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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT3G09150.2 | AT | phytochromobilin:ferredoxin oxidoreductase, chloroplast / phytochromobilin synthase (HY2) | JGI | N/A | IEA |
GO:0010024 | GO-bp | phytochromobilin biosynthetic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0010024 | GO-bp | phytochromobilin biosynthetic process | JGI | N/A | IEA |
GO:0055114 | GO-bp | oxidation-reduction process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0055114 | GO-bp | oxidation-reduction process | JGI | N/A | IEA |
GO:0016636 | GO-mf | oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, iron-sulfur protein as acceptor | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016636 | GO-mf | oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, iron-sulfur protein as acceptor | JGI | N/A | IEA |
GO:0050897 | GO-mf | cobalt ion binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0050897 | GO-mf | cobalt ion binding | JGI | N/A | IEA |
PF05996 | PFAM | Ferredoxin-dependent bilin reductase | JGI | N/A | IEA |
PWY-7170 | SoyCyc9 | phytochromobilin biosynthesis | Plant Metabolic Network | ISS | |
GN7V-59863 | SoyCyc9-rxn | phytochromobilin:ferredoxin oxidoreductase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.14g009100 not represented in the dataset |
Glyma.14g009100 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.02g304700 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma14g01270 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.14g009100.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.14g009100.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 GGATGAGTGAGTTGAGGGATTTAGAACTAGTAGTAGTGATTGAGTGCAGAAGAAGCTGCTTAACATAAATGGGATTTAGAATTAGCAGTTCCTCCTCTTCATCATGCTTTTGTTTGCAACGTGCGCTTCTTCCTCCGTTAACAGCGATAGCCACTTCTACTCGTGCCTTGAGGAGGAGTAATTGCATACCAAGTTGTTCAGTATCTTATCAAAAGTTTGTTGAGTTTGCATTGGATGAAACCAAACGCCACACTCACTTGATCCCTTCGCCTTTACAGGAAAAGTTCAGTTTCATGAATTCCAAGGATGTTAAAGGAAGTTTTAGTATGCTATCATTTGAAGCTGCAAAAATTAGGCTTCTACGAAGTTTGATCATTCAGACAGAAACAATGCAGGTTTTGGATTTTACTGTCTTTCCAAAAGCAGAATATGATGTCCCCATATTTTGTGCTAACTTTTTCACCTCTGCTAAAACAAACATTATTGTGTTGGACCTTAACCCTGTGCATGATATCATCAATCAGTATGAGTACAAGGAGAAGTACTTTAAAAGCTTAATTCCTCTTGGCCTTAAATATGCTGAGGTATGGTTGGAATTGATATGCAAAGCAGTTAAAGAGACAGATGAATCTCAGATTTTCCACAATCTCGAAGCACAACATAGATATCTGACATGGAGAGCTGAAAAGGATCCAGGACGAGGTGTTTTGAAGAAGCTGATTGGTGACACACTTGCCAAGGATATGTTGAGAAGCTTTCTCTTTAATGGAGTCGATGAACTTGGAAGCAAAACATTCAATGATTATTTTCCACAGTACTGCTGTCAAGAGGGAAATCTAAATAAAAAAGGCAATATTATTGGGAAGTCCTTTGAAAATCGCCCTTGGAATGCTAGAGGAGAATTTATTGGTGAATGACTGTATACTGTAGAAGCTTGTGCACACGTTTGCAGTCAAACTTTTAATAGGCATGCCACTGGTTAAAATTTCGGCTATAGCGGTTCTGCAAGCGTACAAAAGACCGCTGCAATTTTTGTAGACAAGTTATGCTATAAGATGCTTGTAATACATATGCTACGTCGACACAAATTTTTGCATGGAAAAAAATTTCTGTAACAAATCTCAGGCTCAGCACCTATGGCTGTACGTGTTTGTACATTCGTATTGAAAGATTCTAGTTATATAACTGTAGCTATGTCCGATTAGCTTCAAGTCCTAGAAATTTAAATGTAGTACTTTACCATGCAGTTTAGATTTATTTGTATAACCCAAAAATTGTCACTCGATTCAGTTTTTGGGTTAAATCAAGAATTTGTTGGATACGATTGGGCTATGTATTCGGCATGCTGGCTAAATTGGGTCTCTTTGTAATTTGGGTATTTTGGAAGTTGTGAATTTCGAGTTGATCCACCTGTCTCATTTACTTAAGTTTCAACCTCAAGCCTAGATTATG 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>Glyma.14g009100.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.1 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MGFRISSSSSSSCFCLQRALLPPLTAIATSTRALRRSNCIPSCSVSYQKFVEFALDETKRHTHLIPSPLQEKFSFMNSKDVKGSFSMLSFEAAKIRLLRSLIIQTETMQVLDFTVFPKAEYDVPIFCANFFTSAKTNIIVLDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGSFSWIDVDV* >Glyma.14g009100.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.10 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MGREATSESIKFFSPIVIWTKFTSNPQKYDILYSAFREYYKVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGE* >Glyma.14g009100.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.11 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MGREATSESIKFFSPIVIWTKFTSNPQKYDILYSAFREYYKVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGSFSWIDVDV* >Glyma.14g009100.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.2 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MGFRISSSSSSSCFCLQRALLPPLTAIATSTRALRRSNCIPSCSVSYQKFVEFALDETKRHTHLIPSPLQEKFSFMNSKDVKGSFSMLSFEAAKIRLLRSLIIQTETMQVLDFTVFPKAEYDVPIFCANFFTSAKTNIIVLDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGE* >Glyma.14g009100.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.3 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MLTELVSILLYLLQYAISDPHEVLDFTVFPKAEYDVPIFCANFFTSAKTNIIVLDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGSFSWIDVDV* >Glyma.14g009100.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.4 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MLTELVSILLYLLQYAISDPHEVLDFTVFPKAEYDVPIFCANFFTSAKTNIIVLDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGE* >Glyma.14g009100.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.5 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSVERLFYNMLTASLFCLRLLVQVLDFTVFPKAEYDVPIFCANFFTSAKTNIIVLDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGE* >Glyma.14g009100.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.6 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNSKDVKGSFSMLSFEAAKIRLLRSLIIQTETMQVLDFTVFPKAEYDVPIFCANFFTSAKTNIIVLDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGE* >Glyma.14g009100.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.7 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNSKDVKGSFSMLSFEAAKIRLLRSLIIQTETMQVLDFTVFPKAEYDVPIFCANFFTSAKTNIIVLDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGSFSWIDVDV* >Glyma.14g009100.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.8 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGSFSWIDVDV* >Glyma.14g009100.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.14g009100.9 locus=Glyma.14g009100 ID=Glyma.14g009100.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDLNPVHDIINQYEYKEKYFKSLIPLGLKYAEVWLELICKAVKETDESQIFHNLEAQHRYLTWRAEKDPGRGVLKKLIGDTLAKDMLRSFLFNGVDELGSKTFNDYFPQYCCQEGNLNKKGNIIGKSFENRPWNARGEFIGE*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||