Glyma.16g093800

SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.16g093800

Feature Type:	gene_model
Chromosome:	Gm16
Start:	15144247
stop:	15160454
Source:	JGI
Version:	Wm82.a2.v1
High confidence:	yes

A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.16g093800

Database ID	Annotation Type	Annotation Description	Annotation Source	Match Score	Evidence Code
AT3G24870.1	AT	Helicase/SANT-associated, DNA binding protein	JGI	N/A	IEA
GO:0003677	GO-mf	DNA binding	EnsemblGenomes	N/A	IEA
PF07529	PFAM	HSA	JGI	N/A	IEA
GN7V-66863	SoyCyc9-rxn	nucleoplasmin ATPase	Plant Metabolic Network		ISS

Expression Patterns of Glyma.16g093800

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology


Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection	Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene families from PhyloGenes.

Gene model name correspondences to Glyma.16g093800 Gene Call Version Wm82.a2.v1

Corresponding Name	Annotation Version	Evidence	Comments
Glyma16g14060	Wm82.a1.v1.1	IGC	As supplied by JGI

Transcripts of Glyma.16g093800

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.16g093800.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.14 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g093800.14.p locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.19 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g093800.19.p locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.19.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.33 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g093800.33.p locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.33.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.16g093800

Limit To All Plant Sequences

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>Glyma.16g093800.13.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.13 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.16.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.16 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.16.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.17.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.17 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.17.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.18.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.18 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.18.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.19.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.19 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.19.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.2 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.20.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.20 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.20.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.21.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.21 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.21.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.26.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.26 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.26.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.28.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.28 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.28.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.3 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.30.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.30 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.30.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.32.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.32 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.32.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.33.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.33 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.33.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.34.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.34 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.34.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.35.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.35 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.35.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.36.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.36 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.36.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.38.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.38 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.38.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.39.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.39 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.39.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.4 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.40.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.40 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.40.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.41.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.41 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.41.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.16g093800.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g093800.9 locus=Glyma.16g093800 ID=Glyma.16g093800.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA

U.S. Public Domain