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Report for Sequence Feature Glyma.14g158900

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm14
Start:35348347
stop:35359397
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.14g158900
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G76990.1AT ACT domain repeat 3 JGI N/AIEA
GO:0008152GO-bp metabolic process JGI N/AIEA
GO:0016597GO-mf amino acid binding JGI N/AIEA
PTHR13734Panther TRNA-NUCLEOTIDYLTRANSFERASE/POLY(A) POLYMERASE FAMILY MEMBER JGI N/AIEA
PTHR13734:SF23Panther JGI N/AIEA
PF01842PFAM ACT domain JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.14g158900
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.14g158900 not represented in the dataset
Glyma.14g158900 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.14g158900 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma14g25590 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.14g158900
>Glyma.14g158900.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g158900.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATATGCACTTCATAGTTCATAGAACTACTATGTACCACAACATATAGCACTCATGATGGGGTCTTTCATAGGAACTGCACAATTCATTTGATTGATTTCTTTGCTGGAAAACGAGGCCAGGTGTTGACTGGGGAAGCTGATTGAATGGCAAAAGTTTGTTGGCCATATTTTGATCCGGAGTATGAGAACTTCAGCAACAGGATCAACCCTCCAAGGGTCTCTGTGGACAATGATAGTTGCCATGATTGTACACTGATCAAGTTTGATAGTATTAACAAACCTGGAATTCTGCTGGAAGTGGTACAAATCCTGACAGATCTTGACTTCATAATTACCAAAGCTTACATATCTTCTGATGGTGGATGGTTTATGGATGTATTTCATGTCACGGATCAGCAAGGAAAGAAGATAACAGACAGCAAAACGATTGACTTCATTGAAAAGACTCTAGGACCAAAAGGCCAGAGCACAGAAGGGGTGAATTGTTGGCAAGGCAAAAGGGTTGGAGTGCACTCAATTGGTGATCACACAGCTATTGAGCTCATCGGTAGAGACCGCCCTGGTCTTTTGTCTGAGATATCAGCAGTCCTTGCCAGCCTCCAATTCAATGTTATCGCAGCTGAAGTTTGGACTCATAACAGGAGAATTGCTTGTGTCCTTTATGTCAATGATGCTACAAACCAAGCCATGGATGACTCAAAAAGATTGTCTATTATGGAGGAGCAGCTTAACCACATCCTACGCGGGTGTGAGGATGATGAGAAAGTGGCTAGGACCAGTTTCACAATGGGTTTCACCCACATGGATCGTAGGCTCCACCAAATGCTGTTTGCTGATAGGGATTATGAGAGTGTTGGATTAACAACCACAGATGTTGATTGTCCTCCTTCTTTTAGGCCAAAAATCAGAATAGAACGTATTGTGGAAAAAGGTTACTCAGTGGTTAGTGTGAGATGCAAGGATCGAGCAAAATTGATGTTTGACATTGTTTGCACTCTCACTGACATGGAATATGTTGTTTTCCATGCTACAATCTCATCCGAAGGGCAATATGCATCTCAGGAGTACTTTATCCGGCACATGGATGGATGCACGCTTGATACTGAAGGAGAGAAAGAAAGGGTCATCAAATGCATTGAAGCTGCTATACAAAGAAGAGTTAGCGAGCTATCTACTTGTATTGTTGCGAATGGTACGACAGATATATGGGGCTAAGTCCACTCAGATTGTATGTGACCATCATATCCACCTAATGAATCGGTGACAGTGATGGTCTTTTGTCTTCAATAGAGCATTAGAGCTTAAGAACCTATATGCTTCACGTAATATCATCTCATCCACATCCCTCTAAGTCTCTAACTCGAGGAATTATTACATGGGTGTGAGTCTTGAGCTGTGTGCAAAGGACAGAGTGGGGTTGCTGTCTGAGGTAACAAGGATTCTAAGAGAGAATGGCTTGAGAGTTAGTAGGGCAGGTGTGTCAACTGTAGGGGAGAAAGGCTTGAATGTGTTCTACGTGAGAGATGCATCTGGGAACCCAGTGGACATGAAGATCATTGAAGCACTACACAAGGAAATTGGACAGATAATGATGGTTAATGTAAAGAGGGTACCTGGCTATGTCAAAGCACCAGCTGAAACCCGAGGATGGGCTAAAACAAGCTTTTTCTTTGGGAACTTGTTGGAAAGATTCTTGACCTGACAATGAAAGTTGAGATTCTTGCAACTGATTCTAGGTGCTTGGTAAAGGACACAACAAAATGTATATACTTAAGAATAAGAATACAGTTGTTGCGTGTGTCAGACTTGAGTAGGGCTTGATCTTGGTCCCTTTCTTTCAAACCAATGCTTTATAAACTTGAGTAAGTTATATTCAGACTTTTTCTTTTGCATGTCTATCTATCAATGTTATCTTATTTTTAACTCTAATTTACCTTCTGCCTCTTCTTACCAATTAAAGTGGCAAAGGTTGAATATTAATGAATCGTATCACCAAGGTCAGTCTAAAATTGGTGATGCATATTGATCATTAGATTATATTATAAATGTTTAATATTAAACATAAAAAATATCTTTCTTAAGCTATCATATAATGTTATCTATATTCTCATGTAGCGTAAAGTTGACTCAAAATGTCAATAATGTTTGTTAGCTAGTTGGATCCACAACCCACATATCGACACTTTGTTTCGAGCCAATGCTTTATAAGGTGTAACTTATATATAGACTTTCCTTTTGCATGCTTGTCTCTCAATGTTATCCTATTAAGAATTCTAATGTAACTTCTAGACCTCCTTACCAATCAAAGTGACCAAGGTTGAATGTTAATGCACTATTACAAATAAGGGATTCCATGATAGTTATTTAGGGTCTTCATGAAGATTTTTAACCGTCATGGAATCAACCGTTGTAGAAAGTCGACTGCTTTCCATGATAGTTTTAAAGGAATTTGTTGTGTTTACACGATAAAAATCTTATTTACATATGCTTTTACATCAGTTTTCCTAAAAATCATAGTAGAAAATGCAATTTCAACATCAATTTTCTTGAAAATTGTCATACAAAATGCATCTTTGACATTGGTTTCCCGAAAAATCATCATAGAAAGTCCCTTTTCTATGACGATTTTAGGAAAGTCAATGTTTAAACTGCATTTTGTATGAAAAAAAATTTAGGAACCAATGTAGTTTTGAACTTTTTTTGATATTTATTTTGTTTTACAACAAACTCAACCTATAATTTAATAAAAAAACATACCCAGAAAGTCCAGACCAAAACAAATATAGAAAATAGACCTAGGCAGTCTAGACAAATTCATAAATATTTTATAAGTAATAGAAATAAATATCTTGCATTTCTGATTCGCACAAAAATATGTAAATCAAATATTCAACCAAAAATTATGC

>Glyma.14g158900.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATATGCACTTCATAGTTCATAGAACTACTATGTACCACAACATATAGCACTCATGATGGGGTCTTTCATAGGAACTGCACAATTCATTTGATTGATTTCTTTGCTGGAAAACGAGGCCAGGTGTTGACTGGGGAAGCTGATTGAATGGCAAAAGTTTGTTGGCCATATTTTGATCCGGAGTATGAGAACTTCAGCAACAGGATCAACCCTCCAAGGGTCTCTGTGGACAATGATAGTTGCCATGATTGTACACTGATCAAGTTTGATAGTATTAACAAACCTGGAATTCTGCTGGAAGTGGTACAAATCCTGACAGATCTTGACTTCATAATTACCAAAGCTTACATATCTTCTGATGGTGGATGGTTTATGGATGTATTTCATGTCACGGATCAGCAAGGAAAGAAGATAACAGACAGCAAAACGATTGACTTCATTGAAAAGACTCTAGGACCAAAAGGCCAGAGCACAGAAGGGGTGAATTGTTGGCAAGGCAAAAGGGTTGGAGTGCACTCAATTGGTGATCACACAGCTATTGAGCTCATCGGTAGAGACCGCCCTGGTCTTTTGTCTGAGATATCAGCAGTCCTTGCCAGCCTCCAATTCAATGTTATCGCAGCTGAAGTTTGGACTCATAACAGGAGAATTGCTTGTGTCCTTTATGTCAATGATGCTACAAACCAAGCCATGGATGACTCAAAAAGATTGTCTATTATGGAGGAGCAGCTTAACCACATCCTACGCGGGTGTGAGGATGATGAGAAAGTGGCTAGGACCAGTTTCACAATGGGTTTCACCCACATGGATCGTAGGCTCCACCAAATGCTGTTTGCTGATAGGGATTATGAGAGTGTTGGATTAACAACCACAGATGTTGATTGTCCTCCTTCTTTTAGGCCAAAAATCAGAATAGAACGTATTGTGGAAAAAGGTTACTCAGTGGTTAGTGTGAGATGCAAGGATCGAGCAAAATTGATGTTTGACATTGTTTGCACTCTCACTGACATGGAATATGTTGTTTTCCATGCTACAATCTCATCCGAAGGGCAATATGCATCTCAGGAGTACTTTATCCGGCACATGGATGGATGCACGCTTGATACTGAAGGAGAGAAAGAAAGGGTCATCAAATGCATTGAAGCTGCTATACAAAGAAGAGTTAGCGAGGGTGTGAGTCTTGAGCTGTGTGCAAAGGACAGAGTGGGGTTGCTGTCTGAGGTAACAAGGATTCTAAGAGAGAATGGCTTGAGAGTTAGTAGGGCAGGTGTGTCAACTGTAGGGGAGAAAGGCTTGAATGTGTTCTACGTGAGAGATGCATCTGGGAACCCAGTGGACATGAAGATCATTGAAGCACTACACAAGGAAATTGGACAGATAATGATGGTTAATGTAAAGAGGGTACCTGGCTATGTCAAAGCACCAGCTGAAACCCGAGGATGGGCTAAAACAAGCTTTTTCTTTGGGAACTTGTTGGAAAGATTCTTGACCTGACAATGAAAGTTGAGATTCTTGCAACTGATTCTAGGTGCTTGGTAAAGGACACAACAAAATGTATATACTTAAGAATAAGAATACAGTTGTTGCGTGTGTCAGACTTGAGTAGGGCTTGATCTTGGTCCCTTTCTTTCAAACCAATGCTTTATAAACTTGAGTAAGTTATATTCAGACTTTTTCTTTTGCATGTCTATCTATCAATGTTATCTTATTTTTAACTCTAATTTACCTTCTGCCTCTTCTTACCAATTAAAGTGGCAAAGGTTGAATATTAATGAATCGTATCACCAAGGTCAGTCTAAAATTGGTGATGCATATTGATCATTAGATTATATTATAAATGTTTAATATTAAACATAAAAAATATCTTTCTTAAGCTATCATATAATGTTATCTATATTCTCATGTAGCGTAAAGTTGACTCAAAATGTCAATAATGTTTGTTAGCTAGTTGGATCCACAACCCACATATCGACACTTTGTTTCGAGCCAATGCTTTATAAGGTGTAACTTATATATAGACTTTCCTTTTGCATGCTTGTCTCTCAATGTTATCCTATTAAGAATTCTAATGTAACTTCTAGACCTCCTTACCAATCAAAGTGACCAAGGTTGAATGTTAATGCACTATTACAAATAAGGGATTCCATGATAGTTATTTAGGGTCTTCATGAAGATTTTTAACCGTCATGGAATCAACCGTTGTAGAAAGTCGACTGCTTTCCATGATAGTTTTAAAGGAATTTGTTGTGTTTACACGATAAAAATCTTATTTACATATGCTTTTACATCAGTTTTCCTAAAAATCATAGTAGAAAATGCAATTTCAACATCAATTTTCTTGAAAATTGTCATACAAAATGCATCTTTGACATTGGTTTCCCGAAAAATCATCATAGAAAGTCCCTTTTCTATGACGATTTTAGGAAAGTCAATGTTTAAACTGCATTTTGTATGAAAAAAAATTTAGGAACCAATGTAGTTTTGAACTTTTTTTGATATTTATTTTGTTTTACAACAAACTCAACCTATAATTTAATAAAAAAACATACCCAGAAAGTCCAGACCAAAACAAATATAGAAAATAGACCTAGGCAGTCTAGACAAATTCATAAATATTTTATAAGTAATAGAAATAAATATCTTGCATTTCTGATTCGCACAAAAATATGTAAATCAAATATTCAACCAAAAATTATGC

>Glyma.14g158900.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g158900.14 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g158900.15 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g158900.9 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.14g158900
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>Glyma.14g158900.10 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g158900.10.p locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.14g158900
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>Glyma.14g158900.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g158900.10 locus=Glyma.14g158900 ID=Glyma.14g158900.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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