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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT3G14980.1 | AT | Acyl-CoA N-acyltransferase with RING/FYVE/PHD-type zinc finger protein | JGI | N/A | IEA |
GO:0005515 | GO-mf | protein binding | JGI | N/A | IEA |
GO:0008080 | GO-mf | N-acetyltransferase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0046872 | GO-mf | metal ion binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
PTHR24098 | Panther | FAMILY NOT NAMED | JGI | N/A | IEA |
PTHR24098:SF48 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00628 | PFAM | PHD-finger | JGI | N/A | IEA |
Glyma.12g228700 not represented in the dataset |
Glyma.12g228700 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.13g271100 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma12g35760 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.12g228700.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g228700 ID=Glyma.12g228700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 GTACAACTGTACATACATATTCCAAAGCCTTTACCACAAGATTTTATTCTATTAATTGGGGTCGGCAGTGATGAAGTTTGTCAACCAGTAATGTATGGCTGAAGAAATGCTTTCTTCATAAATTGGTTTACAATATGCCAAAGTAGCTTTTTGTAATGGTGCCAACATGTAGACCACCAATAGAAATTTTATAGTGAAACCACACTTGTCAGCAGGGATGTTGATCAGCAATGAAACAGAGGATTTATGTGATGATAACTTTGAAGGATCTAACGAAGAAAGACAGATTTTTTCAGAGGTATTTTCTGGTAATGGCATTTTTCAGTCTAATCAGAAGTGTCTTGTTCCTGTAGCTATCAGCTTTGAACATGAATCCGCTAAAAACACATTTAAATCATTCTGCTCTAGTAATGAAAACTCAGTTGTATTGCATCCATCATCTTCTAGACTTACACACCCTGAAGAAGAGGACTTTAATGTAATTCAGCATTCCAAAGAGGCTGCTCTGGGGTGTGTGCCAGAGAGTTTCATTTGTGAAGACCAGAATGACGAGGATGTGAATGTCAAACGTATGAAATTTTCTCTGCATGAACTTGCTTGTAGTAGATCTGATTCAGAAAAAAAATTGAGTTCATCACGACTTTCAAAAGTAGTAGTTTCTAACCTGTCTCGTGCTGCTACAAGCTGTGATAGTGAACCAATTGCATTTCATTTAGTTGAATCATCTAAACATGGTGTGATATCTAGCTGCTATCTATTGAACCATAACAAGGTAAATAAACAAGCTGCCAAGGATAAGGTAGATGTTACAAATTTTAACTCAACAACAGCAGATGGAAATATTGCAAAAGAGTTGTGTGTAAGTAAAGCAGCTGCTTCTCCTGTTTCCCAGGAAAGCTTTGCGAACAGGCGTGTAGTTACCAGTCCGTCAACCACTGTTGTGAAGAAGTCTGGGTCTCCTTTAAATCCCGAGGAAATGGTGGAATCTTCTAATGTAGGCATCTCAAATGCATCCTCAATGCTAGAGGAAGAGGACCCTCGTACTATACTGCAGTTTCATATTTTGCAGTTGCTAAAGATGGCAGGATGGTCTATTGAGAAGCGTCAACGGCCTAGTAGGCGTTACCCAGAGTCAGTTTATAGGACACCAGAGGGAAAGACTATTCGGGAGTTTACAAAGGCTTGGAGATTATGTGGTGAGCTATTGTCTGTTGAAAAATGCAATTTTATGTGCAGAGATTATAAGGAATGGACTGATATTAGTCAATTCTGGTCTGATCTATCCAGTACACTGATAAATGTTGAAAAAACAAAGATGCAGTCAGAAGACCCTGCTGCTGTATTGGCTTATCGATGGTGGCTTTTGGATCCTTTTGTAGTAGTTATATTTTTTGATAGAAAGATTGGTGTGCTGAAAAAGGGAGAGGCAGTGAAAGCAACTTGGAGTTTAGTTTCTAGCAAATATATGGTGGCATGTGCTCCCATTGGTTCAAGCTCTGGGAATTTGAATCAGGTACCTGGAGGGTCTAATGTAGGTGCTGTTCATCAAGCCAGAATTAGAAATTCCAAAAGTTTTGATAAACAGAGTTCAGAGAACTATCTGGAAACAAATAAAATTATTGATGGAGATCTGCCAATGGACATGTCAGAAGAAAATAATGCATCCAGTGTGAGCCATGGCCTGGTTCATTCTCATGACTCAAGGGATATGCAACAGTCTGAATGTAGTGAGGAAGAAGGTGGCAAAATCTCAGTAGATTCTGTATTTGGGAAAGATAACAAATATTCTGCTTCTGATGTTATTCTTAAAAAGAAAATGCGGAGGAAGTGCAAAAGGGTATCTGAAATCAAACTGAGTATGTTCTACCATAGTGACATGCTGGGTTCAACTGTTACTGACCAGGTGCAGTTACTAGATGGTGAAGCAAGTGGGTTGGAAGAGGTCCAGGATTATCTAGTTGACAATGCGGGAAAGAAAAGAAACTGCAGAAAGTTATCATCTGTTGGTGCAATTCAGAGAAATATTAGGAAAACAAACTGCCCCACAGCTGGAACAGATAAGTCTAACAGATGCCAGATTAAAGACGATGATTTATTGGTGTCTGCAATATTCAGGAATAAGGACTTCAGCCCAAAGGCAATCCGGGGTAATTCTAGTGCTAAATCCCGCAAATCAAGGGGTCAGAGAAAGCTTAAAAGCCAAAAGGGCCGTTGCAGGTTGCTACCAAGGAATCCCTGTAATGCAGGGAAGCACAATAAGGACTGCAATAGGTTTTATTTGGGTGCTAGGACAATATTGTCCTGGTTGATTGATAATGGGGTCATATCTTTAAATGATGTGATTCAATACCGAAATCCTAAGGATAATGTTGTCATTAAGGATGGTAGGATCACCAAAGATGGTATTATTTGTACATGTTGTGATAAGGTGCTCACATTATCAGAGTTCAAGTTTCATGCTGGGTTTACAGTGAATCGCCCCTGCTTGAATATTTTCATGGAGTCTGGTGAGCCCTTTACACTCTGCCTCCTTCAAGCTTGGTCAGCTGAATACAAAGCCAGGAGAAGCCAAAATCAAGCCGTACatgctgatgataatgataaaaatgatgatTCGTGCGGATTGTGTGGCGAGGGGGGTGAGCTGATATGTTGCGATAACTGTCCATCTACTTTTCACCTAGCTTGTTTGTCCACTCAGGAGATCCCAGATGGCGACTGGTACTGCACTAACTGCACTTGTAGGATATGTGGAAATTTGGTCATTGACAAAGACACTTCAGATGCGCATGATTCATTACAATGTTCACAGTGTGAACATAAATATCATGAGAAATGCCTTGAAGATAGAGATAAACAAGAAGTAGCAATTTCAGACACTTGGTTTTGTGGTCAGAGTTGTCAGGAGGTGTACTCTGGACTCCAGACTCAGGTGGGGTTAGTTAATCAAGTTGCTGATGGCATCTCATGGACCCTTCTTAGATGCATCCACGATGATCAAAAAGTTCATTCTGCACAGTGGTTTGCCCTAAAGGCAGTATGCAATACAAAATTAGCCGTTGCTCTTACTATAATGGAGGAGTGTTTTGTGTCAATGTTTGATCCTAGAACAGGCATCCACATGATACCCCAAGTTTTATACAACTGGGGGTCTGAGTTTGCTCGTTTAAACTTTCAAGGGTTTTACACCATTGTATTGGAGAAAAAGGATGTATTAATATCTGTAGCATCTATCAGGGTGCATGGAACTACAGTAGCAGAGATGCCTCTAATTGCTACTTGCAGTCAGTATCGTCGCCAGGGAATGTGCCGACTCCTTGTGAGTGCTATTGAACAGATGTTAATATCTTTCAAGGTGGAAAAGCTTGTGGTATCAGCCATTCCAGATTTGGTCGAGACATGGACAAAGGGCTTTGGATTTATAACTGTTGATGACATTGAAAGGCAAAGATTGAATAAAATTAACTTGATGGTTTTTCCTGGGACAGTGTTACTTGTGAAATCCTTACATGGGAAGGAGAAAATTGAAGGACTGTGTGATCTATCAATTCTAGCAACAGATGAATCAATCAAAGCAGGTATCTGTTCTGAAGGAATGGCCATTTCTGAATCATTTGCACAAGTTGTTGGAAACATAACTACCAACAAAGGTGGAGCAAAGTCAGAACATGAACCTGTGGATGGAAAAAATCAATCAGACTATGAAGCTGGCAGTGAAACAGGCAGAGATGATAAAATACAAGCTGTTGACACTGCAATAGAAGCCAAAGAATCAACAGAAATAAGTAGTTCTTCTAGAGAAGAGAAGGTCACCCAGTTGAAAGTGTCAGGTGACTCAGAGAAATCTATTGAAGAAAACAATGTGAATGAATTGAGAACAAGCAACAAAGCAGAAATGACAAGTGATTCAGTACAGCAATCTAGTGAGAATTGTTGTGCTGACAAAGATGGTGCTGAACCAGCTATTAGTATTGTTGAGGACAAGAATATCAAAATAGGTGAGTGTCAGGAAAATGCTTTGCAGGGTCATTTTTCAAATTTGTCCTGCAAAACATTTTTAGGCAGCAATTTTGACACGGATTCCAATATTGAATGCTCAGTGATGTATGATGAAACAGCTTTTTTTGGGACTTTTGCAAAGTCTGCAAGCTGAATCAGAAGTTGAAAGAAAGTAGATGTTTAGAGAGATGGTGTGATGATGCTCATAACAAACTTGTAGGGTATCTTAGGGAAACTAACTGCAAAATATGGAAAAATAACCGGTTAGGTAAGGTAAAATTGTGACACTATGTAACTAGGGACCAGTGCGGCATATAGGATGAAGGCAAACAAAAATGTTTATGGCCTTGCTTTGGTGGTAAGGAAGATAAGAGGTCAAAGGAGGTTGTGCTACAAATTAGGCATCGTTGGGATGTTCAAATCACTTTATTTATGCACCTACTTTTAAGAAAAATATTTTAAAAAATAAATTCTAGTCTTTTGAGGTTTCAACTATGACAAATTGATTGCACGATGATGTAAAACAACTTATTACGAGATGATGAAAATTA >Glyma.12g228700.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g228700 ID=Glyma.12g228700.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 GTCCGTCCCATGACATAGATACAACACTCACATGTAGATGCTCCTAGAGAGAGAAAGTTTTTTAGAGAGAGAAAGTTTTATGTTCCTTTGTGTTTGCCATCTGTTGCAGTGTGGTAGCATTGTTGGGTTTCCAATTCTATCTCTGGTGGGGTTGAAGGTGAGAAATGAAGCGAGGGAAGATTGCAATTCGTGCTCTCAGCTCAGAAAATGTTGAATTGCTTTTGGGATTTTGAGGAACCCTGATTCTGGGGATTCCAAAGCCTTTACCACAAGATTTTATTCTATTAATTGGGGTCGGCAGTGATGAAGTTTGTCAACCAGTAATGTATGGCTGAAGAAATGCTTTCTTCATAAATTGGTTTACAATATGCCAAAGTAGCTTTTTGTAATGGTGCCAACATGTAGACCACCAATAGAAATTTTATAGTGAAACCACACTTGTCAGCAGGGATGTTGATCAGCAATGAAACAGAGGATTTATGTGATGATAACTTTGAAGGATCTAACGAAGAAAGACAGATTTTTTCAGAGGTATTTTCTGACTTACACACCCTGAAGAAGAGGACTTTAATGTAATTCAGCATTCCAAAGAGGCTGCTCTGGGGTGTGTGCCAGAGAGTTTCATTTGTGAAGACCAGAATGACGAGGATGTGAATGTCAAACGTATGAAATTTTCTCTGCATGAACTTGCTTGTAGTAGATCTGATTCAGAAAAAAAATTGAGTTCATCACGACTTTCAAAAGTAGTAGTTTCTAACCTGTCTCGTGCTGCTACAAGCTGTGATAGTGAACCAATTGCATTTCATTTAGTTGAATCATCTAAACATGGTGTGATATCTAGCTGCTATCTATTGAACCATAACAAGGTAAATAAACAAGCTGCCAAGGATAAGGTAGATGTTACAAATTTTAACTCAACAACAGCAGATGGAAATATTGCAAAAGAGTTGTGTGTAAGTAAAGCAGCTGCTTCTCCTGTTTCCCAGGAAAGCTTTGCGAACAGGCGTGTAGTTACCAGTCCGTCAACCACTGTTGTGAAGAAGTCTGGGTCTCCTTTAAATCCCGAGGAAATGGTGGAATCTTCTAATGTAGGCATCTCAAATGCATCCTCAATGCTAGAGGAAGAGGACCCTCGTACTATACTGCAGTTTCATATTTTGCAGTTGCTAAAGATGGCAGGATGGTCTATTGAGAAGCGTCAACGGCCTAGTAGGCGTTACCCAGAGTCAGTTTATAGGACACCAGAGGGAAAGACTATTCGGGAGTTTACAAAGGCTTGGAGATTATGTGGTGAGCTATTGTCTGTTGAAAAATGCAATTTTATGTGCAGAGATTATAAGGAATGGACTGATATTAGTCAATTCTGGTCTGATCTATCCAGTACACTGATAAATGTTGAAAAAACAAAGATGCAGTCAGAAGACCCTGCTGCTGTATTGGCTTATCGATGGTGGCTTTTGGATCCTTTTGTAGTAGTTATATTTTTTGATAGAAAGATTGGTGTGCTGAAAAAGGGAGAGGCAGTGAAAGCAACTTGGAGTTTAGTTTCTAGCAAATATATGGTGGCATGTGCTCCCATTGGTTCAAGCTCTGGGAATTTGAATCAGGTACCTGGAGGGTCTAATGTAGGTGCTGTTCATCAAGCCAGAATTAGAAATTCCAAAAGTTTTGATAAACAGAGTTCAGAGAACTATCTGGAAACAAATAAAATTATTGATGGAGATCTGCCAATGGACATGTCAGAAGAAAATAATGCATCCAGTGTGAGCCATGGCCTGGTTCATTCTCATGACTCAAGGGATATGCAACAGTCTGAATGTAGTGAGGAAGAAGGTGGCAAAATCTCAGTAGATTCTGTATTTGGGAAAGATAACAAATATTCTGCTTCTGATGTTATTCTTAAAAAGAAAATGCGGAGGAAGTGCAAAAGGGTATCTGAAATCAAACTGAGTATGTTCTACCATAGTGACATGCTGGGTTCAACTGTTACTGACCAGGTGCAGTTACTAGATGGTGAAGCAAGTGGGTTGGAAGAGGTCCAGGATTATCTAGTTGACAATGCGGGAAAGAAAAGAAACTGCAGAAAGTTATCATCTGTTGGTGCAATTCAGAGAAATATTAGGAAAACAAACTGCCCCACAGCTGGAACAGATAAGTCTAACAGATGCCAGATTAAAGACGATGATTTATTGGTGTCTGCAATATTCAGGAATAAGGACTTCAGCCCAAAGGCAATCCGGGGTAATTCTAGTGCTAAATCCCGCAAATCAAGGGGTCAGAGAAAGCTTAAAAGCCAAAAGGGCCGTTGCAGGTTGCTACCAAGGAATCCCTGTAATGCAGGGAAGCACAATAAGGACTGCAATAGGTTTTATTTGGGTGCTAGGACAATATTGTCCTGGTTGATTGATAATGGGGTCATATCTTTAAATGATGTGATTCAATACCGAAATCCTAAGGATAATGTTGTCATTAAGGATGGTAGGATCACCAAAGATGGTATTATTTGTACATGTTGTGATAAGGTGCTCACATTATCAGAGTTCAAGTTTCATGCTGGGTTTACAGTGAATCGCCCCTGCTTGAATATTTTCATGGAGTCTGGTGAGCCCTTTACACTCTGCCTCCTTCAAGCTTGGTCAGCTGAATACAAAGCCAGGAGAAGCCAAAATCAAGCCGTACatgctgatgataatgataaaaatgatgatTCGTGCGGATTGTGTGGCGAGGGGGGTGAGCTGATATGTTGCGATAACTGTCCATCTACTTTTCACCTAGCTTGTTTGTCCACTCAGGAGATCCCAGATGGCGACTGGTACTGCACTAACTGCACTTGTAGGATATGTGGAAATTTGGTCATTGACAAAGACACTTCAGATGCGCATGATTCATTACAATGTTCACAGTGTGAACATAAATATCATGAGAAATGCCTTGAAGATAGAGATAAACAAGAAGTAGCAATTTCAGACACTTGGTTTTGTGGTCAGAGTTGTCAGGAGGTGTACTCTGGACTCCAGACTCAGGTGGGGTTAGTTAATCAAGTTGCTGATGGCATCTCATGGACCCTTCTTAGATGCATCCACGATGATCAAAAAGTTCATTCTGCACAGTGGTTTGCCCTAAAGGCAGTATGCAATACAAAATTAGCCGTTGCTCTTACTATAATGGAGGAGTGTTTTGTGTCAATGTTTGATCCTAGAACAGGCATCCACATGATACCCCAAGTTTTATACAACTGGGGGTCTGAGTTTGCTCGTTTAAACTTTCAAGGGTTTTACACCATTGTATTGGAGAAAAAGGATGTATTAATATCTGTAGCATCTATCAGGGTGCATGGAACTACAGTAGCAGAGATGCCTCTAATTGCTACTTGCAGTCAGTATCGTCGCCAGGGAATGTGCCGACTCCTTGTGAGTGCTATTGAACAGATGTTAATATCTTTCAAGGTGGAAAAGCTTGTGGTATCAGCCATTCCAGATTTGGTCGAGACATGGACAAAGGGCTTTGGATTTATAACTGTTGATGACATTGAAAGGCAAAGATTGAATAAAATTAACTTGATGGTTTTTCCTGGGACAGTGTTACTTGTGAAATCCTTACATGGGAAGGAGAAAATTGAAGGACTGTGTGATCTATCAATTCTAGCAACAGATGAATCAATCAAAGCAGGTATCTGTTCTGAAGGAATGGCCATTTCTGAATCATTTGCACAAGTTGTTGGAAACATAACTACCAACAAAGGTGGAGCAAAGTCAGAACATGAACCTGTGGATGGAAAAAATCAATCAGACTATGAAGCTGGCAGTGAAACAGGCAGAGATGATAAAATACAAGCTGTTGACACTGCAATAGAAGCCAAAGAATCAACAGAAATAAGTAGTTCTTCTAGAGAAGAGAAGGTCACCCAGTTGAAAGTGTCAGGTGACTCAGAGAAATCTATTGAAGAAAACAATGTGAATGAATTGAGAACAAGCAACAAAGCAGAAATGACAAGTGATTCAGTACAGCAATCTAGTGAGAATTGTTGTGCTGACAAAGATGGTGCTGAACCAGCTATTAGTATTGTTGAGGACAAGAATATCAAAATAGGTGAGTGTCAGGAAAATGCTTTGCAGGGTCATTTTTCAAATTTGTCCTGCAAAACATTTTTAGGCAGCAATTTTGACACGGATTCCAATATTGAATGCTCAGTGATGTATGATGAAACAGCTTTTTTTGGGACTTTTGCAAAGTCTGCAAGCTGAATCAGAAGTTGAAAGAAAGTAGATGTTTAGAGAGATGGTGTGATGATGCTCATAACAAACTTGTAGGGTATCTTAGGGAAACTAACTGCAAAATATGGAAAAATAACCGGTTAGGTAAGGTAAAATTGTGACACTATGTAACTAGGGACCAGTGCGGCATATAGGATGAAGGCAAACAAAAATGTTTATGGCCTTGCTTTGGTGGTAAGGAAGATAAGAGGTCAAAGGAGGTTGTGCTACAAATTAGGCATCGTTGGGATGTTCAAATCACTTTATTTATGCACCTACTTTTAAGAAAAATATTTTAAAAAATAAATTCTAGTCTTTTGAGGTTTCAACTATGACAAATTGATTGCACGATGATGTAAAACAACTTATTACGAGATGATGAAAATTA >Glyma.12g228700.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g228700 ID=Glyma.12g228700.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g228700.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g228700.5 locus=Glyma.12g228700 ID=Glyma.12g228700.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||