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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G74960.1 | AT | fatty acid biosynthesis 1 | JGI | N/A | IEA |
GO:0006633 | GO-bp | fatty acid biosynthetic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0008152 | GO-bp | metabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0003824 | GO-mf | catalytic activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016740 | GO-mf | transferase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016747 | GO-mf | transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
KOG1394 | KOG | 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase (I and II) | JGI | N/A | IEA |
PTHR11712 | Panther | POLYKETIDE SYNTHASE-RELATED | JGI | N/A | IEA |
PTHR11712:SF52 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00109 | PFAM | Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain | JGI | N/A | IEA |
PF02801 | PFAM | Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain | JGI | N/A | IEA |
PWY-5973 | SoyCyc9 | cis-vaccenate biosynthesis | Plant Metabolic Network | ISS | |
GN7V-51564 | SoyCyc9-rxn | β-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase II | Plant Metabolic Network | ISS |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma15g20030 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.15g181500.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g181500.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g181500.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g181500.8 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g181500.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g181500.1.p locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g181500.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g181500.2.p locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g181500.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g181500.3.p locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g181500.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g181500.4.p locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGGTTCTGCCATACTCGCAATGGATCTGGGGTGGATGGGCCCTAATTATTCAATCTCTACAGCGTGTGCTACTAGTAATTTTTGTATATTGAATGCTGCAAACCATATCATTAGAGGTGAAGCTGACTTGATGCTTTGTGGTGGCTCAGATGGTGCTATTGTACCAATTGGCCTAGGAGGCTTTGTGGCATGTAGGACACTCTCACGGAGAAATAGTGATCCTTCTAAAGCTTCACGCCCTTGGGATACTAATCGTGATGGATTTGTCTTAGGAGAAGGTGCTGGTGTTTTGCTTTTGGAAGAATTAGAGCATGCTAAGAAAAGAGGTGCAAATATATATGCAGAGTTCCTTGGTGGAAGTTTCACCTTTGATGCTTATCATGTTACTCAACCACATCCTAATGATGGGGTTGGTGTTATTCTTTGCATGGAAAAGGCATTAAATCATTCTAGAATATCAAGGGAAGATGTGAACTACATAAATGCACATGCCACTTCTACACCAATTGGAGATCTAAAGGAGTATAAGGCTCTAATTCATTGTTTTGGCCAAAATCTTGAGCTAAGAGTGAATTCAACGAAATCTATGATCGGTCACCTACTAGGGGCAGCTGGTGGTGTGGAAGCCGTAGCAACAATACAGGCAATAAAGACAGGGTGGGTTCATCCCAATATCAATTTAGAAAACCCAGATGAAGGAGTGAATAACCAGACAATGTATTGGATACTCACACTACTCCTTTGGTTGAACAAAAATGATTATAGGGGGGATTGCTTTCTTGGATGA >Glyma.15g181500.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g181500.5.p locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGACTTCCATAGCCTCTCCATTTTGTACGTGCCTGGTTGCCACTTGGAGGAACCACCTGGTTGCCACTTGGAGGAAGCACCTTCCCAACTCCAACCTTGTGAAGCATTGCAATCTTGTGCCTCGTTCAGGGAAAAAGGCCTTGGTGGATGGTGGAATTACTCAAGACATAATGGATGAGTTAAATAAACAAAAATGTGGGATTTTGATTGGTTCAGCAATGGGTGGCATGCAGATTTGTTATGATGCTGTTGAAGCTTTTCGAGTCTCATATAAGAGGATTAATCCTTTTACTATACCCTTTGCAACAACAAATATGGGTTCTGCCATACTCGCAATGGATCTGGGGTGGATGGGCCCTAATTATTCAATCTCTACAGCGTGTGCTACTAGTAATTTTTGTATATTGAATGCTGCAAACCATATCATTAGAGGTGAAGCTGACTTGATGCTTTGTGGTGGCTCAGATGGTGCTATTGTACCAATTGGCCTAGGAGGCTTTGTGGCATGTAGGACACTCTCACGGAGAAATAGTGATCCTTCTAAAGCTTCACGCCCTTGGGATACTAATCGTGATGGATTTGTCTTAGGAGAAGGTGCTGGTGTTTTGCTTTTGGAAGAATTAGAGCATGCTAAGAAAAGAGGTGCAAATATATATGCAGAGTTCCTTGGTGGAAGTTTCACCTTTGATGCTTATCATGTTACTCAACCACATCCTAATGATGGGGTTGGTGTTATTCTTTGCATGGAAAAGGCATTAAATCATTCTAGAATATCAAGGGAAGATGTGAACTACATAAATGCACATGCCACTTCTACACCAATTGGAGATCTAAAGGAGTATAAGGCTCTAATTCATTGTTTTGGCCAAAATCTTGAGCTAAGAGTGAATTCAACGAAATCTATGATCGGTCACCTACTAGGGGCAGCTGGTGGTGTGGAAGCCGTAGCAACAATACAGGCAATAAAGACAGGGTGGGTTCATCCCAATATCAATTTAGAAAACCCAGATGAAGGAGTGGATACCAATGTTCTTGTCGGCTCTAAGAAAGAGACACTAGATATCAAGGCGGCCATGTCTAATTCATTCGGCTTTGGTGGCCAAAATTCCTCTATCATATTTGCCCCTTTCAAATGCAATAGATTTTAG >Glyma.15g181500.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g181500.6.p locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGGTTCTGCCATACTCGCAATGGATCTGGGGTGGATGGGCCCTAATTATTCAATCTCTACAGCGTGTGCTACTAGTAATTTTTGTATATTGAATGCTGCAAACCATATCATTAGAGGTGAAGCTGACTTGATGCTTTGTGGTGGCTCAGATGGTGCTATTGTACCAATTGGCCTAGGAGGCTTTGTGGCATGTAGGACACTCTCACGGAGAAATAGTGATCCTTCTAAAGCTTCACGCCCTTGGGATACTAATCGTGATGGATTTGTCTTAGGAGAAGGTGCTGGTGTTTTGCTTTTGGAAGAATTAGAGCATGCTAAGAAAAGAGGTGCAAATATATATGCAGAGTTCCTTGGTGGAAGTTTCACCTTTGATGCTTATCATGTTACTCAACCACATCCTAATGATGGGGTTGGTGTTATTCTTTGCATGGAAAAGGCATTAAATCATTCTAGAATATCAAGGGAAGATGTGAACTACATAAATGCACATGCCACTTCTACACCAATTGGAGATCTAAAGGAGTATAAGGCTCTAATTCATTGTTTTGGCCAAAATCTTGAGCTAAGAGTGAATTCAACGAAATCTATGATCGGTCACCTACTAGGGGCAGCTGGTGGTGTGGAAGCCGTAGCAACAATACAGGCAATAAAGACAGGGTGGGTTCATCCCAATATCAATTTAGAAAACCCAGATGAAGGAGTGGATACCAATGTTCTTGTCGGCTCTAAGAAAGAGACACTAGATATCAAGGCGGCCATGTCTAATTCATTCGGCTTTGGTGGCCAAAATTCCTCTATCATATTTGCCCCTTTCAAATGCAATAGATTTTAG >Glyma.15g181500.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g181500.7.p locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGACTTCCATAGCCTCTCCATTTTGTACGTGCCTGGTTGCCACTTGGAGGAACCACCTGGTTGCCACTTGGAGGAAGCACCTTCCCAACTCCAACCTTGTGAAGCATTGCAATCTTGTGCCTCGTTCAGGGAAAAAGGCCTTGGTGGATGGTGGAATTACTCAAGACATAATGGATGAGTTAAATAAACAAAAATGTGGGATTTTGATTGGTTCAGCAATGGGTGGCATGCAGATTTGTTATGATGCTGTTGAAGCTTTTCGAGTCTCATATAAGAGGATTAATCCTTTTACTATACCCTTTGCAACAACAAATATGGGTTCTGCCATACTCGCAATGGATCTGGGGTGGATGGGCCCTAATTATTCAATCTCTACAGCGTGTGCTACTAGTAATTTTTGTATATTGAATGCTGCAAACCATATCATTAGAGGTGAAGCTGACTTGATGCTTTGTGGTGGCTCAGATGGTGCTATTGTACCAATTGGCCTAGGAGGCTTTGTGGCATGTAGGACACTCTCACGGAGAAATAGTGATCCTTCTAAAGCTTCACGCCCTTGGGATACTAATCGTGATGGATTTGTCTTAGGAGAAGGTGCTGGTGTTTTGCTTTTGGAAGAATTAGAGCATGCTAAGAAAAGAGGTGCAAATATATATGCAGAGTTCCTTGGTGGAAGTTTCACCTTTGATGCTTATCATGTTACTCAACCACATCCTAATGATGGGGTTGGTGTTATTCTTTGCATGGAAAAGGCATTAAATCATTCTAGAATATCAAGGGAAGATGTGAACTACATAAATGCACATGCCACTTCTACACCAATTGGAGATCTAAAGGAGTATAAGGCTCTAATTCATTGTTTTGGCCAAAATCTTGAGGTGAAATAA >Glyma.15g181500.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g181500.8.p locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGACTTCCATAGCCTCTCCATTTTGTACGTGCCTGGTTGCCACTTGGAGGAACCACCTGGTTGCCACTTGGAGGAAGCACCTTCCCAACTCCAACCTTGTGAAGCATTGCAATCTTGTGCCTCGTTCAGGTAAAGCGATGGTTGTAGCTTTGCAACCTACTCAAGACGCTACAATAATGAGAAAACCTACAAAACACAGGCGAGTAGTTGTGACAGGCATGAGTGTGGTTACACCACTTGGTCATGATCCTGATGTCTTCTATAGTAATTTACTTGAGGGTGTTAGCGGGATAAGCAAGATTGATACTTTTGACTGTGAAGAATTTCCAACGAGAATAGGTGGTGAGATCAAGTCCTTTTCAACTGATGGTTGGGTAGCACCAAAACTTTCAAAGAGGATGGATAAATATATGTTGTATTTGCTAACGGCAGGGAAAAAGGCCTTGGTGGATGGTGGAATTACTCAAGACATAATGGATGAGTTAAATAAACAAAAATGTGGGATTTTGATTGGTTCAGCAATGGGTGGCATGCAGATTTGTTATGATGCTGTTGAAGCTTTTCGAGTCTCATATAAGAGGATTAATCCTTTTACTATACCCTTTGCAACAACAAATATGGGTTCTGCCATACTCGCAATGGATCTGGGGTGGATGGGCCCTAATTATTCAATCTCTACAGCGTGTGCTACTAGTAATTTTTGTATATTGAATGCTGCAAACCATATCATTAGAGGTGAAGCTGACTTGATGCTTTGTGGTGGCTCAGATGGTGCTATTGTACCAATTGGCCTAGGAGGCTTTGTGGCATGTAGGACACTCTCACGGAGAAATAGTGATCCTTCTAAAGCTTCACGCCCTTGGGATACTAATCGTGATGGATTTGTCTTAGGAGAAGGTGCTGGTGTTTTGCTTTTGGAAGAATTAGAGCATGCTAAGAAAAGAGGTGCAAATATATATGCAGAGTTCCTTGGTGGAAGTTTCACCTTTGATGCTTATCATGTTACTCAACCACATCCTAATGATGGGGTTGGTGTTATTCTTTGCATGGAAAAGGCATTAAATCATTCTAGAATATCAAGGGAAGATGTGAACTACATAAATGCACATGCCACTTCTACACCAATTGGAGATCTAAAGGAGTATAAGGCTCTAATTCATTGTTTTGGCCAAAATCTTGAGGTGAAATAA
>Glyma.15g181500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g181500.1 locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MTSIASPFCTCLVATWRNHLVATWRKHLPNSNLVKHCNLVPRSGKAMVVALQPTQDATIMRKPTKHRRVVVTGMSVVTPLGHDPDVFYSNLLEGVSGISKIDTFDCEEFPTRIGGEIKSFSTDGWVAPKLSKRMDKYMLYLLTAGKKALVDGGITQDIMDELNKQKCGILIGSAMGGMQICYDAVEAFRVSYKRINPFTIPFATTNMGSAILAMDLGWMGPNYSISTACATSNFCILNAANHIIRGEADLMLCGGSDGAIVPIGLGGFVACRTLSRRNSDPSKASRPWDTNRDGFVLGEGAGVLLLEELEHAKKRGANIYAEFLGGSFTFDAYHVTQPHPNDGVGVILCMEKALNHSRISREDVNYINAHATSTPIGDLKEYKALIHCFGQNLELRVNSTKSMIGHLLGAAGGVEAVATIQAIKTGWVHPNINLENPDEGVDTNVLVGSKKETLDIKAAMSNSFGFGGQNSSIIFAPFKCNRF* >Glyma.15g181500.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g181500.2 locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MTSIASPFCTCLVATWRNHLVATWRKHLPNSNLVKHCNLVPRSGKKALVDGGITQDIMDELNKQKCGILIGSAMGGMQICYDAVEAFRVSYKRINPFTIPFATTNMGSAILAMDLGWMGPNYSISTACATSNFCILNAANHIIRGEADLMLCGGSDGAIVPIGLGGFVACRTLSRRNSDPSKASRPWDTNRDGFVLGEGAGVLLLEELEHAKKRGANIYAEFLGGSFTFDAYHVTQPHPNDGVGVILCMEKALNHSRISREDVNYINAHATSTPIGDLKEYKALIHCFGQNLELRVNSTKSMIGHLLGAAGGVEAVATIQAIKTGWVHPNINLENPDEGVNNQTMYWILTLLLWLNKNDYRGDCFLG* >Glyma.15g181500.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g181500.3 locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MTSIASPFCTCLVATWRNHLVATWRKHLPNSNLVKHCNLVPRSGKAMVVALQPTQDATIMRKPTKHRRVVVTGMSVVTPLGHDPDVFYSNLLEGVSGISKIDTFDCEEFPTRIGGEIKSFSTDGWVAPKLSKRMDKYMLYLLTAGKKALVDGGITQDIMDELNKQKCGILIGSAMGGMQICYDAVEAFRVSYKRINPFTIPFATTNMGSAILAMDLGWMGPNYSISTACATSNFCILNAANHIIRGEADLMLCGGSDGAIVPIGLGGFVACRTLSRRNSDPSKASRPWDTNRDGFVLGEGAGVLLLEELEHAKKRGANIYAEFLGGSFTFDAYHVTQPHPNDGVGVILCMEKALNHSRISREDVNYINAHATSTPIGDLKEYKALIHCFGQNLELRVNSTKSMIGHLLGAAGGVEAVATIQAIKTGWVHPNINLENPDEGVNNQTMYWILTLLLWLNKNDYRGDCFLG* >Glyma.15g181500.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g181500.4 locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MGSAILAMDLGWMGPNYSISTACATSNFCILNAANHIIRGEADLMLCGGSDGAIVPIGLGGFVACRTLSRRNSDPSKASRPWDTNRDGFVLGEGAGVLLLEELEHAKKRGANIYAEFLGGSFTFDAYHVTQPHPNDGVGVILCMEKALNHSRISREDVNYINAHATSTPIGDLKEYKALIHCFGQNLELRVNSTKSMIGHLLGAAGGVEAVATIQAIKTGWVHPNINLENPDEGVNNQTMYWILTLLLWLNKNDYRGDCFLG* >Glyma.15g181500.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g181500.5 locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MTSIASPFCTCLVATWRNHLVATWRKHLPNSNLVKHCNLVPRSGKKALVDGGITQDIMDELNKQKCGILIGSAMGGMQICYDAVEAFRVSYKRINPFTIPFATTNMGSAILAMDLGWMGPNYSISTACATSNFCILNAANHIIRGEADLMLCGGSDGAIVPIGLGGFVACRTLSRRNSDPSKASRPWDTNRDGFVLGEGAGVLLLEELEHAKKRGANIYAEFLGGSFTFDAYHVTQPHPNDGVGVILCMEKALNHSRISREDVNYINAHATSTPIGDLKEYKALIHCFGQNLELRVNSTKSMIGHLLGAAGGVEAVATIQAIKTGWVHPNINLENPDEGVDTNVLVGSKKETLDIKAAMSNSFGFGGQNSSIIFAPFKCNRF* >Glyma.15g181500.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g181500.6 locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MGSAILAMDLGWMGPNYSISTACATSNFCILNAANHIIRGEADLMLCGGSDGAIVPIGLGGFVACRTLSRRNSDPSKASRPWDTNRDGFVLGEGAGVLLLEELEHAKKRGANIYAEFLGGSFTFDAYHVTQPHPNDGVGVILCMEKALNHSRISREDVNYINAHATSTPIGDLKEYKALIHCFGQNLELRVNSTKSMIGHLLGAAGGVEAVATIQAIKTGWVHPNINLENPDEGVDTNVLVGSKKETLDIKAAMSNSFGFGGQNSSIIFAPFKCNRF* >Glyma.15g181500.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g181500.7 locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MTSIASPFCTCLVATWRNHLVATWRKHLPNSNLVKHCNLVPRSGKKALVDGGITQDIMDELNKQKCGILIGSAMGGMQICYDAVEAFRVSYKRINPFTIPFATTNMGSAILAMDLGWMGPNYSISTACATSNFCILNAANHIIRGEADLMLCGGSDGAIVPIGLGGFVACRTLSRRNSDPSKASRPWDTNRDGFVLGEGAGVLLLEELEHAKKRGANIYAEFLGGSFTFDAYHVTQPHPNDGVGVILCMEKALNHSRISREDVNYINAHATSTPIGDLKEYKALIHCFGQNLEVK* >Glyma.15g181500.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g181500.8 locus=Glyma.15g181500 ID=Glyma.15g181500.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MTSIASPFCTCLVATWRNHLVATWRKHLPNSNLVKHCNLVPRSGKAMVVALQPTQDATIMRKPTKHRRVVVTGMSVVTPLGHDPDVFYSNLLEGVSGISKIDTFDCEEFPTRIGGEIKSFSTDGWVAPKLSKRMDKYMLYLLTAGKKALVDGGITQDIMDELNKQKCGILIGSAMGGMQICYDAVEAFRVSYKRINPFTIPFATTNMGSAILAMDLGWMGPNYSISTACATSNFCILNAANHIIRGEADLMLCGGSDGAIVPIGLGGFVACRTLSRRNSDPSKASRPWDTNRDGFVLGEGAGVLLLEELEHAKKRGANIYAEFLGGSFTFDAYHVTQPHPNDGVGVILCMEKALNHSRISREDVNYINAHATSTPIGDLKEYKALIHCFGQNLEVK*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||