Report for Sequence Feature Glyma.14g080800
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm14
Start: 6992996
stop: 7004070
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.14g080800
Database ID Annotation Type Annotation Description Annotation Source Match Score Evidence Code
AT4G11800.1 AT
Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein
JGI N/A IEA
GO:0016020 GO-cc
membrane
EnsemblGenomes N/A IEA
GO:0016021 GO-cc
integral component of membrane
EnsemblGenomes N/A IEA
GO:0016787 GO-mf
hydrolase activity
EnsemblGenomes N/A IEA
GO:0016787 GO-mf
hydrolase activity
JGI N/A IEA
PF00149 PFAM
Calcineurin-like phosphoesterase
JGI N/A IEA
Expression Patterns of Glyma.14g080800
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS .
Gene information in GlycineMine developed by LIS .
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Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.14g080800
Paralog Evidence Comments
Glyma.17g244600 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.14g080800 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma14g08860 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.14g080800
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.14g080800.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
CGGTTTTTAGAAAAGAATATGCCGTTGCTATGTTCCTCGCAGACATTCTCAGATGCCAAGTGGGTCTGAGTGAGATAGATAGAGATAGATTGATTCTCATGTTAAGTTTCCTTCTCTTTTAAATCGCACGCACTTCTCATGTGAGTGATCTTTTTATTCCATTTCGCCTTCTCTCGCGATACCAGGATTCTCTGGTGCTGCTCTCTATGGTTTTCTGGAATTCCTAAAGTGAACTTCATTGCCAGAAATTTGGTAGATATTAGAATTTTTTTTTTATTGGAATGGGCTCTAGTAAGCAGTCTGCTGGTATTCTTGATACGCTGAAAATGCAGAGGGTTAGAACTATTCTAACCCACACTTATCCTTACCCTCACGAGCATTCCCGCCATGCTGTAATTGCTGTTGTTGTGGGTTGCCTCTTTTTCATCTCATCTGACAATATACATACTCTTGTAGAAAAATTAGATAACAATGTTAAATGGTGGTCTATGTATGCCTGCTTGTTTGGGTTTTTTTATTTCTTTTCATCACCATTTATAGGAAAGACTTTCAAACCAAGCTATTCAAATTTCAGTCGATGGTACATAGCTTGGATTTTAGTGGCAGCTGTGTATCATCTTCCTAGCTTTCAGTCAATGGGAGTGGATATGAGGATGAATCTATCTTTGTTTTTGACAATATATCTCTCTTCCATCTTGTTTCTTCTTGTTTTTCACATTATATTTCTTGGTCTCTGGTATATCGGCTTTGTTTCACGTGTGGCGGGAAAGAGACCAGAGATCTTGACCATTCTTCAAAACTGTGCGGTACTTAGCGTGGCATGCTGTGTATTTTATAGTCATTGTGGTAACCGTGCCATGTTAAGAGAGAGACCACTTGACCGAAGAAATTCTAACTGGTTTTCTTTCTGGAAAAAAGAGGAGAGGAACACATGGCTTGCAAAGTTTCTTCGGATGAACGAATTGAAGGACCAGGTCTGCTCATCTTGGTTTGCACCAGTTGGATCTGCAAGTGATTATCCTCTCTTGTCAAAGTGGGTTATTTATGGGGAGATAGCTTGCAATGGATCATGTCCTGGTTCATCAGATGAAATTTCTCCCATTTACTCACTCTGGGCTACATTTATTGGGCTTTACATTGCAAATTATGTGGTGGAGAGGTCAACAGGATGGGCTCTCACTCACCCATTATCTGTTAAAGAATATGAGAAGTTGAAGAAGAAGCAAATGAAGCCTGATTTTTTAGACATGGTTCCATGGTACTCTGGAACATCTGCTGATTTATTCAAAACGGTTTTTGACCTCCTAGTATCAGTGACTGTCTTCGTTGGGCGTTTTGACATGCGTATGATGCAGGCAGCAATGAGTAGGGTTAGTGATGGAAATCATCAAGGTGATCTTCTATATGATCATTTTAGTGAGAAGGATGATTTTTGGTTTGACTTTATGGCTGATACTGGTGATGGTGGGAACTCATCTTATGCTGTTGCACGGCTGCTTGCTAAGCCTTTTATTCGGACACTGAAAGATGATTCTGAGCTTACCTTGCCACGTGGAAACTTGCTACTTATTGGGGGTGATCTTGCGTATCCAAATCCATCAGCATTCACATATGAAAGGCGTCTTTTTGTTCCTTTTGAGTATGCTCTTCAACCTCCTCCTTGGTATAAAGCAGAGCAGATAGCTGTGAACAAGCCGGAGGTACCCTTTGGGGCTCAATTAAAACAGTACAATGGACCTCAATGTTTTGTTATTCCTGGAAACCATGACTGGTTTGATGGACTCCAGACCTTTATGAGGTATATATGCCATAGAAGCTGGTTAGGTGGATGGCTCATGCCCCAGAAGAAGAGTTATTTTGCTTTGCAACTCCCTAAACGGTGGTGGGTTTTTGGGCTTGATCTAGCTCTTCATGGTGATATTGATGTGTACCAATTCAAGTTCTTTACGGAACTGATAACAGAGAAAGTTCAAGAGGATGACTCTGTGATCATTATTACTCATGAACCTAATTGGCTCACTGACTGGTATTGGAATGATGTTACTGGAAAGAACATTTCACACCTTATTTCTGATTATTTAAGAGGAAGATGTAAGCTTCGAATGGCTGGGGACTTGCATCATTACATGCGTCATTCTCATGTAAAGTCAGATGGGCCTGTACATGTTCACCATCTTCTTGTTAATGGTTGTGGTGGTGCATTTCTACATCCTACCCATGTTTTCAGTAAATTCAACAAACTTGATGAAGTTTCCTATGAATGCAAAGCTGCATATCCTTCCTTTGAAGATTCAAGCAGGATTGCATTGGGAAATATCTTAAAATTTCGGAAGAAGAACTGGCAATTTGATTTTATTGGTGGCATTATATATTTTGTACTAGTCTTTTCAATGTTTCCACAATGTCAGCTGAATCACATCCTCCAAGATGATACATTTTCTGGTCACATAAGGAGTTTCCTTGGTACTGTGTGGAATGGATTTATTTATATTCTGCAGCACTCTTGTGTGTCACTAGTGGGAGCTATACTATTACTAATTGCAGCATATTCTTTTGTTCCACCCAAATTGTCACGGAAGAAACGAGCCATAATTGGAGTTCTTCATGTTTCTGCTCACCTTGCTGCAGCACTGATTCTTATGTTGCTTCTTGAAATAGGCATTGAAATATGCATCCAGCATAAGTTGCTAGCAACTTCAGGGTATCACACTTTATATCAGTGGTATAGATCAGTGGAAAGTGAGCACTTTCCCGATCCAACTGGACTCAGAGCTCGTATTGAACAATGGACATTTGGACTTTACCCGGCATGTATCAAGTATTTAATGTCAGCTTTTGATGTGCCAGAGGTCATGGCAGTCTCCCGGAGCAATATTTGCAACAATGGATTAGAGTCTATTTCCCGAGGGGGTGCTGTAATATATTATGCTTCCGTCTTCCTTTATTTTTGGGTCTTCTCGACCCCTGTTGTTTCCTTGGTGTTTGGGAGCTACTTATACATTTGCATCAACTGGCTTCACTTACACTTTGATGAAGCCTTTTCGTCTCTTCGAATAGCTAATTACAAATCATTCACACGGTTTCACATCAATTCGGATGGTGATCTTGAAGTTTATACTTTGGCTGTTGATAAGGTTCCAAAGGAATGGAAGCTCGATCCTGATTGGGATGGAGAGACAAAACATCCACATGAGTTGAGTCATTTGAGAAGGTTTCCCAGCAAATGGAGGGCAGCCATTGCCCACCAGGATCCAGTTCGTACGGTCAAAATTGTTGACCATTTCGTTATTGGACGGACAGATAAGAATGACTGTGCTACTACTGCACCTAACGGACCAGTTCAATGATTTGTTGATTTGGTTTGGTTTATCCTGTTTGTAACATTATTTAGGAAGCAATTTGAAGAAATGAAAAAAAAGAAAAAAAAGAATAGTAGTTCCCACATATTTTTGTTTCTTTTTTCTATTTCTGCAAAATGAGAGATAGTTGGACTAGTGTGAATTCGATGGTCTTTAATGCAAGGCCCTGACAAGTCAAACCTCGGTTGAATTTAATGGTGAATCCGAAAATGGCTAATTTAATTCAATCTATATCCGAGTTGGTGAATTAAACGTGTTGTTTGTCTAAATTTGAAAAAATTGGAAAAAGCTGAATTGATGTTAAAATGATAGTATGGTATAGTCTATAGGGTTGGCCTAGTGTAAAGTTTTGTTATGTTTACATTTAACATGAGAATTTATATTCTGTTTCTTTTGTGTGTAAATTTTTTTTTGGATTAGTCAGTCATATATTGTGAGGGAGATATGATAGCTGTGGTTTTTTGACTCAAGACAAAATTTGTAGTATAGTATTACAAATagtcaaatggtagcctaaccatattcttctttacatcaggaaaatttgaagattcaagtttccaaaacagtgCAACCAGCCAAGTGTGCAATGTGAAGGATTGGAATTGTTTAAGGATAGGCTATGTTTGCCCAACTTGGTAGGGAATATAGGGACAAGCTATTGTTATTGTAAGTGAAAAATAACCATGACATTTTAGACTCTAGTACTGGTATTTTGTATTTCGATTTCTTGAAATCTACTAATTGCAATAAACAAAAAAGACTGTTGAATGGAA
>Glyma.14g080800.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ctcttctctctctctctctctGAATAATTTTTCTTCGTCGTTTAAACATCGGGAACGTCGCTTGTGATTGCTGTCTCTCTCTGCAACTTCtctttcGATTCTCTGGTGCTGCTCTCTATGGTTTTCTGGAATTCCTAAAGTGAACTTCATTGCCAGAAATTTGGTAGATATTAGAATTTTTTTTTTATTGGAATGGGCTCTAGTAAGCAGTCTGCTGGTATTCTTGATACGCTGAAAATGCAGAGGGTTAGAACTATTCTAACCCACACTTATCCTTACCCTCACGAGCATTCCCGCCATGCTGTAATTGCTGTTGTTGTGGGTTGCCTCTTTTTCATCTCATCTGACAATATACATACTCTTGTAGAAAAATTAGATAACAATGTTAAATGGTGGTCTATGTATGCCTGCTTGTTTGGGTTTTTTTATTTCTTTTCATCACCATTTATAGGAAAGACTTTCAAACCAAGCTATTCAAATTTCAGTCGATGGTACATAGCTTGGATTTTAGTGGCAGCTGTGTATCATCTTCCTAGCTTTCAGTCAATGGGAGTGGATATGAGGATGAATCTATCTTTGTTTTTGACAATATATCTCTCTTCCATCTTGTTTCTTCTTGTTTTTCACATTATATTTCTTGGTCTCTGGTATATCGGCTTTGTTTCACGTGTGGCGGGAAAGAGACCAGAGATCTTGACCATTCTTCAAAACTGTGCGGTACTTAGCGTGGCATGCTGTGTATTTTATAGTCATTGTGGTAACCGTGCCATGTTAAGAGAGAGACCACTTGACCGAAGAAATTCTAACTGGTTTTCTTTCTGGAAAAAAGAGGAGAGGAACACATGGCTTGCAAAGTTTCTTCGGATGAACGAATTGAAGGACCAGGTCTGCTCATCTTGGTTTGCACCAGTTGGATCTGCAAGTGATTATCCTCTCTTGTCAAAGTGGGTTATTTATGGGGAGATAGCTTGCAATGGATCATGTCCTGGTTCATCAGATGAAATTTCTCCCATTTACTCACTCTGGGCTACATTTATTGGGCTTTACATTGCAAATTATGTGGTGGAGAGGTCAACAGGATGGGCTCTCACTCACCCATTATCTGTTAAAGAATATGAGAAGTTGAAGAAGAAGCAAATGAAGCCTGATTTTTTAGACATGGTTCCATGGTACTCTGGAACATCTGCTGATTTATTCAAAACGGTTTTTGACCTCCTAGTATCAGTGACTGTCTTCGTTGGGCGTTTTGACATGCGTATGATGCAGGCAGCAATGAGTAGGGTTAGTGATGGAAATCATCAAGGTGATCTTCTATATGATCATTTTAGTGAGAAGGATGATTTTTGGTTTGACTTTATGGCTGATACTGGTGATGGTGGGAACTCATCTTATGCTGTTGCACGGCTGCTTGCTAAGCCTTTTATTCGGACACTGAAAGATGATTCTGAGCTTACCTTGCCACGTGGAAACTTGCTACTTATTGGGGGTGATCTTGCGTATCCAAATCCATCAGCATTCACATATGAAAGGCGTCTTTTTGTTCCTTTTGAGTATGCTCTTCAACCTCCTCCTTGGTATAAAGCAGAGCAGATAGCTGTGAACAAGCCGGAGGTACCCTTTGGGGCTCAATTAAAACAGTACAATGGACCTCAATGTTTTGTTATTCCTGGAAACCATGACTGGTTTGATGGACTCCAGACCTTTATGAGGTATATATGCCATAGAAGCTGGTTAGGTGGATGGCTCATGCCCCAGAAGAAGAGTTATTTTGCTTTGCAACTCCCTAAACGGTGGTGGGTTTTTGGGCTTGATCTAGCTCTTCATGGTGATATTGATGTGTACCAATTCAAGTTCTTTACGGAACTGATAACAGAGAAAGTTCAAGAGGATGACTCTGTGATCATTATTACTCATGAACCTAATTGGCTCACTGACTGGTATTGGAATGATGTTACTGGAAAGAACATTTCACACCTTATTTCTGATTATTTAAGAGGAAGATGTAAGCTTCGAATGGCTGGGGACTTGCATCATTACATGCGTCATTCTCATGTAAAGTCAGATGGGCCTGTACATGTTCACCATCTTCTTGTTAATGGTTGTGGTGGTGCATTTCTACATCCTACCCATGTTTTCAGTAAATTCAACAAACTTGATGAAGTTTCCTATGAATGCAAAGCTGCATATCCTTCCTTTGAAGATTCAAGCAGGATTGCATTGGGAAATATCTTAAAATTTCGGAAGAAGAACTGGCAATTTGATTTTATTGGTGGCATTATATATTTTGTACTAGTCTTTTCAATGTTTCCACAATGTCAGCTGAATCACATCCTCCAAGATGATACATTTTCTGGTCACATAAGGAGTTTCCTTGGTACTGTGTGGAATGGATTTATTTATATTCTGCAGCACTCTTGTGTGTCACTAGTGGGAGCTATACTATTACTAATTGCAGCATATTCTTTTGTTCCACCCAAATTGTCACGGAAGAAACGAGCCATAATTGGAGTTCTTCATGTTTCTGCTCACCTTGCTGCAGCACTGATTCTTATGTTGCTTCTTGAAATAGGCATTGAAATATGCATCCAGCATAAGTTGCTAGCAACTTCAGGGTATCACACTTTATATCAGTGGTATAGATCAGTGGAAAGTGAGCACTTTCCCGATCCAACTGGACTCAGAGCTCGTATTGAACAATGGACATTTGGACTTTACCCGGCATGTATCAAGTATTTAATGTCAGCTTTTGATGTGCCAGAGGTCATGGCAGTCTCCCGGAGCAATATTTGCAACAATGGATTAGAGTCTATTTCCCGAGGGGGTGCTGTAATATATTATGCTTCCGTCTTCCTTTATTTTTGGGTCTTCTCGACCCCTGTTGTTTCCTTGGTGTTTGGGAGCTACTTATACATTTGCATCAACTGGCTTCACTTACACTTTGATGAAGCCTTTTCGTCTCTTCGAATAGCTAATTACAAATCATTCACACGGTTTCACATCAATTCGGATGGTGATCTTGAAGTTTATACTTTGGCTGTTGATAAGGTTCCAAAGGAATGGAAGCTCGATCCTGATTGGGATGGAGAGACAAAACATCCACATGAGTTGAGTCATTTGAGAAGGTTTCCCAGCAAATGGAGGGCAGCCATTGCCCACCAGGATCCAGTTCGTACGGTCAAAATTGTTGACCATTTCGTTATTGGACGGACAGATAAGAATGACTGTGCTACTACTGCACCTAACGGACCAGTTCAATGATTTGTTGATTTGGTTTGGTTTATCCTGTTTGTAACATTATTTAGGAAGCAATTTGAAGAAATGAAAAAAAAGAAAAAAAAGAATAGTAGTTCCCACATATTTTTGTTTCTTTTTTCTATTTCTGCAAAATGAGAGATAGTTGGACTAGTGTGAATTCGATGGTCTTTAATGCAAGGCCCTGACAAGTCAAACCTCGGTTGAATTTAATGGTGAATCCGAAAATGGCTAATTTAATTCAATCTATATCCGAGTTGGTGAATTAAACGTGTTGTTTGTCTAAATTTGAAAAAATTGGAAAAAGCTGAATTGATGTTAAAATGATAGTATGGTATAGTCTATAGGGTTGGCCTAGTGTAAAGTTTTGTTATGTTTACATTTAACATGAGAATTTATATTCTGTTTCTTTTGTGTGTAAATTTTTTTTTGGATTAGTCAGTCATATATTGTGAGGGAGATATGATAGCTGTGGTTTTTTGACTCAAGACAAAATTTGTAGTATAGTATTACAAATagtcaaatggtagcctaaccatattcttctttacatcaggaaaatttgaagattcaagtttccaaaacagtgCAACCAGCCAAGTGTGCAATGTGAAGGATTGGAATTGTTTAAGGATAGGCTATGTTTGCCCAACTTGGTAGGGAATATAGGGACAAGCTATTGTTATTGTAAGTGAAAAATAACCATGACATTTTAGACTCTAGTACTGGTATTTTGTATTTCGATTTCTTGAAATCTACTAATTGCAATAAACAAAAAAGACTGTTGAATGGAA
>Glyma.14g080800.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.14g080800
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.14g080800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g080800.1.p locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g080800.2.p locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g080800.4.p locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g080800.5.p locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g080800.6.p locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.14g080800
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
>Glyma.14g080800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g080800.1 locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g080800.2 locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g080800.3 locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g080800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g080800.4 locus=Glyma.14g080800 ID=Glyma.14g080800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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