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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.15g247400

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm15
Start:47158004
stop:47173438
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.15g247400
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G27190.1AT NB-ARC domain-containing disease resistance protein JGI N/AIEA
GO:0006952GO-bp defense response EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0007165GO-bp signal transduction EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005886GO-cc plasma membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0043531GO-mf ADP binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0043531GO-mf ADP binding JGI N/AIEA
KOG4658 KOG Apoptotic ATPase JGI N/AIEA
PTHR23155Panther LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING PROTEIN JGI N/AIEA
PTHR23155:SF121Panther JGI N/AIEA
PF00931PFAM NB-ARC domain JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.15g247400
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.15g247400 not represented in the dataset
Glyma.15g247400 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene families from PhyloGenes.


Gene model name correspondences to Glyma.15g247400 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma15g39596 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.15g247400
>Glyma.15g247400.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g247400 ID=Glyma.15g247400.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATCACTACACCAAATTTGTTCATTTAGTATTTATTTTTCAAATAGACAAACTTTTTAAGTACCATCACACACACACACATATATATATATATAAAATCTAATTTAATCATTCTCATTTTTTAATTGACATACAATCCAAACTATCCACAAACCAAACATGTGAAAATAAGATAAGCTAATACACATAAAGATTCTAAGATGTCACTTTTATTTTGAAACTAACTTATACACAAACCAAGCAAATTAAACAAATatatgttggagtacaaatgcgaagtgaagtcccacatcgggTAGAAGTGTAAAAGTTAAACACCATATAAGTGAGGAAAAGACCCATAAACTTGCCTTAAGGTTTTGGATTAGGGTATGGTGTCAAATTTCCTTATGTAGTGGATCCTCGTCCATAGGTGTAAATCCCACAAATGAAAAATTGTAGTTGAAGAATTAGATTATATGTCCTAAATGAACAATTTTTTTAGGGGCACTAGTTGCAAGGGTTTATTTTGATTAGTTTCAAAACACGTTACTATGGTTGAACAGCAGAAGAAAAAAAAAGAAGAAAAAAGACTATATGCACCAATGAAAGAGTTGCCGTATAGTTCAGCTTACTCATGCTAGCAAGGCTGCCAATAAAATAAATGTAGATCACGATAGGGCGGTAGAAATGAGTGGGGAAGGAAAACAACTAATATTATATACTAATCTTTTGCCAAGTTTGACCTGAAACAGTAGAAAGGAGTTAAATGACAAGGGAGCTAGTATATACATAGAGAAAGACTTGAGCAGCATCTCGAGAGAGAGCAATACAAAGTGAAGCAGCATAAGCATACTTGAGTCTAGAGGTAGTTTTTTTCTTCCGTACGTGATTTCTGAATCTGTCTCTCCAAAGCTTCAATAGGTGTAAATCCCACAAATGAAAAATTGTAGTTGAAGAATTAGATTATATGTCCTAAATGAACAATTTTTTTAGGGGCACTAGTTGCAAGGGTTTATTTTGATTAGTTTCAAAACACGTTACTATGGTTGAACAGCAGAAGAAAAAAAAAGAAGAAAAAAGACTATATGCACCAATGAAAGAGTTGCCGTATAGTTCAGCTTACTCATGCTAGCAAGGCTGCCAATAAAATAAATGTAGATCACGATAGGGCGGTAGAAATGAGTGGGGAAGGAAAACAACTAATATTATATACTAATCTTTTGCCAAGTTTGACCTGAAACAGTAGAAAGGAGTTAAATGACAAGGGAGCTAGTATATACATAGAGAAAGACTTGAGCAGCATCTCGAGAGAGAGCAATACAAAGTGAAGCAGCATAAGCATACTTGAGTCTAGAGAGATAGGAAGTGAGAGAGGAAGGTGTATGTTGCTACCTCTTTCACATTAGCTACCACCAACAAAGTTATCAGATAGTACTAGGGGCTGGCCATGGATGCGATAGCTCATGTCCCAGGTGTTTCTCAAATTGCTAATTATGTGATTACATTTATTAAGGATCAAATTGGGTACATATCCTCCTACGAGGAAAACCTTGAAAAGCTTATGACCCAGGTTCAAACTCTGGAGGATACTCAAGTTCTTGTGAAGAACCGGGTTGCTGAGGCTGAAAGGAACGGATACAAGATTGAAAATATTGTACAGAATTGGCTCAAGAATGCAAATGAGATTGTTGCTGAGGCAAAGAAAGTCATTGATGTTGAAGGAGCTACATGGTGTCTGGGACGATATTGTCCCTCTCGGTGGATAAGATGTCAGCTGAGCAAGCGTCTTGAAGAAACGACAAAAAAGATTACAGATCACATAGAGAAAGGAAAAATTGATACAATTTCTTACCGTGATGCGCCTGATGTCACAACTACACCATTTTCTAGAGGTTATGAAGCACTGGAGTCCAGAACATCAATGCTGAATGAGATTAAGGAAATTCTTAAGGATCCTAAAATGTACATGATTGGGGTGCATGGCATGGGTGGCGTGGGTAAAACCACTCTTGTGAATGAGTTAGCTTGGCAAGTAAAAAAAGATGGATTATTTGTTGCTGTAGCCATAGCCAATATAACCAATTCTCCAAATGTGAAAAAAATTCAAGGCCAAATTGCTGATGCATTGTGGGATCGGAAGCTTAAAAAAGAGACAGAAAGTGGAAGAGCAATAGAACTGCGTGAAAGGATAAAAAAGCAGGAGAAAGTTCTTATTATTCTTGATGACATTTGGAGTGAACTTGATTTGACGGAAGTGGGAATTCCTTTTGGTGATGAACACAATGGTTGCAAATTGGTGATAACTTCCAGAGAACGTGAAGTGCTGATAAAGATGGACACTCAAAAAGATTTTAATCTTACAGCTTTACTGGAGGAGGATAGTTGGAATTTGTTCCAGAAAATAGCAGGTAATGTTAATGAAGTTAGTATAAAACCAATTGCAGAAGAAGTGGCAAAATGTTGTGCTGGTTTGCCTCTTTTGATCACAGCCTTGGGAAAGGGTTTGAGAAAAAAGGAAGTCCATGCTTGGAGGGTTGCCCTGAAACAACTAAAGGAATTTAAGCATAAAGAGTTGGAGAATAATGTCTACCCTGCTTTGAAGTTAAGTTATGATTTTTTAGATACAGAGGAATTGAAGTCACTATTCTTATTTATTGGTTCATTTGGACTAAATGAGATGCTCACTGAAGATTTGTTTATATGCTGTTGGGGGTTGGGCTTTTATGGTGGCGTGGACAAATTGATGGAGGCAAGAGACACACATTACACATTAATAAATGAGCTTAGGGCCTCTTCATTATTGCTTGAAGGTAAACTTGATTGGGTTGGAATGCATGATGTTGTGCGTGACGTGGCTAAATCAATTGCATCTAAGTCTCCTCCGACCGACCCGACCTATCCCACCTATGCAGATCAGTTTGGCAAGTGCCATTATATTAGATTTCAGTCTTCCTTGACTGAAGTCCAAGCTGATAAATCTTTCTCTGGGATGATGAAAGAAGTGATGACTTTGATTTTACATAAAATGTCCTTCACCCCTTTCCTACCCCCTTCTCTCAATCTCTTGATAAACCTTCGCTCATTGAATCTGAGAAGATGTAAATTGGGAGACATAAGGATAGTGGCCGAACTCTCAAATTTAGAAATTCTTTCCTTGGCCGAGTCTAGTTTTGCAGACCTCCCAGTTGAAATAAAACATCTGACTCGTCTTCGTTTGCTAAATTTAACAGACTGCTATGATCTAAGAGTCATTCCTACAAATATTATATCAAGTTTGATGTGCTTAGAAGAATTGTACATGGGAGGTTGCAATAATATTGAATGGGAGGTTGAAGGAAGCAAAAGTGAAAGCAACAATGCTAACGTACGTGAGTTACAGGATTTGCATAATTTGACAACTTTGGAGATATCATTCATAGATACTTCGGTTTTGCCAATGGACTTCCAGTTCCCTGCAAATCTCGAAAGATACCACATATTGATTAGTGATCTGGGGGAATGGGAGTTGTCTTCAATATGGTATGGTAGAGCTCTCGGAAGAACACTTAAGCTCAAAGACTATTGGCGGACGAGCAGATCGTTGTTCACCACAGTTGAGGACTTGAGATTTGCTAAATTAAAGGGTATTAAGGATTTGTTGTATAATTTGGATGTGGGAGGTTTTTCTCAATTAAAGCATTTGTATATCCAAGACAATGATGAATTGTTGTACCTCATTAACACAAGAAGGTTGATGAATCACCATTCTGCATTCCTCAATTTGGAGACTTTGGTTCTTAAGTTGCTGTATAAGATGGAAGAAATATGTCATGGTCCAATGCAGACACAGTCTCTTGCAAAGCTAAAAGTTATTAAAGTTACATATTGCAATGGGTTGAAGAATCTATTTTTGTATTCTCTCACAGGAAACCTTTCTCAACTTCATGATATGGAAATTTCTCATTGTAGAGGTATGACAGAGATCATAGCTATGGAAAAACAAGAGGATTGGAAAGAACTTCAACAGATTGTTCTGCCTGAATTGCATTCTGTCACTTTAGAAGGTTTACCTGAGCTTCAGAGTTTCTATTGTTCTGTAACAGTCGATCAGGGTAATCCATCCGGTCAGAGCAATACTTTGGCACTGTTTAATCAACAGGTTCAATTTCCAAACTCGGAGACAGTGAAAATCAGCATCATGAATGATTGGGAATCAATATGGCCTAATCAAGAGCCTCCAAATTCCTTCCATCACAATCTGGATATTGACATTTATGACTGTAAAAGCATGGATTTTGTCATTCCCACCTCTGCTGCTAAAGAGTTTCATCAGCAGCACCAATTTCTTGAAATAAGATCGTGTGGCATAAAGAATATTGTTGAAAAAAGTGATATTATTTGTGATATGACGCATGTTTACCTTGAAAAAATAACTGTAGCAGAGTGTCCAGGCATGAAGACCATAATTCCATCCTTTGTGCTATTTCAGTGTTTAGATGAATTGATTGTGTCCAGTTGTCATGGACTGGTAAATATTATAAGGCCATCAACAACCACAAGTTTACCAAACCTCCGCATTTTAAGGATAAGTGAATGTGATGAGCTAGAGGAAATTTATGGAAGCAATAATGAGAGTGATGATACACCACTGGGCGAGATTGCTTTTAGGAAATTGGAGGAATTGACATTGGAATACTTACCGAGGCTCACAAGCTTTTGCCAGGGAAGTTATGGCTTCAGGTTTCCATCATTACAAAAGGTACATTTGAAAGATTGTCCAATGATGGAGACTTTTTGTCAGGGAAACTTAACCACACCAAGCCTCACAAAGGTGGAATATGAAGGGATACAATATGTTTGGCATTCTAGTAAACTGAGTGAAGATCATTGGTATGGCGACCTTAATACTACTGTTAGAACAGTTTTCACTAAAAAGGATCAATATAATCCAGATTTGGAGAAACTGGATATCAGAAACAACAAAAATTTGAAGTCCATATGGCCTAATCAAGTGACTCCAAATTCCTTTCCTAACCTGACG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>Glyma.15g247400.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g247400 ID=Glyma.15g247400.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATCACTACACCAAATTTGTTCATTTAGTATTTATTTTTCAAATAGACAAACTTTTTAAGTACCATCACACACACACACATATATATATATATAAAATCTAATTTAATCATTCTCATTTTTTAATTGACATACAATCCAAACTATCCACAAACCAAACATGTGAAAATAAGATAAGCTAATACACATAAAGATTCTAAGATGTCACTTTTATTTTGAAACTAACTTATACACAAACCAAGCAAATTAAACAAATatatgttggagtacaaatgcgaagtgaagtcccacatcgggTAGAAGTGTAAAAGTTAAACACCATATAAGTGAGGAAAAGACCCATAAACTTGCCTTAAGGTTTTGGATTAGGGTATGGTGTCAAATTTCCTTATGTAGTGGATCCTCGTCCATAGGTGTAAATCCCACAAATGAAAAATTGTAGTTGAAGAATTAGATTATATGTCCTAAATGAACAATTTTTTTAGGGGCACTAGTTGCAAGGGTTTATTTTGATTAGTTTCAAAACACGTTACTATGGTTGAACAGCAGAAGAAAAAAAAAGAAGAAAAAAGACTATATGCACCAATGAAAGAGTTGCCGTATAGTTCAGCTTACTCATGCTAGCAAGGCTGCCAATAAAATAAATGTAGATCACGATAGGGCGGTAGAAATGAGTGGGGAAGGAAAACAACTAATATTATATACTAATCTTTTGCCAAGTTTGACCTGAAACAGTAGAAAGGAGTTAAATGACAAGGGAGCTAGTATATACATAGAGAAAGACTTGAGCAGCATCTCGAGAGAGAGCAATACAAAGTGAAGCAGCATAAGCATACTTGAGTCTAGAGGTAGTTTTTTTCTTCCGTACGTGATTTCTGAATCTGTCTCTCCAAAGCTTCAATAGGTGTAAATCCCACAAATGAAAAATTGTAGTTGAAGAATTAGATTATATGTCCTAAATGAACAATTTTTTTAGGGGCACTAGTTGCAAGGGTTTATTTTGATTAGTTTCAAAACACGTTACTATGGTTGAACAGCAGAAGAAAAAAAAAGAAGAAAAAAGACTATATGCACCAATGAAAGAGTTGCCGTATAGTTCAGCTTACTCATGCTAGCAAGGCTGCCAATAAAATAAATGTAGATCACGATAGGGCGGTAGAAATGAGTGGGGAAGGAAAACAACTAATATTATATACTAATCTTTTGCCAAGTTTGACCTGAAACAGTAGAAAGGAGTTAAATGACAAGGGAGCTAGTATATACATAGAGAAAGACTTGAGCAGCATCTCGAGAGAGAGCAATACAAAGTGAAGCAGCATAAGCATACTTGAGTCTAGAGAGATAGGAAGTGAGAGAGGAAGGTGTATGTTGCTACCTCTTTCACATTAGCTACCACCAACAAAGTTATCAGATAGTACTAGGGGCTGGCCATGGATGCGATAGCTCATGTCCCAGGTTCAAACTCTGGAGGATACTCAAGTTCTTGTGAAGAACCGGGTTGCTGAGGCTGAAAGGAACGGATACAAGATTGAAAATATTGTACAGAATTGGCTCAAGAATGCAAATGAGATTGTTGCTGAGGCAAAGAAAGTCATTGATGTTGAAGGAGCTACATGGTGTCTGGGACGATATTGTCCCTCTCGGTGGATAAGATGTCAGCTGAGCAAGCGTCTTGAAGAAACGACAAAAAAGATTACAGATCACATAGAGAAAGGAAAAATTGATACAATTTCTTACCGTGATGCGCCTGATGTCACAACTACACCATTTTCTAGAGGTTATGAAGCACTGGAGTCCAGAACATCAATGCTGAATGAGATTAAGGAAATTCTTAAGGATCCTAAAATGTACATGATTGGGGTGCATGGCATGGGTGGCGTGGGTAAAACCACTCTTGTGAATGAGTTAGCTTGGCAAGTAAAAAAAGATGGATTATTTGTTGCTGTAGCCATAGCCAATATAACCAATTCTCCAAATGTGAAAAAAATTCAAGGCCAAATTGCTGATGCATTGTGGGATCGGAAGCTTAAAAAAGAGACAGAAAGTGGAAGAGCAATAGAACTGCGTGAAAGGATAAAAAAGCAGGAGAAAGTTCTTATTATTCTTGATGACATTTGGAGTGAACTTGATTTGACGGAAGTGGGAATTCCTTTTGGTGATGAACACAATGGTTGCAAATTGGTGATAACTTCCAGAGAACGTGAAGTGCTGATAAAGATGGACACTCAAAAAGATTTTAATCTTACAGCTTTACTGGAGGAGGATAGTTGGAATTTGTTCCAGAAAATAGCAGGTAATGTTAATGAAGTTAGTATAAAACCAATTGCAGAAGAAGTGGCAAAATGTTGTGCTGGTTTGCCTCTTTTGATCACAGCCTTGGGAAAGGGTTTGAGAAAAAAGGAAGTCCATGCTTGGAGGGTTGCCCTGAAACAACTAAAGGAATTTAAGCATAAAGAGTTGGAGAATAATGTCTACCCTGCTTTGAAGTTAAGTTATGATTTTTTAGATACAGAGGAATTGAAGTCACTATTCTTATTTATTGGTTCATTTGGACTAAATGAGATGCTCACTGAAGATTTGTTTATATGCTGTTGGGGGTTGGGCTTTTATGGTGGCGTGGACAAATTGATGGAGGCAAGAGACACACATTACACATTAATAAATGAGCTTAGGGCCTCTTCATTATTGCTTGAAGGTAAACTTGATTGGGTTGGAATGCATGATGTTGTGCGTGACGTGGCTAAATCAATTGCATCTAAGTCTCCTCCGACCGACCCGACCTATCCCACCTATGCAGATCAGTTTGGCAAGTGCCATTATATTAGATTTCAGTCTTCCTTGACTGAAGTCCAAGCTGATAAATCTTTCTCTGGGATGATGAAAGAAGTGATGACTTTGATTTTACATAAAATGTCCTTCACCCCTTTCCTACCCCCTTCTCTCAATCTCTTGATAAACCTTCGCTCATTGAATCTGAGAAGATGTAAATTGGGAGACATAAGGATAGTGGCCGAACTCTCAAATTTAGAAATTCTTTCCTTGGCCGAGTCTAGTTTTGCAGACCTCCCAGTTGAAATAAAACATCTGACTCGTCTTCGTTTGCTAAATTTAACAGACTGCTATGATCTAAGAGTCATTCCTACAAATATTATATCAAGTTTGATGTGCTTAGAAGAATTGTACATGGGAGGTTGCAATAATATTGAATGGGAGGTTGAAGGAAGCAAAAGTGAAAGCAACAATGCTAACGTACGTGAGTTACAGGATTTGCATAATTTGACAACTTTGGAGATATCATTCATAGATACTTCGGTTTTGCCAATGGACTTCCAGTTCCCTGCAAATCTCGAAAGATACCACATATTGATTAGTGATCTGGGGGAATGGGAGTTGTCTTCAATATGGTATGGTAGAGCTCTCGGAAGAACACTTAAGCTCAAAGACTATTGGCGGACGAGCAGATCGTTGTTCACCACAGTTGAGGACTTGAGATTTGCTAAATTAAAGGGTATTAAGGATTTGTTGTATAATTTGGATGTGGGAGGTTTTTCTCAATTAAAGCATTTGTATATCCAAGACAATGATGAATTGTTGTACCTCATTAACACAAGAAGGTTGATGAATCACCATTCTGCATTCCTCAATTTGGAGACTTTGGTTCTTAAGTTGCTGTATAAGATGGAAGAAATATGTCATGGTCCAATGCAGACACAGTCTCTTGCAAAGCTAAAAGTTATTAAAGTTACATATTGCAATGGGTTGAAGAATCTATTTTTGTATTCTCTCACAGGAAACCTTTCTCAACTTCATGATATGGAAATTTCTCATTGTAGAGGTATGACAGAGATCATAGCTATGGAAAAACAAGAGGATTGGAAAGAACTTCAACAGATTGTTCTGCCTGAATTGCATTCTGTCACTTTAGAAGGTTTACCTGAGCTTCAGAGTTTCTATTGTTCTGTAACAGTCGATCAGGGTAATCCATCCGGTCAGAGCAATACTTTGGCACTGTTTAATCAACAGGTGGTGATCCCTAAACTTGAAAAATTGAAATTATATGACATGAATGTATTCAAGATATGGGATGATAAACTTCCCGTCCTTTCATGCTTTCAAAACTTGAAGAGTTTGATAGTGAGCAAATGTAATTGTTTCACAAGTTTATTCCCATATGGAGTGGCAAGAGCACTGGTCAAACTACAACATGTTGAGATTTCCTGGTGCAAAAGGCTGAAAGCCATTTTCGCCCAAGAAGAGGTTCAATTTCCAAACTCGGAGACAGTGAAAATCAGCATCATGAATGATTGGGAATCAATATGGCCTAATCAAGAGCCTCCAAATTCCTTCCATCACAATCTGGATATTGACATTTATGACTGTAAAAGCATGGATTTTGTCATTCCCACCTCTGCTGCTAAAGAGTTTCATCAGCAGCACCAATTTCTTGAAATAAGATCGTGTGGCATAAAGAATATTGTTGAAAAAAGTGATATTATTTGTGATATGACGCATGTTTACCTTGAAAAAATAACTGTAGCAGAGTGTCCAGGCATGAAGACCATAATTCCATCCTTTGTGCTATTTCAGTGTTTAGATGAATTGATTGTGTCCAGTTGTCATGGACTGGTAAATATTATAAGGCCATCAACAACCACAAGTTTACCAAACCTCCGCATTTTAAGGATAAGTGAATGTGATGAGCTAGAGGAAATTTATGGAAGCAATAATGAGAGTGATGATACACCACTGGGCGAGATTGCTTTTAGGAAATTGGAGGAATTGACATTGGAATACTTACCGAGGCTCACAAGCTTTTGCCAGGGAAGTTATGGCTTCAGGTTTCCATCATTACAAAAGGTACATTTGAAAGATTGTCCAATGATGGAGACTTTTTGTCAGGGAAACTTAACCACACCAAGCCTCACAAAGGTGGAATATGAAGGGATACAATATGTTTGGCATTCTAGTAAACTGAGTGAAGATCATTGGTATGGCGACCTTAA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>Glyma.15g247400.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g247400.5.p locus=Glyma.15g247400 ID=Glyma.15g247400.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.15g247400.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g247400.6.p locus=Glyma.15g247400 ID=Glyma.15g247400.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.15g247400
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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