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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT5G61450.1 | AT | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
GO:0016020 | GO-cc | membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
Glyma.12g006700 not represented in the dataset |
Glyma.12g006700 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.09g229600 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma12g00930 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.12g006700.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 GATCCGTGAGGGCGAGAACGAACGAGGGATGTGTCGCTAGGGTTTGCGAGAGAGTGAGAGAGTTGCGTTTGGAGCGAAACAGAACAGAACAGAACAGAGGAAAGACATTGATAGATTGATCATCGATGAAGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGGCGTGGCTGTGACAAGCCCTGTGAGTGGCGAAGACAGCGATGATAAGCAACGCCCTTCCTTTCCCTCCGTCAGATTCTCTTCCCGCAACGCTTCCTCCAAATACGATTTCGTCAAGGTGAAGGTGTGGTTGGGTGATAATGCGGATCACTACTATGTTCTCTCCCGATTTTTGCTCAGCAGAATGCTAACGGTAACCAAGATTCCAAACCACGTTGCTATCAAAATTGCTCTCGAATTGAAGAAGCTGCTCACAGATAACAGCCTTCTAGATGTCTCTCAATCTGACTTGGAAGTCAACCTATTTAAGCTTATGGAGCGGCGGGGATATGGAGAAGAATACATAAATCGTTACAAGATGATGACGAGATTTCATCATCAAAGAGTTCCGTTAGTAATCCTTGTTTGTGGAACTGCTTGTGTTGGGAAGTCTACTATTGCCACCCAGCTTGCACAGAGGCTAAATTTACCAAATGTATTACAGACAGATATGGTTTATGAATTGTTGCGCACATCAACAGATGCACCATTGGCATCGACTCCAGTATGGGCTAGAGACTTCAGTTCATCAGAGGAGTTAATAACTGAATTTTGCAGAGAATGCAGGGTTGTTCGCAAAGGTTTGGCTGGTGATCTGAAAAAGGCAATGAAAGATGGGAAGCCAATTATAATCGAGGGGATACATTTGGATCCTAGCATTTATTTAGTGGATGATGACAATAAATCACCCTCTGGTGTACATTCAGAAAATAAAGAGATAAATCCAGCATTTATGACATTGGATGATAATGCTACTGCACAAATAAAAGACATTCATGTGGGTAGCAGTGATGAGAGTAATGGTGGCTCCAGGATTTTGAGCTCTGATGAAGGAGTATCTGCTGACCAGGTTGATGTAGTATCAAATTCCATGGCATCCATGGGCCTAACTGAAAGCATCCCTGAACATAAAGTTGCTTCTCTTAGGGAACTGGAGACAGACAAAACTACTATTAGTAGGGCGAAGTCAGGTCCCAAACCAATAATTGTGCCTATTGTTTTGAAGATGGCTGAATTTGACCATAAGGATAATGAGAAGCTTATAGCCAACTTGAAAACCATACAGGATTATCTGTGCTCATTCACATCGCAGGGGTTGACTGTGGTCAATGTATCGGCAACAACATTTCCTCAAACATTGGATTGGCTGCATGGTTACCTTCTTCAGTGCATCGAGCAAGGTATTAAAGAAAATGTTACACCAGTAGCTCCATCATAGTTCATGTAATGAATGCTTCCAATTTTGACAGATTCAACTTCACTTTGTAAATGGATGATGCTGGAGAATAACTTATCAAATCAAAAGGTTAGGAAGATCATGTTCAAAGCTATCAACTCAACTGATCGCCAGCCCTATTACGGTCTTGCTTTGCAATATATGATCATTGATGATATCTTATTTTGTGAGCAGGATCATGGCTTGGGGAAAAGATAGCAGCATAACTGAATAATAGATGTTGTAATTATTGGATTATCAACATTTGCTACCAAATTAATTGTATGATCTATCATGTGTTTTGATGAGAAATTTCATGCTTCCATTCCATTGCGTTGTATGATCAACATCTTGCGGCATAACAAATATCAACAAACATACACACCCCCAATCCGTTTGAATTTAATTATGCAATTCATGCATGGATGTACGATTTGCTTTTAAGGAAACTTATAAAGATATTGTTCAAGA >Glyma.12g006700.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.9 sequence-type=transcript locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.1.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGAAGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGGCGTGGCTGTGACAAGCCCTGTGAGTGGCGAAGACAGCGATGATAAGCAACGCCCTTCCTTTCCCTCCGTCAGATTCTCTTCCCGCAACGCTTCCTCCAAATACGATTTCGTCAAGGTGAAGGTGTGGTTGGGTGATAATGCGGATCACTACTATGTTCTCTCCCGATTTTTGCTCAGCAGAATGCTAACGGTAACCAAGATTCCAAACCACGTTGCTATCAAAATTGCTCTCGAATTGAAGAAGCTGCTCACAGATAACAGCCTTCTAGATGTCTCTCAATCTGACTTGGAAGTCAACCTATTTAAGCTTATGGAGCGGCGGGGATATGGAGAAGAATACATAAATCGTTACAAGATGATGACGAGATTTCATCATCAAAGAGTTCCGTTAGTAATCCTTGTTTGTGGAACTGCTTGTGTTGGGAAGTCTACTATTGCCACCCAGCTTGCACAGAGGCTAAATTTACCAAATGTATTACAGACAGATATGGTTTATGAATTGTTGCGCACATCAACAGATGCACCATTGGCATCGACTCCAGTATGGGCTAGAGACTTCAGTTCATCAGAGGAGTTAATAACTGAATTTTGCAGAGAATGCAGGGTTGTTCGCAAAGGTTTGGCTGGTGATCTGAAAAAGGCAATGAAAGATGGGAAGCCAATTATAATCGAGGGGATACATTTGGATCCTAGCATTTATTTAGTGGATGATGACAATAAATCACCCTCTGGTGTACATTCAGAAAATAAAGAGATAAATCCAGCATTTATGACATTGGATGATAATGCTACTGCACAAATAAAAGACATTCATGTGGGTAGCAGTGATGAGAGTAATGGTGGCTCCAGGATTTTGAGCTCTGATGAAGGAGTATCTGCTGACCAGGTTGATGTAGTATCAAATTCCATGGCATCCATGGGCCTAACTGAAAGCATCCCTGAACATAAAGTTTTTCTTGCAGTTGCTTCTCTTAGGGAACTGGAGACAGACAAAACTACTATTAGTAGGGCGAAGTCAGGTCCCAAACCAATAATTGTGCCTATTGTTTTGAAGATGGCTGAATTTGACCATAAGGCATTACTTGAGGAGTGGATCTCTGCTCGGACATTTAATGACAAATGTCCAGACCTGGATAATGAGAAGCTTATAGCCAACTTGAAAACCATACAGGATTATCTGTGCTCATTCACATCGCAGGGGTTGACTGTGGTCAATGTATCGGCAACAACATTTCCTCAAACATTGGATTGGCTGCATGGTTACCTTCTTCAGTGCATCGAGCAAGGTATTAAAGAAAATGTTACACCAGTAGCTCCATCATAG >Glyma.12g006700.10 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.10.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.2.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGAAGAGGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGGCGTGGCTGTGACAAGCCCTGTGAGTGGCGAAGACAGCGATGATAAGCAACGCCCTTCCTTTCCCTCCGTCAGATTCTCTTCCCGCAACGCTTCCTCCAAATACGATTTCGTCAAGGTGAAGGTGTGGTTGGGTGATAATGCGGATCACTACTATGTTCTCTCCCGATTTTTGCTCAGCAGAATGCTAACGGTAACCAAGATTCCAAACCACGTTGCTATCAAAATTGCTCTCGAATTGAAGAAGCTGCTCACAGATAACAGCCTTCTAGATGTCTCTCAATCTGACTTGGAAGTCAACCTATTTAAGCTTATGGAGCGGCGGGGATATGGAGAAGAATACATAAATCGTTACAAGATGATGACGAGATTTCATCATCAAAGAGTTCCGTTAGTAATCCTTGTTTGTGGAACTGCTTGTGTTGGGAAGTCTACTATTGCCACCCAGCTTGCACAGAGGCTAAATTTACCAAATGTATTACAGACAGATATGGTTTATGAATTGTTGCGCACATCAACAGATGCACCATTGGCATCGACTCCAGTATGGGCTAGAGACTTCAGTTCATCAGAGGAGTTAATAACTGAATTTTGCAGAGAATGCAGGGTTGTTCGCAAAGGTTTGGCTGGTGATCTGAAAAAGGCAATGAAAGATGGGAAGCCAATTATAATCGAGGGGATACATTTGGATCCTAGCATTTATTTAGTGGATGATGACAATAAATCACCCTCTGGTGTACATTCAGAAAATAAAGAGATAAATCCAGCATTTATGACATTGGATGATAATGCTACTGCACAAATAAAAGACATTCATGTGGGTAGCAGTGATGAGAGTAATGGTGGCTCCAGGATTTTGAGCTCTGATGAAGGAGTATCTGCTGACCAGGTTGATGTAGTATCAAATTCCATGGCATCCATGGGCCTAACTGAAAGCATCCCTGAACATAAAGTTGCTTCTCTTAGGGAACTGGAGACAGACAAAACTACTATTAGTAGGGCGAAGTCAGGTCCCAAACCAATAATTGTGCCTATTGTTTTGAAGATGGCTGAATTTGACCATAAGGATAATGAGAAGCTTATAGCCAACTTGAAAACCATACAGGATTATCTGTGCTCATTCACATCGCAGGGGTTGACTGTGGTCAATGTATCGGCAACAACATTTCCTCAAACATTGGATTGGCTGCATGGTTACCTTCTTCAGTGCATCGAGCAAGGTATTAAAGAAAATGTTACACCAGTAGCTCCATCATAG >Glyma.12g006700.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.3.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.4.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.5.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.6.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.7.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.8.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.9 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.12g006700.9.p locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.12g006700.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g006700.1 locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MKREKEKEKGVAVTSPVSGEDSDDKQRPSFPSVRFSSRNASSKYDFVKVKVWLGDNADHYYVLSRFLLSRMLTVTKIPNHVAIKIALELKKLLTDNSLLDVSQSDLEVNLFKLMERRGYGEEYINRYKMMTRFHHQRVPLVILVCGTACVGKSTIATQLAQRLNLPNVLQTDMVYELLRTSTDAPLASTPVWARDFSSSEELITEFCRECRVVRKGLAGDLKKAMKDGKPIIIEGIHLDPSIYLVDDDNKSPSGVHSENKEINPAFMTLDDNATAQIKDIHVGSSDESNGGSRILSSDEGVSADQVDVVSNSMASMGLTESIPEHKVFLAVASLRELETDKTTISRAKSGPKPIIVPIVLKMAEFDHKALLEEWISARTFNDKCPDLDNEKLIANLKTIQDYLCSFTSQGLTVVNVSATTFPQTLDWLHGYLLQCIEQGIKENVTPVAPS* >Glyma.12g006700.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.12g006700.10 locus=Glyma.12g006700 ID=Glyma.12g006700.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||