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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT2G39445.1 | AT | Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase, GPI19/PIG-P subunit | JGI | N/A | IEA |
GO:0006506 | GO-bp | GPI anchor biosynthetic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0000506 | GO-cc | glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016020 | GO-cc | membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0017176 | GO-mf | phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
KOG2257 | KOG | N-acetylglucosaminyltransferase complex, subunit PIG-P, required for phosphatidylinositol biosynthesis | JGI | N/A | IEA |
PTHR21726 | Panther | PHOSPHATIDYLINOSITOL N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE SUBUNIT P (DOWN SYNDROME CRITICAL REGION PROTEIN 5)-RELATED | JGI | N/A | IEA |
PF08510 | PFAM | PIG-P | JGI | N/A | IEA |
GN7V-41953 | SoyCyc9-rxn | phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.15g092700 not represented in the dataset |
Glyma.15g092700 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.13g219700 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma15g09930 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.15g092700.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 GTTCTCAGTTGGCTCTAGCCGCCACAACGCGGTTTATGTTCTGCTGCTTTCACTCTTCTGTTCAAACTTCGAAATCCAAGTCGCAGTTGCGAAACCGCAACACAAACTGCGATAGCGCCGCCCCGCACCGGGGCGATAGCGGACGCGACGGCCGCTCCTTCAATCCTCCCCGCAGCAGAGGAATTTTGGGCCAGGGTTGGTAGTCCTAGCAGGACTGTCTACAGCATAAGCTTTTGTCCGAAGCCTTTTCGTGTTAATTTTGGTTGGTTGTTGATTAAATTGTCCTGGCTCCATATGTATCTCATGAAATTTTCTGATGATTTTTTTCTGCTCGCTAATATCATCCGTTCTTGACCTTGTTATTGATTATTTTTTTCCGGGTTTGTTCTTTTACATTGTTGTCTTGCTTGCTTAACAATTTGCACGTGTAATGTGTTGTTGAGTTTCTGGTTTAGGTGTTTAACATGTTAACATAGATAAGCTGGGGCAATAGGGGGCTGTACAGGATTCAAGCTTTGAATCTGATATGTTCCCTCAGCAACTTTAGGTAGTGAATATGAGCGTCTGGAATTATATCCAGCGAGGTCCCAGCAAGCTTAGAAATAGACTATACACCTTATTAGGACCTTCCATCCACTTACTACAACAATATGCAACTCTATGCACTAATTACTTAAGACTAAAGCCATGAAAATAAGTATTGCCAGCAATGTGTGTTTTAAAGATAGCTATAAGTTGATCCTTAATGCTCTTGCTGCCATTTTTTTAATATGCTGGGATTATTTTTCTTATTGTTAATACTGATTTTCTGTACAGTGATGTATGCACTCATTTCTATGTCTAAGAGTGTGTCGGGGAATGTAGGTATCGTGTTATGGTTGAATTTGATGTTTAAAACAAACAGAATTTGCATCATTCTTGAGCATTTGTTAAGAGGTTAACTGTAATTGAAGGGATGTGACATGGAAAGTCCCCACTCTCAGAACAGTCCAAGAAGAACCCTCAGTCTGTCGAAAAAGCGGAGGGCAACTGCGTCCTGTTTTGACCCTGATGAGATAAGCTCTGGCTTCGGATTGTCTGGTGATCATGGCCCTAAGCCTTCTGAAGTTTATGGTTTTGTAGGTTCTATTACTACTGTTGTTGCTACAGTTATTTTCTTGGTATGGGCATATGTTCCAGAATCATGGCTACAATCTGTTGGCATCTCTTACTATCCTAGCAGATATTGGGCTCTAGCAGTACCAACTTATGTAATGGTGACCATTGTATTGATGCTGGGATTCTACATTGGCCTTAATTTCATTTCAACACCTTCCCCTGCATCTTTAAACACAGTTTTTGATGAATTCAGTAGGGATCCTTTGAGTCTCGAGTGTACCCTAGAAGATGAGAAACCCATCGAGCCCATTTCAGATATTGGTATTGACAGAATCAATGATATTATGTTCAAAAATAATGCAGCCTAACAATTAAACACATCTCCAGTGATTGGTGGGAGTCGCTGCCAAACAAGTGCTGCTAATTTGGGTTCTTGTACGAGAGGTTATAGCTATTGGACGTGAAATTGATTTAGTTGATTTTGTGAAAGAATGATTTGATTCCATCTTACTGTATAATTTCTTTTTAATGTCAATTTTTCGCTCCGGCTTTTTAGTGCTTATGTCTGCTTATTTCAGTAAACTTTGAACCTTGCTTAGTATTCACATAAGGATAAATTTTCCTTTTATATACTTCCGGATGAATGAATTGTCAGGCCACGGTCATAATTATTTATTGAGTCTTGGAATAATGGAATATGTTCATTGTGCTTTCCG >Glyma.15g092700.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 GTTCTCAGTTGGCTCTAGCCGCCACAACGCGGTTTATGTTCTGCTGCTTTCACTCTTCTGTTCAAACTTCGAAATCCAAGTCGCAGTTGCGAAACCGCAACACAAACTGCGATAGCGCCGCCCCGCACCGGGGCGATAGCGGACGCGACGGCCGCTCCTTCAATCCTCCCCGCAGCAGAGGTCATTGTCGCGGCAAGGGGCCGCTCCGCTCCGGCGCGATACTTAGATTTGCATTAGCATCAAATGAATGCGAATTTTGGGCCAGGGTTGGTAGTCCTAGCAGGACTGTCTACAGCATAAGCTTTTGTCCGAAGCCTTTTCGTGTTAATTTTGGGATGTGACATGGAAAGTCCCCACTCTCAGAACAGTCCAAGAAGAACCCTCAGTCTGTCGAAAAAGCGGAGGGCAACTGCGTCCTGTTTTGACCCTGATGAGATAAGCTCTGGCTTCGGATTGTCTGGTGATCATGGCCCTAAGCCTTCTGAAGTTTATGGTTTTGTAGGTTCTATTACTACTGTTGTTGCTACAGTTATTTTCTTGGTATGGGCATATGTTCCAGAATCATGGCTACAATCTGTTGGCATCTCTTACTATCCTAGCAGATATTGGGCTCTAGCAGTACCAACTTATGTAATGGTGACCATTGTATTGATGCTGGGATTCTACATTGGCCTTAATTTCATTTCAACACCTTCCCCTGCATCTTTAAACACAGTTTTTGATGAATTCAGTAGGGATCCTTTGAGTCTCGAGTGTACCCTAGAAGATGAGAAACCCATCGAGCCCATTTCAGATATTGGTATTGACAGAATCAATGATATTATGTTCAAAAATAATGCAGCCTAACAATTAAACACATCTCCAGTGATTGGTGGGAGTCGCTGCCAAACAAGTGCTGCTAATTTGGGTTCTTGTACGAGAGGTTATAGCTATTGGACGTGAAATTGATTTAGTTGATTTTGTGAAAGAATGATTTGATTCCATCTTACTGTATAATTTCTTTTTAATGTCAATTTTTCGCTCCGGCTTTTTAGTGCTTATGTCTGCTTATTTCAGTAAACTTTGAACCTTGCTTAGTATTCACATAAGGATAAATTTTCCTTTTATATACTTCCGGATGAATGAATTGTCAGGCCACGGTCATAATTATTTATTGAGTCTTGGAATAATGGAATATGTTCATTGTGCTTTCCG >Glyma.15g092700.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g092700.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g092700.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 GTTCTCAGTTGGCTCTAGCCGCCACAACGCGGTTTATGTTCTGCTGCTTTCACTCTTCTGTTCAAACTTCGAAATCCAAGTCGCAGTTGCGAAACCGCAACACAAACTGCGATAGCGCCGCCCCGCACCGGGGCGATAGCGGACGCGACGGCCGCTCCTTCAATCCTCCCCGCAGCAGAGGTCATTGTCGCGGCAAGGGGCCGCTCCGCTCCGGCGCGATACTTAGATTTGCATTAGCATCAAATGAATGCGAATTTTGGGCCAGGGTTGGTAGTCCTAGCAGGACTGTCTACAGCATAAGCTTTTGTCCGAAGCCTTTTCGTGTTAATTTTGTGATGTATGCACTCATTTCTATGTCTAAGAGTGTGTCGGGGAATGGATGTGACATGGAAAGTCCCCACTCTCAGAACAGTCCAAGAAGAACCCTCAGTCTGTCGAAAAAGCGGAGGGCAACTGCGTCCTGTTTTGACCCTGATGAGATAAGCTCTGGCTTCGGATTGTCTGGTGATCATGGCCCTAAGCCTTCTGAAGTTTATGGTTTTGTAGGTTCTATTACTACTGTTGTTGCTACAGTTATTTTCTTGGTATGGGCATATGTTCCAGAATCATGGCTACAATCTGTTGGCATCTCTTACTATCCTAGCAGATGAATTCAGTAGGGATCCTTTGAGTCTCGAGTGTACCCTAGAAGATGAGAAACCCATCGAGCCCATTTCAGATATTGGTATTGACAGAATCAATGATATTATGTTCAAAAATAATGCAGCCTAACAATTAAACACATCTCCAGTGATTGGTGGGAGTCGCTGCCAAACAAGTGCTGCTAATTTGGGTTCTTGTACGAGAGGTTATAGCTATTGGACGTGAAATTGATTTAGTTGATTTTGTGAAAGAATGATTTGATTCCATCTTACTGTATAATTTCTTTTTAATGTCAATTTTTCGCTCCGGCTTTTTAGTGCTTATGTCTGCTTATTTCAGTAAACTTTGAACCTTGCTTAGTATTCACATAAGGATAAATTTTCCTTTTATATACTTCCGGATGAATGAATTGTCAGGCCACGGTCATAATTATTTATTGAGTCTTGGAATAATGGAATATGTTCATTGTGCTTTCCG >Glyma.15g092700.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g092700.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g092700.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g092700.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g092700.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g092700.9 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g092700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g092700.1.p locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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ATGGAAAGTCCCCACTCTCAGAACAGTCCAAGAAGAACCCTCAGTCTGTCGAAAAAGCGGAGGGCAACTGCGTCCTGTTTTGACCCTGATGAGATAAGCTCTGGCTTCGGATTGTCTGGTGATCATGGCCCTAAGCCTTCTGAAGTTTATGGTTTTGTAGGTTCTATTACTACTGTTGTTGCTACAGTTATTTTCTTGGTATGGGCATATGTTCCAGAATCATGGCTACAATCTGTTGGCATCTCTTACTATCCTAGCAGATATTGGGCTCTAGCAGTACCAACTTATGTAATGGTGACCATTGTATTGATGCTGGGATTCTACATTGGCCTTAATTTCATTTCAACACCTTCCCCTGCATCTTTAAACACAGTTTTTGATGAATTCAGTAGGGATCCTTTGAGTCTCGAGTGTACCCTAGAAGATGAGAAACCCATCGAGCCCATTTCAGATATTGGTATTGACAGAATCAATGATATTATGTTCAAAAATAATGCAGCCTAA >Glyma.15g092700.12 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g092700.12.p locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGAAAGTCCCCACTCTCAGAACAGTCCAAGAAGAACCCTCAGTCTGTCGAAAAAGCGGAGGGCAACTGCGTCCTGTTTTGACCCTGATGAGATAAGCTCTGGCTTCGGATTGTCTGGTGATCATGGCCCTAAGCCTTCTGAAGTTTATGGTTTTGTAGGTTCTATTACTACTGTTGTTGCTACAGTTATTTTCTTGGTATGGGCATATGTTCCAGAATCATGGCTACAATCTGTTGGCATCTCTTACTATCCTAGCAGATATTGGGCTCTAGCAGTACCAACTTATGTAATGGTGACCATTGTATTGATGCTGGGATTCTACATTGGCCTTAATTTCATTTCAACACCTTCCCCTGCATCTTTAAACACAGTTTTTGATGAATTCAGTAGGGATCCTTTGAGTCTCGAGTGTACCCTAGAAGATGAGAAACCCATCGAGCCCATTTCAGATATTGGTATTGACAGAATCAATGATATTATGTTCAAAAATAATGCAGCCTAA >Glyma.15g092700.13 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g092700.13.p locus=Glyma.15g092700 ID=Glyma.15g092700.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||