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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT5G57110.1 | AT | autoinhibited Ca2+ -ATPase, isoform 8 | JGI | N/A | IEA |
GO:0006811 | GO-bp | ion transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0006816 | GO-bp | calcium ion transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0070588 | GO-bp | calcium ion transmembrane transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0099132 | GO-bp | ATP hydrolysis coupled cation transmembrane transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016020 | GO-cc | membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0000166 | GO-mf | nucleotide binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0000166 | GO-mf | nucleotide binding | JGI | N/A | IEA |
GO:0005388 | GO-mf | calcium-transporting ATPase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005516 | GO-mf | calmodulin binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005516 | GO-mf | calmodulin binding | JGI | N/A | IEA |
GO:0005524 | GO-mf | ATP binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016787 | GO-mf | hydrolase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0046872 | GO-mf | metal ion binding | JGI | N/A | IEA |
KOG0204 | KOG | Calcium transporting ATPase | JGI | N/A | IEA |
PTHR24093 | Panther | FAMILY NOT NAMED | JGI | N/A | IEA |
PTHR24093:SF73 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00122 | PFAM | E1-E2 ATPase | JGI | N/A | IEA |
PF00689 | PFAM | Cation transporting ATPase, C-terminus | JGI | N/A | IEA |
PF00690 | PFAM | Cation transporter/ATPase, N-terminus | JGI | N/A | IEA |
PF00702 | PFAM | haloacid dehalogenase-like hydrolase | JGI | N/A | IEA |
PF12515 | PFAM | Ca2+-ATPase N terminal autoinhibitory domain | JGI | N/A | IEA |
Glyma.15g167500 not represented in the dataset |
Glyma.15g167500 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.09g061200 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|
>Glyma.15g167500.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g167500 ID=Glyma.15g167500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g167500.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g167500 ID=Glyma.15g167500.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g167500.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g167500 ID=Glyma.15g167500.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g167500.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g167500.1.p locus=Glyma.15g167500 ID=Glyma.15g167500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g167500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g167500.1 locus=Glyma.15g167500 ID=Glyma.15g167500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSFLNASSPRYAAESDIEAGTSARRSADLDDGDFSDPFDIARTKNASVERLRRWRQAALVLNASRRFRYTLDLKKEEEKKQILRKIRAHAQAIRAAYLFKAAGVGPGSEPIKPPPIPTAGEFPIGQEQLASISREHDTAALQQYGGVVGLSNLLKTNSEKGIHGDDADLLKRRNAFGSNNYPRKKGRNFLMFMWDACKDLTLVILMVAAAASLALGIKSEGIKEGWYDGGSIAFAVILVIVVTAISDYKQSLQFRDLNEEKRNIHLEVVRGGRRVEISIYDIVVGDVIPLNIGNQVPADGILITGHSLAIDESSMTGESKIVHKDSKDPFLMSGCKVADGSGTMLVTGVGINTEWGLLMASISEDTGEETPLQVRLNGVATFIGIVGLTVAVIVLIVLLARYFSGHTKNPDGSVQFIAGKTKVGDAIDGAIKIITVAVTIVVVAVPEGLPLAVTLTLAYSMRKMMADKALVRRLSACETMGSATTICSDKTGTLTMNQMTVVEAYAGGKKIDPPHKLESYPMLRSLLIEGVAQNTNGSVYAPEGANDVEVSGSPTEKAILQWGIQIGMNFMAARSESSIIHVFPFNSEKKRGGVAIQTADCNIHIHWKGAAEIVLACCTGYVDVNDQLVGMDEEKMTFFKKAIEDMAADSLRCVAIAYRSYEKEKVPTNEELLSHWSLPEDDLILLAIVGLKDPCRPGVKQAVELCQKAGVKVKMVTGDNVKTAKAIALECGILNSYADATEPNIIEGKTFRGYSDAQRDEIADRISVMGRSSPNDKLLLVQALRRKGHVVAVTGDGTNDAPALHEADIGLAMGIQGTEVAKESSDIIILDDNFASVVKVVRWGRSVYANIQKFIQFQLTVNVAALVINVVAAISSGDVPLNAVQLLWVNLIMDTLGALALATEPPTDHLMDRSPVGRREPLITNIMWRNLLIQAMYQVSVLLVLNFRGISILGLSHDRKAHAIKVKNTLIFKAFVLCQIFNEFNARKPDEFNIFKGVTRNYLFMGIIGLTVVLQIVIIEFLGKFTSTVRLNWKHWLISVVIGLIGWPLAVIGKLIPVPTTPINNVFSKFRISRKKEPEESQ* >Glyma.15g167500.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g167500.2 locus=Glyma.15g167500 ID=Glyma.15g167500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSFLNASSPRYAAESDIEAGTSARRSADLDDGDFSDPFDIARTKNASVERLRRWRQAALVLNASRRFRYTLDLKKEEEKKQILRKIRAHAQAIRAAYLFKAAGVGPGSEPIKPPPIPTAGEFPIGQEQLASISREHDTAALQQYGGVVGLSNLLKTNSEKGIHGDDADLLKRRNAFGSNNYPRKKGRNFLMFMWDACKDLTLVILMVAAAASLALGIKSEGIKEGWYDGGSIAFAVILVIVVTAISDYKQSLQFRDLNEEKRNIHLEVVRGGRRVEISIYDIVVGDVIPLNIGNQVPADGILITGHSLAIDESSMTGESKIVHKDSKDPFLMSGCKVADGSGTMLVTGVGINTEWGLLMASISEDTGEETPLQVRLNGVATFIGIVGLTVAVIVLIVLLARYFSGHTKNPDGSVQFIAGKTKVGDAIDGAIKIITVAVTIVVVAVPEGLPLAVTLTLAYSMRKMMADKALVRRLSACETMGSATTICSDKTGTLTMNQMTVVEAYAGGKKIDPPHKLESYPMLRSLLIEGVAQNTNGSVYAPEGANDVEVSGSPTEKAILQWGIQIGMNFMAARSESSIIHVFPFNSEKKRGGVAIQTADCNIHIHWKGAAEIVLACCTGYVDVNDQLVGMDEEKMTFFKKAIEDMAADSLRCVAIAYRSYEKEKVPTNEELLSHWSLPEDDLILLAIVGLKDPCRPGVKQAVELCQKAGVKVKMVTGDNVKTAKAIALECGILNSYADATEPNIIEGKTFRGYSDAQRDEIADRISVMGRSSPNDKLLLVQALRRKGHVVAVTGDGTNDAPALHEADIGLAMGIQGTEVAKESSDIIILDDNFASVVKVVRWGRSVYANIQKFIQFQLTVNVAALVINVVAAISSGDVPLNAVQLLWVNLIMDTLGALALATEPPTDHLMDRSPVGRREPLITNIMWRNLLIQAMYQVSVLLVLNFRGISILGLSHDRKAHAIKVKNTLIFKAFVLCQIFNEFNARKPDEFNIFKGVTRNYLFMGIIGLTVVLQIVIIEFLGKFTSTVRLNWKHWLISVVIGLIGWPLAVIGKLIPVPTTPINNVFSKFRISRKKEPEESQ* >Glyma.15g167500.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g167500.3 locus=Glyma.15g167500 ID=Glyma.15g167500.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSFLNASSPRYAAESDIEAGTSARRSADLDDGDFSDPFDIARTKNASVERLRRWRQAALVLNASRRFRYTLDLKKEEEKKQILRKIRAHAQAIRAAYLFKAAGVGPGSEPIKPPPIPTAGEFPIGQEQLASISREHDTAALQQYGGVVGLSNLLKTNSEKGIHGDDADLLKRRNAFGSNNYPRKKGRNFLMFMWDACKDLTLVILMVAAAASLALGIKSEGIKEGWYDGGSIAFAVILVIVVTAISDYKQSLQFRDLNEEKRNIHLEVVRGGRRVEISIYDIVVGDVIPLNIGNQVPADGILITGHSLAIDESSMTGESKIVHKDSKDPFLMSGCKVADGSGTMLVTGVGINTEWGLLMASISEDTGEETPLQVRLNGVATFIGIVGLTVAVIVLIVLLARYFSGHTKNPDGSVQFIAGKTKVGDAIDGAIKIITVAVTIVVVAVPEGLPLAVTLTLAYSMRKMMADKALVRRLSACETMGSATTICSDKTGTLTMNQMTVVEAYAGGKKIDPPHKLESYPMLRSLLIEGVAQNTNGSVYAPEGANDVEVSGSPTEKAILQWGIQIGMNFMAARSESSIIHVFPFNSEKKRGGVAIQTADCNIHIHWKGAAEIVLACCTGYVDVNDQLVGMDEEKMTFFKKAIEDMAADSLRCVAIAYRSYEKEKVPTNEELLSHWSLPEDDLILLAIVGLKDPCRPGVKQAVELCQKAGVKVKMVTGDNVKTAKAIALECGILNSYADATEPNIIEGKTFRGYSDAQRDEIADRISVMGRSSPNDKLLLVQALRRKGHVVAVTGDGTNDAPALHEADIGLAMGIQGTEVAKESSDIIILDDNFASVVKVVRWGRSVYANIQKFIQFQLTVNVAALVINVVAAISSGDVPLNAVQLLWVNLIMDTLGALALATEPPTDHLMDRSPVGRREPLITNIMWRNLLIQAMYQVSVLLVLNFRGISILGLSHDRKAHAIKVKNTLIFKAFVLCQIFNEFNARKPDEFNIFKGVTRNYLFMGIIGLTVVLQIVIIEFLGKFTSTVRLNWKHWLISVVIGLIGWPLAVIGKLIPVPTTPINNVFSKFRISRKKEPEESQ* >Glyma.15g167500.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g167500.4 locus=Glyma.15g167500 ID=Glyma.15g167500.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSFLNASSPRYAAESDIEAGTSARRSADLDDGDFSDPFDIARTKNASVERLRRWRQAALVLNASRRFRYTLDLKKEEEKKQILRKIRAHAQAIRAAYLFKAAGVGPGSEPIKPPPIPTAGEFPIGQEQLASISREHDTAALQQYGGVVGLSNLLKTNSEKGIHGDDADLLKRRNAFGSNNYPRKKGRNFLMFMWDACKDLTLVILMVAAAASLALGIKSEGIKEGWYDGGSIAFAVILVIVVTAISDYKQSLQFRDLNEEKRNIHLEVVRGGRRVEISIYDIVVGDVIPLNIGNQVPADGILITGHSLAIDESSMTGESKIVHKDSKDPFLMSGCKVADGSGTMLVTGVGINTEWGLLMASISEDTGEETPLQVRLNGVATFIGIVGLTVAVIVLIVLLARYFSGHTKNPDGSVQFIAGKTKVGDAIDGAIKIITVAVTIVVVAVPEGLPLAVTLTLAYSMRKMMADKALVRRLSACETMGSATTICSDKTGTLTMNQMTVVEAYAGGKKIDPPHKLESYPMLRSLLIEGVAQNTNGSVYAPEGANDVEVSGSPTEKAILQWGIQIGMNFMAARSESSIIHVFPFNSEKKRGGVAIQTADCNIHIHWKGAAEIVLACCTGYVDVNDQLVGMDEEKMTFFKKAIEDMAADSLRCVAIAYRSYEKEKVPTNEELLSHWSLPEDDLILLAIVGLKDPCRPGVKQAVELCQKAGVKVKMVTGDNVKTAKAIALECGILNSYADATEPNIIEGKTFRGYSDAQRDEIADRISVMGRSSPNDKLLLVQALRRKGHVVAVTGDGTNDAPALHEADIGLAMGIQGTEVAKESSDIIILDDNFASVVKVVRWGRSVYANIQKFIQFQLTVNVAALVINVVAAISSGDVPLNAVQLLWVNLIMDTLGALALATEPPTDHLMDRSPVGRREPLITNIMWRNLLIQAMYQVSVLLVLNFRGISILGLSHDRKAHAIKVKNTLIFKAFVLCQIFNEFNARKPDEFNIFKGVTRNYLFMGIIGLTVVLQIVIIEFLGKFTSTVRLNWKHWLISVVIGLIGWPLAVIGKLIPVPTTPINNVFSKFRISRKKEPEESQ*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||