Glyma.14g010300

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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

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Warning: get_headers(https://bar.utoronto.ca/api/efp_image/efp_soybean/soybean_severin/Absolute/Glyma.14g010300): Failed to open stream: php_network_getaddresses: getaddrinfo for bar.utoronto.ca failed: Temporary failure in name resolution in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1020

Warning: Trying to access array offset on false in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1021

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Deprecated: preg_match(): Passing null to parameter #2 ($subject) of type string is deprecated in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1031

Report for Sequence Feature Glyma.14g010300

Feature Type:	gene_model
Chromosome:	Gm14
Start:	793295
stop:	800566
Source:	JGI
Version:	Wm82.a2.v1
High confidence:	yes

A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.14g010300

Database ID	Annotation Type	Annotation Description	Annotation Source	Match Score	Evidence Code
AT5G23810.1	AT	amino acid permease 7	JGI	N/A	IEA
GO:0003333	GO-bp	amino acid transmembrane transport	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0003333	GO-bp	amino acid transmembrane transport	JGI	N/A	IEA
GO:0005886	GO-cc	plasma membrane	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0016020	GO-cc	membrane	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0016021	GO-cc	integral component of membrane	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0015171	GO-mf	amino acid transmembrane transporter activity	EnsemblGenomes	N/A	IEA
KOG1303	KOG	Amino acid transporters	JGI	N/A	IEA
PTHR22950	Panther	AMINO ACID TRANSPORTER	JGI	N/A	IEA
PF01490	PFAM	Transmembrane amino acid transporter protein	JGI	N/A	IEA

Expression Patterns of Glyma.14g010300

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.14g010300 not represented in the dataset	Glyma.14g010300 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection	Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Related Legume Genes

Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.

Gene information in GlycineMine developed by LIS.

Related Plant Genes

Gene families from PhyloGenes.

Paralogs of Glyma.14g010300

Paralog	Evidence	Comments
Glyma.02g303500	IGC	Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.

Gene model name correspondences to Glyma.14g010300 Gene Call Version Wm82.a2.v1

Corresponding Name	Annotation Version	Evidence	Comments
Glyma14g01405	Wm82.a1.v1.1	IGC	As supplied by JGI

Transcripts of Glyma.14g010300

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.14g010300.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g010300.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g010300.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
TTTTTCATAAATTGAAAATTTTGAATACATGACACTTAAAAGTTAGAGGAGACTATGGATACGTGGTGATCTTAAAGGTATGAAGTATTGTGATGTATATAAAGTTTGTACTCAAAAACTACGAGAAAGAGATGATGTTGGAGTGTTTGGTGTGTTGACTAAGGTGAGCAATACTCGACATGATGTTAAACATAATATGTAAGTTTTCTAAATTATCTATTTTGTACATTTTCAAATATTCTGAATCTTCCTACATTAGCCCCACTATTTCACTCACGTACCTCTGGTCCTCTGATAGATACTGATTACTGAATCATTTTCACTATGTTGAGCATTGAGAGAATATATTCCACAAGAACACGACAGCTCCATTATTAGAAAGTTATGATGACGAGTGCATATCTTTTATCAAAAGGCTACCACAGTCATACACCATGCAGTTTCAAACTTCAAAGAATCTCCTTCCTCTTCGCATCATGTTCTGGCCTGTATTTTTTATAATGAAATCTAGTACAATAAAGTTTTCCTGATTTTATGCTGTGTCCTGTCGTTAGTAATGTCTGTTTTAGTACACACCTTAATTATCAAGAACATGGCTTCCAAAAGTTTTAAGAAACTAGCTATTTTAATTTTGGTTTGGCACAGACACACATGCTTATCAGCATAGTTTAGATTTATTTACACTATTTCCTGCAACTTCTTCTATGCTGCTAGTCAATTACTTAACTTTAGGAGAGTTGTCGTAGACATCTTCCTTTTTAATTTAATAAGCATGTTACATGCAAACCAAAATTATGTAGTTACCAAACAAACATAATTTTGAATTCAAGTAGGTGCCATATAGTTCCTTTGATTGTAGTTGGCTGTAGACTGTACAGGGAATTCAATTGCACTGAACTCCATGAATACCAATTGAGTTGGATGCTTGGATAAAAATGGCTGTTCAAAACTCTCTCCAAATAACTAGAAGTGGTAGTGGTGGTTATGACGATGACGGGCGTGCTAAAAGGACTGGAACTTTATGGAGTGCTGTGGCTCATATCATCACAGCCATTATCGGTGCTGGTGTTCTGTCTTTAGCTTGGAGTACTTCCCAATTGGGATGGATTGCAGGACCAGTTTGCTTGCTTTTTTGTGCAATTGTCACCTATGTTTCTTCATTCCTCCTTTCCGATTGTTACAGAACTCTGGATCCTGTAACTGTGAAAAGAAACTACTCTTACATGGATGCTGTTAGAGTCTATCTTGGCAATAAGAGGACATGGTTGGCTGGTTCCCTTCAATATTTGAGCTTGTATGGGGTTAGTACTGCTTATGTAATTACCACAGCAACCTGTTTGAGAGCCATATTGAAATCAAATTGTTATCACAAGGAAGGGCATCAGGCTCCTTGTAAATATGGGGATGTAGTATATATGATGCTGTTTGGACTAGTTCAGGTCATAATGTCATTCATACCAGATCTCCACAACATGGCATGGGTTTCAATTGTTGCGGCCATAATGTCCTTTACATACTCATCTATTGGACTTGGACTTGGAATCACAACAGTCATAGAAAATGGAAGAATTATGGGTAGTTTAACAGGAGTACCGGCTTCAAATATTGCTGACAAGTTATGGTTAGTCTTCCAAGCAATTGGTGATATTGCCTTTGCCTATCCATACACAGTCATCCTCCTTGAGATACAGGACACTCTAGAGTCTCCTCCACCAGAAAACAAGACCATGAAAAAGGCCTCCATGATTGCTATCCTCATTACAACATTCTTCTACCTCTGTTGCGGATGCTTTGGATATGCAGCTTTTGGAAATCAAACACCAGGGAACCTCTTGACAGGGTTTGGATTTTACGAGCCTTACTGGCTCATTGACTTTGCGAATGCTTGCATTGTTCTTCACTTGGTAGGAGGATATCAGATTTACAGTCAGCCGATCTATGGAGCTGTTGACAGATGGTGTTCAAAAAGATACCCCAACAGTGGATTTGTGAATAATTTCTACCAATTGAAACTGCCTCGGTTGCCAGCTTTTCAGCTAAACATGTTCAGGATATGTTTTAGAACAACCTAGTGGTTTCCACGACTGGACTCGCTATCCTATTTCCTTACTTCAATCAAGTTATAGGAGTGTTAGGAGCCTTAGGCTTTTGGCCATTGGCTATATATTTCCCTGTAGAGATGTACTTTGTGCAGAGGAAAATTGAAGCTTGGTCTAGAAAATGGATTGTCCTTAGGACCTTCAGCTTTATTTGCTTTCTGGTGTCATTAGTGGCCCTCATTGGATCACTTGAAGGAATCATAAGTGAGAAACTAAGCTAATGAAGGGTGCTTCATTTGTTTGAGTTTATTGTCTTGTTGCCATATCTTCCATGTAATTCAGTTTCGCATTAATTCTATTACTATTTACTATTGAGAGTTAATAAAGGGGATAACAATTATGTGGGGATGTGTCAAAGTGAAGGCGTTGTGGACGTGGAATAGTTCTGTTGGGTGAAAAACTCCCTTTAAAGAAAGTatacgaaaaataaggtcgcatttagcaaaagtggcacagaaaggaagaaaaaaagaagaaattctgaagcaggcccaatccaataggggcgctcagcgcgcatcaggcgctaagcgagcaactaactgaaggcgctgagcatggcggaaaccgttgcgcgcgctaagccagccaggcgcccagcgcccgatccaacagacgcacaggcccagcgtgcatggcgcgcccagcgcgcgatctgaacgcgctaagcgcgaggtgtggcgctgagcgcgactacgaaggcccataagcccacttcagccactataaatagagaggcagtcccaaggaaaattcattccatctcagagcatcactctcagtacttcaagcctgagttttcttccctctctatattctttgttttgttttgttagcctagcctttctttcatccccagttgtaagccctcaatggccatgagtggctaaacccctagctagggcctggcaggcctaaaaagccaacgatgtacactgagcttcaagagttatcaatgcaaaagaatttattccaggttt

>Glyma.14g010300.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ACATGACACTTAAAAGTTAGAGGAGACTATGGATACGTGGTGATCTTAAAGGTATGAAGTATTGTGATGTATATAAAGTTTGTACTCAAAAACTACGAGAAAGAGATGATGTTGGAGTGTTTGGTGTGTTGACTAAGACTGTACAGGGAATTCAATTGCACTGAACTCCATGAATACCAATTGAGTTGGATGCTTGGATAAAAATGGCTGTTCAAAACTCTCTCCAAATAACTAGAAGTGGTAGTGGTGGTTATGACGATGACGGGCGTGCTAAAAGGACTGGAACTTTATGGAGTGCTGTGGCTCATATCATCACAGCCATTATCGGTGCTGGTGTTCTGTCTTTAGCTTGGAGTACTTCCCAATTGGGATGGATTGCAGGACCAGTTTGCTTGCTTTTTTGTGCAATTGTCACCTATGTTTCTTCATTCCTCCTTTCCGATTGTTACAGAACTCTGGATCCTGTAACTGTGAAAAGAAACTACTCTTACATGGATGCTGTTAGAGTCTATCTTGGCAATAAGAGGACATGGTTGGCTGGTTCCCTTCAATATTTGAGCTTGTATGGGGTTAGTACTGCTTATGTAATTACCACAGCAACCTGTTTGAGAGCCATATTGAAATCAAATTGTTATCACAAGGAAGGGCATCAGGCTCCTTGTAAATATGGGGATGTAGTATATATGATGCTGTTTGGACTAGTTCAGGTCATAATGTCATTCATACCAGATCTCCACAACATGGCATGGGTTTCAATTGTTGCGGCCATAATGTCCTTTACATACTCATCTATTGGACTTGGACTTGGAATCACAACAGTCATAGAAAATGGAAGAATTATGGGTAGTTTAACAGGAGTACCGGCTTCAAATATTGCTGACAAGTTATGGTTAGTCTTCCAAGCAATTGGTGATATTGCCTTTGCCTATCCATACACAGTCATCCTCCTTGAGATACAGGACACTCTAGAGTCTCCTCCACCAGAAAACAAGACCATGAAAAAGGCCTCCATGATTGCTATCCTCATTACAACATTCTTCTACCTCTGTTGCGGATGCTTTGGATATGCAGCTTTTGGAAATCAAACACCAGGGAACCTCTTGACAGGGTTTGGATTTTACGAGCCTTACTGGCTCATTGACTTTGCGAATGCTTGCATTGTTCTTCACTTGGTAGGAGGATATCAGATTTACAGTCAGCCGATCTATGGAGCTGTTGACAGATGGTGTTCAAAAAGATACCCCAACAGTGGATTTGTGAATAATTTCTACCAATTGAAACTGCCTCGGTTGCCAGCTTTTCAGCTAAACATGTTCAGGATATGTTTTAGAACAACCTAGTGGTTTCCACGACTGGACTCGCTATCCTATTTCCTTACTTCAATCAAGTTATAGGAGTGTTAGGAGCCTTAGGCTTTTGGCCATTGGCTATATATTTCCCTGTAGAGATGTACTTTGTGCAGAGGAAAATTGAAGCTTGGTCTAGAAAATGGATTGTCCTTAGGACCTTCAGCTTTATTTGCTTTCTGGTGTCATTAGTGGCCCTCATTGGATCACTTGAAGGAATCATAAGTGAGAAACTAAGCTAATGAAGGGTGCTTCATTTGTTTGAGTTTATTGTCTTGTTGCCATATCTTCCATGTAATTCAGTTTCGCATTAATTCTATTACTATTTACTATTGAGAGTTAATAAAGGGGATAACAATTATGTGGGGATGTGTCAAAGTGAAGGCGTTGTGGACGTGGAATAGTTCTGTTGGGTGAAAAACTCCCTTTAAAGAAAGTGTAATGCTACACAAACAACTCCACATAAACTTGTtgataactgctaaataactgtgaatttataggaattaattagtcaaattttggcttaaaattagttatttagcagttatttgtaattaaaagtgagaaaattaatttaaattgaatttctggttgcagatacgaaaaataaggtcgcatttagcaaaagtggcacagaaaggaagaaaaaaagaagaaattctgaagcaggcccaatccaataggggcgctcagcgcgcatcaggcgctaagcgagcaactaactgaaggcgctgagcatggcggaaaccgttgcgcgcgctaagccagccaggcgcccagcgcccgatccaacagacgcacaggcccagcgtgcatggcgcgcccagcgcgcgatctgaacgcgctaagcgcgaggtgtggcgctgagcgcgactacgaaggcccataagcccacttcagccactataaatagagaggcagtcccaaggaaaattcattccatctcagagcatcactctcagtacttcaagcctgagttttcttccctctctatattctttgttttgttttgttagcctagcctttctttcatccccagttgtaagccctcaatggccatgagtggctaaacccctagctagggcctggcaggcctaaaaagccaacgatgtacactgagcttcaagagttatcaatgcaaaagaa

>Glyma.14g010300.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g010300.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.14g010300

Limit To All Plant Sequences

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>Glyma.14g010300.12 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g010300.12.p locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g010300.13 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g010300.13.p locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g010300.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g010300.2.p locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g010300.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g010300.5.p locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.14g010300.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.14g010300.6.p locus=Glyma.14g010300 ID=Glyma.14g010300.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.14g010300

Limit To All Plant Sequences

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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA

U.S. Public Domain