Glyma.13g370500

SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

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Warning: get_headers(): php_network_getaddresses: getaddrinfo for bar.utoronto.ca failed: Temporary failure in name resolution in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1020

Warning: get_headers(https://bar.utoronto.ca/api/efp_image/efp_soybean/soybean_severin/Absolute/Glyma.13g370500): Failed to open stream: php_network_getaddresses: getaddrinfo for bar.utoronto.ca failed: Temporary failure in name resolution in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1020

Warning: Trying to access array offset on false in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1021

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Deprecated: preg_match(): Passing null to parameter #2 ($subject) of type string is deprecated in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1031

Report for Sequence Feature Glyma.13g370500

Feature Type:	gene_model
Chromosome:	Gm13
Start:	45599394
stop:	45602993
Source:	JGI
Version:	Wm82.a2.v1
High confidence:	yes

A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.13g370500

Database ID	Annotation Type	Annotation Description	Annotation Source	Match Score	Evidence Code
AT2G03220.1	AT	fucosyltransferase 1	JGI	N/A	IEA
GO:0009832	GO-bp	plant-type cell wall biogenesis	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0009969	GO-bp	xyloglucan biosynthetic process	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0036065	GO-bp	fucosylation	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0042546	GO-bp	cell wall biogenesis	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0042546	GO-bp	cell wall biogenesis	JGI	N/A	IEA
GO:0005794	GO-cc	Golgi apparatus	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0016020	GO-cc	membrane	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0016020	GO-cc	membrane	JGI	N/A	IEA
GO:0008107	GO-mf	galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase activity	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0008107	GO-mf	galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase activity	JGI	N/A	IEA
GO:0008417	GO-mf	fucosyltransferase activity	EnsemblGenomes	N/A	IEA
PF03254	PFAM	Xyloglucan fucosyltransferase	JGI	N/A	IEA
GN7V-67519	SoyCyc9-rxn	type 1 precursor disaccharide 2-α-L-fucosyltransferase	Plant Metabolic Network		ISS

Expression Patterns of Glyma.13g370500

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.13g370500 not represented in the dataset	Glyma.13g370500 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection	Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.

Gene information in GlycineMine developed by LIS.

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Gene families from PhyloGenes.

Gene model name correspondences to Glyma.13g370500 Gene Call Version Wm82.a2.v1

Corresponding Name	Annotation Version	Evidence	Comments
Glyma13g44770	Wm82.a1.v1.1	IGC	As supplied by JGI

Transcripts of Glyma.13g370500

Limit To All Plant Sequences

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>Glyma.13g370500.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.14 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.15 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.13g370500

Limit To All Plant Sequences

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>Glyma.13g370500.10 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g370500.10.p locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.11 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g370500.11.p locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.12 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g370500.12.p locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.14 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g370500.14.p locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.15 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g370500.15.p locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g370500.7.p locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g370500.8.p locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.9 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g370500.9.p locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.13g370500

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.13g370500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.1 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.10 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.11 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.12.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.12 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.13.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.13 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.14.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.14 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.15.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.15 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.16.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.16 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.16.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.17.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.17 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.17.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.18.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.18 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.18.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.19.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.19 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.19.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.2 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g370500.20.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g370500.20 locus=Glyma.13g370500 ID=Glyma.13g370500.20.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA

U.S. Public Domain