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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G02170.1 | AT | metacaspase 1 | JGI | N/A | IEA |
GO:0006508 | GO-bp | proteolysis | JGI | N/A | IEA |
GO:0004197 | GO-mf | cysteine-type endopeptidase activity | JGI | N/A | IEA |
KOG1546 | KOG | Metacaspase involved in regulation of apoptosis | JGI | N/A | IEA |
PF00656 | PFAM | Caspase domain | JGI | N/A | IEA |
Glyma.15g054100 not represented in the dataset |
Glyma.15g054100 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma15g05955 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.15g054100.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 TCGTATTCAACTTTTGGATTGGCAATAGAGTTGTCTGAGACCCGAGAAGACAGCGGGAATGGATTCCTCATTTAATTTGGCTTTTCTTATCAATGGAAGCCCATGCATGCACATAGATAGATGAAAAGTGAAACTAGTCTCCTCTATATATCCTTGTCGTTGGTTACACGTTTGGCCTATAGAGAAAACTAATTTTCAAAAAATGAATGGTAAACATAAAACTGGATCACGGAGAAAGAATGTTCCTTTCCCCGCAAACACTAGTACAACTCGTTGCCTTTTTTCTTCTAAGATGAATAGTTCAAAGCGTGCTGGGGAAGCAAAATTTACCTGCAGTGGTTGCGAACGCAAGTTTCTATTACCTACAATCACAAATGCATACCGTTGCTATAAATGTGATAGTGTCGCCAATTCAACTTTAGGTTCTGAGCAATCAAGGAAAGACAGTGGAGTCTGCAAACATGATCAACTGAATAATGCTTACCCAAATGGAGCTTTGCTGCCACCTTCAGCTAGTTGTTCCTTGTCATTATCCATGACGATGGGTAACAAGCGTGCAGTTATATGTGGAGTTACATACGGGAAAAGGAAATTCAAGCTAGAAGGAACCATTAATGATGTTAATAACATGAAAAATCTACTTCTTGATAACTTTAAATTCCCAATTGGGTGCATACGTGTCCTTACAGAAGAACAGAAGGATCCCAATTTAATTCCAACAAAGAAGAACATACTGGATTCCTTAAATTGGCTCGTGAAGGACTGCCAGTCAGAGGACTCATTAGTCTTCTACTTCTCAGGACATGGTTTGCAACAACCAGAAGATCGCAAAGGAGATGAAATTGACGGGCTTGATGAAACTATTTGTCCTGTTGATTTTTTGAGAGAAGGAATGATCACTGACAATGAAATAAATTCTATCATTGTTCAACCACTCAAGCAAGGTGTCACACTTCATGCTATTATTGATGCTTGTCATAGTGGAACAACACTTGATCTTCTGTATCTTTGCAAAAAAGAAAAAGGCAGTTGGAAATGGAAGGATAACAAACCACCTCATAGTAAAGAAACTATGACAACACAAACAAATGGTGGACTTGCTATTTGCCTCAGTGCTTGTGAAGATGGTCAGATGGCTGCTGATACTGCAGCTTTTGATGGAAACAGGTTTAACGGTCTTGTGACCTATCTTTTCTCACAAATAATTAGAGATAATCCTGAAATAACATATGGTGGTTTACTAGAAAAGCTACATCAGGAAATTGGAAATATCCATCAAAGCAAATTCTCCAACAGCATCTTGAAACGTATTTTTCACCGAAAAATTGATCAGGATCCTCATTTATCATCGTCAGAGAAATTTGATATTGCTACAAGAATTTTTAAATTGTGAGCATGTTAACGTTATTCCTTGTCATTATCCATGACGATGGGTAACAAGCGCGCAGTTATATGTGGAGTTACATTCGGGAAAAGGAAATTCAAGCTCAAAGGAGCCATTAATGATGTTAATAACATAAAAAATCTACTTCTTGATATCTTTAAATTCCCAATTGGGTGCATACGTGTCCTCAGAAGAACAGAAGGATCCCAATTTAATTCCAACAAAAAAGAACATACTGGAATCATTAAATTGGCTTGTGAAGGACTGCCGGTCAGAGGACTCATTAGTCTTCTACTTTGCCGGACATGGTCTGCAACAAACAGAATATCATGAAATTGGATTCTTAATATACAACAAAATCTTGCAAAAAAAGAAAGAAAGAATAAAGTCTGTACTGATTACGGGTTAGTGGAGATGTTTCTACAACAACAAAAAAAAAGATTAAAAGCGCAGGAGTGCAGGACTTTATTAGGCTTGTGTATAGTAAGCTTCAGTTTTGTTTCACTCACCATTTTCTATGTAAATTGAATACAAAGGTTGTAATAGTGACTCCTCCAATAGTTATACTTCT >Glyma.15g054100.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g054100.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g054100.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g054100.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g054100.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g054100.1.p locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g054100.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g054100.2.p locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g054100.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g054100.3.p locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g054100.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.15g054100.4.p locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.15g054100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g054100.1 locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNGKHKTGSRRKNVPFPANTSTTRCLFSSKMNSSKRAGEAKFTCSGCERKFLLPTITNAYRCYKCDSVANSTLGSEQSRKDSGVCKHDQLNNAYPNGALLPPSASCSLSLSMTMGNKRAVICGVTYGKRKFKLEGTINDVNNMKNLLLDNFKFPIGCIRVLTEEQKDPNLIPTKKNILDSLNWLVKDCQSEDSLVFYFSGHGLQQPEDRKGDEIDGLDETICPVDFLREGMITDNEINSIIVQPLKQGVTLHAIIDACHSGTTLDLLYLCKKEKGSWKWKDNKPPHSKETMTTQTNGGLAICLSACEDGQMAADTAAFDGNRFNGLVTYLFSQIIRDNPEITYGGLLEKLHQEIGNIHQSKFSNSILKRIFHRKIDQDPHLSSSEKFDIATRIFKL* >Glyma.15g054100.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g054100.2 locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNGKHKTGSRRKNVPFPANTSTTRCLFSSKMNSSKRAGEAKFTCSGCERKFLLPTITNAYRCYKCDSVANSTLGSEQSRKDSGVCKHDQLNNAYPNGALLPPSASCSLSLSMTMGNKRAVICGVTYGKRKFKLEGTINDVNNMKNLLLDNFKFPIGCIRVLTEEQKDPNLIPTKKNILDSLNWLVKDCQSEDSLVFYFSGHGLQQPEDRKGDEIDGLDETICPVDFLREGMITDNEINSIIVQPLKQGVTLHAIIDACHSGTTLDLLYLCKKEKGSWKWKDNKPPHSKETMTTQTNGGLAICLSACEDGQMAADTAAFDGNRFNGLVTYLFSQIIRDNPEITYGGLLEKLHQEIGNIHQSKFSNSILKRIFHRKIDQDPHLSSSEKFDIATRIFKL* >Glyma.15g054100.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g054100.3 locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNGKHKTGSRRKNVPFPANTSTTRCLFSSKMNSSKRAGEAKFTCSGCERKFLLPTITNAYRCYKCDSVANSTLGSEQSRKDSGVCKHDQLNNAYPNGALLPPSASCSLSLSMTMGNKRAVICGVTYGKRKFKLEGTINDVNNMKNLLLDNFKFPIGCIRVLTEEQKDPNLIPTKKNILDSLNWLVKDCQSEDSLVFYFSGHGLQQPEDRKGDEIDGLDETICPVDFLREGMITDNEINSIIVQPLKQGVTLHAIIDACHSGTTLDLLYLCKKEKGSWKWKDNKPPHSKETMTTQTNGGLAICLSACEDGQMAADTAAFDGNRFNGLVTYLFSQIIRDNPEITYGGLLEKLHQEIGNIHQSKFSNSILKRIFHRKIDQDPHLSSSEKFDIATRIFKL* >Glyma.15g054100.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g054100.4 locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNGKHKTGSRRKNVPFPANTSTTRCLFSSKMNSSKRAGEAKFTCSGCERKFLLPTITNAYRCYKCDSVANSTLGSEQSRKDSGVCKHDQLNNAYPNGALLPPSASCSLSLSMTMGNKRAVICGVTYGKRKFKLEGTINDVNNMKNLLLDNFKFPIGCIRVLTEEQKDPNLIPTKKNILDSLNWLVKDCQSEDSLVFYFSGHGLQQPEDRKGDEIDGLDETICPVDFLREGMITDNEINSIIVQPLKQGVTLHAIIDACHSGTTLDLLYLCKKEKGSWKWKDNKPPHSKETMTTQTNGGLAICLSACEDGQMAADTAV* >Glyma.15g054100.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g054100.5 locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNGKHKTGSRRKNVPFPANTSTTRCLFSSKMNSSKRAGEAKFTCSGCERKFLLPTITNAYRCYKCDSVANSTLGSEQSRKDSGVCKHDQLNNAYPNGALLPPSASCSLSLSMTMGNKRAVICGVTYGKRKFKLEGTINDVNNMKNLLLDNFKFPIGCIRVLTEEQKDPNLIPTKKNILDSLNWLVKDCQSEDSLVFYFSGHGLQQPEDRKGDEIDGLDETICPVDFLREGMITDNEINSIIVQPLKQGVTLHAIIDACHSGTTLDLLYLCKKEKGSWKWKDNKPPHSKETMTTQTNGGLAICLSACEDGQMAADTAAFDGNRFNGLVTYLFSQIIRDNPEITYGGLLEKLHQEIGNIHQSKFSNSILKRIFHRKIDQDPHLSSSEKFDIATRIFKL* >Glyma.15g054100.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g054100.6 locus=Glyma.15g054100 ID=Glyma.15g054100.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNGKHKTGSRRKNVPFPANTSTTRCLFSSKMNSSKRAGEAKFTCSGCERKFLLPTITNAYRCYKCDSVANSTLGSEQSRKDSGVCKHDQLNNAYPNGALLPPSASCSLSLSMTMGNKRAVICGVTYGKRKFKLEGTINDVNNMKNLLLDNFKFPIGCIRVLTEEQKDPNLIPTKKNILDSLNWLVKDCQSEDSLVFYFSGHGLQQPEDRKGDEIDGLDETICPVDFLREGMITDNEINSIIVQPLKQGVTLHAIIDACHSGTTLDLLYLCKKEKGSWKWKDNKPPHSKETMTTQTNGGLAICLSACEDGQMAADTAV*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||