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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT2G42450.1 | AT | alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
GO:0006629 | GO-bp | lipid metabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0006629 | GO-bp | lipid metabolic process | JGI | N/A | IEA |
GO:0004806 | GO-mf | triglyceride lipase activity | JGI | N/A | IEA |
GO:0016787 | GO-mf | hydrolase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
KOG2088 | KOG | Predicted lipase/calmodulin-binding heat-shock protein | JGI | N/A | IEA |
PTHR21493 | Panther | CGI-141-RELATED/LIPASE CONTAINING PROTEIN | JGI | N/A | IEA |
PTHR21493:SF4 | Panther | ALPHA/BETA-HYDROLASE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN | JGI | N/A | IEA |
PF01764 | PFAM | Lipase (class 3) | JGI | N/A | IEA |
LIPAS-PWY | SoyCyc9 | triacylglycerol degradation | Plant Metabolic Network | ISS | |
GN7V-67072 | SoyCyc9-rxn | diacylglycerol lipase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.10g035200 not represented in the dataset |
Glyma.10g035200 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.13g121500 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma10g04060 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.10g035200.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.10g035200 ID=Glyma.10g035200.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.10g035200.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.10g035200 ID=Glyma.10g035200.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.10g035200.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.10g035200 ID=Glyma.10g035200.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.10g035200.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.10g035200 ID=Glyma.10g035200.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.10g035200.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.10g035200 ID=Glyma.10g035200.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.10g035200.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g035200.1 locus=Glyma.10g035200 ID=Glyma.10g035200.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MNTQYVKQLLRNFYSTKFFLNREKPHWNYMHRVFNQLQLQRSRADKVEDKLKEEQETQQISFKSEVKKADGNDGISKYSSDDEDSLDSKWKLELAWLTKALEPALQFCRWALPTGNGIGNKPPPSNRSLTEIIACIQRSKIGIQDWSLSDLTIGLYLIYLRQASTHPFEDIKGIQILSESIVQDLIYHIELAKGAYRDNPFSLSRNCMLRESNVKKFVKYSSVMRPAYYIGVDTRKKLVILGIRGTHTFYDLITDILSSSDGEVTYEGYSTHFGTAESARWFLRHEIEIIRKCLEKHAGFKLRLVGHSLGGAIASLLAIMIHRKSPKELGFSPDIVSAVGYGTPPCVSRELAESCSGYVSTVVMQDDIIPRLSVASLTRLRNEIVQTDWMSVIEKEDWKSVTDLVTNAKQFVSSVQDVARRLADYANFRRNKSLAVGTADKELPVATEAPLPSKAAKENSGVTKVEGTKPAVIEELFIPGTVYYLKRNLASQNVGKDFFTLYKREPGEHFQKVIFSGNFITDHRCDSHYYALRDVLKGLPWCGKEGIFK* >Glyma.10g035200.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g035200.2 locus=Glyma.10g035200 ID=Glyma.10g035200.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||