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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research



Report for Sequence Feature Glyma.12g072700

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm12
Start:5350043
stop:5363213
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT2G28520.1AT VHA-A1 JGI N/AIEA
GO:0033179GO-cc proton-transporting V-type ATPase, V0 domain JGI N/AIEA
GO:0015078GO-mf proton transmembrane transporter activity JGI N/AIEA
K02154KEGG Exosome JGI N/AIEA
PTHR11629PantherFam VACUOLAR PROTON ATPASES JGI N/AIEA
PTHR11629:SF72PantherFam V-TYPE PROTON ATPASE SUBUNIT A1 JGI N/AIEA
PF01496Pfam V-type ATPase 116kDa subunit family JGI N/AIEA

Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma12g07740 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


>Glyma.12g072700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g072700.1.p locus=Glyma.12g072700 id=Glyma.12g072700.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGATCGGTTCTTTGGAAACTTGCCGCCAATGGATCTGATGCGCTCCGAGACGATGACCTTCGTCCAGCTCATCATCCCCGCCGAGTCCGCGCACCGCGCCATCAACTATTTAGGCGAACTCGGCCTCCTTCAATTCCGCGACTTAAATGCTGAAAAAAGCCCCTTCCAGAGAATATTTGTTAACCAGGTAAAGCGATGTGCAGAAATGTCAAGAAAGCTACGATTCTTCGAGGATCAAATCAATAAAGCTGGTCTAATGTCTTCTCCTTCAGTCTTGCAAACAGATATTTATCTGGAGGATTTAGAGATACAACTTGCTGAGCATGAACATGAGCTAATTGAAATGAACTCTAACAGTGAGAAACTTCGGCAATCATATAATGAACTCCTGGAGTTCAAGATTGTATTACAAAAGGCATGTCGTTTTCTTGTTTCAAGTCATGGCAATGCTTTTTCAGAAGAGAGAGAACTGGAGGAGAATGTTTTCTCAAATGGAGACTATATTGAGACACCATTTTTGTTTGAGCAGGAAATGAGGCATGCACCATCAGATCAATCTGGTTTAAGATTTATCAGTGGGATAATTTGTAAATCCAAAGTTCTTAGGTTTGAAAGGATGTTGTTTCGTGCCACAAGAGGCAATATGCTTTTCAATCATGCACTAGCCGATGAACAAATCATGGATCCTATTTCAACTGAGATGGTTGAGAAAATTGTGTTTGTTGTGTTTTTCTCTGGGGAGCAAGCAAGAACCAAGATTCTGAAAATTTGTGATGCATTTGGTGCAAATTGTTACCCTGTTCCTGAAGATATAAGTAAACAGAGGCAAATAACTTCGGAGGTTTCATCCCGTCTTGCTGACTTAGAGGCAACTCTGGATGCTGGGATTAGGCATCGGAATAAGGCTCTAGCTTCTGTAGGAGGCCATTTAACAAAATGGATGGACATGGTAAGAAGAGAGAAGGCTGTGTATGATACACTGAACATGCTAAATTTTGATGTCACCAAAAAATGTCTTGTTGGAGAGGGCTGGTGCCCTATATTTGCAAAAACACAGATTCAGGAGGCACTGCAGCGTGCAACTTTTGACAGTAGTTCTCAAGTTGGCATAATCTTTCATTCAATGGATGCACTGGAATCACCACCTACATATTTTAGGACCAATAGTTTCACAAGTCCATATCAGGAAATTGTTGATGCATATGGTGTTGCAAGATATCAAGAAGCAAATCCTGCAGTTTATACCACTATTATATTCCCATTTCTTTTCGCGGTTATGTTTGGTGACTGGGGTCATGGAATTTGCCTGTTGCTGGGAGCGTTGGTTCTTATAGCACGTCAAAGCAAGCTCAGCACTCAGCGACTTGGAAGCTTTATGGAGATGCTATTTGGTGGGCGTTATGTGCTACTTTTGATGTCACTATTTTCAATCTATTGTGGGTTAATCTACAATGAATTCTTCTCAGTTCCTTATCACATATTTGGTCCATCTGCTTATAAATGCCGAGATAACTCATGCAGGGATGCACATACTATTGGCTTAGTAAAATACCGAGAACCATATCCATTTGGTGTGGATCCCAGTTGGCGGGGAAGTCGTTCAGAGTTGCCTTTTCTAAACTCTCTCAAGATGAAGATGTCCATTCTGCTGGGTGTGGTGCACATGAACTTGGGAATTCTTTTAAGTTATTTCAATGCTCGTTTCTTTGGCAATTCGCTGGATATAAGGTACCAGTTTGTGCCCCAGATGATTTTCCTTAACTGTCTATTTGGGTATCTTTCCCTTCTCATCGTTGTCAAGTGGTGTACTGGCTCTCAGGCAGACCTTTATCATGTAATGATTTACATGTTTTTAAGCCCTTTTGACAATCTTGGTGAGAATCAATTATTCTGGGGCCAAAGACCACTTCAAGTTGTGTTATTGCTTTTGGCTGTAATTGCAGTTCCATGGATGCTCTTTCCAAAACCTTTTATACTAAAGAAGCTTCATAATGAGAGATTTCAAGGACGCACTTATGGTGTGCTTAATAACTCTGAGGTTGATCTTGAGTTGGAACCAGATTCTGCCAGGCAACATCATGAGGAATTCAATTTCAGTGAGGTTTTTGTTCACCAAATGATTCACTCCATTGAGTTTGTTCTAGGTTCAGTTTCAAATACAGCCTCATATCTACGACTTTGGGCATTAAGCTTGGCTCACTCAGAACTTTCCACCGTTTTTTATGAGAAAGTCCTGTTACTTGCTTGGGGGTATGACAATCTTGTCATTCGGTTAGTGGGGCTAGCTGTTTTTGCCTTTGCAACTGCCTTTATACTACTAATGATGGAGACTCTCAGCGCTTTTCTTCACGCCTTGCGTCTTCACTGGGTAGAATTTCAGAATAAATTCTACAGCGGTGATGGCTACAAGTTCAAACCTTTTTCCTTTGCCTCCTTAACAGAGGATGAAAATTGA

>Glyma.12g072700.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g072700.2.p locus=Glyma.12g072700 id=Glyma.12g072700.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGTCAAGAAAGCTACGATTCTTCGAGGATCAAATCAATAAAGCTGGTCTAATGTCTTCTCCTTCAGTCTTGCAAACAGATATTTATCTGGAGGATTTAGAGATACAACTTGCTGAGCATGAACATGAGCTAATTGAAATGAACTCTAACAGTGAGAAACTTCGGCAATCATATAATGAACTCCTGGAGTTCAAGATTGTATTACAAAAGGCATGTCGTTTTCTTGTTTCAAGTCATGGCAATGCTTTTTCAGAAGAGAGAGAACTGGAGGAGAATGTTTTCTCAAATGGAGACTATATTGAGACACCATTTTTGTTTGAGCAGGAAATGAGGCATGCACCATCAGATCAATCTGGTTTAAGATTTATCAGTGGGATAATTTGTAAATCCAAAGTTCTTAGGTTTGAAAGGATGTTGTTTCGTGCCACAAGAGGCAATATGCTTTTCAATCATGCACTAGCCGATGAACAAATCATGGATCCTATTTCAACTGAGATGGTTGAGAAAATTGTGTTTGTTGTGTTTTTCTCTGGGGAGCAAGCAAGAACCAAGATTCTGAAAATTTGTGATGCATTTGGTGCAAATTGTTACCCTGTTCCTGAAGATATAAGTAAACAGAGGCAAATAACTTCGGAGGTTTCATCCCGTCTTGCTGACTTAGAGGCAACTCTGGATGCTGGGATTAGGCATCGGAATAAGGCTCTAGCTTCTGTAGGAGGCCATTTAACAAAATGGATGGACATGGTAAGAAGAGAGAAGGCTGTGTATGATACACTGAACATGCTAAATTTTGATGTCACCAAAAAATGTCTTGTTGGAGAGGGCTGGTGCCCTATATTTGCAAAAACACAGATTCAGGAGGCACTGCAGCGTGCAACTTTTGACAGTAGTTCTCAAGTTGGCATAATCTTTCATTCAATGGATGCACTGGAATCACCACCTACATATTTTAGGACCAATAGTTTCACAAGTCCATATCAGGAAATTGTTGATGCATATGGTGTTGCAAGATATCAAGAAGCAAATCCTGCAGTTTATACCACTATTATATTCCCATTTCTTTTCGCGGTTATGTTTGGTGACTGGGGTCATGGAATTTGCCTGTTGCTGGGAGCGTTGGTTCTTATAGCACGTCAAAGCAAGCTCAGCACTCAGCGACTTGGAAGCTTTATGGAGATGCTATTTGGTGGGCGTTATGTGCTACTTTTGATGTCACTATTTTCAATCTATTGTGGGTTAATCTACAATGAATTCTTCTCAGTTCCTTATCACATATTTGGTCCATCTGCTTATAAATGCCGAGATAACTCATGCAGGGATGCACATACTATTGGCTTAGTAAAATACCGAGAACCATATCCATTTGGTGTGGATCCCAGTTGGCGGGGAAGTCGTTCAGAGTTGCCTTTTCTAAACTCTCTCAAGATGAAGATGTCCATTCTGCTGGGTGTGGTGCACATGAACTTGGGAATTCTTTTAAGTTATTTCAATGCTCGTTTCTTTGGCAATTCGCTGGATATAAGGTACCAGTTTGTGCCCCAGATGATTTTCCTTAACTGTCTATTTGGGTATCTTTCCCTTCTCATCGTTGTCAAGTGGTGTACTGGCTCTCAGGCAGACCTTTATCATGTAATGATTTACATGTTTTTAAGCCCTTTTGACAATCTTGGTGAGAATCAATTATTCTGGGGCCAAAGACCACTTCAAGTTGTGTTATTGCTTTTGGCTGTAATTGCAGTTCCATGGATGCTCTTTCCAAAACCTTTTATACTAAAGAAGCTTCATAATGAGAGATTTCAAGGACGCACTTATGGTGTGCTTAATAACTCTGAGGTTGATCTTGAGTTGGAACCAGATTCTGCCAGGCAACATCATGAGGAATTCAATTTCAGTGAGGTTTTTGTTCACCAAATGATTCACTCCATTGAGTTTGTTCTAGGTTCAGTTTCAAATACAGCCTCATATCTACGACTTTGGGCATTAAGCTTGGCTCACTCAGAACTTTCCACCGTTTTTTATGAGAAAGTCCTGTTACTTGCTTGGGGGTATGACAATCTTGTCATTCGGTTAGTGGGGCTAGCTGTTTTTGCCTTTGCAACTGCCTTTATACTACTAATGATGGAGACTCTCAGCGCTTTTCTTCACGCCTTGCGTCTTCACTGGGTAGAATTTCAGAATAAATTCTACAGCGGTGATGGCTACAAGTTCAAACCTTTTTCCTTTGCCTCCTTAACAGAGGATGAAAATTGA

>Glyma.12g072700.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g072700.4.p locus=Glyma.12g072700 id=Glyma.12g072700.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGATCGGTTCTTTGGAAACTTGCCGCCAATGGATCTGATGCGCTCCGAGACGATGACCTTCGTCCAGCTCATCATCCCCGCCGAGTCCGCGCACCGCGCCATCAACTATTTAGGCGAACTCGGCCTCCTTCAATTCCGCGACTTAAATGCTGAAAAAAGCCCCTTCCAGAGAATATTTGTTAACCAGGTAAAGCGATGTGCAGAAATGTCAAGAAAGCTACGATTCTTCGAGGATCAAATCAATAAAGCTGGTCTAATGTCTTCTCCTTCAGTCTTGCAAACAGATATTTATCTGGAGGATTTAGAGATACAACTTGCTGAGCATGAACATGAGCTAATTGAAATGAACTCTAACAGTGAGAAACTTCGGCAATCATATAATGAACTCCTGGAGTTCAAGATTGTATTACAAAAGGCATGTCGTTTTCTTGTTTCAAGTCATGGCAATGCTTTTTCAGAAGAGAGAGAACTGGAGGAGAATGTTTTCTCAAATGGAGACTATATTGAGACACCATTTTTGTTTGAGCAGGAAATGAGGCATGCACCATCAGATCAATCTGGTTTAAGATTTATCAGTGGGATAATTTGTAAATCCAAAGTTCTTAGGTTTGAAAGGATGTTGTTTCGTGCCACAAGAGGCAATATGCTTTTCAATCATGCACTAGCCGATGAACAAATCATGGATCCTATTTCAACTGAGATGGTTGAGAAAATTGTGTTTGTTGTGTTTTTCTCTGGGGAGCAAGCAAGAACCAAGATTCTGAAAATTTGTGATGCATTTGGTGCAAATTGTTACCCTGTTCCTGAAGATATAAGTAAACAGAGGCAAATAACTTCGGAGGTTTCATCCCGTCTTGCTGACTTAGAGGCAACTCTGGATGCTGGGATTAGGCATCGGAATAAGGCTCTAGCTTCTGTAGGAGGCCATTTAACAAAATGGATGGACATGGTAAGAAGAGAGAAGGCTGTGTATGATACACTGAACATGCTAAATTTTGATGTCACCAAAAAATGTCTTGTTGGAGAGGGCTGGTGCCCTATATTTGCAAAAACACAGATTCAGGAGGCACTGCAGCGTGCAACTTTTGACAGTAGTTCTCAAGTTGGCATAATCTTTCATTCAATGGATGCACTGGAATCACCACCTACATATTTTAGGACCAATAGTTTCACAAGTCCATATCAGGAAATTGTTGATGCATATGGTGTTGCAAGATATCAAGAAGCAAATCCTGCAGTTTATACCACTATTATATTCCCATTTCTTTTCGCGGTTATGTTTGGTGACTGGGGTCATGGAATTTGCCTGTTGCTGGGAGCGTTGGTTCTTATAGCACGTCAAAGCAAGCTCAGCACTCAGCGACTTGGAAGCTTTATGGAGATGCTATTTGGTGGGCGTTATGTGCTACTTTTGATGTCACTATTTTCAATCTATTGTGGGTTAATCTACAATGAATTCTTCTCAGTTCCTTATCACATATTTGGTCCATCTGCTTATAAATGCCGAGATAACTCATGCAGGGATGCACATACTATTGGCTTAGTAAAATACCGAGAACCATATCCATTTGGTGTGGATCCCAGTTGGCGGGGAAGTCGTTCAGAGTTGCCTTTTCTAAACTCTCTCAAGATGAAGATGTCCATTCTGCTGGGTGTGGTGCACATGAACTTGGGAATTCTTTTAAGTTATTTCAATGCTCGTTTCTTTGGCAATTCGCTGGATATAAGGTACCAGTTTGTGCCCCAGATGATTTTCCTTAACTGTCTATTTGGGTATCTTTCCCTTCTCATCGTTGTCAAGTGGTGTACTGGCTCTCAGGCAGACCTTTATCATGTAATGATTTACATGTTTTTAAGCCCTTTTGACAATCTTGGTGAGAATCAATTATTCTGGGGCCAAAGACCACTTCAAGTTGTGTTATTGCTTTTGGCTGTAATTGCAGTTCCATGGATGCTCTTTCCAAAACCTTTTATACTAAAGAAGCTTCATAATGAGAGATTTCAAGGACGCACTTATGGTGTGCTTAATAACTCTGAGGTTGATCTTGAGTTGGAACCAGATTCTGCCAGGCAACATCATGAGGAATTCAATTTCAGTGAGGTTTTTGTTCACCAAATGATTCACTCCATTGAGTTTGTTCTAGGTTCAGTTTCAAATACAGCCTCATATCTACGACTTTGGGCATTAAGCTTGGCTCACTCAGAACTTTCCACCGTTTTTTATGAGAAAGTCCTGTTACTTGCTTGGGGGTGA

>Glyma.12g072700.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g072700.1 locus=Glyma.12g072700 id=Glyma.12g072700.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g072700.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g072700.2 locus=Glyma.12g072700 id=Glyma.12g072700.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MSRKLRFFEDQINKAGLMSSPSVLQTDIYLEDLEIQLAEHEHELIEMNSNSEKLRQSYNELLEFKIVLQKACRFLVSSHGNAFSEERELEENVFSNGDYIETPFLFEQEMRHAPSDQSGLRFISGIICKSKVLRFERMLFRATRGNMLFNHALADEQIMDPISTEMVEKIVFVVFFSGEQARTKILKICDAFGANCYPVPEDISKQRQITSEVSSRLADLEATLDAGIRHRNKALASVGGHLTKWMDMVRREKAVYDTLNMLNFDVTKKCLVGEGWCPIFAKTQIQEALQRATFDSSSQVGIIFHSMDALESPPTYFRTNSFTSPYQEIVDAYGVARYQEANPAVYTTIIFPFLFAVMFGDWGHGICLLLGALVLIARQSKLSTQRLGSFMEMLFGGRYVLLLMSLFSIYCGLIYNEFFSVPYHIFGPSAYKCRDNSCRDAHTIGLVKYREPYPFGVDPSWRGSRSELPFLNSLKMKMSILLGVVHMNLGILLSYFNARFFGNSLDIRYQFVPQMIFLNCLFGYLSLLIVVKWCTGSQADLYHVMIYMFLSPFDNLGENQLFWGQRPLQVVLLLLAVIAVPWMLFPKPFILKKLHNERFQGRTYGVLNNSEVDLELEPDSARQHHEEFNFSEVFVHQMIHSIEFVLGSVSNTASYLRLWALSLAHSELSTVFYEKVLLLAWGYDNLVIRLVGLAVFAFATAFILLMMETLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGDGYKFKPFSFASLTEDEN*

>Glyma.12g072700.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g072700.4 locus=Glyma.12g072700 id=Glyma.12g072700.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MDRFFGNLPPMDLMRSETMTFVQLIIPAESAHRAINYLGELGLLQFRDLNAEKSPFQRIFVNQVKRCAEMSRKLRFFEDQINKAGLMSSPSVLQTDIYLEDLEIQLAEHEHELIEMNSNSEKLRQSYNELLEFKIVLQKACRFLVSSHGNAFSEERELEENVFSNGDYIETPFLFEQEMRHAPSDQSGLRFISGIICKSKVLRFERMLFRATRGNMLFNHALADEQIMDPISTEMVEKIVFVVFFSGEQARTKILKICDAFGANCYPVPEDISKQRQITSEVSSRLADLEATLDAGIRHRNKALASVGGHLTKWMDMVRREKAVYDTLNMLNFDVTKKCLVGEGWCPIFAKTQIQEALQRATFDSSSQVGIIFHSMDALESPPTYFRTNSFTSPYQEIVDAYGVARYQEANPAVYTTIIFPFLFAVMFGDWGHGICLLLGALVLIARQSKLSTQRLGSFMEMLFGGRYVLLLMSLFSIYCGLIYNEFFSVPYHIFGPSAYKCRDNSCRDAHTIGLVKYREPYPFGVDPSWRGSRSELPFLNSLKMKMSILLGVVHMNLGILLSYFNARFFGNSLDIRYQFVPQMIFLNCLFGYLSLLIVVKWCTGSQADLYHVMIYMFLSPFDNLGENQLFWGQRPLQVVLLLLAVIAVPWMLFPKPFILKKLHNERFQGRTYGVLNNSEVDLELEPDSARQHHEEFNFSEVFVHQMIHSIEFVLGSVSNTASYLRLWALSLAHSELSTVFYEKVLLLAWG*







Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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