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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.16g136600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm16
Start:29558940
stop:29569896
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.16g136600
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G17680.1AT JGI N/AIEA
GO:0007165GO-bp signal transduction JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
GO:0043531GO-mf ADP binding JGI N/AIEA
KOG4658 KOG Apoptotic ATPase JGI N/AIEA
PTHR11017PantherFam LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING PROTEIN JGI N/AIEA
PF00931Pfam NB-ARC domain JGI N/AIEA
PF13676Pfam TIR domain JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.16g136600 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma16g25071 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.16g136600
>Glyma.16g136600.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g136600.2.p locus=Glyma.16g136600 id=Glyma.16g136600.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.16g136600.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g136600.3.p locus=Glyma.16g136600 id=Glyma.16g136600.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCTGTGCGATCATCCTCCTACGATGTGTTCCTCAGCTTCCGAGGGGAAGATACTCGTCATGGTTTCACTGGCAATCTCTACAATGTCCTCCGGGAAAGGGGAATTGACACCTTCATTGATGACGAGGAGCTCCAGAAAGGGCACGAAATCACAAAAGCACTTGAGGAGGCAATTGAGAAGTCCAAGATTTTCATCATCGTGCTCTCTGAAAACTACGCATCTTCCTCCTTTTGCTTAAACGAACTCACTCACATCCTTAACTTTACTAAGGGGAAGAGTGATCGGTCGATTTTGCCAGTTTTTTATAAAGTGGATCCTTCAGATGTCCGATACCACAGAGGTAGTTTTGGAGAAGCACTGGCTAATCATGAAAAGAAGTTGAAGTCTAATTACATGGAGAAGCTTCAGATCTGGAAGATGGCTCTGCAACAAGTTTCTAACTTTTCTGGCCATCATTTCCAACCTGATGGGGACAAATATGAATACGATTTTATTAAGGAGATAGTTGAATCGGTGCCTAGCAAGTTTAATCGTAATCTTTTATATGTTTCGGATGTCCTGGTTGGGCTAAAGTCACCGGTGCTAGCAGTAAAGTCGCTTCTGGATGTTGGAGCTGATGATGTTGTCCACATGGTGGGGATCCATGGACTTGGCGGAGTGGGTAAAACAACACTTGCTGTCGCAGTCTATAATTCCATTGCTTGCCATTTTGAAGCCTGTTGCTTTCTTGAAAATGTGAGAGAAACTTCCAACAAAAAGGGGTTAGAAAGTCTCCAAAACATCCTTCTTTCTAAAACAGTTGGAGATATGAAAATTGAAGTAACAAATTCGAGAGAAGGAACTGACATAATAAAGCGTAAGCTCAAGGAAAAGAAGGTTCTTCTGGTTCTAGATGATGTTAATGAACATGAACAGTTACAAGCGATTATTGACAGCCCTGATTGGTTTGGTCGTGGTAGTAGAGTCATCATCACCACTCGAGATGAACAATTGTTAGTGCTTCACAATGTTAAAAGAACATATAAGGTGAGAGAGTTGAATGAGAAACATGCTCTTCAATTACTTACTCAGAAGGCTTTTGGGTTGGAAAAAAAAGTTGATCCAAGTTACCATGATATTTTGAATCGAGCGGTAACTTATGCTTCAGGCCTTCCATTGGCTTTAAAAGTAATAGGTTCCAACTTATTTGGAAAAAGTATAGAAGAATGGGAATCTGTTCTAGATGGATATGAAAGAAGTCCTGATAAAAGTATCTATATGACACTTAAAGTAAGTTATGATGCTTTGAATGAAGATGAGAAAAGTATTTTTCTTGATATTGCTTGTTGCTTCAAAGATTATGAATTGGCAAAGGTTCAAGATATACTTTATGCTCATTATGGTCGTTCCATGAAATATGATATTGGGGTGTTGGTTGAAAAATCTCTGATAAACATTCATAGGTCATGGTATGATAAGGAGGTCATGAGATTGCATGACTTGATAGAAGACGTGGGTAAAGAAATTGTCCGAAGAGAATCACCAAAAGAGCCTGGGAAACGTAGCAGGTTATGGTCCCATGAGGATATAAAGGAAGTTTTACAAGAAAAAAAGGGGACTGGAAAGATTGAAATCATATGTATGAATTTTTCCTCATTTGGAAAAGAAGTAGAATGGGACGGAGATGCCTTAAAGAAGATGGAAAATCTCAAAACACTTATTATCAAGAGTGCTTGTTTTTCCAAAGGTCCCAAACATCTTCCGAATTCTTTAAGAGTATTGGAATGGTGGAGATGTCCTTCACAGGATTTGCCACATAATTTTAACCCAAAGCAACTTGCTATATGCAAGTTACCCCATAGTAACTTTACGTCACTCGGGTTGGCTCCATTATTTGATAAGAGTGTCGTGAATTTGACAAGTTTAATTTTGGACGAGTGTGATAGTTTAACAGAGATACCAGATGTATCCTGTCTCTCAAAATTGGAAAAATTGTCATTTAAAGATTGTAGGAATTTATTTACAATTCACCCTTCAGTTGGTTTATTGGAAAAGCTTAAAATCTTGGATGCTAAAGGTTGCCGAAAGCTTGAGAGTTTTCCACCGTTGAAGTTGACCTCTCTTGAATGGCTTAAACTTTCGTATTGTGTCAATCTCGAGAGTATTCCCGAATGCATCGAAGAATGCCGCTTTTTAACTACCCTTATTGTGGATGGTTGCGCTCGTCTTCAAGAAATTAGAGGGATTCCTCCAAACTTGAAAAAATTCTCTGCAACAGGATGCCCAGCCTTGACTTCCTCAAGCATAAGCATGTTCCTGAATCAGGAACTGCATGAGGCTCGAGACATCTACGTTAATTTGCCAAGAGTAAAGATTCCAAAGTGGTTTGAGTGCCAGAGTCGGGGAGAGTCAATTGTTTTCTGGTTCCGTAACAAATTCCCAGCCATAATTGTTTGCATTGATACAGAGTTTTGCTTTGATGAGCTTGCTGTCAACGTGTTCATTAATGATGAAGATGAAAGTAATCATGTAAGTTTGGATGTTACCGAATGCTGCATGGGTCCTTCTACAGCTGTTTTTCGTCTTAAAATGGAAGATTATTTAGATGAAGAACTATTAAAGAATGAATGGAACCGTGCAGAGATTGGTTGTGAATATTTGTGGGACGAATACGCAATCCATGTATTGAAAGAGCAAAGTAGCATGGAGGATATTCGATTCACTAAGAAAAGGTTGCGGGTCTGGAAAAAGCAAAGGCGGAGATGTCCTTCACAGGATAGTAGCTTTACGTCAGTCGGGTTGGATCCATTCTATGAAAAGACGCTCGTGAATTTGACAAGTTTAATTTTGGACGAGTGTGATAGTTTAACAGAGATACCAGATGTATCCTGTCTCTCAAATTTGGAAAATTTGTCATTTAGTGAGTGTCTGAATTTATTTAGAATTCACCATTCAGTTGGTTTATTGGGAAAGCTTAAAATCTTGAATGCTGAAGGTTGCCCAGAGCTTAAGAGTTTTCCACCGTTGAAGTTGACCTCTCTTGAAAGCCTTGATCTTTCGTATTGTTCCAGTCTCGAGAGTTTTCCTGAAATATTAGGAAAGATGGAAAATATAACAGAACTTGACTTGAGCGAATGTCCCATAACAAAACTCCCACCTTCATTTCGAAATCTTACTCGGCTTCAAGAGTTGGAGTTGGATCATGGACCCGAAAGTGCTGATCAGTTAATGGACTTTGATGCTGCCACCCTCATTTCGAACATCTGCATGATGCCAGAACTATATGATATTAGTGCTCGCCGTTTGCAATGGAGGCTATTGCCAGACGATGCTTTGAAATTGACCTCAGTCGTGTGTTCAAGCGTTCATTCTCTCACTTTGGAACTGTCAGATGAGCTTCTTCCGCTATTTCTCTCATGGTTTGTAAATGTGGAGAATTTACGGCTAGAAGGGAGTAAATGCACAGTCATTCCCGAATGCATCAAAGAATGCCGCTTTTTATCTATCCTTATTTTGAGTGGTTGCGATCGTCTTCAAGAAATTAGAGGGATTCCTCCAAACTTGGAAAGATTCGCCGCAACAGAATCCCCAGACTTGACTTCCTCAAGCATAAGCATGTTGCTGAATCAGGTAGTGTTTTTTATGTTTTCAATTTGGTCATTGCAGAGTATTTTAATGTTGCTAAACTTGATCAATTATTTATGA
Predicted protein sequences of Glyma.16g136600
>Glyma.16g136600.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g136600.2 locus=Glyma.16g136600 id=Glyma.16g136600.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.16g136600.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g136600.3 locus=Glyma.16g136600 id=Glyma.16g136600.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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