Report for Sequence Feature Glyma.14g116000
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm14
Start: 14017789
stop: 14022454
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.14g116000
Expression Patterns of Glyma.14g116000
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Related Legume Genes
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS .
Gene information in GlycineMine developed by LIS .
Related Plant Genes
Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.14g116000
Paralog Evidence Comments
Glyma.17g211700 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.14g116000 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma14g14320 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.14g116000
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.14g116000.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g116000.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g116000.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
TTGTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGGTTGTTTCTTTGACTCCActctctctctctctctctatcaagtttgtttctctgacacaacactttctctctctaactctTTAAATTTTTGGAAACCTACTCTCTCTATACTGCTGCTGAATTTTAATTTTTTTGGATTGAACTCTGCAGGGGTAAGAGATAGTTGCATAAATTTTACATGtttttttttttgttattttgtattgtttctttGGTTCTGAGAAGGTGAAGAAGAGTATGCATGTGCTGATGATGACTTGCTTTACTTGTATGCATGCATGTTTTGACTTGCTTGgtggtggatgagtgagtgagtgtgtgagagagtgggttaagtgtgtTCTGTTTCTATCTAAAAGTTGAATACTTGGGTGGATTTTCTGAATTCCTCACAGAATTTGGTTTTGTGAGGTTTATATTTCAGCATCATTTGGAATTTGATCGAGAAATGAATGTCTGAAAGCATGTACTAGTTAACTTACTGTGGAAAATATAGTTTTCTCAATCTCAATTTAGTCAATTTTTTTTCCTTCGGTCTTGTGTTGGGTATTTGTGGCGTTCCTTTTTTTTCATTTGATTTGTTCTGCTCTTGTATCTATACTTAACTTGATATCACTTCATAGTTTTGCAGCAGCAGTTTTGATGTGTGATTCAATTGTTCAATATACGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGTGTGAATGATAGTCTTCTGGCAAGCATTTCTGGCTTCATCATGTTATTTTGTCTATATTTGCTTCCAAAATATTGTATCAAGAGAAAGTTCAAAGGTGTTGAAATTATAATATCTTTGGGTCTAGAGTTTGAACATGTTCtactactactactattattattattattattattTGTGGCTACTGGTGCAGTTCTTACTTTTGT
>Glyma.14g116000.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
CTTGTTTGTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGGTCAGAGGTCCTATATCCTTTGAAACAGATTCTTGGGGATTTGGGTGCACCATTGTCGAAATGTTGACTGGTAACCAACCTTGGTATGGATGTCCTGTTCGCAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGGTTTGTAAAtatttatatatttatttattttttaAAAATTCTCTTGAAAATTTCTGTGGCTGTGTAAGCTTTTGCTTAGTTTCAAAAAGTTGTAATTATCTTGGGTCTGGCATATTTTATTTAGTTGCATTCATTTAGTGAGGCTTATGTGTGAGAAGATCCACTAAAAAGAGCATATGGATATGTTAATGGTCAAGGTTAGCTCCTCTTATGCTCCCACTAGATACAACTGATTTTATCTTCCAGAGTAATTGGGCAGCATCACAGATTCTTTACCTCACAAAAGATTTTTTTCCATAATTGCATGCCAAGCACTGTGatctttaacatcatcatcatcatcctcatATTTGTTGCTCATAAACTTAGAATATGATGTCATTTTGGAAGTCCATACAGATAACATGAATCCATTTTTTCTGATATTTCAAATTAATTTAGTACTACAGCTTGAGGTTGAGGTTATATGAAAGGATTGAGAGCTTTAAGTTGAATTGTTTCCTTGTGATGTAATGTGTTCAGAGCTAGTTATTAAATTTTAATAAATTTTTCAAAGGCTCCTGAACACTGTTTTTCTGCTGCACTCTCCAGTGTTGTGATTCTACTTTTTTGTTGGCATGGCATTGCAGTGTGAATG
>Glyma.14g116000.14 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
GTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGGTTGTTTCTTTGACTCCActctctctctctctctctatcaagtttgtttctctgacacaacactttctctctctaactctTTAAATTTTTGGAAACCTACTCTCTCTATACTGCTGCTGAATTTTAATTTTTTTGGATTGAACTCTGCAGGGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGGTCAGAGGTCCTATATCCTTTGAAACAGATTCTTGGGGATTTGGGTGCACCATTGTCGAAATGTTGACTGGTAACCAACCTTGGTATGGATGTCCTGTTCGCAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGGTTTGTAAAtatttatatatttatttattttttaAAAATTCTCTTGAAAATTTCTGTGGCTGTGTAAGCTTTTGCTTAGTTTCAAAAAGTTGTAATTATCTTGGGTCTGGCATATTTTATTTAGTTGCATTCATTTAGTGAGGCTTATGTGTGAGAAGATCCACTAAAAAGAGCATATGGATATGTTAATGGTCAAGGTTAGCTCCTCTTATGCTCCCACTAGATACAACTGATTTTATCTTCCAGAGTAATTGGGCAGCATCACAGATTCTTTACCTCACAAAAGATTTTTTTCCATAATTGCATGCCAAGCAC
>Glyma.14g116000.15 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g116000.16 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.16.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
GCAGTTTTGATGTGTGATTCAATTGTTCAATATACGGTAAGATTCGAGGTTCATTTGGGGTGCCATGTTGTAATTAGTAATTTGTTGTTGGCATCAATCTGAGAATCCTGTCCTATCTTTCAAatatttacatgtattctcattttttttttatgtttattCTGTCATATCTGTGTCTTAGGGGCACTTGATTAAGGCCAAAATGGATAGAGAAGGAAAAAATAAACGATCCTCTCCATTGTACAATTCGTCGACATACCTAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGGTTTGTAAAtatttatatatttatttattttttaAAAATTCTCTTGAAAATTTCTGTGGCTGTGTAAGCTTTTGCTTAGTTTCAAAAAGTTGTAATTATCTTGGGTCTGGCATATTTTATTTAGTTGCATTCATTTAGTGAGGCTTATGTGTGAGAAGATCCACTAAAAAGAGCATATGGATATGTTAATGGTCAAGGTTAGCTCCTCTTATGCTCCCACTAGATACAACTGATTTTATCTTCCAGAGTAATTGG
>Glyma.14g116000.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g116000.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
CCCCTCTTGTTTGTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGGGGCAGAGGTAGGATAAAAATGGAGGAAGAAAAAGTAGGTGAATTCAGTTGGTTAGTCAGTTAGTTTTGGGTGGGAGAGACCACGCTTTCAAATTCCTGCAGAAGACACCATTGTACGTCATTCTTGCTCTTACTGATTCTGGATAACGGTTGATCAAGAGTTGGAGGAGTATAGTCAATAAAATTTCCTTCCTGTCTTTCTACTAGTCTCTATGTTCTGTGCCAGCCAGCATCTATCATACTCCAACAAAACAAGAGTGTAGTAGCAGACCTTAGGTTATATGAATTTTTTTTATTCAGATAAGGATGAAAATTGTCCACAAACAGAAATATATGATGATTTACCATATCAGAATTGCTATAGTCCCAAGTGGACTCTCAAATAGTGGTATGCCTTATGCTAGTAAAATGTTACGAGGGTCATGGTGGCACAATAGTCAATTTTTATACATTTTCTATGCTAAGAAGTGGTAACCCTTTTCATTTATGTTTTGGAAAATCTATCATTATTCTGTTTCTGTATTCTTAAATGCCATAAATCAATTACAAATGTACACCACTGTATAACATGGTGAAATATTCAGTTGACTAGAAGCACCGATGCATAGCATTTAGCAAGCTCATCTGTCATAGCTAGCCGGTAACATTTGCAGTCTTGATTGTGTGTTCTGGACATAAATAAGAGTAGCCTATTAGTTGATGGTTAGTGAAAGTGCCACTAATCCATGAAAATATCTGTACTAGAAAGAACTAAATCAATAATATATCATAACAGCATGAAATTGTTTGTATTTAAGCACAACTATCTCTCAGTTAATTTCTATTTATCTTCATGAAAATAAGATCTTTTACAACTACAACTACAAGGAGATCTTCGAATTCAAGTGCTACAATACCAGTTAGCACAATGTGGGTTCCTGCAGTTGCTAATATGATTTTTAAGGAAGGTGTTACCTCGTCCAATGGTCGGT
>Glyma.14g116000.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.14g116000
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
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Predicted protein sequences of Glyma.14g116000
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
>Glyma.14g116000.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g116000.1 locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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