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Warning: get_headers(): php_network_getaddresses: getaddrinfo for bar.utoronto.ca failed: Temporary failure in name resolution in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1020

Warning: get_headers(https://bar.utoronto.ca/api/efp_image/efp_soybean/soybean_severin/Absolute/Glyma.11g034600): Failed to open stream: php_network_getaddresses: getaddrinfo for bar.utoronto.ca failed: Temporary failure in name resolution in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1020

Warning: Trying to access array offset on false in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1021

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Deprecated: preg_match(): Passing null to parameter #2 ($subject) of type string is deprecated in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1031

Report for Sequence Feature Glyma.11g034600

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm11
Start:2514862
stop:2525673
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G17380.1AT MUTS-like protein 4 JGI N/AIEA
GO:0006298GO-bp mismatch repair EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0006298GO-bp mismatch repair JGI N/AIEA
GO:0051026GO-bp chiasma assembly EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0000795GO-cc synaptonemal complex EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding JGI N/AIEA
GO:0008094GO-mf DNA-dependent ATPase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0030983GO-mf mismatched DNA binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0030983GO-mf mismatched DNA binding JGI N/AIEA
KOG0220 KOG Mismatch repair ATPase MSH4 (MutS family) JGI N/AIEA
PTHR11361Panther DNA MISMATCH REPAIR MUTS RELATED PROTEINS JGI N/AIEA
PTHR11361:SF36Panther JGI N/AIEA
PF00488PFAM MutS domain V JGI N/AIEA
PF05190PFAM MutS family domain IV JGI N/AIEA
PF05192PFAM MutS domain III JGI N/AIEA

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.11g034600 not represented in the dataset

Glyma.11g034600 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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View a gene family containing related genes from other legumes at LIS

Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.


View gene and ortholog information at GlycineMine

Gene information in GlycineMine developed by LIS.



View a gene family containing related genes from other plant species at PhyloGenes

Gene families from PhyloGenes.


Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma11g03750 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


>Glyma.11g034600.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.15 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.11g034600.15.p locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.15.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.16 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.11g034600.16.p locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.16.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.17 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.11g034600.17.p locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.17.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.11g034600.4.p locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.11g034600.5.p locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.11g034600.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.11g034600.7.p locus=Glyma.11g034600 ID=Glyma.11g034600.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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