SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research



Report for Sequence Feature Glyma.14g116000

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm14
Start:14017789
stop:14022454
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G32250.1AT Protein kinase superfamily protein JGI N/AIEA
GO:0006468GO-bp protein phosphorylation EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0006468GO-bp protein phosphorylation JGI N/AIEA
GO:0005737GO-cc cytoplasm EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0016020GO-cc membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0016021GO-cc integral component of membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0004672GO-mf protein kinase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0004672GO-mf protein kinase activity JGI N/AIEA
GO:0004674GO-mf protein serine/threonine kinase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding JGI N/AIEA
KOG0198 KOG MEKK and related serine/threonine protein kinases JGI N/AIEA
PTHR22967Panther SERINE/THREONINE PROTEIN KINASE JGI N/AIEA
PTHR22967:SF2Panther JGI N/AIEA
PF00069PFAM Protein kinase domain JGI N/AIEA
PF07714PFAM Protein tyrosine kinase JGI N/AIEA

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene families from PhyloGenes.


ParalogEvidenceComments
Glyma.17g211700 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.

Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma14g14320 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


>Glyma.14g116000.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
TTTGTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGGTTGTTTCTTTGACTCCActctctctctctctctctatcaagtttgtttctctgacacaacactttctctctctaactctTTAAATTTTTGGAAACCTACTCTCTCTATACTGCTGCTGAATTTTAATTTTTTTGGATTGAACTCTGCAGGGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGGTTTGTAAAtatttatatatttatttattttttaAAAATTCTCTTGAAAATTTCTGTGGCTGTGTAAGCTTTTGCTTAGTTTCAAAAAGTTGTAATTATCTTGGGTCTGGCATATTTTATTTAGTTGCATTCATTTAGTGAGGCTTATGTGTGAGAAGATCCACTAAAAAGAGCATATGGATATGTTAATGGTCAAGGTTAGCTCCTCTTATGCTCCCACTAGATACAACTGATTTTATCTTCCAGAGTAATTGGGCAGCATCACAGATTCTTTACCTCACAAAAGATTTTTTTCCATAATTGCATGCCAAGCACTGTGatctttaacatcatcatcatcatcctcatATTTGTTGCTCATAAACTTAGAATATGATGTCATTTTGGAAGTCCATACAGATAACATGAATCCATTTTTTCTGATATTTCAAATTAATTTAGTACTACAGCTTGAGGTTGAGGTTATATGAAAGGATTGAGAGCTTTAAGTTGAATTGTTTCCTTGTGATGTAATGTGTTCAGAGCTAGTTATTAAATTTTAATAAATTTTTCAAAGGCTCCTGAACACTGTTTTTCTGCTGCACTCTCCAGTGTTGTGATTCTACTTTTTTGTTGGCATGGCATTGCAGTGTGAATGATAGTCTTCTGGCAAGCATTTCTGGCTTCATCATGTTATTTTGTCTATATTTGCTTCCAAAATATTGTATCAAGAGAAAGTTCAAAGGTGTTGAAATTATAATATCTTTGGGTCTAGAGTTTGAACATGTTCtactactactactattattattattattattattTGTGGCTACTGGTGCAGTTCTTACTTTTGTCTATGCAAATAAA

>Glyma.14g116000.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
CTTGTTTGTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGTGTGAATGATAGTCTTCTGGCAAGCATTTCTGGCTTCATCATGTTATTTTGTCTATATTTGCTTCCAAAATATTGTATCAAGAGAAAGTTCAAAGGTGTTGAAATTATAATATCTTTGGGTCTAGAGTTTGAACATGTTCtactactactactattattattattattattattTGTGGCTACTGGTGCAGTTCTTACTTTTGT

>Glyma.14g116000.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
TTGTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGGTTGTTTCTTTGACTCCActctctctctctctctctatcaagtttgtttctctgacacaacactttctctctctaactctTTAAATTTTTGGAAACCTACTCTCTCTATACTGCTGCTGAATTTTAATTTTTTTGGATTGAACTCTGCAGGGGTAAGAGATAGTTGCATAAATTTTACATGtttttttttttgttattttgtattgtttctttGGTTCTGAGAAGGTGAAGAAGAGTATGCATGTGCTGATGATGACTTGCTTTACTTGTATGCATGCATGTTTTGACTTGCTTGgtggtggatgagtgagtgagtgtgtgagagagtgggttaagtgtgtTCTGTTTCTATCTAAAAGTTGAATACTTGGGTGGATTTTCTGAATTCCTCACAGAATTTGGTTTTGTGAGGTTTATATTTCAGCATCATTTGGAATTTGATCGAGAAATGAATGTCTGAAAGCATGTACTAGTTAACTTACTGTGGAAAATATAGTTTTCTCAATCTCAATTTAGTCAATTTTTTTTCCTTCGGTCTTGTGTTGGGTATTTGTGGCGTTCCTTTTTTTTCATTTGATTTGTTCTGCTCTTGTATCTATACTTAACTTGATATCACTTCATAGTTTTGCAGCAGCAGTTTTGATGTGTGATTCAATTGTTCAATATACGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGTGTGAATGATAGTCTTCTGGCAAGCATTTCTGGCTTCATCATGTTATTTTGTCTATATTTGCTTCCAAAATATTGTATCAAGAGAAAGTTCAAAGGTGTTGAAATTATAATATCTTTGGGTCTAGAGTTTGAACATGTTCtactactactactattattattattattattattTGTGGCTACTGGTGCAGTTCTTACTTTTGT

>Glyma.14g116000.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
CTTGTTTGTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGGTCAGAGGTCCTATATCCTTTGAAACAGATTCTTGGGGATTTGGGTGCACCATTGTCGAAATGTTGACTGGTAACCAACCTTGGTATGGATGTCCTGTTCGCAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGGTTTGTAAAtatttatatatttatttattttttaAAAATTCTCTTGAAAATTTCTGTGGCTGTGTAAGCTTTTGCTTAGTTTCAAAAAGTTGTAATTATCTTGGGTCTGGCATATTTTATTTAGTTGCATTCATTTAGTGAGGCTTATGTGTGAGAAGATCCACTAAAAAGAGCATATGGATATGTTAATGGTCAAGGTTAGCTCCTCTTATGCTCCCACTAGATACAACTGATTTTATCTTCCAGAGTAATTGGGCAGCATCACAGATTCTTTACCTCACAAAAGATTTTTTTCCATAATTGCATGCCAAGCACTGTGatctttaacatcatcatcatcatcctcatATTTGTTGCTCATAAACTTAGAATATGATGTCATTTTGGAAGTCCATACAGATAACATGAATCCATTTTTTCTGATATTTCAAATTAATTTAGTACTACAGCTTGAGGTTGAGGTTATATGAAAGGATTGAGAGCTTTAAGTTGAATTGTTTCCTTGTGATGTAATGTGTTCAGAGCTAGTTATTAAATTTTAATAAATTTTTCAAAGGCTCCTGAACACTGTTTTTCTGCTGCACTCTCCAGTGTTGTGATTCTACTTTTTTGTTGGCATGGCATTGCAGTGTGAATG

>Glyma.14g116000.14 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
GTTTGTTCGTTTGCTACGGTTCTCTCACTTTCTGGGTGCAACATTTTTTTTTCTGTTTCTCCGAGATTCCATCGCAAAGGTTGTTTCTTTGACTCCActctctctctctctctctatcaagtttgtttctctgacacaacactttctctctctaactctTTAAATTTTTGGAAACCTACTCTCTCTATACTGCTGCTGAATTTTAATTTTTTTGGATTGAACTCTGCAGGGAGTCAAGAATGTCTAAAGAAGTTATTGCTACTCAATCACCTACTCCTTTTGAGTATGAGATCTTGGATAGTGATGCTGAAGTCCTTAGAACTGTTAGAGCCTCATCCAATTGTGCTAATCCATGGATTGAACCTGAAAGGTTGAAACTTAGACATAGAATTGGCCGAGGCCCCTTTGGTGATGTCTGGCTAGCAACTCATCATCAGTCAACTGAAGATTTTGATGAGTACCATGAAGTTGCTGCTAAGATGTTGCATCCAATCAGAGAGGATCATGTGAAGATTGTATTAGAGAAGTTCAATGAATTGTATTTTAAGTGCCAAGGAGTTGCTAGCGTTTCCTGGCTACATGGAATTTCAGTCTTAAATGGGAGGATATGCATCATTATGAATTTGTGTGAGGGTTCAATTGGTGACAAGATGGCAGGACTCAAAGAAGGAAGGATTTCATTGAATGATGTCTTAAGGTATGGAATCAATCTAGCTCAAGGTGTTCAGGAACTTCACTCTAAAGGCAGCTTCATCCTGAACCTTAAACCTTTTAATGTTCTTCTCAATGATAATGATCAAGCAATTTTGGGAGATGTTGGTATTCCTAGCCTTTTGCTTGGCTCATCATTCCTGAGCTCAGACATGGCTAAGAGGCTTGGAACTCCAAATTACATGGCTCCAGAGCAATGGGAACCAGAGGTCAGAGGTCCTATATCCTTTGAAACAGATTCTTGGGGATTTGGGTGCACCATTGTCGAAATGTTGACTGGTAACCAACCTTGGTATGGATGTCCTGTTCGCAGAATATACCAGTCAGTTGTTGAAAAACATGAAAAACCAAATATTCCAAGTGGCCTTCCTTCTTCAGTTGAGAATATCCTCAGTGGATGCTTTGAGTATGATTTGAGGAATCGCCCGTTAATGGTAGATATTCTGAGTGTCTTTCAAAGGTTTGTAAAtatttatatatttatttattttttaAAAATTCTCTTGAAAATTTCTGTGGCTGTGTAAGCTTTTGCTTAGTTTCAAAAAGTTGTAATTATCTTGGGTCTGGCATATTTTATTTAGTTGCATTCATTTAGTGAGGCTTATGTGTGAGAAGATCCACTAAAAAGAGCATATGGATATGTTAATGGTCAAGGTTAGCTCCTCTTATGCTCCCACTAGATACAACTGATTTTATCTTCCAGAGTAATTGGGCAGCATCACAGATTCTTTACCTCACAAAAGATTTTTTTCCATAATTGCATGCCAAGCAC

>Glyma.14g116000.15 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g116000.16 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.16.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g116000.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g116000.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g116000.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g116000 ID=Glyma.14g116000.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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