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A previous version of this gene model can be found here:
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT1G54170.1 | AT | CTC-interacting domain 3 | JGI | N/A | IEA |
| GO:0010603 | GO-bp | regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0034063 | GO-bp | stress granule assembly | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0010494 | GO-cc | cytoplasmic stress granule | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0003723 | GO-mf | RNA binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| KOG2375 | KOG | Protein interacting with poly(A)-binding protein | JGI | N/A | IEA |
| PTHR12854 | Panther | ATAXIN 2-RELATED | JGI | N/A | IEA |
| PF06741 | PFAM | LsmAD domain | JGI | N/A | IEA |
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Glyma.16g005700 not represented in the dataset |
Glyma.16g005700 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Paralog | Evidence | Comments |
|---|---|---|
| Glyma.07g036300 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma16g00765 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.16g005700.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 AATTGTTAAGTTCTTTCAAGCGTTCGTTCTTTTCAATTTTTGTTGGCCTTTGAAAACCGAAGAAGAAGAAGCACTGTGATTCTGATTCTCTCTCCGTCGTTGCAACTGGTGCCTCCGTCGTTTTCATCCCTAACCCCACACCTTCGACGCCCTATTATGATATGATCGCAGATTAGTGGGCAAGGGCTGTGGGTGAGGATGAATTTGCAACAAATTGGGCAGCCTAAATCATCTAATGGATATGGTCATCAGAAATCTGAAAAAGAAGGGGCAACTAAGTCTGATAATAAGCTCCCATCTGTAAAGTCAAATTCTAGCAGCAGATTAGCAGGAGTAGTGACTGGCAATAAAGGTGGTGGTTATGGGAGTCCTTCACATGATCGATTAGTATATTTAACAACATGCCTTATTGGGCAGCATGTGGAAGTCCAGGTGAAAAATGGATCTATATACTCTGGAATATTTCATGCAACAAATTCTGACAAAGATTTTGGAATCATTTTGAAAATGGCTCGCTTGACAAAGGCTGCCTCTTTGCAAGGACAGGGATCTGGTGTAGAATTTGTCAGCGAAGCTCCTTCTAAGACTTTAATTATACCTGCCAACGACCTTGCACAAGTTATAGCAAAGGATGTTGCTGTTTCCAGAGATGGCCTACCTAGTGAATCTCACTATGATATGCATCACGAAATCATGGTTGATTCAGTAATATCTCAATCCTGTCATGTTGAGACAGGGAGAGAATTACAGCGATGGGTACCTGATGAAGATGATCAACAATGCCCTGAACTGGAAAATATCTTTGATGGCCCTTGGAATAGGGGATGGGATCAGTTTGAAACAAATGAAATGTTGTTCGGTGTAAAAAGCACATTCAACGAGGATTTCTATACAACAAAGCTTGAAATAGGGCCCCAGACTAGAGAGTTGGAAAAGCAAGCTTTAAGAATAGCAAGAGAAATTGAGGGTGAGGAAACACAAGATCTTCATCTAGCAGAGGAAAGAGGCCTTTACCATAACTTTGATATTGATGAAGAAACCAGATTCTCTTCAGTCTATAGGGGTAAAGGTGTTGATGATAGTGGATATGATGAAAATGAGGACAGGCTCTTGGATTCACATAATTCTGAAACTTTTGATAATATTTATGGTTTAGTCAATAAGAGCCCAGGTGAAGCAAGTGGTCGGAAAGGCAGTAATGGAGCTCAAACGTGGTCAAATTTCTCCTCTGTGAATCACTCAGAGTTATCTCAGTCAAGTTCTGGTGTGGATTTATGTCGCTCTGGTTCTAAAGATCATGCTAAGCAGTTATCATCTGAACTCCCTGCCCTGAGTTGCTCATTTTCAGATGGAGAAAGCAGGATTCAGCTGAACTCAGTTAATAACCTACATGGAGTCAATGATAATACTGTGGAAGAAAATTGGATACAAGCTGAGGATGTTCAACTTTTAAAATCTGAGGATTTACAGTCATCACTTAAGTTGAAGAAAGATGGCTCTGATGAAGGGGGTTTATCTACTAATGTGGCCTTGTGTGCCCCTTCTACTCGTATTTTATCAAAGACTCCTAAAGAAACTGGGTCAGTTGGGGAATCAAAGTCTGTAATTTCACGTGGAAGACTAGGTAGATCATTGGGTTCTGATTATGTGGCAGCAACCTCTGGTCCTGGTCTATCACCAAGTTCTTCAGTTGGTTCACTGTCTTCGGAAAAATCAACTCTGAATCCCAATGCCAAGGAGTTCAGGCTCAACCCTAATGCAAAGAGTTTTATTCCGTCTCAATCACATGCTAGGCCCCGCTCCCCCATGTCTGATGGTTCCTTCTATTTCCCAGCTACTGTATCCACCATACCAAATATGCCAGCCATGTCCATGGGTATTGGAGTTGGGACTACTTTTGCAGGGCCACAACCAGTCGTATATAATCCACAAGCGGCACAAATGCCATCCCAACCATATTTTCATCCAAATGGACCACAGTATGGACAACTTCTTGGTCATCCTAGGCAAGTTTTATACATGCCAAGTTACCTCCCTGAGATGCCATATAAGGGACGGGATCATTGACCACTTATAGTTGAATGCATTCTTGACAACTTCTCTCTGCTTGAAAAGAATGAACTGAGTGGATGGCTTGAAGAGTTTCAAATGACAAGAATATCTTCGGCTTATGGGAGGATTTCGATAAAAAAAAAAATTATAATTTCTAGGCAAGTTGGCTTATTATTGGATATAAGTTAATTAATCTTATATTCACTCATACATCTTTTGGGATTTCTCAGTTTTCGGTTATGTAATAGCAGTAGCTTAACTCAGATTGGCATTCCCCCCCTTAGGAGGAGGAGGAGGACGGCTACTACtattattattattattattattattattattattattattattattattatGCAATATTTACTTTAAAGTTGTGTCTTCCCTATTTTAATTACTACCACTATTTTGACCTTTAGTCATGTCTACAATCATCAGGTTATGAGTTAGATACAAGTATATTTTGTATGTGTCATTGTGTGATGAATTAAACAAGTGTGAACTTGGAATCAATACTTTTTTTTCTT >Glyma.16g005700.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 AATTGTTAAGTTCTTTCAAGCGTTCGTTCTTTTCAATTTTTGTTGGCCTTTGAAAACCGAAGAAGAAGAAGCACTGTGATTCTGATTCTCTCTCCGTCGTTGCAACTGGTGCCTCCGTCGTTTTCATCCCTAACCCCACACCTTCGACGCCCTATTATGATATGATCGCAGATTAGTGGGCAAGGGCTGTGGGTGAGGATGAATTTGCAACAAATTGGGCAGCCTAAATCATCTAATGGATATGGTCATCAGAAATCTGAAAAAGAAGGGGCAACTAAGTCTGATAATAAGCTCCCATCTGTAAAGTCAAATTCTAGCAGCAGATTAGCAGGAGTAGTGACTGGCAATAAAGGTGGTGGTTATGGGAGTCCTTCACATGATCGATTAGTATATTTAACAACATGCCTTATTGGGCAGCATGTGGAAGTCCAGGTGAAAAATGGATCTATATACTCTGGAATATTTCATGCAACAAATTCTGACAAAGATTTTGGAATCATTTTGAAAATGGCTCGCTTGACAAAGGCTGCCTCTTTGCAAGGACAGGGATCTGGTGTAGAATTTGTCAGCGAAGCTCCTTCTAAGACTTTAATTATACCTGCCAACGACCTTGCACAAGTTATAGCAAAGGATGTTGCTGTTTCCAGAGATGGCCTACCTAGTGAATCTCACTATGATATGCATCACGAAATCATGGTTGATTCAGTAATATCTCAATCCTGTCATGTTGAGACAGGGAGAGAATTACAGCGATGGGTACCTGATGAAGATGATCAACAATGCCCTGAACTGGAAAATATCTTTGATGGCCCTTGGAATAGGGGATGGGATCAGTTTGAAACAAATGAAATGTTGTTCGGTGTAAAAAGCACATTCAACGAGGATTTCTATACAACAAAGCTTGAAATAGGGCCCCAGACTAGAGAGTTGGAAAAGCAAGCTTTAAGAATAGCAAGAGAAATTGAGGGTGAGGAAACACAAGATCTTCATCTAGCAGAGGAAAGAGGCCTTTACCATAACTTTGATATTGATGAAGAAACCAGATTCTCTTCAGTCTATAGGGGTAAAGGTGTTGATGATAGTGGATATGATGAAAATGAGGACAGGCTCTTGGATTCACATAATTCTGAAACTTTTGATAATATTTATGGTTTAGTCAATAAGAGCCCAGGTGAAGCAAGTGGTCGGAAAGGCAGTAATGGAGCTCAAACGTGGTCAAATTTCTCCTCTGTGTTTCATGCACAGAATCACTCAGAGTTATCTCAGTCAAGTTCTGGTGTGGATTTATGTCGCTCTGGTTCTAAAGATCATGCTAAGCAGTTATCATCTGAACTCCCTGCCCTGAGTTGCTCATTTTCAGATGGAGAAAGCAGGATTCAGCTGAACTCAGTTAATAACCTACATGGAGTCAATGATAATACTGTGGAAGAAAATTGGATACAAGCTGAGGATGTTCAACTTTTAAAATCTGAGGATTTACAGTCATCACTTAAGTTGAAGAAAGATGGCTCTGATGAAGGGGGTTTATCTACTAATGTGGCCTTGTGTGCCCCTTCTACTCGTATTTTATCAAAGACTCCTAAAGAAACTGGGTCAGTTGGGGAATCAAAGTCTGTAATTTCACGTGGAAGACTAGGTAGATCATTGGGTTCTGATTATGTGGCAGCAACCTCTGGTCCTGGTCTATCACCAAGTTCTTCAGTTGGTTCACTGTCTTCGGAAAAATCAACTCTGAATCCCAATGCCAAGGAGTTCAGGCTCAACCCTAATGCAAAGAGTTTTATTCCGTCTCAATCACATGCTAGGCCCCGCTCCCCCATGTCTGATGGTTCCTTCTATTTCCCAGCTACTGTATCCACCATACCAAATATGCCAGCCATGTCCATGGGTATTGGAGTTGGGACTACTTTTGCAGGGCCACAACCAGTCGTATATAATCCACAAGCGGCACAAATGCCATCCCAACCATATTTTCATCCAAATGGACCACAGTATGGACAACTTCTTGGTCATCCTAGGCAAGTTTTATACATGCCAAGTTACCTCCCTGAGATGCCATATAAGGGACGGGATCATTGACCACTTATAGTTGAATGCATTCTTGACAACTTCTCTCTGCTTGAAAAGAATGAACTGAGTGGATGGCTTGAAGAGTTTCAAATGACAAGAATATCTTCGGCTTATGGGAGGATTTCGATAAAAAAAAAAATTATAATTTCTAGGCAAGTTGGCTTATTATTGGATATAAGTTAATTAATCTTATATTCACTCATACATCTTTTGGGATTTCTCAGTTTTCGGTTATGTAATAGCAGTAGCTTAACTCAGATTGGCATTCCCCCCCTTAGGAGGAGGAGGAGGACGGCTACTACtattattattattattattattattattattattattattattattattatGCAATATTTACTTTAAAGTTGTGTCTTCCCTATTTTAATTACTACCACTATTTTGACCTTTAGTCATGTCTACAATCATCAGGTTATGAGTTAGATACAAGTATATTTTGTATGTGTCATTGTGTGATGAATTAAACAAGTGTGAACTTGGAATCAATACTTTTTTTTCTT >Glyma.16g005700.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.16g005700.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 TTCTTTCAAGCGTTCGTTCTTTTCAATTTTTGTTGGCCTTTGAAAACCGAAGAAGAAGAAGCACTGTGATTCTGATTCTCTCTCCGTCGTTGCAACTGGTGCCTCCGTCGTTTTCATCCCTAACCCCACACCTTCGACGCCCTATTATGATATGATCGCAGATTAGTGGGCAAGGGCTGTGGGTGAGGATGAATTTGCAACAAATTGGGCAGCCTAAATCATCTAATGGATATGGTCATCAGAAATCTGAAAAAGAAGGGGCAACTAAGTCTGATAATAAGCTCCCATCTGTAAAGTCAAATTCTAGCAGCAGATTAGCAGGAGTAGTGACTGGCAATAAAGGTGGTGGTTATGGGAGTCCTTCACATGATCGATTAGTATATTTAACAACATGCCTTATTGGGCAGCATGTGGAAGTCCAGGTGAAAAATGGATCTATATACTCTGGAATATTTCATGCAACAAATTCTGACAAAGATTTTGGAATCATTTTGAAAATGGCTCGCTTGACAAAGGCTGCCTCTTTGCAAGGACAGGGATCTGGTGTAGAATTTGTCAGCGAAGCTCCTTCTAAGACTTTAATTATACCTGCCAACGACCTTGCACAAGTTATAGCAAAGGATGTTGCTGTTTCCAGAGATGGCCTACCTAGTGAATCTCACTATGATATGCATCACGAAATCATGGTTGATTCAGTAATATCTCAATCCTGTCATGTTGAGACAGGGAGAGAATTACAGCGATGGGTACCTGATGAAGATGATCAACAATGCCCTGAACTGGAAAATATCTTTGATGGCCCTTGGAATAGGGGATGGGATCAGTTTGAAACAAATGAAATGTTGTTCGGTGTAAAAAGCACATTCAACGAGGATTTCTATACAACAAAGCTTGAAATAGGGCCCCAGACTAGAGAGTTGGAAAAGCAAGCTTTAAGAATAGCAAGAGAAATTGAGGGTGAGGAAACACAAGATCTTCATCTAGCAGAGGAAAGAGGCCTTTACCATAACTTTGATATTGATGAAGAAACCAGATTCTCTTCAGTCTATAGGGTCAATAAGAGCCCAGGTGAAGCAAGTGGTCGGAAAGGCAGTAATGGAGCTCAAACGTGGTCAAATTTCTCCTCTGTGTTTCATGCACAGAATCACTCAGAGTTATCTCAGTCAAGTTCTGGTGTGGATTTATGTCGCTCTGGTTCTAAAGATCATGCTAAGCAGTTATCATCTGAACTCCCTGCCCTGAGTTGCTCATTTTCAGATGGAGAAAGCAGGATTCAGCTGAACTCAGTTAATAACCTACATGGAGTCAATGATAATACTGTGGAAGAAAATTGGATACAAGCTGAGGATGTTCAACTTTTAAAATCTGAGGATTTACAGTCATCACTTAAGTTGAAGAAAGATGGCTCTGATGAAGGGGGTTTATCTACTAATGTGGCCTTGTGTGCCCCTTCTACTCGTATTTTATCAAAGACTCCTAAAGAAACTGGGTCAGTTGGGGAATCAAAGTCTGTAATTTCACGTGGAAGACTAGGTAGATCATTGGGTTCTGATTATGTGGCAGCAACCTCTGGTCCTGGTCTATCACCAAGTTCTTCAGTTGGTTCACTGTCTTCGGAAAAATCAACTCTGAATCCCAATGCCAAGGAGTTCAGGCTCAACCCTAATGCAAAGAGTTTTATTCCGTCTCAATCACATGCTAGGCCCCGCTCCCCCATGTCTGATGGTTCCTTCTATTTCCCAGCTACTGTATCCACCATACCAAATATGCCAGCCATGTCCATGGGTATTGGAGTTGGGACTACTTTTGCAGGGCCACAACCAGTCGTATATAATCCACAAGCGGCACAAATGCCATCCCAACCATATTTTCATCCAAATGGACCACAGTATGGACAACTTCTTGGTCATCCTAGGCAAGTTTTATACATGCCAAGTTACCTCCCTGAGATGCCATATAAGGGACGGGATCATTGACCACTTATAGTTGAATGCATTCTTGACAACTTCTCTCTGCTTGAAAAGAATGAACTGAGTGGATGGCTTGAAGAGTTTCAAATGACAAGAATATCTTCGGCTTATGGGAGGATTTCGATAAAAAAAAAAATTATAATTTCTAGGCAAGTTGGCTTATTATTGGATATAAGTTAATTAATCTTATATTCACTCATACATCTTTTGGGATTTCTCAGTTTTCGGTTATGTAATAGCAGTAGCTTAACTCAGATTGGCATTCCCCCCCTTAGGAGGAGGAGGAGGACGGCTACTACtattattattattattattattattattattattattattattattattatGCAATATTTACTTTAAAGTTGTGTCTTCCCTATTTTAATTACTACCACTATTTTGACCTTTAGTCATGTCTACAATCATCAGGTTATGAGTTAGATACAAGTATATTTTGTATGTGTCATTGTGTGATGAATTAAACAAGTGTGAACTTGGAATCAATACTTTTTTTTCTT >Glyma.16g005700.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.16g005700.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.16g005700.8 sequence-type=transcript locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.16g005700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.16g005700.1.p locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.16g005700.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g005700.1 locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNLQQIGQPKSSNGYGHQKSEKEGATKSDNKLPSVKSNSSSRLAGTGVVTGNKGGGYGSPSHDRLVYLTTCLIGQHVEVQVKNGSIYSGIFHATNSDKDFGIILKMARLTKAASLQGQGSGVEFVSEAPSKTLIIPANDLAQVIAKDVAVSRDGLPSESHYDMHHEIMVDSVISQSCHVETGRELQRWVPDEDDQQCPELENIFDGPWNRGWDQFETNEMLFGVKSTFNEDFYTTKLEIGPQTRELEKQALRIAREIEGEETQDLHLAEERGLYHNFDIDEETRFSSVYRGKGVDDSGYDENEDRLLDSHNSETFDNIYGLVNKSPGEASGRKGSNGAQTWSNFSSVFHAQNHSELSQSSSGVDLCRSGSKDHAKQLSSELPALSCSFSDGESRIQLNSVNNLHGVNDNTVEENWIQAEDVQLLKSEDLQSSLKLKKDGSDEGGLSTNVALCAPSTRILSKTPKETGSVGESKSVISRGRLGRSLGSDYVAATSGPGLSPSSSVGSLSSEKSTLNPNAKEFRLNPNAKSFIPSQSHARPRSPMSDGSFYFPATVSTIPNMPAMSMGIGVGTTFAGPQPVVYNPQAAQMPSQPYFHPNGPQYGQLLGHPRQVLYMPSYLPEMPYKGRDH* >Glyma.16g005700.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.16g005700.2 locus=Glyma.16g005700 ID=Glyma.16g005700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||