCCCTCGCCAATAGGTGGTGTTCTTGTAATTAGTGCTAACACTATTCATTATCACAGTCAGTCTGCTTCTTGTGCATTGGCCTTGAACAGTTATGCTGTTACACTTGACAGTAGTCAAGAGATACCAAGATCAAGTTTCAATGTGGAGCTTGATGCTGCCAATGCAACTTGGTTGTTAAGTGATGTGGCCTTGCTGTCAACAAAAACTGGTGAACTGCTATTGCTTACGCTTGTTTATGATGGAAGGGTTGTACAGAGACTTGATCTTTCCAAGTCAAAAGCTTCAGTTCTGTCATCTGGTATTACAACAATTGGAAATTCTCTGTTTTTCCTCGCCAGTCGGTTAGGGGACAGTATGCTAGTGCAATTTTCTTGTGGATCAGGTGTTTCCATGTTGTCATCCAATCTAAAAGAAGAGGTTGGTGATATTGAAGCAGATGCTCCATCAAAGAGATTGCGAAGGTCTCCTTCTGATGCTTTGCAAGATATGGTTAGTGGTGAGGAGCTCTCCTTGTATGGGTCTGCTCCAAATAGAACAGAATCAGCACAGAAATCCTTCTCGTTTGCAGTGAGGGATTCATTGATTAATGTTGGTCCTTTGAAAGATTTCTCATATGGTTTAAGAATAAATGCTGATGCAAATGCTACAGGGATAGCCAAACAGAGTAACTATGAATTGGTGTGCTGTTCTGGTCATGGAAAAAATGGTTCTCTTTGTGTTTTGCGGCAATCAATTCGCCCAGAAGTGATTACTGAGGTTGAACTTCCTGGTTGCAAAGGAATTTGGACTGTGTATCATAAGAGCACACGCTCTCATAATGCTGATTCTTCTAAGATGGCTGATGACGATGATGAGTATCATGCTTACCTTATTATTAGTTTGGAGGCTCGTACTATGGTACTAGAAACTGCTGATCTTCTGAGTGAGGTTACTGAAAGTGTGGACTACTATGTTCAAGGAAAAACACTTGCTGCGGGGAATTTATTTGGAAGGTGTCGAGTTATCCAAGTCTATGAACGTGGTGCTCGAATTCTAGATGGTTCTTTTATGACCCAAGATGTAAGCTTTGGAGCTTCTAATTTGGAATCTGGTTCTGCATCTGACAGTGCTATAGCACTTTCTGTTTCTATAGCTGATCCATTTGTCTTGCTCAGGATGAGTGATGGAAGTATTCGACTTCTGATTGGAGATCCTAGTACCTGCACTATCTCTGTCACTTCTCCAGCTTCATTTGAGAGCTCCAAGGGATCAGTTTCTTCATGTACACTGTACCATGATAAAGGACCTGAGCCTTGGCTGAGGAAAACTAGTACTGATGCATGGCTTTCTACTGGTGTTGGTGAGACTATTGATGGCACTGATGGTGCAGCTCAGGATCATGGGGATATTTATTGTGTTGTTTGTTTTGATAATGGTAACCTTGAAATATTTGATGTCCCCAATTTCAATTGTGTCTTTTCTGTGGAAAATTTTATGTCTGGAAAGAGCCATCTTGTTGATGCTCTGATGAAAGAGGTACTGAAAGATTCTAAACAAGGGGATAGAGATGGAGTGATCAACCAAGGGAGGAAGGAAAATATACCGGATATGAAGGTTGTAGAGTTGGCCATGCAGAGATGGTCTGGGCAGCATAGCCGTCCATTTCTTTTTGGGATTTTGAGTGATGGAACTATTCTTTGTTACCATGCTTACCTTTATGAAAGTCCAGATAGTACTTCTAAAGTTGAGGATTCAGCATCAGCCGGAGGATCCATTGGCCTTAGCAGTACCAATGTTTCCAGGCTTAGAAATTTGAGATTTGTTCGTGTGCCTTTGGATGCATATGCCAGGGAGGATACATCAAATGGACCACCTTGTCAACAAATTACTATTTTCAAGAATATTGGTAGTTATGAAGGATTCTTCCTATCAGGGTCAAGACCAGCTTGGGTTATGGTGTTGAGGGAACGACTTCGTGTTCATCCACAGCTATGTGATGGGTCTATTGTTGCTTTTACTGTCCTTCACAACGTGAACTGCAATCAAGGACTTATATATGTTACATCACAGGGTGTTTTGAAGATATGCCAGTTGCCTTCTGGCTCAAACTATGACAGCTACTGGCCTGTACAAAAAATTCCACTAAAAGCCACACCACACCAAGTAACATACTTTGCGGAGAAGAACTTATATCCACTTATTGTCTCATTTCCTGTTCTTAAGCCACTAAATCAAGTTATTTCTCTGGTTGACCAAGATATCAACCATCAAAATGAGAGTCAGAATATGAATCCTGATGAGCAAAACCGCTTTTATCCTATTGATGAATTTGAGGTTCGTATTATGGAGCCAGAAAAGTCTGGTGGCCCTTGGCAAACTAAGGCAACAATACCTATGCAAAGTTCTGAAAATGCCCTTACTGTGAGGATGGTTACTTTAGTGAATACAACCTCAAAAGAAAATGAAACACTTTTAGCCATTGGTACTGCTTATGTGCAAGGAGAGGATGTTGCTGCAAGAGGACGTATCCTATTGTTCTCTTTGGGGAAAAATACTGATAATCCACAAACTCTGGTTTCAGAGGTGTACTCTAAGGAATTAAAAGGTGCTATATCTGCCTTGGCCTCTCTTCAAGGCCATCTATTAATAGCATCTGGTCCAAAAATTATTCTGCACAAGTGGAATGGCACTGAGTTGAATGGTATTGCATTTTTTGATGCACCACCATTACATGTTGTGAGCTTAAATATTGTAAAGAACTTCATCCTTATTGGCGATATCCATAAAAGCATATACTTTCTTAGTTGGAAAGAGCAGGGTGCTCAATTGAGCTTATTAGCCAAGGATTTTGGCTCTCTCGATTGTTTTGCGACAGAATTCTTGATTGATGGAAGTACTCTCAGTCTCATGGTTTCAGATGATAATAGAAACATCCAGATTTTTTACTATGCCCCAAAGATGTCTGAGAGTTGGAAAGGACAGAAGCTTCTTTCAAGAGCTGAATTTCATGTTGGTGCCCATGTGACTAAATTCTTAAGGTTGCAAATGTTATCCACTTCGGATCGAGCTGGTGCTGTACCAGGCTCAGATAAAACCAATCGTTTTGCCTTATTATTTGGTACCTTGGATGGAAGTATTGGTTGCATTGCGCCTCTTGATGAAATCACATTTCGCAGACTGCAGTCTTTGCAGAGAAAACTTGTTGATGCTGTACCCCATGTCGCTGGCCTGAACCCCAGAGCTTTTAGACTATTTCGGTCAAATGGAAAGGCCCATCGGCCTGGCCCTGACAGTATAGTTGATTGTGAGCTGCTATGCCATTATGAAATGCTTCCATTGGAGGAACAGCTTGAAATTGCTCACCAGGTTGGAACAACTCGATCACAAATTCTGTCAAATCTAAGTGATCTGTCTCTTGGAACAAGCTTCTTGTGA
>Glyma.16g203900.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g203900.2.p locus=Glyma.16g203900 ID=Glyma.16g203900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATGGTCAACAACTATAGAAAAGATCTGATACATGCTGGTTCTGGTTTAGTTGGGGAGGATGATGCCTTGGGATCTTCAGGAGCAGTTGCTGCTCGTATTGAGTCATCTTATATGATAAACCTACGTGACTTGGATATGAGGCATGTAAAAGATTTTACGTTTGTTCATGGCTATATTGAACCTGTAATGGTGATTTTGCATGAACGTGAACTCACTTGGGCCGGGCGTGTCTCATGGAAGCATCATACTTGCATGATATCAGCACTTAGTATCAGCACAACTTTGAAGCAGCATCCACTTATTTGGTCAGCTGTTAATCTTCCCCATGATGCGTACAAGCTTCTTGCAGTGCCCTCGCCAATAGGTGGTGTTCTTGTAATTAGTGCTAACACTATTCATTATCACAGTCAGTCTGCTTCTTGTGCATTGGCCTTGAACAGTTATGCTGTTACACTTGACAGTAGTCAAGAGATACCAAGATCAAGTTTCAATGTGGAGCTTGATGCTGCCAATGCAACTTGGTTGTTAAGTGATGTGGCCTTGCTGTCAACAAAAACTGGTGAACTGCTATTGCTTACGCTTGTTTATGATGGAAGGGTTGTACAGAGACTTGATCTTTCCAAGTCAAAAGCTTCAGTTCTGTCATCTGGTATTACAACAATTGGAAATTCTCTGTTTTTCCTCGCCAGTCGGTTAGGGGACAGTATGCTAGTGCAATTTTCTTGTGGATCAGGTGTTTCCATGTTGTCATCCAATCTAAAAGAAGAGGTTGGTGATATTGAAGCAGATGCTCCATCAAAGAGATTGCGAAGGTCTCCTTCTGATGCTTTGCAAGATATGGTTAGTGGTGAGGAGCTCTCCTTGTATGGGTCTGCTCCAAATAGAACAGAATCAGCACAGAAATCCTTCTCGTTTGCAGTGAGGGATTCATTGATTAATGTTGGTCCTTTGAAAGATTTCTCATATGGTTTAAGAATAAATGCTGATGCAAATGCTACAGGGATAGCCAAACAGAGTAACTATGAATTGGTGTGCTGTTCTGGTCATGGAAAAAATGGTTCTCTTTGTGTTTTGCGGCAATCAATTCGCCCAGAAGTGATTACTGAGGTTGAACTTCCTGGTTGCAAAGGAATTTGGACTGTGTATCATAAGAGCACACGCTCTCATAATGCTGATTCTTCTAAGATGGCTGATGACGATGATGAGTATCATGCTTACCTTATTATTAGTTTGGAGGCTCGTACTATGGTACTAGAAACTGCTGATCTTCTGAGTGAGGTTACTGAAAGTGTGGACTACTATGTTCAAGGAAAAACACTTGCTGCGGGGAATTTATTTGGAAGGTGTCGAGTTATCCAAGTCTATGAACGTGGTGCTCGAATTCTAGATGGTTCTTTTATGACCCAAGATGTAAGCTTTGGAGCTTCTAATTTGGAATCTGGTTCTGCATCTGACAGTGCTATAGCACTTTCTGTTTCTATAGCTGATCCATTTGTCTTGCTCAGGATGAGTGATGGAAGTATTCGACTTCTGATTGGAGATCCTAGTACCTGCACTATCTCTGTCACTTCTCCAGCTTCATTTGAGAGCTCCAAGGGATCAGTTTCTTCATGTACACTGTACCATGATAAAGGACCTGAGCCTTGGCTGAGGAAAACTAGTACTGATGCATGGCTTTCTACTGGTGTTGGTGAGACTATTGATGGCACTGATGGTGCAGCTCAGGATCATGGGGATATTTATTGTGTTGTTTGTTTTGATAATGGTAACCTTGAAATATTTGATGTCCCCAATTTCAATTGTGTCTTTTCTGTGGAAAATTTTATGTCTGGAAAGAGCCATCTTGTTGATGCTCTGATGAAAGAGGTACTGAAAGATTCTAAACAAGGGGATAGAGATGGAGTGATCAACCAAGGGAGGAAGGAAAATATACCGGATATGAAGGTTGTAGAGTTGGCCATGCAGAGATGGTCTGGGCAGCATAGCCGTCCATTTCTTTTTGGGATTTTGAGTGATGGAACTATTCTTTGTTACCATGCTTACCTTTATGAAAGTCCAGATAGTACTTCTAAAGTTGAGGATTCAGCATCAGCCGGAGGATCCATTGGCCTTAGCAGTACCAATGTTTCCAGGCTTAGAAATTTGAGATTTGTTCGTGTGCCTTTGGATGCATATGCCAGGGAGGATACATCAAATGGACCACCTTGTCAACAAATTACTATTTTCAAGAATATTGGTAGTTATGAAGGATTCTTCCTATCAGGGTCAAGACCAGCTTGGGTTATGGTGTTGAGGGAACGACTTCGTGTTCATCCACAGCTATGTGATGGGTCTATTGTTGCTTTTACTGTCCTTCACAACGTGAACTGCAATCAAGGACTTATATATGTTACATCACAGGGTGTTTTGAAGATATGCCAGTTGCCTTCTGGCTCAAACTATGACAGCTACTGGCCTGTACAAAAAATTCCACTAAAAGCCACACCACACCAAGTAACATACTTTGCGGAGAAGAACTTATATCCACTTATTGTCTCATTTCCTGTTCTTAAGCCACTAAATCAAGTTATTTCTCTGGTTGACCAAGATATCAACCATCAAAATGAGAGTCAGAATATGAATCCTGATGAGCAAAACCGCTTTTATCCTATTGATGAATTTGAGGTTCGTATTATGGAGCCAGAAAAGTCTGGTGGCCCTTGGCAAACTAAGGCAACAATACCTATGCAAAGTTCTGAAAATGCCCTTACTGTGAGGATGGTTACTTTAGTGAATACAACCTCAAAAGAAAATGAAACACTTTTAGCCATTGGTACTGCTTATGTGCAAGGAGAGGATGTTGCTGCAAGAGGACGTATCCTATTGTTCTCTTTGGGGAAAAATACTGATAATCCACAAACTCTGGTTTCAGAGGTGTACTCTAAGGAATTAAAAGGTGCTATATCTGCCTTGGCCTCTCTTCAAGGCCATCTATTAATAGCATCTGGTCCAAAAATTATTCTGCACAAGTGGAATGGCACTGAGTTGAATGGTATTGCATTTTTTGATGCACCACCATTACATGTTGTGAGCTTAAATATTGTAAAGAACTTCATCCTTATTGGCGATATCCATAAAAGCATATACTTTCTTAGTTGGAAAGAGCAGGGTGCTCAATTGAGCTTATTAGCCAAGGATTTTGGCTCTCTCGATTGTTTTGCGACAGAATTCTTGATTGATGGAAGTACTCTCAGTCTCATGGTTTCAGATGATAATAGAAACATCCAGATTTTTTACTATGCCCCAAAGATGTCTGAGAGTTGGAAAGGACAGAAGCTTCTTTCAAGAGCTGAATTTCATGTTGGTGCCCATGTGACTAAATTCTTAAGGTTGCAAATGTTATCCACTTCGGATCGAGCTGGTGCTGTACCAGGCTCAGATAAAACCAATCGTTTTGCCTTATTATTTGGTACCTTGGATGGAAGTATTGGTTGCATTGCGCCTCTTGATGAAATCACATTTCGCAGACTGCAGTCTTTGCAGAGAAAACTTGTTGATGCTGTACCCCATGTCGCTGGCCTGAACCCCAGAGCTTTTAGACTATTTCGGTCAAATGGAAAGGCCCATCGGCCTGGCCCTGACAGTATAGTTGATTGTGAGCTGCTATGCCATTATGAAATGCTTCCATTGGAGGAACAGCTTGAAATTGCTCACCAGGTTGGAACAACTCGATCACAAATTCTGTCAAATCTAAGTGATCTGTCTCTTGGAACAAGCTTCTTGTGA
>Glyma.16g203900.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g203900.3.p locus=Glyma.16g203900 ID=Glyma.16g203900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.16g203900
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
>Glyma.16g203900.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g203900.1 locus=Glyma.16g203900 ID=Glyma.16g203900.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g203900.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g203900.3 locus=Glyma.16g203900 ID=Glyma.16g203900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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