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Warning: get_headers(https://bar.utoronto.ca/api/efp_image/efp_soybean/soybean_severin/Absolute/Glyma.13G224300): Failed to open stream: php_network_getaddresses: getaddrinfo for bar.utoronto.ca failed: Temporary failure in name resolution in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1020

Warning: Trying to access array offset on false in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1021

Deprecated: preg_match(): Passing null to parameter #2 ($subject) of type string is deprecated in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1025

Deprecated: preg_match(): Passing null to parameter #2 ($subject) of type string is deprecated in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1031

Report for Sequence Feature Glyma.13G224300

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm13
Start:33703380
stop:33715996
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.13G224300
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G18710.2AT Protein kinase superfamily protein JGI N/AIEA
GO:0006468GO-bp protein phosphorylation EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0006468GO-bp protein phosphorylation JGI N/AIEA
GO:0016020GO-cc membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0016021GO-cc integral component of membrane EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0004672GO-mf protein kinase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0004672GO-mf protein kinase activity JGI N/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding JGI N/AIEA
KOG1164 KOG Casein kinase (serine/threonine/tyrosine protein kinase) JGI N/AIEA
PTHR24057Panther GLYCOGEN SYNTHASE KINASE-3 ALPHA JGI N/AIEA
PTHR24057:SF114Panther JGI N/AIEA
PF00069PFAM Protein kinase domain JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.13G224300
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.13G224300 not represented in the dataset
Glyma.13G224300 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.13G224300 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma.13g224300 Wm82.a4.v1ISS As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.13G224300
>Glyma.13g224300.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g224300 ID=Glyma.13g224300.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g224300.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g224300 ID=Glyma.13g224300.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g224300.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g224300 ID=Glyma.13g224300.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g224300.14 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g224300 ID=Glyma.13g224300.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.13g224300.15 sequence-type=transcript locus=Glyma.13g224300 ID=Glyma.13g224300.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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GTAATCCCTCATAacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatataATGGCGGATTGGGGTCCAATGGTGATAGCAGTGGTGTTGTTTGTGTTGCTAAGCCCTGGTCTTCTGTTTCAATTGCCAGGGAAGAGCAAAGTGGTGGAGTTTGGGAACATGCAAACCAGGGCAGTGTCTATCTTGGTCCACACAATCATCTTCTTTGGTCTCATTACCATCTTTCTTGTTGCTATTGGCTAAATGCTTGGAAACTGGCGAGCCAGTGGCCATTAAGAAGGTTTTACTGGACAAAAGATATAAGAATCGTGAGCTACAGTTAATGCACTTGATGGATCATCCAAATGTGATCTCTCTGAAGCATCGTTTCTTTTCCACTACAAGTGCAGATGAACTTTTTCTTAATTTGGTGATGGAATATGTTCCAGAGTCTATGTATCGAGTCTCAAAGTTCTATAGTAATACTAATCAGAGCATGCCACTTATTTATGTAAAACTTTACATGCACCAGATTTTCAGGGGGCTGGCTTATATCCACACTGTTCCTGGAGGTTGCCACAAAGATTTGAAGCCTCAAAATATACTGGTTGACCCTCTTACACACCAGGTTAAGATATGTGATTTTGGAAGTGCAAAAGTGCTGGTCAAAGGTGAAGCTAATATATCACATATATGTTCACTTTTCTACCGGGCACCAGAACTTATGTTTGGTGCCACTGAGTATACTACTTCAATTGATATTTGGTCAGCTGGCTGTGTCCTTGCTGAGCTGCTTTTGGGCCAGGTTACTCAAATGAAGCAGGAGCATGACAAGAGGCAAGCAAGCCTCATAGCTGAACACAACGAACAGCTAAAGCGTACCCAACTGCAAGCTGAAAATGAATTGAGAGAGAAAACAATGTTTATGAGGAATGATCATGAAGCTCAGATCAAAGCATTGAGGTGTGAACTTGAAGATGAGTGTCGGAAGCTGGAAGAGGAGTTGCATCTTCAAAAAATCCAAAGAAGACAGGCAAAGGGCTTTGTTGCAGTTGCAGTGGAAAGTGATGAGTGACAAGCCTAAAGAGGACCAAGAAGTGAATTCAAAACAGGCACAGTTGGGGAAATGAGAAGACATTTGTTGTATACCTAAATGTGCTTCTTTAATATTCTTTCAACACAAGCCTGAGAATTGTGAACTTAAATACATAGAAGGGTGATGCAAATAAAGGCCCACTGGTTCACATATGCATAGTCTTCATGCTAAAATTGTCACTTATGAAACAGGCATAATCTTGTTACTGAAGGCATAACTATTTACTAGCATGATATTAGATAAATTTGATTGGTACCACTTCTCATATCATAGTTGTTTCAAAATTTAAGTTGAAAAGATTTTTATTGATGATTTTTGCACATCACAAAGGGAAGGGTGAAGGCAGTGCTCTGAAGGCTTCATGTCATAGCAGCAGAAATAGTGTGTGTGTGTCTTTAATTGATAGACATTGGTTTGGTTGTGATTTGGTATCTGTTACTTTAATCATGCTTCTTTTCAAGCTCCTTACTATCTTAAAGATGAACACTATAGAAAGTAACTACACTTACTATTTAGTGGTTTCATGAGTGTAAGGATATTCCAATTGCAATTTGTTTTTTTATTCTGATATCATGTATGCTTAAAAGTTCTGCTGAAAAGATGGGTTATGAGTGATTAAGATATCTAACCAAATTTTATTTGTGGAAAATGTGATGAGCATATGAATTTGATGATGATCTGGTATCTAAGTGTTAGAATACATTAGACAGGGTTCAGTGAGTGCAAATTGAATCAACCTTTGTAATGAATTTCAATTGAATTTGAAAATTAACATAATGATTTTCATACCTTGAATTCAAATGTCAAATCACTGctttcaaagacggttattacataataaccgtctttgaatgtcgaggagatgtaacaatcaaaggcggttattatgtaataaccgtctttgaatgtcaacccagatgtaacattcaaagacggttattatgtaataaccgtctttgaatttcgaggagatgtaacaatcaaaggcggttattatgtaataaccgtctttgaatgttgaaccagacactacattcaaagacggttattacgtaataaccgtctttgaatttcgaagagatgtaacaatcaaaggcggttattatgtaataaccgtctttgaatgtcaacccagatgtaacattcaaagacggttattacata

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GTAATCCCTCATAacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatataATGGCGGATTGGGGTCCAATGGTGATAGCAGTGGTGTTGTTTGTGTTGCTAAGCCCTGGTCTTCTGTTTCAATTGCCAGGGAAGAGCAAAGTGGTGGAGTTTGGGAACATGCAAACCAGGGCAGTGTCTATCTTGGTCCACACAATCATCTTCTTTGGTCTCATTACCATCTTTCTTGTTGCTATTGGCTAAATGCTTGGAAACTGGCGAGCCAGTGGCCATTAAGAAGGTTTTACTGGACAAAAGATATAAGAATCGTGAGCTACAGTTAATGCACTTGATGGATCATCCAAATGTGATCTCTCTGAAGCATCGTTTCTTTTCCACTACAAGTGCAGATGAACTTTTTCTTAATTTGGTGATGGAATATGTTCCAGAGTCTATGTATCGAGTCTCAAAGTTCTATAGTAATACTAATCAGAGCATGCCACTTATTTATGTAAAACTTTACATGCACCAGATTTTCAGGGGGCTGGCTTATATCCACACTGTTCCTGGAGGTTGCCACAAAGATTTGAAGCCTCAAAATATACTGGTTGACCCTCTTACACACCAGGTTAAGATATGTGATTTTGGAAGTGCAAAAGTGCTGGTCAAAGGTGAAGCTAATATATCACATATATGTTCACTTTTCTACCGGGCACCAGAACTTATGTTTGGTGCCACTGAGTATACTACTTCAATTGATATTTGGTCAGCTGGCTGTGTCCTTGCTGAGCTGCTTTTGGGCCAGCCCTTATTACCTGGCGAAAATGCACTGGACCAGCTTGTAGAGATTATCAAGGTTACTCAAATGAAGCAGGAGCATGACAAGAGGCAAGCAAGCCTCATAGCTGAACACAACGAACAGCTAAAGCGTACCCAACTGCAAGCTGAAAATGAATTGAGAGAGAAAACAATGTTTATGAGGAATGATCATGAAGCTCAGATCAAAGCATTGAGGTGTGAACTTGAAGATGAGTGTCGGAAGCTGGAAGAGGAGTTGCATCTTCAAAAAATCCAAAGAAGACAGGCAAAGGGCTTTGTTGCAGTTGCAGTGGAAAGTGATGAGTGACAAGCCTAAAGAGGACCAAGAAGTGAATTCAAAACAGGTTGACTTGTGTTTGAATCTATTTGTCTGTGTCTGTCTTCAAATGGATGCCATATTTGCTCATTTTCATGTTGGGTTACCTTTGGTAGTTTGGTTTGACATATTACATTTATCATTTGGTAGGCACAGTTGGGGAAATGAGAAGACATTTGTTGTATACCTAAATGTGCTTCTTTAATATTCTTTCAACACAAGCCTGAGAATTGTGAACTTAAATACATAGAAGGGTGATGCAAATAAAGGCCCACTGGTTCACATATGCATAGTCTTCATGCTAAAATTGTCACTTATGAAACAGGCATAATCTTGTTACTGAAGGCATAACTATTTACTAGCATGATATTAGATAAATTTGATTGGTACCACTTCTCATATCATAGTTGTTTCAAAATTTAAGTTGAAAAGATTTTTATTGATGATTTTTGCACATCACAAAGGGAAGGGTGAAGGCAGTGCTCTGAAGGCTTCATGTCATAGCAGCAGAAATAGTGTGTGTGTGTCTTTAATTGATAGACATTGGTTTGGTTGTGATTTGGTATCTGTTACTTTAATCATGCTTCTTTTCAAGCTCCTTACTATCTTAAAGATGAACACTATAGAAAGTAACTACACTTACTATTTAGTGGTTTCATGAGTGTAAGGATATTCCAATTGCAATTTGTTTTTTTATTCTGATATCATGTATGCTTAAAAGTTCTGCTGAAAAGATGGGTTATGAGTGATTAAGATATCTAACCAAATTTTATTTGTGGAAAATGTGATGAGCATATGAATTTGATGATGATCTGGTATCTAAGTGTTAGAATACATTAGACAGGGTTCAGTGAGTGCAAATTGAATCAACCTTTGTAATGAATTTCAATTGAATTTGAAAATTAACATAATGATTTTCATACCTTGAATTCAAATGTCAAATCACTGctttcaaagacggttattacataataaccgtctttgaatgtcgaggagatgtaacaatcaaaggcggtta

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Coding sequences of Glyma.13G224300
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Predicted protein sequences of Glyma.13G224300
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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