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Report for Sequence Feature Glyma.15g000900

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm15
Start:82228
stop:108631
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.15g000900
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G16800.1AT P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein JGI N/AIEA
GO:0006302GO-bp double-strand break repair EnsemblGenomesN/AIEA
KOG1801 KOG tRNA-splicing endonuclease positive effector (SEN1) JGI N/AIEA
PTHR10887Panther DNA2/NAM7 HELICASE FAMILY JGI N/AIEA
PTHR10887:SF27Panther JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.15g000900
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.15g000900 not represented in the dataset
Glyma.15g000900 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.15g000900 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma15g00301 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.15g000900
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>Glyma.15g000900.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.15g000900
>Glyma.15g000900.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g000900.1 locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.15g000900.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g000900.2 locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.15g000900.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g000900.3 locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.15g000900.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g000900.4 locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.15g000900.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g000900.5 locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.15g000900.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g000900.6 locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.15g000900.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g000900.7 locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.15g000900.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.15g000900.9 locus=Glyma.15g000900 ID=Glyma.15g000900.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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