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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT4G32700.2 | AT | helicases;ATP-dependent helicases;nucleic acid binding;ATP binding;DNA-directed DNA polymerases;DNA binding | JGI | N/A | IEA |
GO:0006260 | GO-bp | DNA replication | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0006260 | GO-bp | DNA replication | JGI | N/A | IEA |
GO:0006261 | GO-bp | DNA-dependent DNA replication | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0009640 | GO-bp | photomorphogenesis | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0009933 | GO-bp | meristem structural organization | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0010468 | GO-bp | regulation of gene expression | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0051301 | GO-bp | cell division | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0071897 | GO-bp | DNA biosynthetic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0090305 | GO-bp | nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:1902749 | GO-bp | regulation of cell cycle G2/M phase transition | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:1990067 | GO-bp | intrachromosomal DNA recombination | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:2000011 | GO-bp | regulation of adaxial/abaxial pattern formation | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005737 | GO-cc | cytoplasm | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0003676 | GO-mf | nucleic acid binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0003676 | GO-mf | nucleic acid binding | JGI | N/A | IEA |
GO:0003677 | GO-mf | DNA binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0003677 | GO-mf | DNA binding | JGI | N/A | IEA |
GO:0003887 | GO-mf | DNA-directed DNA polymerase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0003887 | GO-mf | DNA-directed DNA polymerase activity | JGI | N/A | IEA |
GO:0004386 | GO-mf | helicase activity | JGI | N/A | IEA |
GO:0005524 | GO-mf | ATP binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005524 | GO-mf | ATP binding | JGI | N/A | IEA |
GO:0008026 | GO-mf | ATP-dependent helicase activity | JGI | N/A | IEA |
GO:0008409 | GO-mf | 5'-3' exonuclease activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
KOG0950 | KOG | DNA polymerase theta/eta, DEAD-box superfamily | JGI | N/A | IEA |
PTHR11752 | Panther | HELICASE SKI2W | JGI | N/A | IEA |
PTHR11752:SF3 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00270 | PFAM | DEAD/DEAH box helicase | JGI | N/A | IEA |
PF00271 | PFAM | Helicase conserved C-terminal domain | JGI | N/A | IEA |
PF00476 | PFAM | DNA polymerase family A | JGI | N/A | IEA |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
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Glyma14g20430 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.14g140800.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g140800 ID=Glyma.14g140800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 CCAAACACCGCCCGTTCCCCCGAAAATTTCAATTTCAATTTGCAGCTTTCAGTCAGGGCGCCACTCCAAAGAGCACAAACCGCTCGGTTCGTCGTGTCTCTTCAACTCGGCTCTCGCGAAGCATCAAAGCAACGCATTATGCGACGTTGTATGATGCATCATCATTCTCATGCCTAGCGCAAGGCGAAGAAGAAGAACAACAACGAAACACAACGCTTCTCGTTCTTCACATGGCTTCTCCTTCGCATCGCTCTCGCATCGATCAGTTTTACGCTTCGAAGAAGAGGAAAGCAGCGTCGCCTGTTCCTAAAGCCGGGAGATTCGAAAAAGGTGCGAGGCATGGGGCTGATGAGTCTCCGAGTGCCAAAGGCACTTTGGAGGGTTACTTGGTTTCGTCACAGGACGGTGGTGGTGACGGCTGCGGTGACGCAAACACTGTTAAGGTTAAGAGAAACTTGACATCGGAGATTGGTGGTTCTCTTGACAATGAGCTTAATAAGCATACTGTTTCATTGGGTCAAGGGTGTGGAGATTCTCAATCTATTCAGCCGAGTGAAATTGGACAGGGTGTGGCGAAATCGGAGAGGAAACAGTTTGCTGCTGACTTTTTGTCTTTGTATTGCAGTGTATTGCATCCGAGTGTGGGTTTGCCGTTGGAGATGAAAATGGATGATCACAAGAGACATGGTTCACCAACATTAGTAGAGGGAAATAGTGTTTTACTGCGGAAGAATAATGACACTGCTGGTGAGCTATGTTTCGGTGGTGAAAATACATTGTTGAGTGTGAAGATCGATGAAGACATCAAGTCTGGTGTTGTTGGTAATAATAATTCTATGGGATGTGTTCCTGGCTCTTGTACGAAGGTTTCTGGTGGTGGTGATACTACTGGCTTTGAGACAGGCTTTAGGAAATGTAATAATACACCTAAACCATCAATGAAATTGGCTGAATACTACAACACACCGGGGTCTTTGATTGTTAAAGCAAGTGTTAGGGAGACTCCAAAGTCAACACGCGGCAGCTCATCATTTTCGCCTGGAGAGGCATTTTGGAATGAGGCAATTCAACTTGCTGATGGTTTGTGTGTTCCCATGGGTAATGATCCTTCTAAGGTTATGGGAGAAAGTAATGTGGTGGAAGAGGAACCTGAGATGAAGAACTCATGCAATTTACAAAATTATGATGGCAAACCAAGGAAAATATTGGATCAAAGTAAAAACAGAATCCGGAATAGGGAAATGGGTGCTCCTTTAGGGTTAGTTGGGATGCACACTAAAGATTCTGTGAAAGAAGCATCCAGCCTTCCTGTTAAACATTTTGATTTTTCGTTTGAGGACAACAATTTGGAAGAAAATACCTTGCAAGACTGTCGTGTTGGTGATTCAATCAATGTTACTTGTGTGGCTGGTAAACAGTATGATTCATGTTCTATGATAGGTCATACATATGAAAAGATGAATGAAGTGCAAGAGAATACTTTAGTAGATACATTAGGCAAAAGGGTTTGTCAGGATAATGTTAGCATGACATCTAATTCACCCCACAATGAGGTCAGGACACCGATTAGTGCACATGCATCTGATGAAGCCAGTACTCCTTCAACTAGTGTATCACTTAATGATCATTTTGACCTAAACAGCTGGCTTCCTCCTGAAATATGCAGCATATATAGAAAGAAAGGAATCTCAAGACTTTACAGTTGGCAGGTTGATTGCCTTCGAGTGGATGGTGTCCTACAGAGAAGAAATCTTGTATATTGTGCTTCTACAAGTGCTGGTAAGAGTTTTGTTGCTGAGATTTTAATGCTGCGGAGGGTGATAATAACTGGAAAAATGGCACTACTTGTTCTTCCGTATGTATCAATTTGTGCAGAAAAGGCTGAACACCTCGAACGTCTCCTTGATCCACTTGGTAAACATGTTCGTAGTTATTATGGAAACCAAGGTGGTGGAACACTTCCTAAAGATACTTCTGTAGCTGTCTGCACTATAGAGAAGGCAAACTCACTAGTTAATAGATTATTGGAAGAGGGGCGTCTATCAGAAATGGGAATTATCGTAATTGATGAACTGCATATGGTTGGTGATCCAAGAAGAGGTTATCTACTTGAACTTATGTTGACAAAGCTTCGTTATGCAGCAGGGGAAGGTATTCCAAAATCAAGTGATGGAGAAAGTTCCGGTGGAAGCAGTGATAAGGCTGATCCTGCCCAAGGTCTGCAAATTGTCGGAATGAGTGCAACAATGCCAAATGTTGCAGCAGTTGCTGACTGGCTTCAAGCAGCACTATACCAGACCGAGTTCCGGCCAGTTCCTCTAGAAGAATATATAAAAGTTGGTAATTCCATTTACAACAAAAGTATGGAACTTTGTAGAATAATCTCAAAAGCGGCTGAACTTGGTGGTAAAGATCCAGATCATGTTGTTGAACTATGTAATGAGGTTGTTCAAGAGGGACACTCAGTTTTAATATTTTGCTCTAGCCGGAAGGGTTGTGAGTCAACTGCAAGGCACATTGCAAAGTTCCTTAAAAGCTTTACTGTTGATGCTAATGATTGTGAGTTTGCCGATATTACTTCTGCTATTAACTCCTTGGGAAAGTGCCCTGCTGGGTTGGACCCCATATTACAGGAAACTCTTCCTTCTGGTGTTGCATTTCACCATGCTGGCCTTACGGTTGAGGAACGAGAGATTGTTGAAACCTGTTATCGGAAGGGCCTTTTACGTGTCTTAACTGCCACGTCAACCTTAGCAGCTGGGGTAAATCTGCCAGCTAGGAGGGTAATTTTCCGCCAACCTAGAATTGGTTGTGATTTTCTAGATGGGACGAGGTACAAACAGATGGCTGGTCGTGCTGGTCGAACTGGAATTGATACAAAAGGAGAAAGTATACTTATCTGTAAACCAGAAGAACTAAAAAAGGTTTCGGGACTGCTTAATGAAAGCTGTCCTCCATTACATTCCTGTTTGTCCGAAGACATGAATGGAATGACTCATGCAATCTTAGAAGTAGTGGCTGGAGGAATTGTTCAAACTGCTAGCGATATTAACCGGTATGTTAGATGTACCCTTTTAAATTCTACAAAACCATTTCTAGACGTGGTGAAATCTGCACAAGAATCCCTTCGATGGTTGTGCCAAAGAAAATTTCTTGAATGGAATGAAGACACTAAACTCTACAGTACCACACCTCTTGGACGTGCATCTTTTGGCAGTTCTCTTTGTCCACAAGAGTCACTTATTGTGTTAGCTGATCTTTCAAGGGCAAGGGAAGGATTTGTCCTTGCATCTGACTTGCATTTAGTTTACTTGGTGACACCAATCAATGTAGATGTTGAGCCAGATTGGGAATTGTACTATGAGCATTTTGTGAAATTGTCTCTGCTTGACCAGTCAGTTGGCAATCGAGTAGGTGTGACAGAACCATTCTTGATGTATATGGCACATGGTGCACCACTACGTGCTTCAAACAAGTCAAGAGATAATACAAGATCATTGCACAATCAACGAAGAAATCAACTTGGGATTTCCAGTGCAACAGCTAACTATGATGATCAAACACTTCGTGTCTGTAGAAGATTCTATGTTGCTCTCATTTTGTCACTTCTAGTTCAGGAAATTCCTGTGGGTGAGGTTTGTGAAGCATTCAAAGTTGCCAGGGGAATGGTTCAAGCCTTGCAAGAGAATGCTGGTAGGTTTGCATCTATGGTTGCTGTGTTTTGTGAGCGACTTGGGTGGCATGATCTTGAAGGCTTAGTTGCTAAGTTTCAAAACCGTGTATCATTTGGAGTTAGAGCAGAGATTGTAGAACTTACCACTATTCCCTATGTTAAAGGTTCTCGAGCCAGATCACTCTATAAAGCTGGTTTACGTACACCCCATGCAATTGCTGAGGCATCCATTCCTGAGATAGTAAAAGCACTTTTTGAATCTTCATCATGGGCCACAGAAGGTTCTGCACAAAGGGGATTTCAATTTGGTATAGCAAAAAAGATAAAGAATGGTGCCCGCAAGATTGTTTTTGATAAAGCTGAGGAGGCAAGTAACGCTGCTTTCTCAGCCTTTAAATCACTTGGGTTCAATGTCCCACAGTTTGATCCTCAAATATTATCTACTGCTGCTCGTGATTCTATCAGGCTAGGAACTGGAAGTACCTCTGGAAGTGACACAACTGATACTAGTCATAGTTTTGTTAATGCAGATTGCATTGATAATACTAATAAATTTACTTTAGATAAAGAAAAAGAAGACTTAATAAAATTATCTGTTAACGGTACTGTGGCTTCTGTAGAAGGAAAATCAAGAAGCAGGATGATATGTAGCTTGTCCAGTGTTCCAGTTGCAGGACCTAAAATGGATGAACTCAATAGGACTTCTGACCATACCAAAAATGCAGACATGACCATTCTCTCTGTTCAATTGCAGAAACCAAATGATAAATCTGGTGTACATGATGGGTGCGATGCTCATTGTACAGAGGAAGCGCATAAGAATGGAAATTTGGCTAGTGGTAATGCTGGTAGTTCCAGCCAGAAAGGTCCCATTAATGCAGTTAGTAGTCCTGGTGGGCTTGATTCATTTTTGGATCTATGGGACTCTATGCCAGAGTTCTATTTTGATATCCATTATATCAAACGATTGGAATTGCACTCTACTGCTCCCTTTGAAATACATGGCATAGCTGTTTGTTGGGAAAACTCTTCTGTGTACTACATTAATCTTCCCAGAGATATTCTGTTGTCTGACAGTATAAAAGATGGCTGTTTATCCTTGAGTGCATGCAGTCATAAGAAGAAAGTTTCATCTTCTAATTCTAAGCAAGATCTAGAGATTGCTAGATCTAGATGGAACAGAATTAGTAAAATAATAGGGAAAATAAATGTCAGAAAGTTCACCTGGAATTTGAAGATTCAGATGCAGGTGCTGAAAAGGCCAGCATTTTCAGTTCAGAGATTTGGTTGCTTGGACACACTTGGAAAAAGTATGGACCTTGAAGTT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>Glyma.14g140800.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g140800 ID=Glyma.14g140800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.14g140800.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g140800 ID=Glyma.14g140800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.14g140800.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g140800 ID=Glyma.14g140800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.14g140800.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g140800.5 locus=Glyma.14g140800 ID=Glyma.14g140800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||