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Report for Sequence Feature Glyma.13g106700

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm13
Start:22099835
stop:22112407
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.13g106700
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT2G19390.1AT JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.13g106700
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.13g106700 not represented in the dataset
Glyma.13g106700 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Paralogs of Glyma.13g106700
ParalogEvidenceComments
Glyma.17g052600 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.

Gene model name correspondences to Glyma.13g106700 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma13g16630 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.13g106700
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>Glyma.13g106700.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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CTGTGA
Coding sequences of Glyma.13g106700
>Glyma.13g106700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.1.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.10 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.10.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.11 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.11.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.12 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.12.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.14 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.14.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.15 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.15.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.17 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.17.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.17.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.2.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.3.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.4.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.13g106700.5.p locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.13g106700
>Glyma.13g106700.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g106700.1 locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g106700.10 locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g106700.11 locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.12.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g106700.12 locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.13.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g106700.13 locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.14.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g106700.14 locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g106700.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.13g106700.9 locus=Glyma.13g106700 ID=Glyma.13g106700.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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