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A previous version of this gene model can be found here:
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT3G62040.1 | AT | Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
| GO:0008152 | GO-bp | metabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0016787 | GO-mf | hydrolase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| KOG3109 | KOG | Haloacid dehalogenase-like hydrolase | JGI | N/A | IEA |
| PTHR12725 | Panther | HALOACID DEHALOGENASE-LIKE HYDROLASE | JGI | N/A | IEA |
| PTHR12725:SF15 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
| PF00702 | PFAM | haloacid dehalogenase-like hydrolase | JGI | N/A | IEA |
| PWY-7204 | SoyCyc9 | pyridoxal 5'-phosphate salvage II (plants) | Plant Metabolic Network | ISS | |
| GN7V-64830 | SoyCyc9-rxn | pyridoxal phosphatase | Plant Metabolic Network | ISS |
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Glyma.10G139400 not represented in the dataset |
Glyma.10G139400 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma.10g139400 | Wm82.a4.v1 | ISS | As supplied by JGI |
| Glyma10g27980 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
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>Glyma.10g139400.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.10g139400.1.p locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGATACTTCTTATAGGACTGGTGGAGTCAAGTACGAGTGCTTGCTTTTTGATATGGATGACACTCTTTACCCATTGAGCTTAGGTCTCAATTTGTTTTGTCGCAAGAACATACAAGAGTATATGTTAGAACTCTTGCATATTGAAGAGAGTGAAGTGCCAAAAATGTGTTTGGATTTGTATAGGGAATACGGGACAACTATGGCAGGATTAAAGGTCCTTGGTTATGAGTTTGACAATGACGAGTTTCATGCTTACGTGCATGGAAGGTTACCATACGAGAAACTGAAGCCTGATCCAGTATTAAGGAACCTTCTGCTTTCCATGCCTCAGCGTAAAATAATATTCACCAATGCAGATCATGCACATGCAGTTAAAGTTCTCAACAGATTGGGTTTGGAAGATTGTTTTGAGGGCATCATATGCTTTGAAACGCTTAATCCTCCCAAACAAATCAATTGCATGGATGTACCAAATGATAATCATGTGCTCACAGATTTAACAGAAAATGGATGTTTCAATTCCCACCCACAAATCCTCTGTAAACCATCTGTGGAAGCCTTTGAAGCTGCTATTCGGATTGCTAATGTGGATCCAAAGAAAACAATTTTCTTTGATGACAGTGTTAGAAATGTTGAAAGTGCAAAAATAACTGGACTTAACACTGTTTTAGTGGGCCATTCAGATTTGGTCCCTGGAGCTGATCATGCCCTGAACAGCATTCATAATATCAAAGAAGCGTTACCTGAAATTTGGGAGATTGAAGATGGCAACCAACAGCAAAAGATTCAACCCCCAACAGTTGAAACCATGGTCCTAGCTTAA >Glyma.10g139400.10 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>Glyma.10g139400.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.1 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTIFFDDSVRNVESAKITGLNTVLVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.10 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.2 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.3 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTIFFDDSVRNVESAKITGLNTVLVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.4 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTIFFDDSVRNVESAKITGLNTVLVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.5 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTIFFDDSVRNVESAKITGLNTVLVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.6 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTIFFDDSVRNVESAKITGLNTVLVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.7 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTIFFDDSVRNVESAKITGLNTVLVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.8 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTIFFDDSVRNVESAKITGLNTVLVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA* >Glyma.10g139400.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.10g139400.9 locus=Glyma.10g139400 ID=Glyma.10g139400.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MDTSYRTGGVKYECLLFDMDDTLYPLSLGLNLFCRKNIQEYMLELLHIEESEVPKMCLDLYREYGTTMAGLKVLGYEFDNDEFHAYVHGRLPYEKLKPDPVLRNLLLSMPQRKIIFTNADHAHAVKVLNRLGLEDCFEGIICFETLNPPKQINCMDVPNDNHVLTDLTENGCFNSHPQILCKPSVEAFEAAIRIANVDPKKTIFFDDSVRNVESAKITGLNTVLVGHSDLVPGADHALNSIHNIKEALPEIWEIEDGNQQQKIQPPTVETMVLA*
| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||