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Report for Sequence Feature Glyma.12g055900

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm12
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Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G12950.1AT JGI N/AIEA
K09955KEGG Function unknown JGI N/AIEA
PTHR31151PantherFam PROLINE-TRNA LIGASE (DUF1680) JGI N/AIEA
PTHR31151:SF0PantherFam PROLINE-TRNA LIGASE (DUF1680) JGI N/AIEA
PF07944Pfam Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 JGI N/AIEA

Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma12g05980 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


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>Glyma.12g055900.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g055900.7.p locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.7.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGAGGCGTTAGTGTTTGCGCTTGTGGCCATTCTGTTGTGTGGTTGTGATGCTGCTAAAGAATGCACAAACATTCCTACACAATCTCATACATTCAGGTATGAGCTATTGATGTCCACTAATGCAACGTGGAAAGCAGAGGTGATGGATCACTACCATTTGACGCCAACGGATGAAACGGCTTGGGCGGATTTGCTGCCGAGGAAGTTATTGTCAGAACAGAACCAACATGACTGGGGGGTGATGTATAGGAAGATTAAGAACATGGGTGTGTTCAAGTCAGGTGAAGGATTTCTCAAAGAAGTGCCTCTTCAGGATGTGAGGTTGCATAAGGATTCCATCCATGGTAGAGCACAGCAAACAAATTTGGAGTATCTGTTGATGTTGGATGTGGACAGCTTGATTTGGAGCTTCAGGAAGACAGCTGCTCTATCCACACCTGGGACTCCTTATGGAGGGTGGGAAGGTCCAGAAGTTGAGCTCAGAGGTCATTTTGTTGGGCATTACTTGAGCGCATCAGCTCTAATGTGGGCCAGCACACAGAATGATACCCTGAAGCAGAAAATGTCATCTCTTGTTGCTGGTCTGTCTGCCTGTCAGGAGAAAATTGGAACCGGATATCTATCTGCATTTCCATCTGAGTTTTTTGATCGATTTGAAGCTGTTCAACCTGTTTGGGCTCCCTATTATACCATTCACAAGATCTTGGCTGGCCTCTTGGATCAACATACTTTTGCTGGAAACCCTCAAGCTCTAAAAATGGTAACATGGATGGTTGATTACTTCTACAACAGAGTGCAGAATGTAATAACAAAGTACACTGTAAATAGACACTATCAATCAATGAATGAAGAAACTGGAGGAATGAATGATGTCCTTTATAGATTATACAGCATAACGGGAGATTCTAAGCACCTAGTGTTGGCTCACCTTTTTGACAAGCCATGCTTTTTAGGGTTGCTTGCAGTGCAGGCTAATGACATAGCTGATTTACATGCTAATACACATATCCCAATTGTTGTTGGATCTCAAATGCGGTATGAAATCACAGGCGATCCACTTTATAAGCAAATTGGGACATTCTTTATGGACCTCGTAAACTCTTCTCACAGCTACGCAACTGGAGGGACATCAGTCAGAGAGTTCTGGAGTGATCCAAAGAGAATAGCAGACAACTTAAGAACGACAGAGAATGAAGAATCATGCACAACTTATAATATGTTGAAGGTTTCGCGTCACCTGTTTAGATGGACCAAAGAAGTCTCTTATGCAGACTATTATGAGCGTGCCTTAACCAATGGTGTGCTCAGCATTCAAAGAGGAACAGATCCTGGAGTGATGATTTATATGCTTCCACTAGGTTTTGCGGTTTCAAAGGCTAGAACTGGACATAGTTGGGGAACACAGTTTGACTCTTTCTGGTGCTGCTATGGAACAGGAATTGAATCATTCTCAAAGCTGGGGGATTCTATCTATTTTGAAGAGGAAGGCAAAGATCCTACACTTTACATCATTCAGTACATTTCAAGCTCATTTAATTGGAAATCAGGCAAAATTTTGCTCAATCAGACAGTTGTTCCAGCTTCTTCATCGGATCCTTACCTACGAGTCACATTTACATTTTCTCCTGTTGAGAATACTTTGTCTACATTGAACTTTCGACTACCAAGTTGGACTCTTCTGGATGGTGCCAAGGGGATATTAAATGGTCAAACTTTATCTCTGCCAAATCCAGGAAATTATTTGTCAATCACAAGACAATGGAGTGCTAGTGACAAGCTGACCCTTCAGCTGCCCCTTACCGTAAGGACAGAGGCCATAAAAGATGACAGGCCTGAATATGCATCTGTTCAAGCAATTCTTTATGGTCCTTACCTTCTTGCTGGTCATACAACCGGTGGTGATTGGAACCTTAAAGCTGGGGCTAACAATGCAGACTGGATTACTCCTATTCCTGCCAGTTACAATAGTCAGCTAGTTTCTTTTTTCCGAGACTTTGAAGGATCAACTTTTGTCTTGGCAAATTCAAACCAATCAGTTTCAATGCAAAAATTGCCTGAATTTGGCACTGATTTGGCTCTTCAGGCAACCTTTAGGATTGTCCTAGAAGAATCTTCCTCAAAGTTTTCAAAATTAGCAGATGCTAATGATAGATCAGTGATGTTAGAACCATTTGATCTTCCTGGAATGAATGTGATTCACCAAGGAGCAGGCAAACCTCTTCTCACTGTAGATTCTTCCCAAGGGGGGCCGTCTGCTGTTTTTCTTTTGGTACCAGGATTGGATGGACGAAATGAAACCGTATCTTTAGAATCCCAGAGCAACAAGGGATGTTATGTGTACAGTGGTATGAGCCCTAGTGCAGGAGTCAAGCTCAGTTGCAAATCTGATTCTGATGCTACTTTTAACCAAGCAGCAAGCTTTGTTGCTCTGCAAGGATTGAGCCAATACAATCCTATCAGTTTTGTGGCTAAAGGGGCAAACAGGAATTTTCTTTTGCAGCCATTACTCTCATTCAGAGACGAGCATTACACAGTTTATTTCAATATTCAAGATTGA

>Glyma.12g055900.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g055900.8.p locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.8.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g055900.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g055900.1 locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g055900.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g055900.2 locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g055900.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g055900.3 locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g055900.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g055900.4 locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g055900.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g055900.5 locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g055900.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g055900.6 locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g055900.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g055900.7 locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.7.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.12g055900.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g055900.8 locus=Glyma.12g055900 id=Glyma.12g055900.8.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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